MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_019702	T	7	7	2744004	2744010	0 %	100 %	0 %	0 %	428222682
40002	NC_019702	AAT	2	6	2744024	2744029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222682
40003	NC_019702	TCT	2	6	2744031	2744036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222682
40004	NC_019702	TATT	2	8	2744085	2744092	25 %	75 %	0 %	0 %	428222682
40005	NC_019702	T	6	6	2744171	2744176	0 %	100 %	0 %	0 %	428222682
40006	NC_019702	ATA	2	6	2744188	2744193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222682
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40008	NC_019702	TAATT	2	10	2744214	2744223	40 %	60 %	0 %	0 %	428222682
40009	NC_019702	TTA	2	6	2744271	2744276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222682
40010	NC_019702	TGG	2	6	2744285	2744290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222682
40011	NC_019702	ATA	2	6	2744320	2744325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222682
40012	NC_019702	TAG	2	6	2744353	2744358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222682
40013	NC_019702	T	6	6	2744427	2744432	0 %	100 %	0 %	0 %	428222682
40014	NC_019702	ATC	2	6	2744511	2744516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222682
40015	NC_019702	AG	3	6	2744560	2744565	50 %	0 %	50 %	0 %	428222682
40016	NC_019702	AAT	2	6	2744578	2744583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222682
40017	NC_019702	AGA	2	6	2744588	2744593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222682
40018	NC_019702	CATA	2	8	2744650	2744657	50 %	25 %	0 %	25 %	428222682
40019	NC_019702	CTA	2	6	2744662	2744667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222682
40020	NC_019702	CTG	2	6	2744692	2744697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222682
40021	NC_019702	CTC	2	6	2744738	2744743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222682
40022	NC_019702	AGC	2	6	2744984	2744989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222683
40023	NC_019702	GCA	2	6	2745033	2745038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222683
40024	NC_019702	ATC	2	6	2745059	2745064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222683
40025	NC_019702	GTAG	2	8	2745109	2745116	25 %	25 %	50 %	0 %	428222683
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40027	NC_019702	GAA	2	6	2745228	2745233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222683
40028	NC_019702	GCGG	2	8	2745250	2745257	0 %	0 %	75 %	25 %	428222683
40029	NC_019702	ATA	2	6	2745259	2745264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222683
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40031	NC_019702	A	6	6	2745507	2745512	100 %	0 %	0 %	0 %	428222683
40032	NC_019702	TAT	2	6	2745513	2745518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222683
40033	NC_019702	TAA	2	6	2745533	2745538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222683
40034	NC_019702	ATT	2	6	2745589	2745594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222683
40035	NC_019702	TCGT	2	8	2745616	2745623	0 %	50 %	25 %	25 %	428222683
40036	NC_019702	CAT	2	6	2745666	2745671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222683
40037	NC_019702	AT	3	6	2745725	2745730	50 %	50 %	0 %	0 %	428222683
40038	NC_019702	TTAG	2	8	2745767	2745774	25 %	50 %	25 %	0 %	428222683
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40040	NC_019702	TGGA	2	8	2745845	2745852	25 %	25 %	50 %	0 %	428222683
40041	NC_019702	CAAA	2	8	2745942	2745949	75 %	0 %	0 %	25 %	428222683
40042	NC_019702	GAT	2	6	2745986	2745991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222683
40043	NC_019702	CT	3	6	2746059	2746064	0 %	50 %	0 %	50 %	428222683
40044	NC_019702	GCA	2	6	2746067	2746072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222683
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40047	NC_019702	GAC	3	9	2746119	2746127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222683
40048	NC_019702	ATTA	2	8	2746232	2746239	50 %	50 %	0 %	0 %	428222684
40049	NC_019702	A	6	6	2746284	2746289	100 %	0 %	0 %	0 %	428222684
40050	NC_019702	TTAC	2	8	2746306	2746313	25 %	50 %	0 %	25 %	428222684
40051	NC_019702	TACT	2	8	2746321	2746328	25 %	50 %	0 %	25 %	428222684
40052	NC_019702	CAA	2	6	2746335	2746340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222684
40053	NC_019702	AAT	2	6	2746362	2746367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222684
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40059	NC_019702	ATC	2	6	2746657	2746662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222684
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40061	NC_019702	AGT	2	6	2746733	2746738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222684
40062	NC_019702	CTAGT	2	10	2746771	2746780	20 %	40 %	20 %	20 %	428222684
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40089	NC_019702	TA	3	6	2748701	2748706	50 %	50 %	0 %	0 %	428222685
40090	NC_019702	GCT	2	6	2748763	2748768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222685
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40105	NC_019702	TTAA	2	8	2750280	2750287	50 %	50 %	0 %	0 %	428222686
40106	NC_019702	AAG	2	6	2750347	2750352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222686
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40109	NC_019702	CATTCA	2	12	2750444	2750455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222686
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40113	NC_019702	TCA	2	6	2750703	2750708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222687
40114	NC_019702	C	6	6	2750715	2750720	0 %	0 %	0 %	100 %	428222687
40115	NC_019702	GAG	2	6	2750782	2750787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222687
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40117	NC_019702	CTTGGA	2	12	2750848	2750859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428222687
40118	NC_019702	TAAA	2	8	2751035	2751042	75 %	25 %	0 %	0 %	428222687
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40234	NC_019702	TTA	2	6	2758828	2758833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222694
40235	NC_019702	ATC	2	6	2758860	2758865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222694
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40294	NC_019702	CTTCAG	2	12	2762035	2762046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428222698
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40322	NC_019702	TAGCTT	2	12	2763417	2763428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428222700
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40332	NC_019702	GCAA	2	8	2764293	2764300	50 %	0 %	25 %	25 %	428222701
40333	NC_019702	CAA	2	6	2764307	2764312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222701
40334	NC_019702	ATAG	2	8	2764584	2764591	50 %	25 %	25 %	0 %	428222702
40335	NC_019702	CCA	2	6	2764595	2764600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222702
40336	NC_019702	AGGGCA	2	12	2764621	2764632	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428222702
40337	NC_019702	TAG	2	6	2764686	2764691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222702
40338	NC_019702	TGAT	2	8	2764717	2764724	25 %	50 %	25 %	0 %	428222702
40339	NC_019702	GAT	2	6	2765087	2765092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222703
40340	NC_019702	GCA	2	6	2765146	2765151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222703
40341	NC_019702	GCT	2	6	2765219	2765224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222703
40342	NC_019702	AAG	2	6	2765292	2765297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222703
40343	NC_019702	GTA	2	6	2765316	2765321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222703
40344	NC_019702	AGA	3	9	2765383	2765391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222703
40345	NC_019702	ATG	2	6	2765397	2765402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222703
40346	NC_019702	GGCA	2	8	2765554	2765561	25 %	0 %	50 %	25 %	428222704
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40348	NC_019702	GAT	2	6	2765649	2765654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222704
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40465	NC_019702	TTC	2	6	2773226	2773231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222711
40466	NC_019702	TCT	2	6	2773236	2773241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222711
40467	NC_019702	A	7	7	2773280	2773286	100 %	0 %	0 %	0 %	428222711
40468	NC_019702	TAA	2	6	2773314	2773319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222711
40469	NC_019702	CTT	2	6	2773378	2773383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222711
40470	NC_019702	TCA	3	9	2773408	2773416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222712
40471	NC_019702	CCAA	2	8	2773439	2773446	50 %	0 %	0 %	50 %	428222712
40472	NC_019702	GGT	2	6	2773460	2773465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222712
40473	NC_019702	AGT	2	6	2773470	2773475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222712
40474	NC_019702	CATA	2	8	2773487	2773494	50 %	25 %	0 %	25 %	428222712
40475	NC_019702	CTAA	2	8	2773546	2773553	50 %	25 %	0 %	25 %	428222712
40476	NC_019702	CAAATC	2	12	2773641	2773652	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428222713
40477	NC_019702	ATT	2	6	2774028	2774033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222714
40478	NC_019702	CTC	3	9	2774095	2774103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222715
40479	NC_019702	TCAA	2	8	2774138	2774145	50 %	25 %	0 %	25 %	428222715
40480	NC_019702	TTG	2	6	2774201	2774206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222715
40481	NC_019702	CTTTG	2	10	2774459	2774468	0 %	60 %	20 %	20 %	428222716
40482	NC_019702	CTG	2	6	2774564	2774569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222716
40483	NC_019702	ATT	2	6	2774617	2774622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222716
40484	NC_019702	CAGG	2	8	2775055	2775062	25 %	0 %	50 %	25 %	428222717
40485	NC_019702	TTC	2	6	2775071	2775076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222717
40486	NC_019702	TTC	2	6	2775098	2775103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222717
40487	NC_019702	GTCCA	2	10	2775138	2775147	20 %	20 %	20 %	40 %	428222717
40488	NC_019702	AAC	2	6	2775159	2775164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222717
40489	NC_019702	GTT	2	6	2775212	2775217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222717
40490	NC_019702	CAG	2	6	2775247	2775252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222717
40491	NC_019702	G	6	6	2775320	2775325	0 %	0 %	100 %	0 %	428222717
40492	NC_019702	GAT	3	9	2775450	2775458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222717
40493	NC_019702	TGA	2	6	2775479	2775484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222717
40494	NC_019702	GTCCT	2	10	2775527	2775536	0 %	40 %	20 %	40 %	428222717
40495	NC_019702	CCA	2	6	2775709	2775714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222717
40496	NC_019702	TTCT	2	8	2775883	2775890	0 %	75 %	0 %	25 %	428222718
40497	NC_019702	GAT	3	9	2775984	2775992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222718
40498	NC_019702	GAT	2	6	2776026	2776031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222718
40499	NC_019702	TGCT	2	8	2776144	2776151	0 %	50 %	25 %	25 %	428222718
40500	NC_019702	CTC	2	6	2776216	2776221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222719

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