MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM_M

Total Repeats: 1880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020296	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816544
2	NC_020296	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	451816544
3	NC_020296	CGG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816544
4	NC_020296	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	451816545
5	NC_020296	TAG	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816545
6	NC_020296	TTG	2	6	698	703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816545
7	NC_020296	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816545
8	NC_020296	CAT	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816545
9	NC_020296	CCGA	2	8	865	872	25 %	0 %	25 %	50 %	451816545
10	NC_020296	TCT	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816546
11	NC_020296	CGC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816546
12	NC_020296	ATA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816546
13	NC_020296	ACA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816546
14	NC_020296	TTAA	2	8	1416	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	451816546
15	NC_020296	TCA	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816546
16	NC_020296	CTA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816547
17	NC_020296	ATG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816547
18	NC_020296	CGC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816547
19	NC_020296	ATA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816547
20	NC_020296	CCT	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816548
21	NC_020296	GCC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
22	NC_020296	TGT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
23	NC_020296	CAGT	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
24	NC_020296	GGC	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
25	NC_020296	CGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
26	NC_020296	AAC	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
27	NC_020296	GGA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816548
28	NC_020296	TAC	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
29	NC_020296	TAGAGC	2	12	3060	3071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816548
30	NC_020296	CAC	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
31	NC_020296	GAT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
32	NC_020296	CCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	0 %	75 %	451816548
33	NC_020296	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
34	NC_020296	CTT	2	6	3291	3296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816548
35	NC_020296	T	6	6	3316	3321	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
36	NC_020296	TGCC	2	8	3360	3367	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
37	NC_020296	TAC	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
38	NC_020296	ACA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
39	NC_020296	AGA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
40	NC_020296	GTTT	2	8	3477	3484	0 %	75 %	25 %	0 %	451816548
41	NC_020296	GAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
42	NC_020296	CGG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
43	NC_020296	GGAG	2	8	3877	3884	25 %	0 %	75 %	0 %	451816548
44	NC_020296	ATG	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
45	NC_020296	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
46	NC_020296	AGG	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816548
47	NC_020296	ACA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
48	NC_020296	GCC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
49	NC_020296	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
50	NC_020296	AG	3	6	4236	4241	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
51	NC_020296	TTA	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
52	NC_020296	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
53	NC_020296	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
54	NC_020296	ACG	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816548
55	NC_020296	AAT	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816548
56	NC_020296	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816548
57	NC_020296	GTT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
58	NC_020296	CAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
59	NC_020296	TGG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
60	NC_020296	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
61	NC_020296	TCAG	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
62	NC_020296	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816548
63	NC_020296	TTAAT	2	10	4914	4923	40 %	60 %	0 %	0 %	451816548
64	NC_020296	CTAA	2	8	4943	4950	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
65	NC_020296	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
66	NC_020296	CAAT	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
67	NC_020296	ACC	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
68	NC_020296	CTGG	2	8	5105	5112	0 %	25 %	50 %	25 %	451816548
69	NC_020296	TTA	2	6	5190	5195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
70	NC_020296	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
71	NC_020296	GAT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
72	NC_020296	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
73	NC_020296	TCCG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
74	NC_020296	ATG	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
75	NC_020296	GGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
76	NC_020296	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
77	NC_020296	ATC	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
78	NC_020296	AGGA	2	8	5796	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
79	NC_020296	CGG	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
80	NC_020296	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
81	NC_020296	CCG	3	9	5934	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
82	NC_020296	AT	3	6	6099	6104	50 %	50 %	0 %	0 %	451816548
83	NC_020296	TAAC	2	8	6123	6130	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
84	NC_020296	GAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
85	NC_020296	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
86	NC_020296	TGA	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
87	NC_020296	CAT	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
88	NC_020296	TGT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
89	NC_020296	CCG	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
90	NC_020296	AGA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
91	NC_020296	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
92	NC_020296	ACA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
93	NC_020296	C	6	6	6461	6466	0 %	0 %	0 %	100 %	451816548
94	NC_020296	TC	3	6	6474	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	451816548
95	NC_020296	AACTTT	2	12	6494	6505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816548
96	NC_020296	AGA	2	6	6649	6654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
97	NC_020296	TGT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
98	NC_020296	CAC	2	6	6772	6777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
99	NC_020296	AAG	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
100	NC_020296	TGG	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
101	NC_020296	TGT	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
102	NC_020296	GA	3	6	7024	7029	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
103	NC_020296	GAA	2	6	7049	7054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
104	NC_020296	TAC	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
105	NC_020296	CCCAA	2	10	7129	7138	40 %	0 %	0 %	60 %	451816548
106	NC_020296	AAC	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
107	NC_020296	AAG	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
108	NC_020296	TGA	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
109	NC_020296	TCAG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
110	NC_020296	TGG	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
111	NC_020296	C	7	7	7516	7522	0 %	0 %	0 %	100 %	451816548
112	NC_020296	GCAGTA	2	12	7557	7568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816548
113	NC_020296	AAG	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
114	NC_020296	GTG	2	6	7632	7637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
115	NC_020296	ATT	2	6	7640	7645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
116	NC_020296	CGC	2	6	7678	7683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
117	NC_020296	CCG	2	6	7779	7784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
118	NC_020296	TAA	2	6	7789	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816548
119	NC_020296	A	6	6	7825	7830	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
120	NC_020296	TGA	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
121	NC_020296	CAG	2	6	7842	7847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816548
122	NC_020296	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
123	NC_020296	CGGATG	2	12	7950	7961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451816548
124	NC_020296	A	6	6	7964	7969	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
125	NC_020296	TCA	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
126	NC_020296	AC	3	6	8011	8016	50 %	0 %	0 %	50 %	451816548
127	NC_020296	CT	3	6	8029	8034	0 %	50 %	0 %	50 %	451816548
128	NC_020296	GTG	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
129	NC_020296	GGC	2	6	8095	8100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
130	NC_020296	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
131	NC_020296	T	6	6	8212	8217	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
132	NC_020296	TAA	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816548
133	NC_020296	AAGT	2	8	8287	8294	50 %	25 %	25 %	0 %	451816548
134	NC_020296	CAAT	2	8	8317	8324	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
135	NC_020296	GTCC	2	8	8357	8364	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
136	NC_020296	TTG	2	6	8409	8414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
137	NC_020296	CCG	2	6	8490	8495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
138	NC_020296	TGG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
139	NC_020296	ATG	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
140	NC_020296	AAC	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
141	NC_020296	TGA	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
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144	NC_020296	GAT	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
145	NC_020296	GTTTT	2	10	9099	9108	0 %	80 %	20 %	0 %	451816548
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149	NC_020296	TAT	2	6	9295	9300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
150	NC_020296	GAAG	2	8	9314	9321	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
151	NC_020296	CGT	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816548
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154	NC_020296	TAA	2	6	9556	9561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816548
155	NC_020296	TGA	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
156	NC_020296	TAT	2	6	9580	9585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
157	NC_020296	AAG	2	6	9609	9614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
158	NC_020296	TGG	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
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167	NC_020296	TGGA	2	8	9951	9958	25 %	25 %	50 %	0 %	451816548
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244	NC_020296	GTAT	2	8	13686	13693	25 %	50 %	25 %	0 %	451816548
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257	NC_020296	GCG	2	6	15267	15272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816550
258	NC_020296	CCG	2	6	15275	15280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816550
259	NC_020296	TTG	2	6	15363	15368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816550
260	NC_020296	TTC	2	6	15383	15388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816550
261	NC_020296	AAT	2	6	15710	15715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816551
262	NC_020296	TCA	2	6	16039	16044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816552
263	NC_020296	TCAA	2	8	16069	16076	50 %	25 %	0 %	25 %	451816552
264	NC_020296	TTG	2	6	16159	16164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816552
265	NC_020296	TGG	2	6	16180	16185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816552
266	NC_020296	ATT	2	6	16190	16195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816552
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392	NC_020296	ATT	2	6	23422	23427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816560
393	NC_020296	GAA	2	6	23456	23461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816560
394	NC_020296	AGA	2	6	23503	23508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816560
395	NC_020296	CGT	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816560
396	NC_020296	CTAT	2	8	23556	23563	25 %	50 %	0 %	25 %	451816560
397	NC_020296	GAA	2	6	23661	23666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816561
398	NC_020296	CAA	2	6	23710	23715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816561
399	NC_020296	CTG	2	6	23725	23730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816561
400	NC_020296	GA	3	6	23780	23785	50 %	0 %	50 %	0 %	451816561
401	NC_020296	TGT	2	6	23834	23839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816561
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422	NC_020296	GCC	2	6	25245	25250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816565
423	NC_020296	AAC	2	6	25251	25256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816565
424	NC_020296	A	6	6	25282	25287	100 %	0 %	0 %	0 %	451816565
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432	NC_020296	CAAT	2	8	25661	25668	50 %	25 %	0 %	25 %	451816565
433	NC_020296	CGT	2	6	25671	25676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816565
434	NC_020296	CCCAT	2	10	25793	25802	20 %	20 %	0 %	60 %	451816565
435	NC_020296	TAC	2	6	25871	25876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816565
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495	NC_020296	CTG	2	6	29346	29351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816569
496	NC_020296	CAA	2	6	29463	29468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816569
497	NC_020296	TCC	2	6	29477	29482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816569
498	NC_020296	A	6	6	29503	29508	100 %	0 %	0 %	0 %	451816569
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