MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_020307	GC	3	6	519817	519822	0 %	0 %	50 %	50 %	452120066
9503	NC_020307	CAC	2	6	519891	519896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452120066
9504	NC_020307	GTA	2	6	520064	520069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120067
9505	NC_020307	GCC	2	6	520109	520114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120067
9506	NC_020307	GT	3	6	520223	520228	0 %	50 %	50 %	0 %	452120067
9507	NC_020307	TCT	2	6	520282	520287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120068
9508	NC_020307	TAA	2	6	520457	520462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120068
9509	NC_020307	TCA	2	6	520470	520475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120068
9510	NC_020307	GC	3	6	520490	520495	0 %	0 %	50 %	50 %	452120068
9511	NC_020307	TCG	2	6	520811	520816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120069
9512	NC_020307	GCC	2	6	520961	520966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120069
9513	NC_020307	GCC	3	9	520979	520987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120069
9514	NC_020307	GGT	2	6	520994	520999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120069
9515	NC_020307	AAG	2	6	521041	521046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120069
9516	NC_020307	GTG	2	6	521052	521057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120069
9517	NC_020307	AAGCCG	2	12	521088	521099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120069
9518	NC_020307	AGC	2	6	521122	521127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120069
9519	NC_020307	CCGCG	2	10	521149	521158	0 %	0 %	40 %	60 %	452120069
9520	NC_020307	CAA	2	6	521197	521202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452120069
9521	NC_020307	GCA	2	6	521203	521208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120069
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9523	NC_020307	GTAAAG	2	12	521322	521333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452120069
9524	NC_020307	CTG	2	6	521347	521352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120069
9525	NC_020307	ATGCG	2	10	521419	521428	20 %	20 %	40 %	20 %	452120069
9526	NC_020307	TGG	2	6	521467	521472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452120069
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9528	NC_020307	T	6	6	521684	521689	0 %	100 %	0 %	0 %	452120070
9529	NC_020307	CGT	2	6	521720	521725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120070
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9533	NC_020307	CGC	2	6	521851	521856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120070
9534	NC_020307	CAGC	2	8	521876	521883	25 %	0 %	25 %	50 %	452120070
9535	NC_020307	GGCA	2	8	521915	521922	25 %	0 %	50 %	25 %	452120070
9536	NC_020307	GAG	2	6	521953	521958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452120070
9537	NC_020307	TAT	2	6	521959	521964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120070
9538	NC_020307	TTG	2	6	521968	521973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452120070
9539	NC_020307	CGC	2	6	522179	522184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120071
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9541	NC_020307	CGCA	2	8	522287	522294	25 %	0 %	25 %	50 %	452120071
9542	NC_020307	A	6	6	522297	522302	100 %	0 %	0 %	0 %	452120071
9543	NC_020307	CTG	2	6	522336	522341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120071
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9545	NC_020307	TTA	2	6	522404	522409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452120071
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9547	NC_020307	ATAA	2	8	522432	522439	75 %	25 %	0 %	0 %	452120071
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9551	NC_020307	TCT	2	6	522530	522535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120071
9552	NC_020307	CGC	2	6	522603	522608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120071
9553	NC_020307	A	6	6	522636	522641	100 %	0 %	0 %	0 %	452120071
9554	NC_020307	A	6	6	522655	522660	100 %	0 %	0 %	0 %	452120071
9555	NC_020307	TTC	2	6	522677	522682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452120071
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9558	NC_020307	CTG	2	6	522942	522947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120072
9559	NC_020307	CAAC	2	8	522979	522986	50 %	0 %	0 %	50 %	452120072
9560	NC_020307	ATA	2	6	523017	523022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452120072
9561	NC_020307	GC	3	6	523125	523130	0 %	0 %	50 %	50 %	452120072
9562	NC_020307	GC	3	6	523132	523137	0 %	0 %	50 %	50 %	452120072
9563	NC_020307	ATC	2	6	523167	523172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452120072
9564	NC_020307	GAT	2	6	523175	523180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452120072
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9566	NC_020307	GGC	2	6	523226	523231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120072
9567	NC_020307	GC	3	6	523236	523241	0 %	0 %	50 %	50 %	452120072
9568	NC_020307	CTG	3	9	523250	523258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120072
9569	NC_020307	CTGC	2	8	523299	523306	0 %	25 %	25 %	50 %	452120072
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9573	NC_020307	GCA	2	6	523543	523548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452120073
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9579	NC_020307	A	6	6	523774	523779	100 %	0 %	0 %	0 %	452120073
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9605	NC_020307	CGG	2	6	525240	525245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120075
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9607	NC_020307	CGAAT	2	10	525256	525265	40 %	20 %	20 %	20 %	452120075
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9609	NC_020307	TCG	2	6	525343	525348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120075
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9612	NC_020307	CGC	2	6	525464	525469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120075
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9617	NC_020307	CGCTT	2	10	525558	525567	0 %	40 %	20 %	40 %	452120075
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9989	NC_020307	GCAG	2	8	552041	552048	25 %	0 %	50 %	25 %	452120105
9990	NC_020307	AGGC	2	8	552051	552058	25 %	0 %	50 %	25 %	452120105
9991	NC_020307	CCG	2	6	552096	552101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120105
9992	NC_020307	GCC	2	6	552123	552128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452120105
9993	NC_020307	GTC	2	6	552215	552220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452120106
9994	NC_020307	GAA	2	6	552250	552255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452120106
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9998	NC_020307	A	6	6	552403	552408	100 %	0 %	0 %	0 %	452120106
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10000	NC_020307	GGC	2	6	552517	552522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452120106

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