MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_019702	TC	3	6	2881210	2881215	0 %	50 %	0 %	50 %	428222828
42002	NC_019702	TAA	2	6	2881226	2881231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222828
42003	NC_019702	ATT	2	6	2881233	2881238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222828
42004	NC_019702	TAG	2	6	2881240	2881245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222828
42005	NC_019702	CTG	2	6	2881264	2881269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222828
42006	NC_019702	CTTT	2	8	2881288	2881295	0 %	75 %	0 %	25 %	428222828
42007	NC_019702	CTATTA	2	12	2881392	2881403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428222828
42008	NC_019702	AGT	2	6	2881485	2881490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222828
42009	NC_019702	T	6	6	2881501	2881506	0 %	100 %	0 %	0 %	428222828
42010	NC_019702	CTG	2	6	2881510	2881515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222828
42011	NC_019702	TAC	2	6	2881546	2881551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222828
42012	NC_019702	ATA	2	6	2881576	2881581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222828
42013	NC_019702	GGT	2	6	2881740	2881745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222828
42014	NC_019702	GCGGAT	2	12	2881766	2881777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428222828
42015	NC_019702	TGA	2	6	2881796	2881801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222828
42016	NC_019702	A	6	6	2881844	2881849	100 %	0 %	0 %	0 %	428222828
42017	NC_019702	CCT	2	6	2881943	2881948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222828
42018	NC_019702	ATT	2	6	2881953	2881958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222828
42019	NC_019702	TAA	2	6	2882108	2882113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222829
42020	NC_019702	CAG	2	6	2882273	2882278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222829
42021	NC_019702	CAG	2	6	2882309	2882314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222829
42022	NC_019702	ATT	2	6	2882341	2882346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222829
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42024	NC_019702	ATTT	2	8	2882452	2882459	25 %	75 %	0 %	0 %	428222829
42025	NC_019702	C	7	7	2882463	2882469	0 %	0 %	0 %	100 %	428222829
42026	NC_019702	ACCA	2	8	2882486	2882493	50 %	0 %	0 %	50 %	428222829
42027	NC_019702	C	6	6	2882510	2882515	0 %	0 %	0 %	100 %	428222829
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42030	NC_019702	T	6	6	2882641	2882646	0 %	100 %	0 %	0 %	428222829
42031	NC_019702	TGT	2	6	2882737	2882742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222830
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42033	NC_019702	TAA	2	6	2882870	2882875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222830
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42035	NC_019702	TAG	2	6	2883009	2883014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222830
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42042	NC_019702	TAA	2	6	2883230	2883235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222830
42043	NC_019702	TTG	2	6	2883285	2883290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222830
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42054	NC_019702	A	6	6	2883861	2883866	100 %	0 %	0 %	0 %	428222830
42055	NC_019702	AT	3	6	2883884	2883889	50 %	50 %	0 %	0 %	428222830
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42059	NC_019702	TTA	2	6	2884493	2884498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222831
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42062	NC_019702	CGAT	2	8	2884607	2884614	25 %	25 %	25 %	25 %	428222831
42063	NC_019702	TCA	2	6	2884620	2884625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222831
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42088	NC_019702	GGACTA	2	12	2886244	2886255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428222832
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42115	NC_019702	ACG	2	6	2887443	2887448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222832
42116	NC_019702	C	6	6	2887584	2887589	0 %	0 %	0 %	100 %	428222832
42117	NC_019702	TAA	2	6	2887590	2887595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222832
42118	NC_019702	GCT	2	6	2887633	2887638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222832
42119	NC_019702	ATC	2	6	2887671	2887676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222832
42120	NC_019702	GTT	2	6	2887700	2887705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222832
42121	NC_019702	TCA	3	9	2887732	2887740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222832
42122	NC_019702	TTAA	2	8	2887771	2887778	50 %	50 %	0 %	0 %	428222832
42123	NC_019702	ATTT	2	8	2888154	2888161	25 %	75 %	0 %	0 %	428222833
42124	NC_019702	AGC	2	6	2888201	2888206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222833
42125	NC_019702	TTC	2	6	2888252	2888257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222833
42126	NC_019702	GATG	2	8	2888323	2888330	25 %	25 %	50 %	0 %	428222833
42127	NC_019702	TCA	3	9	2888421	2888429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222833
42128	NC_019702	TAC	2	6	2888495	2888500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222833
42129	NC_019702	ATCCTA	2	12	2888596	2888607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222833
42130	NC_019702	AAT	2	6	2888690	2888695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222833
42131	NC_019702	AAAT	2	8	2888746	2888753	75 %	25 %	0 %	0 %	428222833
42132	NC_019702	CAT	2	6	2888830	2888835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222833
42133	NC_019702	GTG	2	6	2888858	2888863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222833
42134	NC_019702	TAAT	2	8	2888934	2888941	50 %	50 %	0 %	0 %	428222833
42135	NC_019702	ACC	2	6	2888960	2888965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222833
42136	NC_019702	CAT	2	6	2888974	2888979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222833
42137	NC_019702	ACAT	2	8	2889117	2889124	50 %	25 %	0 %	25 %	428222833
42138	NC_019702	ATT	2	6	2889149	2889154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222833
42139	NC_019702	TTTA	2	8	2889179	2889186	25 %	75 %	0 %	0 %	428222833
42140	NC_019702	CTT	2	6	2889191	2889196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222833
42141	NC_019702	T	6	6	2889318	2889323	0 %	100 %	0 %	0 %	428222834
42142	NC_019702	TAA	2	6	2889342	2889347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222834
42143	NC_019702	CCA	2	6	2889378	2889383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222834
42144	NC_019702	AGCC	2	8	2889389	2889396	25 %	0 %	25 %	50 %	428222834
42145	NC_019702	ATT	2	6	2889423	2889428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222834
42146	NC_019702	TGC	2	6	2889456	2889461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222834
42147	NC_019702	CCA	2	6	2889462	2889467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222834
42148	NC_019702	TGG	2	6	2889473	2889478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222834
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42151	NC_019702	TAG	2	6	2889685	2889690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222834
42152	NC_019702	T	6	6	2889747	2889752	0 %	100 %	0 %	0 %	428222834
42153	NC_019702	CCA	2	6	2889780	2889785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222834
42154	NC_019702	TGC	2	6	2889841	2889846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222834
42155	NC_019702	C	6	6	2889853	2889858	0 %	0 %	0 %	100 %	428222834
42156	NC_019702	ACC	2	6	2889873	2889878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222834
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42160	NC_019702	GCAT	2	8	2890063	2890070	25 %	25 %	25 %	25 %	428222834
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42162	NC_019702	TGGT	2	8	2890125	2890132	0 %	50 %	50 %	0 %	428222834
42163	NC_019702	TTTGA	2	10	2890142	2890151	20 %	60 %	20 %	0 %	428222834
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42165	NC_019702	ACT	2	6	2890390	2890395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222835
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42170	NC_019702	AGC	2	6	2890855	2890860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222835
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42172	NC_019702	AAT	2	6	2890924	2890929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222835
42173	NC_019702	GA	3	6	2890998	2891003	50 %	0 %	50 %	0 %	428222835
42174	NC_019702	TAT	2	6	2891021	2891026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222835
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42180	NC_019702	ATT	2	6	2891386	2891391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222835
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42182	NC_019702	TCAAGG	2	12	2891429	2891440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428222835
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42185	NC_019702	ACC	2	6	2891783	2891788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222836
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42204	NC_019702	GCA	3	9	2893395	2893403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222837
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42214	NC_019702	C	6	6	2893959	2893964	0 %	0 %	0 %	100 %	428222837
42215	NC_019702	TTA	2	6	2894040	2894045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222837
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42219	NC_019702	ATAG	2	8	2894154	2894161	50 %	25 %	25 %	0 %	428222837
42220	NC_019702	TCA	2	6	2894175	2894180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222837
42221	NC_019702	TTG	2	6	2894187	2894192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222837
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42223	NC_019702	ATT	2	6	2894255	2894260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222837
42224	NC_019702	TGGCAT	2	12	2894269	2894280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428222837
42225	NC_019702	TTG	2	6	2894325	2894330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222837
42226	NC_019702	A	6	6	2894465	2894470	100 %	0 %	0 %	0 %	428222837
42227	NC_019702	GCC	2	6	2894474	2894479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222837
42228	NC_019702	AAT	2	6	2894486	2894491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222837
42229	NC_019702	CGC	2	6	2894573	2894578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222837
42230	NC_019702	AGC	2	6	2894615	2894620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222837
42231	NC_019702	ATT	2	6	2894654	2894659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222837
42232	NC_019702	GGC	2	6	2894702	2894707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222837
42233	NC_019702	ATT	2	6	2894750	2894755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222837
42234	NC_019702	TACA	2	8	2894850	2894857	50 %	25 %	0 %	25 %	428222837
42235	NC_019702	TAC	2	6	2894983	2894988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222838
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42239	NC_019702	ATC	2	6	2895314	2895319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222838
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42252	NC_019702	G	6	6	2896236	2896241	0 %	0 %	100 %	0 %	428222839
42253	NC_019702	TAT	2	6	2896249	2896254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222839
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42267	NC_019702	CGG	2	6	2897512	2897517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222840
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42306	NC_019702	TAAT	2	8	2899879	2899886	50 %	50 %	0 %	0 %	428222842
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42338	NC_019702	ATA	2	6	2902097	2902102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222845
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42341	NC_019702	TAG	2	6	2902208	2902213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222846
42342	NC_019702	GCA	2	6	2902215	2902220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222846
42343	NC_019702	TCA	2	6	2902275	2902280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222846
42344	NC_019702	TTGG	2	8	2902339	2902346	0 %	50 %	50 %	0 %	428222846
42345	NC_019702	ACT	2	6	2902526	2902531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222846
42346	NC_019702	GCG	2	6	2902554	2902559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222846
42347	NC_019702	AGCCAC	2	12	2902661	2902672	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428222846
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42467	NC_019702	TAAA	2	8	2912897	2912904	75 %	25 %	0 %	0 %	428222858
42468	NC_019702	CTA	2	6	2912992	2912997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222858
42469	NC_019702	CGC	2	6	2913013	2913018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222858
42470	NC_019702	GTA	2	6	2913063	2913068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222858
42471	NC_019702	A	7	7	2913087	2913093	100 %	0 %	0 %	0 %	428222858
42472	NC_019702	TTAAC	2	10	2913181	2913190	40 %	40 %	0 %	20 %	428222858
42473	NC_019702	TGC	2	6	2913230	2913235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222858
42474	NC_019702	GATT	2	8	2913241	2913248	25 %	50 %	25 %	0 %	428222858
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42483	NC_019702	TTC	2	6	2913812	2913817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222860
42484	NC_019702	ATT	2	6	2913828	2913833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222860
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42491	NC_019702	ATC	2	6	2914104	2914109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222860
42492	NC_019702	TAA	2	6	2914149	2914154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222860
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42495	NC_019702	TCCG	2	8	2915506	2915513	0 %	25 %	25 %	50 %	428222861
42496	NC_019702	TGC	2	6	2915577	2915582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222861
42497	NC_019702	TGAA	2	8	2915620	2915627	50 %	25 %	25 %	0 %	428222861
42498	NC_019702	CG	3	6	2919105	2919110	0 %	0 %	50 %	50 %	428222862
42499	NC_019702	ACG	2	6	2919143	2919148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222862
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