MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 84801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_020307	CGA	2	6	4115461	4115466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123449
75002	NC_020307	A	6	6	4115471	4115476	100 %	0 %	0 %	0 %	452123449
75003	NC_020307	GTA	2	6	4116151	4116156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123450
75004	NC_020307	GCT	2	6	4116255	4116260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123450
75005	NC_020307	TCA	2	6	4116267	4116272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123450
75006	NC_020307	GGT	2	6	4116347	4116352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123450
75007	NC_020307	ATC	2	6	4116431	4116436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123451
75008	NC_020307	TTGC	2	8	4116551	4116558	0 %	50 %	25 %	25 %	452123451
75009	NC_020307	ACC	2	6	4116765	4116770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123452
75010	NC_020307	GTT	2	6	4116782	4116787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123452
75011	NC_020307	GAT	2	6	4116857	4116862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123452
75012	NC_020307	CTG	2	6	4116899	4116904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75013	NC_020307	CGCT	2	8	4116956	4116963	0 %	25 %	25 %	50 %	452123452
75014	NC_020307	ACC	2	6	4117037	4117042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123452
75015	NC_020307	CGG	2	6	4117054	4117059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123452
75016	NC_020307	CTG	2	6	4117181	4117186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75017	NC_020307	TGC	2	6	4117222	4117227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75018	NC_020307	GGA	2	6	4117246	4117251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452123452
75019	NC_020307	TCAG	2	8	4117275	4117282	25 %	25 %	25 %	25 %	452123452
75020	NC_020307	TCA	2	6	4117311	4117316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123452
75021	NC_020307	CGA	2	6	4117390	4117395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75022	NC_020307	CTG	2	6	4117502	4117507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75023	NC_020307	CAC	2	6	4117522	4117527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123452
75024	NC_020307	GCTG	2	8	4117624	4117631	0 %	25 %	50 %	25 %	452123452
75025	NC_020307	ATT	2	6	4117697	4117702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123452
75026	NC_020307	TGG	2	6	4117753	4117758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123452
75027	NC_020307	CTG	2	6	4117762	4117767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75028	NC_020307	TGC	2	6	4117863	4117868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123452
75029	NC_020307	ACG	2	6	4117974	4117979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123453
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75031	NC_020307	CGG	3	9	4118050	4118058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123453
75032	NC_020307	CGG	2	6	4118125	4118130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123453
75033	NC_020307	GCT	2	6	4118137	4118142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123453
75034	NC_020307	GGCAA	2	10	4118159	4118168	40 %	0 %	40 %	20 %	452123453
75035	NC_020307	AAG	2	6	4118265	4118270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123453
75036	NC_020307	AGC	3	9	4118300	4118308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123453
75037	NC_020307	CAG	2	6	4118317	4118322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123453
75038	NC_020307	GGC	2	6	4118402	4118407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123453
75039	NC_020307	CTGA	2	8	4118516	4118523	25 %	25 %	25 %	25 %	452123454
75040	NC_020307	CAT	2	6	4118548	4118553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123454
75041	NC_020307	TGC	2	6	4118583	4118588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123454
75042	NC_020307	TATGGA	2	12	4118635	4118646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123454
75043	NC_020307	ATG	2	6	4118657	4118662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123454
75044	NC_020307	CCG	2	6	4118724	4118729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123454
75045	NC_020307	GGT	2	6	4118752	4118757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123454
75046	NC_020307	T	6	6	4118761	4118766	0 %	100 %	0 %	0 %	452123454
75047	NC_020307	GAA	2	6	4118770	4118775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123454
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75049	NC_020307	CCAT	2	8	4118854	4118861	25 %	25 %	0 %	50 %	452123455
75050	NC_020307	CTGA	2	8	4118878	4118885	25 %	25 %	25 %	25 %	452123455
75051	NC_020307	TGGCG	2	10	4118891	4118900	0 %	20 %	60 %	20 %	452123455
75052	NC_020307	GCTG	2	8	4119025	4119032	0 %	25 %	50 %	25 %	452123456
75053	NC_020307	GC	3	6	4119111	4119116	0 %	0 %	50 %	50 %	452123456
75054	NC_020307	GAA	2	6	4119155	4119160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452123456
75055	NC_020307	CGG	2	6	4119204	4119209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123456
75056	NC_020307	GCT	2	6	4119220	4119225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123456
75057	NC_020307	A	6	6	4119235	4119240	100 %	0 %	0 %	0 %	452123456
75058	NC_020307	AGT	2	6	4119341	4119346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123456
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75062	NC_020307	ATCGC	2	10	4119489	4119498	20 %	20 %	20 %	40 %	452123456
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75089	NC_020307	TGC	2	6	4120797	4120802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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75099	NC_020307	GCT	2	6	4121191	4121196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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75104	NC_020307	CGGG	2	8	4121343	4121350	0 %	0 %	75 %	25 %	452123456
75105	NC_020307	CAG	2	6	4121425	4121430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123456
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75115	NC_020307	CGG	2	6	4121919	4121924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123457
75116	NC_020307	TTGA	2	8	4121980	4121987	25 %	50 %	25 %	0 %	452123457
75117	NC_020307	TGTT	2	8	4122011	4122018	0 %	75 %	25 %	0 %	452123457
75118	NC_020307	T	6	6	4122049	4122054	0 %	100 %	0 %	0 %	452123457
75119	NC_020307	TGA	2	6	4122105	4122110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123457
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75122	NC_020307	G	6	6	4122184	4122189	0 %	0 %	100 %	0 %	452123457
75123	NC_020307	GGA	2	6	4122205	4122210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452123457
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75127	NC_020307	TGA	2	6	4122319	4122324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123458
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75143	NC_020307	CTG	2	6	4123134	4123139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123458
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75231	NC_020307	TGC	2	6	4128531	4128536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123463
75232	NC_020307	CG	3	6	4128547	4128552	0 %	0 %	50 %	50 %	452123463
75233	NC_020307	GCT	2	6	4128565	4128570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123463
75234	NC_020307	CGA	2	6	4128576	4128581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123463
75235	NC_020307	GC	3	6	4128592	4128597	0 %	0 %	50 %	50 %	452123463
75236	NC_020307	GC	3	6	4128620	4128625	0 %	0 %	50 %	50 %	452123463
75237	NC_020307	TGGC	2	8	4128693	4128700	0 %	25 %	50 %	25 %	452123463
75238	NC_020307	GC	3	6	4128859	4128864	0 %	0 %	50 %	50 %	452123463
75239	NC_020307	GGC	2	6	4128908	4128913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123463
75240	NC_020307	TCG	2	6	4128936	4128941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123463
75241	NC_020307	ATT	2	6	4128986	4128991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452123463
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75244	NC_020307	GCGG	2	8	4129079	4129086	0 %	0 %	75 %	25 %	452123463
75245	NC_020307	CGCTG	2	10	4129141	4129150	0 %	20 %	40 %	40 %	452123463
75246	NC_020307	CGA	2	6	4129180	4129185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123463
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75250	NC_020307	TGCTG	2	10	4129293	4129302	0 %	40 %	40 %	20 %	452123463
75251	NC_020307	ATA	2	6	4129448	4129453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452123463
75252	NC_020307	CGGCG	2	10	4129571	4129580	0 %	0 %	60 %	40 %	452123463
75253	NC_020307	GCG	2	6	4129599	4129604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123463
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75260	NC_020307	CGC	2	6	4129977	4129982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123464
75261	NC_020307	TGA	2	6	4129984	4129989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452123464
75262	NC_020307	CAG	2	6	4130001	4130006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452123464
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75332	NC_020307	GCG	2	6	4133368	4133373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123464
75333	NC_020307	GC	3	6	4133426	4133431	0 %	0 %	50 %	50 %	452123464
75334	NC_020307	TG	3	6	4133488	4133493	0 %	50 %	50 %	0 %	452123464
75335	NC_020307	CAT	2	6	4133540	4133545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452123464
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75338	NC_020307	CGT	2	6	4133669	4133674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123464
75339	NC_020307	GTC	2	6	4133683	4133688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452123464
75340	NC_020307	CGC	2	6	4133705	4133710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452123464
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75342	NC_020307	CCCG	2	8	4133844	4133851	0 %	0 %	25 %	75 %	452123464
75343	NC_020307	CCA	2	6	4133861	4133866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452123464
75344	NC_020307	GCG	2	6	4133888	4133893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452123464
75345	NC_020307	GGT	2	6	4133895	4133900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452123464
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75464	NC_020307	GTT	2	6	4140289	4140294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452123464
75465	NC_020307	TCGT	2	8	4140373	4140380	0 %	50 %	25 %	25 %	452123464
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