MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw3 genomic sequence

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020265	TA	5	10	13	22	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
2	NC_020265	TAAA	2	8	33	40	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
3	NC_020265	TA	5	10	49	58	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
4	NC_020265	TAAA	2	8	69	76	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
5	NC_020265	TA	5	10	85	94	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
6	NC_020265	TAAA	2	8	105	112	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
7	NC_020265	TA	5	10	121	130	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
8	NC_020265	TAAA	2	8	141	148	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
9	NC_020265	TA	5	10	157	166	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
10	NC_020265	TAAA	2	8	177	184	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
11	NC_020265	TA	5	10	193	202	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
12	NC_020265	TAAA	2	8	213	220	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
13	NC_020265	TA	5	10	229	238	50 %	50 %	0 %	0 %	449338586
14	NC_020265	TAAA	2	8	249	256	75 %	25 %	0 %	0 %	449338586
15	NC_020265	AGA	2	6	920	925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
16	NC_020265	CAAAAA	2	12	938	949	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449338587
17	NC_020265	ATT	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338587
18	NC_020265	GAA	2	6	1066	1071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
19	NC_020265	ACG	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338587
20	NC_020265	A	6	6	1171	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	449338587
21	NC_020265	GAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
22	NC_020265	A	6	6	1183	1188	100 %	0 %	0 %	0 %	449338587
23	NC_020265	ATT	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338587
24	NC_020265	AAAAC	2	10	1313	1322	80 %	0 %	0 %	20 %	449338587
25	NC_020265	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
26	NC_020265	ACC	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338588
27	NC_020265	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338588
28	NC_020265	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338588
29	NC_020265	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338588
30	NC_020265	ATG	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338588
31	NC_020265	AAG	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338588
32	NC_020265	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	449338588
33	NC_020265	GAC	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338588
34	NC_020265	AGC	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338588
35	NC_020265	ATG	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338589
36	NC_020265	CAAG	2	8	2141	2148	50 %	0 %	25 %	25 %	449338589
37	NC_020265	AGA	3	9	2231	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
38	NC_020265	TTG	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338589
39	NC_020265	AG	3	6	2432	2437	50 %	0 %	50 %	0 %	449338589
40	NC_020265	AAG	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
41	NC_020265	AAG	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
42	NC_020265	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
43	NC_020265	TA	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	449338589
44	NC_020265	AGA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
45	NC_020265	CAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338589
46	NC_020265	AAG	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
47	NC_020265	AAG	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
48	NC_020265	TTA	2	6	2778	2783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338589
49	NC_020265	AT	3	6	2795	2800	50 %	50 %	0 %	0 %	449338589
50	NC_020265	GAG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338589
51	NC_020265	AGG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338589
52	NC_020265	ATG	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338589
53	NC_020265	A	6	6	2929	2934	100 %	0 %	0 %	0 %	449338589

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.