MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw7 genomic sequence

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020269	ACT	2	6	26	31	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338650
2	NC_020269	TTG	2	6	38	43	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338650
3	NC_020269	AGA	3	9	63	71	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338650
4	NC_020269	AAT	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338650
5	NC_020269	T	6	6	386	391	0 %	100 %	0 %	0 %	449338651
6	NC_020269	A	6	6	393	398	100 %	0 %	0 %	0 %	449338651
7	NC_020269	AAAGA	2	10	401	410	80 %	0 %	20 %	0 %	449338651
8	NC_020269	T	6	6	416	421	0 %	100 %	0 %	0 %	449338651
9	NC_020269	CAAA	2	8	424	431	75 %	0 %	0 %	25 %	449338651
10	NC_020269	AGA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
11	NC_020269	TCGG	2	8	459	466	0 %	25 %	50 %	25 %	449338651
12	NC_020269	GCA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338651
13	NC_020269	AAG	2	6	559	564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
14	NC_020269	CAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
15	NC_020269	CAC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
16	NC_020269	AGA	2	6	614	619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
17	NC_020269	CAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
18	NC_020269	CAA	2	6	637	642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
19	NC_020269	CAC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
20	NC_020269	A	6	6	655	660	100 %	0 %	0 %	0 %	449338651
21	NC_020269	AGA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
22	NC_020269	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
23	NC_020269	CAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
24	NC_020269	CAC	2	6	706	711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
25	NC_020269	A	6	6	712	717	100 %	0 %	0 %	0 %	449338651
26	NC_020269	AGA	2	6	728	733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
27	NC_020269	CAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
28	NC_020269	CAA	2	6	751	756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
29	NC_020269	CAC	2	6	763	768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
30	NC_020269	AGA	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
31	NC_020269	AAC	2	6	791	796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
32	NC_020269	CAA	2	6	808	813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
33	NC_020269	CAC	2	6	820	825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
34	NC_020269	AGA	2	6	842	847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
35	NC_020269	CAA	2	6	850	855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
36	NC_020269	CAA	2	6	865	870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
37	NC_020269	CAC	2	6	877	882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
38	NC_020269	A	6	6	883	888	100 %	0 %	0 %	0 %	449338651
39	NC_020269	AGA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
40	NC_020269	CAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
41	NC_020269	CAA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
42	NC_020269	CAC	2	6	934	939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
43	NC_020269	AGA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
44	NC_020269	CAA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
45	NC_020269	CAA	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
46	NC_020269	AGA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
47	NC_020269	CAA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
48	NC_020269	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
49	NC_020269	T	6	6	1076	1081	0 %	100 %	0 %	0 %	449338651
50	NC_020269	ATC	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338651
51	NC_020269	AAGATA	2	12	1129	1140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449338651
52	NC_020269	CAC	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338651
53	NC_020269	GA	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	449338651
54	NC_020269	ATG	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
55	NC_020269	TAC	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338651
56	NC_020269	ATG	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
57	NC_020269	GAT	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
58	NC_020269	TGA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
59	NC_020269	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338651
60	NC_020269	ATTA	2	8	1562	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	449338651
61	NC_020269	A	6	6	1587	1592	100 %	0 %	0 %	0 %	449338651
62	NC_020269	GAA	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
63	NC_020269	GTTA	2	8	1665	1672	25 %	50 %	25 %	0 %	449338651
64	NC_020269	TTG	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338651
65	NC_020269	AACA	2	8	1750	1757	75 %	0 %	0 %	25 %	449338651
66	NC_020269	ATG	3	9	1825	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
67	NC_020269	TAT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338651
68	NC_020269	TA	3	6	1891	1896	50 %	50 %	0 %	0 %	449338651
69	NC_020269	ATA	2	6	1927	1932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338651
70	NC_020269	ATT	2	6	1990	1995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338651
71	NC_020269	TAA	2	6	1997	2002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338651
72	NC_020269	ATC	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338651
73	NC_020269	ACA	2	6	2096	2101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
74	NC_020269	ACA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338651
75	NC_020269	TAA	2	6	2123	2128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338651
76	NC_020269	TAT	2	6	2162	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338651
77	NC_020269	A	6	6	2212	2217	100 %	0 %	0 %	0 %	449338651
78	NC_020269	GAAAAA	2	12	2280	2291	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	449338651
79	NC_020269	ATG	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
80	NC_020269	AAT	2	6	2460	2465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338651
81	NC_020269	TAA	2	6	2486	2491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338651
82	NC_020269	GAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
83	NC_020269	TATG	2	8	2574	2581	25 %	50 %	25 %	0 %	449338651
84	NC_020269	GAA	3	9	2613	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
85	NC_020269	AGTAAC	2	12	2636	2647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	449338651
86	NC_020269	TGA	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
87	NC_020269	AGT	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
88	NC_020269	CTA	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338651
89	NC_020269	CTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338651
90	NC_020269	GAA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338651
91	NC_020269	ATG	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338651
92	NC_020269	GACGCT	2	12	2889	2900	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449338651
93	NC_020269	GCTGAT	2	12	2910	2921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449338651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.