MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_019702	TCG	2	6	3238165	3238170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223136
47002	NC_019702	CAGTG	2	10	3238213	3238222	20 %	20 %	40 %	20 %	428223136
47003	NC_019702	AGT	2	6	3238237	3238242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223136
47004	NC_019702	AGC	2	6	3238321	3238326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223136
47005	NC_019702	ATT	2	6	3238398	3238403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223136
47006	NC_019702	ATGG	2	8	3238421	3238428	25 %	25 %	50 %	0 %	428223136
47007	NC_019702	GTC	2	6	3238458	3238463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223136
47008	NC_019702	TGTC	2	8	3238483	3238490	0 %	50 %	25 %	25 %	428223136
47009	NC_019702	CGGTGG	2	12	3238525	3238536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428223136
47010	NC_019702	TAC	2	6	3238591	3238596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223136
47011	NC_019702	CCAAA	2	10	3238620	3238629	60 %	0 %	0 %	40 %	428223136
47012	NC_019702	GCA	2	6	3238646	3238651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223136
47013	NC_019702	TA	3	6	3238689	3238694	50 %	50 %	0 %	0 %	428223136
47014	NC_019702	ATG	2	6	3238949	3238954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223136
47015	NC_019702	A	6	6	3239077	3239082	100 %	0 %	0 %	0 %	428223136
47016	NC_019702	AC	3	6	3239123	3239128	50 %	0 %	0 %	50 %	428223136
47017	NC_019702	TAAA	2	8	3239270	3239277	75 %	25 %	0 %	0 %	428223136
47018	NC_019702	TAG	2	6	3239493	3239498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223137
47019	NC_019702	CTA	2	6	3239790	3239795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223137
47020	NC_019702	GTC	2	6	3239814	3239819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223137
47021	NC_019702	GGTG	2	8	3239827	3239834	0 %	25 %	75 %	0 %	428223137
47022	NC_019702	TCC	2	6	3239841	3239846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223137
47023	NC_019702	CTG	2	6	3239853	3239858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223137
47024	NC_019702	CTG	2	6	3239942	3239947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223137
47025	NC_019702	AGATTT	2	12	3239950	3239961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428223137
47026	NC_019702	A	6	6	3239979	3239984	100 %	0 %	0 %	0 %	428223137
47027	NC_019702	ATG	2	6	3240002	3240007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223137
47028	NC_019702	TGG	2	6	3240015	3240020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223137
47029	NC_019702	AAAG	2	8	3240043	3240050	75 %	0 %	25 %	0 %	428223137
47030	NC_019702	TTA	2	6	3240060	3240065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223137
47031	NC_019702	AGC	2	6	3240192	3240197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223138
47032	NC_019702	AGC	2	6	3240266	3240271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223138
47033	NC_019702	TCCA	2	8	3240328	3240335	25 %	25 %	0 %	50 %	428223138
47034	NC_019702	ATT	2	6	3240355	3240360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223138
47035	NC_019702	AT	3	6	3240390	3240395	50 %	50 %	0 %	0 %	428223138
47036	NC_019702	TC	3	6	3240412	3240417	0 %	50 %	0 %	50 %	428223138
47037	NC_019702	T	6	6	3240420	3240425	0 %	100 %	0 %	0 %	428223138
47038	NC_019702	ATA	2	6	3240588	3240593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223139
47039	NC_019702	GAA	2	6	3240653	3240658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223139
47040	NC_019702	ATC	2	6	3240777	3240782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223139
47041	NC_019702	A	7	7	3240888	3240894	100 %	0 %	0 %	0 %	428223139
47042	NC_019702	TAG	2	6	3240900	3240905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223139
47043	NC_019702	T	6	6	3240912	3240917	0 %	100 %	0 %	0 %	428223139
47044	NC_019702	T	6	6	3240952	3240957	0 %	100 %	0 %	0 %	428223139
47045	NC_019702	A	6	6	3241071	3241076	100 %	0 %	0 %	0 %	428223139
47046	NC_019702	GCC	2	6	3241182	3241187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223139
47047	NC_019702	AGCC	2	8	3241217	3241224	25 %	0 %	25 %	50 %	428223139
47048	NC_019702	TTC	2	6	3241265	3241270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223139
47049	NC_019702	CCA	2	6	3241287	3241292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223139
47050	NC_019702	CTTAGA	2	12	3241417	3241428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428223139
47051	NC_019702	TGC	2	6	3241474	3241479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223139
47052	NC_019702	AT	3	6	3242162	3242167	50 %	50 %	0 %	0 %	428223140
47053	NC_019702	TTA	2	6	3242185	3242190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223140
47054	NC_019702	AG	3	6	3242214	3242219	50 %	0 %	50 %	0 %	428223140
47055	NC_019702	CTA	2	6	3242323	3242328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223140
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47057	NC_019702	C	6	6	3242409	3242414	0 %	0 %	0 %	100 %	428223140
47058	NC_019702	TACT	2	8	3242470	3242477	25 %	50 %	0 %	25 %	428223140
47059	NC_019702	AAGC	2	8	3242592	3242599	50 %	0 %	25 %	25 %	428223140
47060	NC_019702	AGC	2	6	3242660	3242665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223140
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47062	NC_019702	ATTT	2	8	3242773	3242780	25 %	75 %	0 %	0 %	428223140
47063	NC_019702	AGA	2	6	3242849	3242854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223140
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47067	NC_019702	TC	3	6	3243045	3243050	0 %	50 %	0 %	50 %	428223140
47068	NC_019702	AG	3	6	3243072	3243077	50 %	0 %	50 %	0 %	428223140
47069	NC_019702	T	6	6	3243128	3243133	0 %	100 %	0 %	0 %	428223140
47070	NC_019702	AAT	2	6	3243209	3243214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223140
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47072	NC_019702	CTGC	2	8	3243322	3243329	0 %	25 %	25 %	50 %	428223140
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47075	NC_019702	TGC	2	6	3243662	3243667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223140
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47078	NC_019702	TTA	2	6	3243780	3243785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223140
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47081	NC_019702	TGC	2	6	3244072	3244077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223140
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47084	NC_019702	GT	3	6	3244155	3244160	0 %	50 %	50 %	0 %	428223140
47085	NC_019702	AGC	2	6	3244238	3244243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223140
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47088	NC_019702	GAA	2	6	3244356	3244361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223140
47089	NC_019702	ATTC	2	8	3244382	3244389	25 %	50 %	0 %	25 %	428223140
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47092	NC_019702	AT	3	6	3244840	3244845	50 %	50 %	0 %	0 %	428223141
47093	NC_019702	ACT	2	6	3244869	3244874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223141
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47099	NC_019702	AAC	2	6	3245250	3245255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223141
47100	NC_019702	GCG	2	6	3245299	3245304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223141
47101	NC_019702	TTA	2	6	3245342	3245347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223141
47102	NC_019702	TAAA	2	8	3245406	3245413	75 %	25 %	0 %	0 %	428223141
47103	NC_019702	A	6	6	3245411	3245416	100 %	0 %	0 %	0 %	428223141
47104	NC_019702	ATG	2	6	3245453	3245458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223141
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47107	NC_019702	TGA	2	6	3245619	3245624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223142
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47109	NC_019702	TTG	2	6	3245764	3245769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223142
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47113	NC_019702	GAA	2	6	3246115	3246120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223142
47114	NC_019702	A	6	6	3246138	3246143	100 %	0 %	0 %	0 %	428223142
47115	NC_019702	ATT	2	6	3246157	3246162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223142
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47117	NC_019702	TTCT	2	8	3246250	3246257	0 %	75 %	0 %	25 %	428223142
47118	NC_019702	TGA	3	9	3246342	3246350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223142
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47236	NC_019702	GCT	2	6	3254055	3254060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223149
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47340	NC_019702	CTA	2	6	3261770	3261775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223156
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47344	NC_019702	TAC	2	6	3262027	3262032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223157
47345	NC_019702	TTAC	2	8	3262038	3262045	25 %	50 %	0 %	25 %	428223157
47346	NC_019702	TAT	2	6	3262054	3262059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223157
47347	NC_019702	TGCC	2	8	3262067	3262074	0 %	25 %	25 %	50 %	428223157
47348	NC_019702	TGG	2	6	3262198	3262203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223157
47349	NC_019702	CAA	2	6	3262216	3262221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223157
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