MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 3174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019846	CTCGGC	2	12	26688	26699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615137
502	NC_019846	CGG	2	6	26701	26706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
503	NC_019846	CCCT	2	8	26735	26742	0 %	25 %	0 %	75 %	433615137
504	NC_019846	GTG	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615137
505	NC_019846	GAT	2	6	27026	27031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
506	NC_019846	GAT	2	6	27060	27065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
507	NC_019846	AC	3	6	27084	27089	50 %	0 %	0 %	50 %	433615137
508	NC_019846	CG	3	6	27121	27126	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
509	NC_019846	GCA	2	6	27168	27173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615137
510	NC_019846	CGG	2	6	27176	27181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
511	NC_019846	TGA	2	6	27209	27214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
512	NC_019846	GCC	2	6	27221	27226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615137
513	NC_019846	AAT	2	6	27266	27271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433615137
514	NC_019846	GCG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
515	NC_019846	TCG	2	6	27314	27319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615137
516	NC_019846	CAG	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615137
517	NC_019846	GATAC	2	10	27428	27437	40 %	20 %	20 %	20 %	433615137
518	NC_019846	CG	3	6	27442	27447	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
519	NC_019846	GGC	2	6	27596	27601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
520	NC_019846	GCC	2	6	27608	27613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615137
521	NC_019846	CTC	2	6	27678	27683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615137
522	NC_019846	CATT	2	8	27713	27720	25 %	50 %	0 %	25 %	433615137
523	NC_019846	GCT	2	6	27759	27764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615137
524	NC_019846	CTT	2	6	27849	27854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615137
525	NC_019846	GC	4	8	27855	27862	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
526	NC_019846	GCAA	2	8	27880	27887	50 %	0 %	25 %	25 %	433615137
527	NC_019846	GCG	2	6	27924	27929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
528	NC_019846	TGA	2	6	27942	27947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
529	NC_019846	GC	3	6	27952	27957	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
530	NC_019846	ATC	3	9	27962	27970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615138
531	NC_019846	TCT	2	6	28002	28007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615138
532	NC_019846	AGC	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615138
533	NC_019846	GC	3	6	28039	28044	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
534	NC_019846	GC	3	6	28067	28072	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
535	NC_019846	GC	4	8	28083	28090	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
536	NC_019846	GGT	2	6	28103	28108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615138
537	NC_019846	GGC	2	6	28136	28141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
538	NC_019846	GGC	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
539	NC_019846	CGG	2	6	28195	28200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
540	NC_019846	TGC	3	9	28251	28259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615138
541	NC_019846	TGA	2	6	28296	28301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615138
542	NC_019846	GCC	2	6	28311	28316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615138
543	NC_019846	GCT	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615138
544	NC_019846	TCG	2	6	28344	28349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615138
545	NC_019846	CGA	2	6	28360	28365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615138
546	NC_019846	CGGT	2	8	28455	28462	0 %	25 %	50 %	25 %	433615138
547	NC_019846	TGT	2	6	28483	28488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615138
548	NC_019846	GGC	2	6	28501	28506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
549	NC_019846	CG	3	6	28566	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	433615139
550	NC_019846	CGG	2	6	28599	28604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615139
551	NC_019846	CTG	2	6	28605	28610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615139
552	NC_019846	TTC	2	6	28672	28677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615139
553	NC_019846	CGG	2	6	28690	28695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615139
554	NC_019846	GC	3	6	28864	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	433615139
555	NC_019846	GCC	2	6	28882	28887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615139
556	NC_019846	CTT	2	6	28922	28927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615139
557	NC_019846	GCG	2	6	28933	28938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615139
558	NC_019846	GAG	2	6	28947	28952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615139
559	NC_019846	GAG	2	6	28956	28961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615139
560	NC_019846	GGA	2	6	28982	28987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615139
561	NC_019846	CAG	2	6	29019	29024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615140
562	NC_019846	GCT	2	6	29062	29067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615140
563	NC_019846	GCT	2	6	29365	29370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615140
564	NC_019846	GCG	2	6	29453	29458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615140
565	NC_019846	CG	3	6	29467	29472	0 %	0 %	50 %	50 %	433615140
566	NC_019846	CGC	2	6	29487	29492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615140
567	NC_019846	GCG	2	6	29613	29618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615141
568	NC_019846	GGC	2	6	29639	29644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615141
569	NC_019846	GCC	2	6	29750	29755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615141
570	NC_019846	CCA	2	6	29762	29767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615141
571	NC_019846	ACG	2	6	29820	29825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615141
572	NC_019846	TCG	2	6	29829	29834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615141
573	NC_019846	GCAGC	2	10	29884	29893	20 %	0 %	40 %	40 %	433615141
574	NC_019846	GCC	3	9	30072	30080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615141
575	NC_019846	CCG	2	6	30178	30183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615141
576	NC_019846	AT	3	6	30196	30201	50 %	50 %	0 %	0 %	433615141
577	NC_019846	AGG	2	6	30216	30221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615141
578	NC_019846	GAT	2	6	30235	30240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615141
579	NC_019846	CGA	2	6	30244	30249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615141
580	NC_019846	TGC	2	6	30282	30287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615141
581	NC_019846	CGG	2	6	30354	30359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615141
582	NC_019846	GCA	2	6	30373	30378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615141
583	NC_019846	GCC	2	6	30550	30555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615142
584	NC_019846	GCT	2	6	30657	30662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615142
585	NC_019846	GCT	2	6	30672	30677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615142
586	NC_019846	AGC	2	6	30713	30718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615142
587	NC_019846	TGTCGG	2	12	30780	30791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433615142
588	NC_019846	AGA	2	6	30824	30829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615142
589	NC_019846	CTT	2	6	30845	30850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615142
590	NC_019846	TCG	2	6	30909	30914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615142
591	NC_019846	CGC	2	6	31044	31049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615142
592	NC_019846	CAC	2	6	31157	31162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615142
593	NC_019846	CACC	2	8	31201	31208	25 %	0 %	0 %	75 %	433615142
594	NC_019846	GAC	2	6	31728	31733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
595	NC_019846	GACC	2	8	31745	31752	25 %	0 %	25 %	50 %	433615143
596	NC_019846	CGT	2	6	31895	31900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
597	NC_019846	ACG	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
598	NC_019846	TCG	2	6	32020	32025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
599	NC_019846	TGC	2	6	32048	32053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
600	NC_019846	ACC	2	6	32073	32078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615143
601	NC_019846	GTT	2	6	32087	32092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615143
602	NC_019846	CGT	3	9	32144	32152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
603	NC_019846	GAC	2	6	32154	32159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
604	NC_019846	TG	3	6	32169	32174	0 %	50 %	50 %	0 %	433615143
605	NC_019846	CGG	2	6	32456	32461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615143
606	NC_019846	CCCA	2	8	32489	32496	25 %	0 %	0 %	75 %	433615143
607	NC_019846	TCA	2	6	32503	32508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615143
608	NC_019846	TTC	2	6	32514	32519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615143
609	NC_019846	CGAA	2	8	32645	32652	50 %	0 %	25 %	25 %	433615143
610	NC_019846	GATA	2	8	32684	32691	50 %	25 %	25 %	0 %	433615143
611	NC_019846	TCG	2	6	32713	32718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
612	NC_019846	GTC	3	9	32739	32747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
613	NC_019846	TCCA	2	8	32753	32760	25 %	25 %	0 %	50 %	433615143
614	NC_019846	CGA	2	6	32900	32905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
615	NC_019846	GGCC	2	8	32993	33000	0 %	0 %	50 %	50 %	433615143
616	NC_019846	ACG	2	6	33055	33060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
617	NC_019846	CGT	2	6	33068	33073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
618	NC_019846	TTG	2	6	33075	33080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615143
619	NC_019846	TG	3	6	33079	33084	0 %	50 %	50 %	0 %	433615143
620	NC_019846	TGGG	2	8	33248	33255	0 %	25 %	75 %	0 %	433615143
621	NC_019846	AAG	2	6	33267	33272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615143
622	NC_019846	AGCCA	2	10	33284	33293	40 %	0 %	20 %	40 %	433615143
623	NC_019846	GAG	2	6	33381	33386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615143
624	NC_019846	CGGC	2	8	33394	33401	0 %	0 %	50 %	50 %	433615143
625	NC_019846	CGA	2	6	33410	33415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
626	NC_019846	CGA	2	6	33419	33424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
627	NC_019846	TCA	2	6	33461	33466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615143
628	NC_019846	AGA	2	6	33487	33492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615143
629	NC_019846	TGT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615143
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631	NC_019846	AAGC	2	8	33579	33586	50 %	0 %	25 %	25 %	433615143
632	NC_019846	TGC	2	6	33640	33645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
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640	NC_019846	CAA	2	6	34019	34024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615143
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658	NC_019846	GAG	2	6	35510	35515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615144
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663	NC_019846	CCCTT	2	10	35812	35821	0 %	40 %	0 %	60 %	433615144
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748	NC_019846	GAT	2	6	41583	41588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615150
749	NC_019846	TCGA	2	8	41596	41603	25 %	25 %	25 %	25 %	433615150
750	NC_019846	CCGGC	2	10	41605	41614	0 %	0 %	40 %	60 %	433615150
751	NC_019846	TCGC	2	8	41657	41664	0 %	25 %	25 %	50 %	433615150
752	NC_019846	ATC	2	6	41686	41691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615150
753	NC_019846	GCC	2	6	41743	41748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615150
754	NC_019846	TCG	2	6	41750	41755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615150
755	NC_019846	GCC	2	6	41764	41769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615150
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757	NC_019846	ATC	2	6	41782	41787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615150
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877	NC_019846	GCC	3	9	46585	46593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615155
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999	NC_019846	GCA	2	6	52668	52673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615162
1000	NC_019846	CGC	2	6	52679	52684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615162

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