MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_019702	TGCC	2	8	2592475	2592482	0 %	25 %	25 %	50 %	428222542
38002	NC_019702	ATC	2	6	2592488	2592493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222542
38003	NC_019702	TAA	2	6	2592508	2592513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222542
38004	NC_019702	GTT	2	6	2592585	2592590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222542
38005	NC_019702	CAT	2	6	2592619	2592624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222542
38006	NC_019702	T	6	6	2592636	2592641	0 %	100 %	0 %	0 %	428222542
38007	NC_019702	TGT	2	6	2592665	2592670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222542
38008	NC_019702	TTA	2	6	2592828	2592833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222542
38009	NC_019702	A	6	6	2593025	2593030	100 %	0 %	0 %	0 %	428222542
38010	NC_019702	GGA	2	6	2593068	2593073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222542
38011	NC_019702	TG	3	6	2593345	2593350	0 %	50 %	50 %	0 %	428222543
38012	NC_019702	AAG	2	6	2593454	2593459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222543
38013	NC_019702	TAA	2	6	2593479	2593484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38014	NC_019702	TAA	2	6	2593569	2593574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38015	NC_019702	TCA	2	6	2593626	2593631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38016	NC_019702	AAT	2	6	2593657	2593662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38017	NC_019702	TGG	2	6	2593668	2593673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222543
38018	NC_019702	AAT	2	6	2593690	2593695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38019	NC_019702	ATT	2	6	2593762	2593767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222543
38020	NC_019702	A	7	7	2593768	2593774	100 %	0 %	0 %	0 %	428222543
38021	NC_019702	TC	3	6	2593924	2593929	0 %	50 %	0 %	50 %	428222543
38022	NC_019702	AAT	2	6	2593930	2593935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38023	NC_019702	AAT	2	6	2594050	2594055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38024	NC_019702	CTA	2	6	2594103	2594108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38025	NC_019702	AAC	2	6	2594132	2594137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222543
38026	NC_019702	AAT	2	6	2594170	2594175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38027	NC_019702	TAA	2	6	2594181	2594186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38028	NC_019702	CAA	2	6	2594230	2594235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222543
38029	NC_019702	TC	3	6	2594314	2594319	0 %	50 %	0 %	50 %	428222543
38030	NC_019702	ACA	2	6	2594327	2594332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222543
38031	NC_019702	TCT	3	9	2594398	2594406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222543
38032	NC_019702	TAA	2	6	2594409	2594414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38033	NC_019702	A	6	6	2594488	2594493	100 %	0 %	0 %	0 %	428222543
38034	NC_019702	GC	3	6	2594503	2594508	0 %	0 %	50 %	50 %	428222543
38035	NC_019702	AAT	2	6	2594530	2594535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38036	NC_019702	AGG	2	6	2594570	2594575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222543
38037	NC_019702	CAA	2	6	2594590	2594595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222543
38038	NC_019702	GAAA	2	8	2594635	2594642	75 %	0 %	25 %	0 %	428222543
38039	NC_019702	AAT	2	6	2594650	2594655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38040	NC_019702	AGA	2	6	2594766	2594771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222543
38041	NC_019702	AGG	2	6	2594799	2594804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222543
38042	NC_019702	TCG	2	6	2594808	2594813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222543
38043	NC_019702	TTA	2	6	2594827	2594832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222543
38044	NC_019702	A	7	7	2594913	2594919	100 %	0 %	0 %	0 %	428222543
38045	NC_019702	TCA	2	6	2594943	2594948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38046	NC_019702	TAC	2	6	2595006	2595011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38047	NC_019702	ATCT	2	8	2595079	2595086	25 %	50 %	0 %	25 %	428222543
38048	NC_019702	CTTTA	2	10	2595110	2595119	20 %	60 %	0 %	20 %	428222543
38049	NC_019702	AATT	2	8	2595146	2595153	50 %	50 %	0 %	0 %	428222543
38050	NC_019702	TAA	2	6	2595165	2595170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38051	NC_019702	GAA	2	6	2595214	2595219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222543
38052	NC_019702	A	6	6	2595283	2595288	100 %	0 %	0 %	0 %	428222543
38053	NC_019702	ACAG	2	8	2595330	2595337	50 %	0 %	25 %	25 %	428222543
38054	NC_019702	TAC	2	6	2595339	2595344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38055	NC_019702	GCT	2	6	2595391	2595396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222543
38056	NC_019702	ATG	2	6	2595401	2595406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222543
38057	NC_019702	ATCAA	2	10	2595431	2595440	60 %	20 %	0 %	20 %	428222543
38058	NC_019702	CAA	2	6	2595567	2595572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222543
38059	NC_019702	AAT	2	6	2595646	2595651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222543
38060	NC_019702	GCAAT	2	10	2595686	2595695	40 %	20 %	20 %	20 %	428222543
38061	NC_019702	TATTT	2	10	2595750	2595759	20 %	80 %	0 %	0 %	428222543
38062	NC_019702	GTA	2	6	2595767	2595772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222543
38063	NC_019702	GCT	2	6	2595811	2595816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222543
38064	NC_019702	ACT	2	6	2595963	2595968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38065	NC_019702	AT	3	6	2596004	2596009	50 %	50 %	0 %	0 %	428222543
38066	NC_019702	GAT	2	6	2596038	2596043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222543
38067	NC_019702	A	8	8	2596044	2596051	100 %	0 %	0 %	0 %	428222543
38068	NC_019702	ATC	2	6	2596079	2596084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222543
38069	NC_019702	GTA	2	6	2596105	2596110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222543
38070	NC_019702	CAT	2	6	2599509	2599514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222544
38071	NC_019702	CTT	2	6	2599566	2599571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222544
38072	NC_019702	CAT	2	6	2599671	2599676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222544
38073	NC_019702	CATC	2	8	2599680	2599687	25 %	25 %	0 %	50 %	428222544
38074	NC_019702	TTTCT	2	10	2599729	2599738	0 %	80 %	0 %	20 %	428222544
38075	NC_019702	TAA	2	6	2599794	2599799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222544
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38077	NC_019702	GCT	2	6	2599859	2599864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222544
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38079	NC_019702	GTA	2	6	2599954	2599959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222544
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38083	NC_019702	T	6	6	2600208	2600213	0 %	100 %	0 %	0 %	428222544
38084	NC_019702	TAA	2	6	2600254	2600259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222544
38085	NC_019702	ATTGGC	2	12	2600260	2600271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428222544
38086	NC_019702	ATA	2	6	2600310	2600315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222544
38087	NC_019702	TAA	2	6	2600331	2600336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222544
38088	NC_019702	CGGAT	2	10	2600380	2600389	20 %	20 %	40 %	20 %	428222544
38089	NC_019702	AAATA	2	10	2600527	2600536	80 %	20 %	0 %	0 %	428222544
38090	NC_019702	TAA	2	6	2600603	2600608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222544
38091	NC_019702	CCG	2	6	2600655	2600660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222544
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38093	NC_019702	ACAA	2	8	2601034	2601041	75 %	0 %	0 %	25 %	428222545
38094	NC_019702	TTA	2	6	2601045	2601050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222545
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38096	NC_019702	AATC	2	8	2601083	2601090	50 %	25 %	0 %	25 %	428222545
38097	NC_019702	CTA	2	6	2601150	2601155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222545
38098	NC_019702	TAACT	2	10	2601173	2601182	40 %	40 %	0 %	20 %	428222545
38099	NC_019702	TAG	2	6	2601197	2601202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222545
38100	NC_019702	AAG	2	6	2601207	2601212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222545
38101	NC_019702	CTT	2	6	2601283	2601288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222545
38102	NC_019702	TATG	2	8	2601294	2601301	25 %	50 %	25 %	0 %	428222545
38103	NC_019702	TCT	2	6	2601315	2601320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222545
38104	NC_019702	CTG	2	6	2601322	2601327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222545
38105	NC_019702	GA	4	8	2601378	2601385	50 %	0 %	50 %	0 %	428222545
38106	NC_019702	TCA	2	6	2601420	2601425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222545
38107	NC_019702	AT	3	6	2601458	2601463	50 %	50 %	0 %	0 %	428222545
38108	NC_019702	ATC	2	6	2601634	2601639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222545
38109	NC_019702	AAC	2	6	2601731	2601736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222545
38110	NC_019702	AGGC	2	8	2601758	2601765	25 %	0 %	50 %	25 %	428222545
38111	NC_019702	GCTT	2	8	2601798	2601805	0 %	50 %	25 %	25 %	428222545
38112	NC_019702	TTG	2	6	2601826	2601831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222545
38113	NC_019702	GAAA	2	8	2601876	2601883	75 %	0 %	25 %	0 %	428222545
38114	NC_019702	AAG	2	6	2601915	2601920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222545
38115	NC_019702	TCA	2	6	2601929	2601934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222545
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38117	NC_019702	A	6	6	2601993	2601998	100 %	0 %	0 %	0 %	428222546
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38231	NC_019702	CTC	2	6	2609248	2609253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222556
38232	NC_019702	CTAAT	2	10	2609397	2609406	40 %	40 %	0 %	20 %	428222557
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38235	NC_019702	TCA	2	6	2609501	2609506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222557
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38339	NC_019702	AACTGG	2	12	2616399	2616410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428222565
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38342	NC_019702	TCT	2	6	2616593	2616598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222565
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38347	NC_019702	AAGC	2	8	2616811	2616818	50 %	0 %	25 %	25 %	428222565
38348	NC_019702	TGG	2	6	2616855	2616860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222565
38349	NC_019702	AG	4	8	2616873	2616880	50 %	0 %	50 %	0 %	428222565
38350	NC_019702	TTG	2	6	2616940	2616945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222565
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38467	NC_019702	AAT	2	6	2624320	2624325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222572
38468	NC_019702	TAA	2	6	2624349	2624354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222573
38469	NC_019702	ACC	2	6	2624507	2624512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222573
38470	NC_019702	ATT	2	6	2624718	2624723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222574
38471	NC_019702	TGC	2	6	2624732	2624737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222574
38472	NC_019702	TTA	2	6	2624783	2624788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222574
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38478	NC_019702	GTA	2	6	2625011	2625016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222574
38479	NC_019702	TTTC	2	8	2625084	2625091	0 %	75 %	0 %	25 %	428222574
38480	NC_019702	GAG	2	6	2625142	2625147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222574
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