MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83001	NC_020307	TTAT	2	8	4544674	4544681	25 %	75 %	0 %	0 %	452123842
83002	NC_020307	GGT	2	6	4544718	4544723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83003	NC_020307	CTGG	2	8	4544730	4544737	0 %	25 %	50 %	25 %	452123842
83004	NC_020307	GCA	2	6	4544750	4544755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123842
83005	NC_020307	TGA	2	6	4544780	4544785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123842
83006	NC_020307	GTG	2	6	4544827	4544832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83007	NC_020307	GTT	2	6	4544848	4544853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123842
83008	NC_020307	TATGCA	2	12	4544865	4544876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452123842
83009	NC_020307	TGA	2	6	4544894	4544899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123842
83010	NC_020307	ATG	2	6	4544932	4544937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123842
83011	NC_020307	TGG	2	6	4544942	4544947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83012	NC_020307	CGC	2	6	4544951	4544956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123842
83013	NC_020307	TGG	2	6	4544963	4544968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83014	NC_020307	CTG	2	6	4544980	4544985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123842
83015	NC_020307	T	6	6	4545010	4545015	0 %	100 %	0 %	0 %	452123842
83016	NC_020307	CGC	2	6	4545023	4545028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123842
83017	NC_020307	GTG	2	6	4545037	4545042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83018	NC_020307	ACA	2	6	4545105	4545110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452123842
83019	NC_020307	GCG	2	6	4545120	4545125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
83020	NC_020307	GC	3	6	4545165	4545170	0 %	0 %	50 %	50 %	452123842
83021	NC_020307	TGG	2	6	4545203	4545208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83022	NC_020307	GAC	2	6	4545220	4545225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123842
83023	NC_020307	GGC	2	6	4545275	4545280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
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83025	NC_020307	CTG	2	6	4545340	4545345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123842
83026	NC_020307	CGG	3	9	4545356	4545364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
83027	NC_020307	AG	3	6	4545376	4545381	50 %	0 %	50 %	0 %	452123842
83028	NC_020307	CTG	2	6	4545397	4545402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123842
83029	NC_020307	GAG	2	6	4545419	4545424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452123842
83030	NC_020307	CTG	2	6	4545652	4545657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123842
83031	NC_020307	TGG	2	6	4545764	4545769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123842
83032	NC_020307	GCCT	2	8	4545817	4545824	0 %	25 %	25 %	50 %	452123842
83033	NC_020307	TAT	2	6	4545888	4545893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123842
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83035	NC_020307	A	6	6	4545932	4545937	100 %	0 %	0 %	0 %	452123842
83036	NC_020307	CGG	2	6	4545939	4545944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
83037	NC_020307	TC	3	6	4545947	4545952	0 %	50 %	0 %	50 %	452123842
83038	NC_020307	CGG	3	9	4545978	4545986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
83039	NC_020307	ATG	2	6	4546000	4546005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123842
83040	NC_020307	CGG	2	6	4546064	4546069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
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83042	NC_020307	GGC	2	6	4546149	4546154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123842
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83045	NC_020307	TGT	2	6	4546298	4546303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123842
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83047	NC_020307	T	6	6	4546524	4546529	0 %	100 %	0 %	0 %	452123843
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83051	NC_020307	TCA	2	6	4546655	4546660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123843
83052	NC_020307	T	6	6	4546725	4546730	0 %	100 %	0 %	0 %	452123843
83053	NC_020307	CAT	2	6	4546812	4546817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123843
83054	NC_020307	T	6	6	4546874	4546879	0 %	100 %	0 %	0 %	452123843
83055	NC_020307	CGC	2	6	4546882	4546887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123843
83056	NC_020307	GA	3	6	4546988	4546993	50 %	0 %	50 %	0 %	452123843
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83058	NC_020307	ATT	2	6	4547112	4547117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123844
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83061	NC_020307	TCT	2	6	4547277	4547282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452123844
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83066	NC_020307	T	6	6	4547551	4547556	0 %	100 %	0 %	0 %	452123844
83067	NC_020307	CAG	2	6	4547635	4547640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123844
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83069	NC_020307	GAT	2	6	4547716	4547721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123844
83070	NC_020307	CG	3	6	4547733	4547738	0 %	0 %	50 %	50 %	452123844
83071	NC_020307	CAA	2	6	4547758	4547763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452123844
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83078	NC_020307	CTCGAT	2	12	4549288	4549299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452123845
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83083	NC_020307	CGCC	2	8	4549431	4549438	0 %	0 %	25 %	75 %	452123845
83084	NC_020307	ATG	2	6	4549511	4549516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123845
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83087	NC_020307	T	6	6	4549602	4549607	0 %	100 %	0 %	0 %	452123845
83088	NC_020307	AACGC	2	10	4549661	4549670	40 %	0 %	20 %	40 %	452123845
83089	NC_020307	TGG	2	6	4549676	4549681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123845
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83098	NC_020307	ATG	2	6	4549981	4549986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123845
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83102	NC_020307	TCA	2	6	4550855	4550860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123846
83103	NC_020307	TCTT	2	8	4550875	4550882	0 %	75 %	0 %	25 %	452123846
83104	NC_020307	TGC	2	6	4550901	4550906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123846
83105	NC_020307	GGTT	2	8	4550922	4550929	0 %	50 %	50 %	0 %	452123846
83106	NC_020307	CG	3	6	4550946	4550951	0 %	0 %	50 %	50 %	452123846
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83112	NC_020307	TGGAC	2	10	4551190	4551199	20 %	20 %	40 %	20 %	452123846
83113	NC_020307	CG	3	6	4551203	4551208	0 %	0 %	50 %	50 %	452123846
83114	NC_020307	CGC	2	6	4551213	4551218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123846
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83116	NC_020307	TGC	2	6	4551535	4551540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123847
83117	NC_020307	TGG	3	9	4551568	4551576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123847
83118	NC_020307	CGG	2	6	4551677	4551682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123847
83119	NC_020307	CCG	2	6	4551756	4551761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123847
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83122	NC_020307	ATC	2	6	4552086	4552091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123848
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83143	NC_020307	CTG	2	6	4553165	4553170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123848
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83215	NC_020307	TGGT	2	8	4556692	4556699	0 %	50 %	50 %	0 %	452123851
83216	NC_020307	CG	4	8	4556723	4556730	0 %	0 %	50 %	50 %	452123851
83217	NC_020307	GC	4	8	4556857	4556864	0 %	0 %	50 %	50 %	452123851
83218	NC_020307	GGC	3	9	4556912	4556920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123851
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83220	NC_020307	CGC	2	6	4557026	4557031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123851
83221	NC_020307	CG	3	6	4557042	4557047	0 %	0 %	50 %	50 %	452123851
83222	NC_020307	GC	3	6	4557063	4557068	0 %	0 %	50 %	50 %	452123851
83223	NC_020307	ACAAA	2	10	4557137	4557146	80 %	0 %	0 %	20 %	452123851
83224	NC_020307	A	6	6	4557180	4557185	100 %	0 %	0 %	0 %	452123851
83225	NC_020307	GGC	2	6	4557233	4557238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123851
83226	NC_020307	ATG	2	6	4557327	4557332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123851
83227	NC_020307	GGC	2	6	4557333	4557338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123851
83228	NC_020307	TGA	2	6	4557347	4557352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123851
83229	NC_020307	GGT	3	9	4557389	4557397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123851
83230	NC_020307	CG	3	6	4557433	4557438	0 %	0 %	50 %	50 %	452123851
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83232	NC_020307	TCA	2	6	4557559	4557564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123851
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83341	NC_020307	G	6	6	4561961	4561966	0 %	0 %	100 %	0 %	452123856
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83345	NC_020307	GAT	2	6	4562111	4562116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123856
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83348	NC_020307	GC	3	6	4562221	4562226	0 %	0 %	50 %	50 %	452123856
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83464	NC_020307	TGGATG	2	12	4568028	4568039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	452123861
83465	NC_020307	GAT	2	6	4568042	4568047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123861
83466	NC_020307	TGG	2	6	4568094	4568099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123861
83467	NC_020307	GCG	2	6	4568230	4568235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123861
83468	NC_020307	GGCGCA	2	12	4568263	4568274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	452123861
83469	NC_020307	GGTTT	2	10	4568295	4568304	0 %	60 %	40 %	0 %	452123861
83470	NC_020307	TCA	2	6	4568368	4568373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123861
83471	NC_020307	AAACCG	2	12	4568379	4568390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452123861
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83475	NC_020307	CG	3	6	4568558	4568563	0 %	0 %	50 %	50 %	452123862
83476	NC_020307	TAT	2	6	4568615	4568620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123862
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83479	NC_020307	GCG	2	6	4568731	4568736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123862
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83481	NC_020307	GCTG	2	8	4568966	4568973	0 %	25 %	50 %	25 %	452123863
83482	NC_020307	GCCA	2	8	4568974	4568981	25 %	0 %	25 %	50 %	452123863
83483	NC_020307	CGA	2	6	4569021	4569026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123863
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83488	NC_020307	CGAG	2	8	4569320	4569327	25 %	0 %	50 %	25 %	452123863
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83490	NC_020307	CCAC	2	8	4569374	4569381	25 %	0 %	0 %	75 %	452123863
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83492	NC_020307	GAT	2	6	4569465	4569470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123863
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83494	NC_020307	T	6	6	4569508	4569513	0 %	100 %	0 %	0 %	452123863
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83499	NC_020307	CGC	2	6	4569758	4569763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123863
83500	NC_020307	GAC	2	6	4569829	4569834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123863

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