MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 39984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020247	CCA	2	6	261374	261379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068623
5002	NC_020247	CT	3	6	261401	261406	0 %	50 %	0 %	50 %	449068623
5003	NC_020247	CTT	2	6	261494	261499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068623
5004	NC_020247	TTC	2	6	261506	261511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068623
5005	NC_020247	GTT	2	6	261636	261641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068623
5006	NC_020247	GTA	2	6	261813	261818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068623
5007	NC_020247	GTAT	2	8	261832	261839	25 %	50 %	25 %	0 %	449068623
5008	NC_020247	TCT	2	6	261846	261851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068623
5009	NC_020247	TCA	2	6	261906	261911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068623
5010	NC_020247	CTTC	2	8	261924	261931	0 %	50 %	0 %	50 %	449068623
5011	NC_020247	CAT	2	6	261932	261937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068623
5012	NC_020247	CTA	2	6	262027	262032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068623
5013	NC_020247	ACA	2	6	262065	262070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068623
5014	NC_020247	CAT	2	6	262084	262089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068623
5015	NC_020247	ACA	2	6	262143	262148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068623
5016	NC_020247	GCT	2	6	262161	262166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068623
5017	NC_020247	GGTA	2	8	262197	262204	25 %	25 %	50 %	0 %	449068623
5018	NC_020247	CTT	2	6	262223	262228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068623
5019	NC_020247	CTT	2	6	262270	262275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068623
5020	NC_020247	CTT	2	6	262306	262311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068623
5021	NC_020247	TTCT	2	8	262365	262372	0 %	75 %	0 %	25 %	449068623
5022	NC_020247	TCTA	2	8	262388	262395	25 %	50 %	0 %	25 %	449068623
5023	NC_020247	GGA	2	6	262446	262451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068623
5024	NC_020247	CTA	2	6	262573	262578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068623
5025	NC_020247	TAT	2	6	262601	262606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068623
5026	NC_020247	T	6	6	262606	262611	0 %	100 %	0 %	0 %	449068623
5027	NC_020247	TTA	2	6	262773	262778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068624
5028	NC_020247	AT	3	6	262787	262792	50 %	50 %	0 %	0 %	449068624
5029	NC_020247	AAG	2	6	262944	262949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068624
5030	NC_020247	GTA	2	6	263033	263038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068624
5031	NC_020247	CAG	2	6	263058	263063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068624
5032	NC_020247	TTA	2	6	263086	263091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068624
5033	NC_020247	TAT	2	6	263172	263177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068624
5034	NC_020247	CTC	2	6	263306	263311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068624
5035	NC_020247	AGG	3	9	263597	263605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068625
5036	NC_020247	AGT	2	6	263620	263625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068625
5037	NC_020247	AG	3	6	263639	263644	50 %	0 %	50 %	0 %	449068625
5038	NC_020247	CGA	2	6	263662	263667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068625
5039	NC_020247	AAGGG	2	10	263723	263732	40 %	0 %	60 %	0 %	449068625
5040	NC_020247	TAG	2	6	263790	263795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068625
5041	NC_020247	GTA	2	6	263823	263828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068626
5042	NC_020247	A	6	6	263999	264004	100 %	0 %	0 %	0 %	449068626
5043	NC_020247	CTA	2	6	264018	264023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068626
5044	NC_020247	GAG	2	6	264030	264035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068626
5045	NC_020247	TGT	2	6	264080	264085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068626
5046	NC_020247	GAT	2	6	264105	264110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068626
5047	NC_020247	GTT	2	6	264144	264149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068626
5048	NC_020247	CA	3	6	264262	264267	50 %	0 %	0 %	50 %	449068626
5049	NC_020247	AAG	2	6	264281	264286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068626
5050	NC_020247	GA	3	6	264302	264307	50 %	0 %	50 %	0 %	449068626
5051	NC_020247	CAT	2	6	264316	264321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068626
5052	NC_020247	A	6	6	264366	264371	100 %	0 %	0 %	0 %	449068626
5053	NC_020247	AGT	2	6	264410	264415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068626
5054	NC_020247	AAC	2	6	264490	264495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068626
5055	NC_020247	A	6	6	264541	264546	100 %	0 %	0 %	0 %	449068626
5056	NC_020247	AAT	3	9	264648	264656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068626
5057	NC_020247	AGA	2	6	264813	264818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068627
5058	NC_020247	AGG	2	6	264858	264863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068627
5059	NC_020247	TAT	2	6	264911	264916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068627
5060	NC_020247	ATA	2	6	264997	265002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068627
5061	NC_020247	AGG	2	6	265089	265094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068627
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5063	NC_020247	ACA	2	6	265143	265148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068627
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5065	NC_020247	AAT	2	6	265278	265283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068627
5066	NC_020247	GAA	2	6	265351	265356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068627
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5068	NC_020247	GA	3	6	265593	265598	50 %	0 %	50 %	0 %	449068628
5069	NC_020247	GTA	2	6	265669	265674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068628
5070	NC_020247	TTATTG	2	12	265700	265711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449068628
5071	NC_020247	CTT	2	6	265737	265742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068628
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5073	NC_020247	TAA	2	6	265800	265805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068628
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5088	NC_020247	G	6	6	266641	266646	0 %	0 %	100 %	0 %	449068629
5089	NC_020247	TGA	2	6	266657	266662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068629
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5092	NC_020247	TAC	2	6	266816	266821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068630
5093	NC_020247	ACC	2	6	266960	266965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068630
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5095	NC_020247	GAG	2	6	267014	267019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068630
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5100	NC_020247	GAA	2	6	267304	267309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068631
5101	NC_020247	TA	3	6	267378	267383	50 %	50 %	0 %	0 %	449068631
5102	NC_020247	CAA	2	6	267394	267399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068631
5103	NC_020247	TCT	2	6	267415	267420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068631
5104	NC_020247	TGA	2	6	267486	267491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068631
5105	NC_020247	AG	3	6	267493	267498	50 %	0 %	50 %	0 %	449068631
5106	NC_020247	ATA	2	6	267520	267525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068631
5107	NC_020247	GAG	2	6	267526	267531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068631
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5111	NC_020247	CCA	2	6	267900	267905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449068632
5112	NC_020247	AGG	2	6	267922	267927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068632
5113	NC_020247	TGA	2	6	268028	268033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068632
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5117	NC_020247	AG	3	6	268227	268232	50 %	0 %	50 %	0 %	449068632
5118	NC_020247	AAG	2	6	268235	268240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068632
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5120	NC_020247	GAG	2	6	268284	268289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068632
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5122	NC_020247	CAA	2	6	268432	268437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068632
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5242	NC_020247	CCCA	2	8	274273	274280	25 %	0 %	0 %	75 %	449068637
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5253	NC_020247	AGTTT	2	10	275410	275419	20 %	60 %	20 %	0 %	449068638
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5363	NC_020247	TCT	2	6	281575	281580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068645
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5368	NC_020247	CAA	2	6	281756	281761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068645
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5373	NC_020247	CA	3	6	282168	282173	50 %	0 %	0 %	50 %	449068646
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5491	NC_020247	T	6	6	288134	288139	0 %	100 %	0 %	0 %	449068653
5492	NC_020247	CTT	2	6	288140	288145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068653
5493	NC_020247	TTC	2	6	288146	288151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068653
5494	NC_020247	T	6	6	288157	288162	0 %	100 %	0 %	0 %	449068653
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