MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM_M

Total Repeats: 1880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020296	TTA	3	9	92112	92120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816636
1502	NC_020296	A	7	7	92260	92266	100 %	0 %	0 %	0 %	451816636
1503	NC_020296	CTG	2	6	92351	92356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816636
1504	NC_020296	GCA	2	6	92366	92371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816636
1505	NC_020296	ATT	2	6	92411	92416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816636
1506	NC_020296	TAG	2	6	92509	92514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816636
1507	NC_020296	ATC	2	6	92562	92567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816636
1508	NC_020296	T	6	6	92594	92599	0 %	100 %	0 %	0 %	451816636
1509	NC_020296	ATT	2	6	92622	92627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816636
1510	NC_020296	TTAT	2	8	92647	92654	25 %	75 %	0 %	0 %	451816636
1511	NC_020296	AAT	2	6	92681	92686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816636
1512	NC_020296	CGC	2	6	92904	92909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816637
1513	NC_020296	AATA	2	8	92910	92917	75 %	25 %	0 %	0 %	451816637
1514	NC_020296	TTGC	2	8	92943	92950	0 %	50 %	25 %	25 %	451816637
1515	NC_020296	AGG	2	6	93134	93139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816637
1516	NC_020296	GAAA	2	8	93306	93313	75 %	0 %	25 %	0 %	451816638
1517	NC_020296	TTGGG	2	10	93324	93333	0 %	40 %	60 %	0 %	451816638
1518	NC_020296	CAG	2	6	93364	93369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816638
1519	NC_020296	ACC	2	6	93375	93380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816638
1520	NC_020296	A	6	6	93660	93665	100 %	0 %	0 %	0 %	451816639
1521	NC_020296	CCA	2	6	93666	93671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816639
1522	NC_020296	ATA	2	6	93702	93707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816639
1523	NC_020296	TTAC	2	8	93708	93715	25 %	50 %	0 %	25 %	451816639
1524	NC_020296	A	6	6	93792	93797	100 %	0 %	0 %	0 %	451816639
1525	NC_020296	TCA	2	6	93859	93864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816639
1526	NC_020296	TCT	2	6	93908	93913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816640
1527	NC_020296	GGT	2	6	93935	93940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816640
1528	NC_020296	CCT	2	6	93987	93992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816640
1529	NC_020296	CAT	2	6	94029	94034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816640
1530	NC_020296	TCA	2	6	94040	94045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816640
1531	NC_020296	ATG	2	6	94057	94062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816640
1532	NC_020296	ACT	2	6	94112	94117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816640
1533	NC_020296	GTTAGG	2	12	94180	94191	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451816640
1534	NC_020296	TAC	2	6	94290	94295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816640
1535	NC_020296	ATA	2	6	94312	94317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816640
1536	NC_020296	CAA	2	6	94323	94328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816640
1537	NC_020296	TTC	2	6	94339	94344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816640
1538	NC_020296	CTGC	2	8	94349	94356	0 %	25 %	25 %	50 %	451816640
1539	NC_020296	GTA	2	6	94360	94365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816640
1540	NC_020296	TCA	2	6	94469	94474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816640
1541	NC_020296	GAT	2	6	94535	94540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816640
1542	NC_020296	TTG	2	6	94632	94637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816640
1543	NC_020296	TAT	2	6	94650	94655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816640
1544	NC_020296	TAG	2	6	94661	94666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816640
1545	NC_020296	ATCT	2	8	94704	94711	25 %	50 %	0 %	25 %	451816640
1546	NC_020296	A	6	6	94715	94720	100 %	0 %	0 %	0 %	451816640
1547	NC_020296	AT	3	6	94802	94807	50 %	50 %	0 %	0 %	451816640
1548	NC_020296	TCA	2	6	94808	94813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816640
1549	NC_020296	TAG	2	6	94819	94824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816640
1550	NC_020296	ATTG	2	8	94865	94872	25 %	50 %	25 %	0 %	451816640
1551	NC_020296	ATT	2	6	94940	94945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816641
1552	NC_020296	GCC	2	6	94953	94958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816641
1553	NC_020296	CCA	2	6	94987	94992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816641
1554	NC_020296	TGG	2	6	95064	95069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816641
1555	NC_020296	GATA	2	8	95114	95121	50 %	25 %	25 %	0 %	451816641
1556	NC_020296	GGT	2	6	95309	95314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816642
1557	NC_020296	TTA	2	6	95362	95367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816642
1558	NC_020296	TGA	2	6	95386	95391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816642
1559	NC_020296	TTC	2	6	95415	95420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816642
1560	NC_020296	TAA	2	6	95424	95429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816642
1561	NC_020296	TCCCC	2	10	95435	95444	0 %	20 %	0 %	80 %	451816642
1562	NC_020296	AAT	2	6	95531	95536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816642
1563	NC_020296	ATAA	2	8	95548	95555	75 %	25 %	0 %	0 %	451816642
1564	NC_020296	T	6	6	95805	95810	0 %	100 %	0 %	0 %	451816643
1565	NC_020296	CTT	2	6	95849	95854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816643
1566	NC_020296	TCG	2	6	95883	95888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816643
1567	NC_020296	TTAAG	2	10	95903	95912	40 %	40 %	20 %	0 %	451816643
1568	NC_020296	TTC	2	6	96156	96161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816644
1569	NC_020296	CA	3	6	96171	96176	50 %	0 %	0 %	50 %	451816644
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1572	NC_020296	CGC	2	6	96595	96600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816645
1573	NC_020296	GTT	2	6	96608	96613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816645
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1575	NC_020296	ATC	2	6	96779	96784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816645
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1587	NC_020296	ACC	2	6	97884	97889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816647
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1594	NC_020296	CCTT	2	8	98106	98113	0 %	50 %	0 %	50 %	451816647
1595	NC_020296	CGC	2	6	98144	98149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816647
1596	NC_020296	TCAA	2	8	98151	98158	50 %	25 %	0 %	25 %	451816647
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1600	NC_020296	TGGG	2	8	98742	98749	0 %	25 %	75 %	0 %	451816648
1601	NC_020296	GGT	2	6	98775	98780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816648
1602	NC_020296	GCC	2	6	98794	98799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816648
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1606	NC_020296	CAC	2	6	99048	99053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816648
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1608	NC_020296	GTGA	2	8	99139	99146	25 %	25 %	50 %	0 %	451816648
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1622	NC_020296	A	6	6	99899	99904	100 %	0 %	0 %	0 %	451816650
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1626	NC_020296	GTT	2	6	100708	100713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816651
1627	NC_020296	TCC	2	6	100722	100727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816651
1628	NC_020296	CTC	2	6	100804	100809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816651
1629	NC_020296	TCC	2	6	100880	100885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816652
1630	NC_020296	ATTG	2	8	100908	100915	25 %	50 %	25 %	0 %	451816652
1631	NC_020296	TAC	2	6	100959	100964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816652
1632	NC_020296	CAT	2	6	100987	100992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816652
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1639	NC_020296	TTCT	2	8	101527	101534	0 %	75 %	0 %	25 %	451816652
1640	NC_020296	CCG	2	6	101618	101623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816652
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1643	NC_020296	TTC	2	6	101723	101728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816652
1644	NC_020296	CGG	3	9	101751	101759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816652
1645	NC_020296	TATT	2	8	101871	101878	25 %	75 %	0 %	0 %	451816652
1646	NC_020296	GTC	2	6	101914	101919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816652
1647	NC_020296	TA	3	6	101949	101954	50 %	50 %	0 %	0 %	451816652
1648	NC_020296	AGG	2	6	101955	101960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816652
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1651	NC_020296	CGG	2	6	102234	102239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816652
1652	NC_020296	GTT	2	6	102797	102802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816653
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1654	NC_020296	GTA	2	6	102927	102932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816653
1655	NC_020296	TGA	2	6	102974	102979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816653
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1658	NC_020296	TTC	2	6	103064	103069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816653
1659	NC_020296	ACT	2	6	103641	103646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816654
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1662	NC_020296	TTA	2	6	103727	103732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816654
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1666	NC_020296	AGC	2	6	103822	103827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816654
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1700	NC_020296	A	6	6	104933	104938	100 %	0 %	0 %	0 %	451816655
1701	NC_020296	A	6	6	104957	104962	100 %	0 %	0 %	0 %	451816655
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1708	NC_020296	AT	3	6	105149	105154	50 %	50 %	0 %	0 %	451816655
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1728	NC_020296	GCAGT	2	10	106910	106919	20 %	20 %	40 %	20 %	451816658
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1731	NC_020296	TGAG	2	8	107199	107206	25 %	25 %	50 %	0 %	451816659
1732	NC_020296	TTA	2	6	107304	107309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816659
1733	NC_020296	TTGA	2	8	107399	107406	25 %	50 %	25 %	0 %	451816659
1734	NC_020296	CAA	2	6	107443	107448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816659
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1737	NC_020296	AGTT	2	8	107616	107623	25 %	50 %	25 %	0 %	451816660
1738	NC_020296	GAG	2	6	107624	107629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816660
1739	NC_020296	CTGA	2	8	107645	107652	25 %	25 %	25 %	25 %	451816660
1740	NC_020296	GGC	2	6	107683	107688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816660
1741	NC_020296	TGGA	2	8	107730	107737	25 %	25 %	50 %	0 %	451816660
1742	NC_020296	GCC	2	6	107818	107823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816661
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1747	NC_020296	GTA	2	6	108056	108061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816661
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1870	NC_020296	T	6	6	116441	116446	0 %	100 %	0 %	0 %	451816671
1871	NC_020296	GTT	2	6	116498	116503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816671
1872	NC_020296	CAG	2	6	116516	116521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816671
1873	NC_020296	GA	3	6	116523	116528	50 %	0 %	50 %	0 %	451816671
1874	NC_020296	GTC	2	6	116533	116538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816671
1875	NC_020296	ATTTT	2	10	116539	116548	20 %	80 %	0 %	0 %	451816671
1876	NC_020296	CTC	2	6	116640	116645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816672
1877	NC_020296	CTCC	2	8	116689	116696	0 %	25 %	0 %	75 %	451816672
1878	NC_020296	T	6	6	116742	116747	0 %	100 %	0 %	0 %	451816672
1879	NC_020296	TCCT	2	8	116772	116779	0 %	50 %	0 %	50 %	451816672
1880	NC_020296	CAT	2	6	116804	116809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816672

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