MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.04

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020052	TGT	2	6	1187	1192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736069
2	NC_020052	T	6	6	1192	1197	0 %	100 %	0 %	0 %	436736069
3	NC_020052	TTA	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736069
4	NC_020052	A	6	6	1278	1283	100 %	0 %	0 %	0 %	436736069
5	NC_020052	TA	3	6	1330	1335	50 %	50 %	0 %	0 %	436736069
6	NC_020052	A	6	6	1335	1340	100 %	0 %	0 %	0 %	436736069
7	NC_020052	A	7	7	1365	1371	100 %	0 %	0 %	0 %	436736069
8	NC_020052	ATTT	2	8	1481	1488	25 %	75 %	0 %	0 %	436736070
9	NC_020052	T	6	6	1486	1491	0 %	100 %	0 %	0 %	436736070
10	NC_020052	TTC	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736070
11	NC_020052	CTAT	2	8	1604	1611	25 %	50 %	0 %	25 %	436736070
12	NC_020052	AAT	2	6	1653	1658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736070
13	NC_020052	GAT	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736070
14	NC_020052	GA	3	6	1755	1760	50 %	0 %	50 %	0 %	436736070
15	NC_020052	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736071
16	NC_020052	AACT	2	8	1952	1959	50 %	25 %	0 %	25 %	436736071
17	NC_020052	TCT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736071
18	NC_020052	CTA	3	9	2093	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736071
19	NC_020052	TCA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736071
20	NC_020052	TTAC	2	8	2123	2130	25 %	50 %	0 %	25 %	436736071
21	NC_020052	TA	3	6	2249	2254	50 %	50 %	0 %	0 %	436736072
22	NC_020052	A	7	7	2272	2278	100 %	0 %	0 %	0 %	436736072
23	NC_020052	A	7	7	2307	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	436736072
24	NC_020052	AAC	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736072
25	NC_020052	AAT	2	6	2338	2343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736072
26	NC_020052	TAA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736072
27	NC_020052	ACT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736073
28	NC_020052	GTT	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736073
29	NC_020052	TAG	2	6	2588	2593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736073
30	NC_020052	A	6	6	2602	2607	100 %	0 %	0 %	0 %	436736073
31	NC_020052	CAA	3	9	2618	2626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736073
32	NC_020052	AGT	2	6	2631	2636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736073
33	NC_020052	CAAT	2	8	2664	2671	50 %	25 %	0 %	25 %	436736073
34	NC_020052	ATT	2	6	2888	2893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736073
35	NC_020052	TAAT	2	8	3092	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	436736074
36	NC_020052	A	6	6	3177	3182	100 %	0 %	0 %	0 %	436736074
37	NC_020052	TAA	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736074
38	NC_020052	AGA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736074
39	NC_020052	A	7	7	3261	3267	100 %	0 %	0 %	0 %	436736074
40	NC_020052	CTAA	2	8	3271	3278	50 %	25 %	0 %	25 %	436736074
41	NC_020052	TGC	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736074
42	NC_020052	CAT	2	6	3450	3455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736074
43	NC_020052	AAC	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736074
44	NC_020052	ATA	2	6	3620	3625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736074
45	NC_020052	AAAGGT	2	12	3628	3639	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436736074
46	NC_020052	GAA	2	6	3649	3654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736074
47	NC_020052	A	7	7	3985	3991	100 %	0 %	0 %	0 %	436736075
48	NC_020052	CAAC	2	8	3998	4005	50 %	0 %	0 %	50 %	436736075
49	NC_020052	ACT	2	6	4085	4090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736075
50	NC_020052	TACT	2	8	4132	4139	25 %	50 %	0 %	25 %	436736075
51	NC_020052	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736075
52	NC_020052	TAA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736075
53	NC_020052	T	7	7	4187	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	436736075
54	NC_020052	ATC	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736075
55	NC_020052	ATG	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736075
56	NC_020052	TTA	2	6	4308	4313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736075
57	NC_020052	TCA	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736075
58	NC_020052	GTA	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736075
59	NC_020052	GAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736075
60	NC_020052	ATTG	2	8	4661	4668	25 %	50 %	25 %	0 %	436736075
61	NC_020052	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736076
62	NC_020052	ACTT	2	8	4788	4795	25 %	50 %	0 %	25 %	436736076
63	NC_020052	ATT	2	6	4804	4809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736076
64	NC_020052	GAA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736076
65	NC_020052	TTA	2	6	4906	4911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736076
66	NC_020052	AAT	2	6	4951	4956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736076
67	NC_020052	TGA	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736076
68	NC_020052	A	7	7	5034	5040	100 %	0 %	0 %	0 %	436736076
69	NC_020052	T	6	6	5058	5063	0 %	100 %	0 %	0 %	436736076
70	NC_020052	CAAAA	2	10	5093	5102	80 %	0 %	0 %	20 %	436736076
71	NC_020052	A	6	6	5108	5113	100 %	0 %	0 %	0 %	436736076
72	NC_020052	GTAC	2	8	5119	5126	25 %	25 %	25 %	25 %	436736076
73	NC_020052	ATT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736076
74	NC_020052	AATT	2	8	5186	5193	50 %	50 %	0 %	0 %	436736076
75	NC_020052	TAA	2	6	5265	5270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736076
76	NC_020052	AGA	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736076
77	NC_020052	GATG	2	8	5362	5369	25 %	25 %	50 %	0 %	436736076
78	NC_020052	CAAG	2	8	5383	5390	50 %	0 %	25 %	25 %	436736077
79	NC_020052	ATCA	2	8	5511	5518	50 %	25 %	0 %	25 %	436736077
80	NC_020052	GATG	2	8	5524	5531	25 %	25 %	50 %	0 %	436736077
81	NC_020052	AT	3	6	5620	5625	50 %	50 %	0 %	0 %	436736077
82	NC_020052	CTA	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736077
83	NC_020052	GAAA	2	8	5753	5760	75 %	0 %	25 %	0 %	436736077
84	NC_020052	GCA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736077
85	NC_020052	CAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736077
86	NC_020052	CGA	2	6	5869	5874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736077
87	NC_020052	ATT	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736077
88	NC_020052	T	6	6	6041	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	436736077
89	NC_020052	GTA	2	6	6114	6119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736077
90	NC_020052	GATT	2	8	6273	6280	25 %	50 %	25 %	0 %	436736077
91	NC_020052	CAG	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736077
92	NC_020052	CAT	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736077
93	NC_020052	CAA	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736077
94	NC_020052	TTA	2	6	6630	6635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736077
95	NC_020052	AAG	2	6	6885	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736077
96	NC_020052	AT	3	6	6931	6936	50 %	50 %	0 %	0 %	436736077
97	NC_020052	A	6	6	6998	7003	100 %	0 %	0 %	0 %	436736077
98	NC_020052	ATT	2	6	7020	7025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736077
99	NC_020052	TA	3	6	7080	7085	50 %	50 %	0 %	0 %	436736077
100	NC_020052	AGC	3	9	7090	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736077
101	NC_020052	TAG	2	6	7104	7109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736077
102	NC_020052	GAAT	2	8	7119	7126	50 %	25 %	25 %	0 %	436736077
103	NC_020052	AGCT	2	8	7141	7148	25 %	25 %	25 %	25 %	436736077
104	NC_020052	ATA	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736077
105	NC_020052	A	7	7	7190	7196	100 %	0 %	0 %	0 %	436736077
106	NC_020052	ACT	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736077
107	NC_020052	TAA	2	6	7207	7212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736077
108	NC_020052	A	7	7	7225	7231	100 %	0 %	0 %	0 %	436736077
109	NC_020052	TGA	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736077
110	NC_020052	ACC	2	6	7311	7316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736078
111	NC_020052	T	6	6	7329	7334	0 %	100 %	0 %	0 %	436736078
112	NC_020052	AGATT	2	10	7457	7466	40 %	40 %	20 %	0 %	436736078
113	NC_020052	TGA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736078
114	NC_020052	TA	3	6	7514	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	436736078
115	NC_020052	TTA	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736078
116	NC_020052	TA	3	6	7558	7563	50 %	50 %	0 %	0 %	436736078
117	NC_020052	AAAT	2	8	7605	7612	75 %	25 %	0 %	0 %	436736078
118	NC_020052	TTA	2	6	7665	7670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736078
119	NC_020052	T	6	6	7703	7708	0 %	100 %	0 %	0 %	436736078
120	NC_020052	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736078
121	NC_020052	ATATT	2	10	7731	7740	40 %	60 %	0 %	0 %	436736078
122	NC_020052	TAA	2	6	7770	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736078
123	NC_020052	A	7	7	7793	7799	100 %	0 %	0 %	0 %	436736078
124	NC_020052	GA	3	6	7839	7844	50 %	0 %	50 %	0 %	436736078
125	NC_020052	AT	3	6	7848	7853	50 %	50 %	0 %	0 %	436736078
126	NC_020052	T	9	9	7861	7869	0 %	100 %	0 %	0 %	436736078
127	NC_020052	TTA	2	6	7879	7884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736078
128	NC_020052	TCTAAA	2	12	7894	7905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436736078
129	NC_020052	A	7	7	7917	7923	100 %	0 %	0 %	0 %	436736078
130	NC_020052	ATT	2	6	7934	7939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736078
131	NC_020052	AAT	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736078
132	NC_020052	A	6	6	8041	8046	100 %	0 %	0 %	0 %	436736078
133	NC_020052	AAGTTA	2	12	8406	8417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436736079
134	NC_020052	ATT	2	6	8438	8443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736079
135	NC_020052	GAACAA	2	12	8483	8494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	436736079
136	NC_020052	T	6	6	8506	8511	0 %	100 %	0 %	0 %	436736079
137	NC_020052	TAA	2	6	8584	8589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736079
138	NC_020052	A	8	8	8811	8818	100 %	0 %	0 %	0 %	436736079
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182	NC_020052	A	6	6	11830	11835	100 %	0 %	0 %	0 %	436736080
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.