MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_019702	TAAT	2	8	2318073	2318080	50 %	50 %	0 %	0 %	428222287
34002	NC_019702	TAGT	2	8	2318142	2318149	25 %	50 %	25 %	0 %	428222287
34003	NC_019702	GGC	2	6	2318431	2318436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222288
34004	NC_019702	ATT	2	6	2318461	2318466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222288
34005	NC_019702	TGG	2	6	2318475	2318480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222288
34006	NC_019702	TTTTC	2	10	2318537	2318546	0 %	80 %	0 %	20 %	428222288
34007	NC_019702	ATT	2	6	2318569	2318574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222288
34008	NC_019702	TAC	2	6	2318604	2318609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222288
34009	NC_019702	CT	4	8	2318681	2318688	0 %	50 %	0 %	50 %	428222288
34010	NC_019702	GAC	2	6	2318725	2318730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222288
34011	NC_019702	C	6	6	2318831	2318836	0 %	0 %	0 %	100 %	428222288
34012	NC_019702	ACTGA	2	10	2318842	2318851	40 %	20 %	20 %	20 %	428222288
34013	NC_019702	CGC	2	6	2318878	2318883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222288
34014	NC_019702	CCG	2	6	2318886	2318891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222288
34015	NC_019702	TCG	2	6	2318952	2318957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222288
34016	NC_019702	CCGCC	2	10	2319049	2319058	0 %	0 %	20 %	80 %	428222288
34017	NC_019702	TCT	2	6	2319088	2319093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222288
34018	NC_019702	GTG	2	6	2319354	2319359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222289
34019	NC_019702	TCC	2	6	2319460	2319465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222289
34020	NC_019702	GT	3	6	2319466	2319471	0 %	50 %	50 %	0 %	428222289
34021	NC_019702	GCA	2	6	2319611	2319616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222289
34022	NC_019702	ATT	2	6	2319701	2319706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222289
34023	NC_019702	ATT	2	6	2319788	2319793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222289
34024	NC_019702	GAA	3	9	2319869	2319877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222289
34025	NC_019702	TGC	2	6	2320110	2320115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222289
34026	NC_019702	TGC	2	6	2320159	2320164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222289
34027	NC_019702	CAA	2	6	2320185	2320190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222289
34028	NC_019702	ACC	2	6	2320204	2320209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222289
34029	NC_019702	CTA	2	6	2320326	2320331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222289
34030	NC_019702	CTC	2	6	2320347	2320352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222289
34031	NC_019702	GGT	2	6	2320463	2320468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222289
34032	NC_019702	TTG	2	6	2320479	2320484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222289
34033	NC_019702	ATCT	2	8	2320521	2320528	25 %	50 %	0 %	25 %	428222289
34034	NC_019702	TGA	2	6	2320566	2320571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222289
34035	NC_019702	GTCA	2	8	2320602	2320609	25 %	25 %	25 %	25 %	428222289
34036	NC_019702	TTAAA	2	10	2320653	2320662	60 %	40 %	0 %	0 %	428222289
34037	NC_019702	GGT	2	6	2320721	2320726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222289
34038	NC_019702	GTA	2	6	2320956	2320961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222289
34039	NC_019702	TGG	2	6	2321090	2321095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222290
34040	NC_019702	AGA	2	6	2321217	2321222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222290
34041	NC_019702	CTG	2	6	2321244	2321249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222290
34042	NC_019702	TAA	2	6	2321340	2321345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222290
34043	NC_019702	ACTA	2	8	2321351	2321358	50 %	25 %	0 %	25 %	428222290
34044	NC_019702	C	6	6	2321486	2321491	0 %	0 %	0 %	100 %	428222291
34045	NC_019702	TA	4	8	2321551	2321558	50 %	50 %	0 %	0 %	428222291
34046	NC_019702	TGGG	2	8	2321798	2321805	0 %	25 %	75 %	0 %	428222291
34047	NC_019702	TAGT	2	8	2321811	2321818	25 %	50 %	25 %	0 %	428222291
34048	NC_019702	TGG	2	6	2321995	2322000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222292
34049	NC_019702	TGG	2	6	2322107	2322112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222292
34050	NC_019702	GAA	3	9	2322120	2322128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222292
34051	NC_019702	CTA	2	6	2322187	2322192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222292
34052	NC_019702	GGA	2	6	2322276	2322281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222292
34053	NC_019702	CGG	2	6	2322519	2322524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222292
34054	NC_019702	A	7	7	2322582	2322588	100 %	0 %	0 %	0 %	428222292
34055	NC_019702	ATT	2	6	2322617	2322622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222292
34056	NC_019702	ATTT	2	8	2322655	2322662	25 %	75 %	0 %	0 %	428222292
34057	NC_019702	AGA	2	6	2322683	2322688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222292
34058	NC_019702	TCC	2	6	2322728	2322733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222292
34059	NC_019702	AAG	2	6	2322937	2322942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222292
34060	NC_019702	GTC	2	6	2322964	2322969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222292
34061	NC_019702	AGC	2	6	2323040	2323045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222292
34062	NC_019702	AGA	3	9	2323178	2323186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222292
34063	NC_019702	AGT	2	6	2323254	2323259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222293
34064	NC_019702	A	7	7	2323346	2323352	100 %	0 %	0 %	0 %	428222293
34065	NC_019702	CGCA	2	8	2323375	2323382	25 %	0 %	25 %	50 %	428222293
34066	NC_019702	CCG	2	6	2323491	2323496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222294
34067	NC_019702	AT	3	6	2323497	2323502	50 %	50 %	0 %	0 %	428222294
34068	NC_019702	TA	3	6	2323619	2323624	50 %	50 %	0 %	0 %	428222294
34069	NC_019702	GATAC	2	10	2323701	2323710	40 %	20 %	20 %	20 %	428222294
34070	NC_019702	ATG	2	6	2323863	2323868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222294
34071	NC_019702	TGG	2	6	2323882	2323887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222294
34072	NC_019702	GCA	2	6	2324272	2324277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222294
34073	NC_019702	ATT	2	6	2324364	2324369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222294
34074	NC_019702	ATG	2	6	2324393	2324398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222294
34075	NC_019702	TAC	2	6	2324512	2324517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222294
34076	NC_019702	TTA	2	6	2324531	2324536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222294
34077	NC_019702	TA	4	8	2324558	2324565	50 %	50 %	0 %	0 %	428222294
34078	NC_019702	GTT	2	6	2324749	2324754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222294
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34080	NC_019702	CGG	2	6	2324937	2324942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222294
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34082	NC_019702	T	6	6	2325008	2325013	0 %	100 %	0 %	0 %	428222294
34083	NC_019702	CAA	2	6	2325041	2325046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222294
34084	NC_019702	TCCC	2	8	2325049	2325056	0 %	25 %	0 %	75 %	428222294
34085	NC_019702	ATT	2	6	2325070	2325075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222294
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34087	NC_019702	TG	3	6	2325354	2325359	0 %	50 %	50 %	0 %	428222295
34088	NC_019702	TAA	2	6	2325382	2325387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222295
34089	NC_019702	A	6	6	2325409	2325414	100 %	0 %	0 %	0 %	428222295
34090	NC_019702	TTA	2	6	2325438	2325443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222295
34091	NC_019702	AACTAA	2	12	2325529	2325540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428222295
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34094	NC_019702	GA	3	6	2325612	2325617	50 %	0 %	50 %	0 %	428222295
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34097	NC_019702	T	6	6	2325710	2325715	0 %	100 %	0 %	0 %	428222295
34098	NC_019702	AGTT	2	8	2325726	2325733	25 %	50 %	25 %	0 %	428222295
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34100	NC_019702	T	7	7	2325785	2325791	0 %	100 %	0 %	0 %	428222295
34101	NC_019702	TTG	2	6	2325917	2325922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222295
34102	NC_019702	AAG	2	6	2326019	2326024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222295
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34104	NC_019702	TTGA	2	8	2326067	2326074	25 %	50 %	25 %	0 %	428222295
34105	NC_019702	AAG	2	6	2326121	2326126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222295
34106	NC_019702	GAA	2	6	2326130	2326135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222295
34107	NC_019702	AG	3	6	2326153	2326158	50 %	0 %	50 %	0 %	428222295
34108	NC_019702	TTAA	2	8	2326235	2326242	50 %	50 %	0 %	0 %	428222295
34109	NC_019702	ATC	2	6	2326245	2326250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222295
34110	NC_019702	ATG	2	6	2326299	2326304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222295
34111	NC_019702	GTTT	2	8	2326314	2326321	0 %	75 %	25 %	0 %	428222295
34112	NC_019702	T	6	6	2326319	2326324	0 %	100 %	0 %	0 %	428222295
34113	NC_019702	GACGGA	2	12	2326417	2326428	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428222295
34114	NC_019702	GCA	2	6	2326429	2326434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222295
34115	NC_019702	TTTG	2	8	2326546	2326553	0 %	75 %	25 %	0 %	428222295
34116	NC_019702	GGA	2	6	2326591	2326596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222295
34117	NC_019702	CGG	2	6	2326730	2326735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222295
34118	NC_019702	GGT	2	6	2326738	2326743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222295
34119	NC_019702	TGA	2	6	2326786	2326791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222295
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34225	NC_019702	T	6	6	2333568	2333573	0 %	100 %	0 %	0 %	428222301
34226	NC_019702	CAG	2	6	2333594	2333599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222301
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34230	NC_019702	AAT	2	6	2333957	2333962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222302
34231	NC_019702	GAT	2	6	2334009	2334014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222302
34232	NC_019702	ATG	2	6	2334022	2334027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222302
34233	NC_019702	TGG	2	6	2334059	2334064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222302
34234	NC_019702	ATGAA	2	10	2334149	2334158	60 %	20 %	20 %	0 %	428222302
34235	NC_019702	AAT	2	6	2334163	2334168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222302
34236	NC_019702	AAC	2	6	2334178	2334183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222302
34237	NC_019702	AG	3	6	2334189	2334194	50 %	0 %	50 %	0 %	428222302
34238	NC_019702	CAAAGG	2	12	2334219	2334230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428222302
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34240	NC_019702	ATG	2	6	2334295	2334300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222302
34241	NC_019702	GTAAA	2	10	2334314	2334323	60 %	20 %	20 %	0 %	428222302
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34244	NC_019702	TGAAT	2	10	2334497	2334506	40 %	40 %	20 %	0 %	428222302
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34253	NC_019702	CTTTAA	2	12	2335411	2335422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428222304
34254	NC_019702	T	6	6	2335454	2335459	0 %	100 %	0 %	0 %	428222304
34255	NC_019702	AACT	2	8	2336199	2336206	50 %	25 %	0 %	25 %	428222305
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34334	NC_019702	TAG	2	6	2341402	2341407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222308
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34337	NC_019702	CTG	2	6	2341932	2341937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222309
34338	NC_019702	GCTTAA	2	12	2341938	2341949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428222309
34339	NC_019702	ATA	2	6	2341970	2341975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222309
34340	NC_019702	T	6	6	2341999	2342004	0 %	100 %	0 %	0 %	428222309
34341	NC_019702	CAA	2	6	2342010	2342015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222309
34342	NC_019702	CAC	2	6	2342028	2342033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222309
34343	NC_019702	TCA	2	6	2342036	2342041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222309
34344	NC_019702	CAT	2	6	2342196	2342201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222309
34345	NC_019702	ATA	2	6	2342253	2342258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222309
34346	NC_019702	TCCA	2	8	2342337	2342344	25 %	25 %	0 %	50 %	428222309
34347	NC_019702	TAG	2	6	2342373	2342378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222309
34348	NC_019702	GATGC	2	10	2342406	2342415	20 %	20 %	40 %	20 %	428222309
34349	NC_019702	CAA	2	6	2342520	2342525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222309
34350	NC_019702	CTT	2	6	2342558	2342563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222309
34351	NC_019702	T	6	6	2342562	2342567	0 %	100 %	0 %	0 %	428222309
34352	NC_019702	AAG	2	6	2342577	2342582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222309
34353	NC_019702	TCT	2	6	2342600	2342605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222309
34354	NC_019702	TGAT	2	8	2342614	2342621	25 %	50 %	25 %	0 %	428222309
34355	NC_019702	CAT	2	6	2342872	2342877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222309
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34360	NC_019702	T	6	6	2343060	2343065	0 %	100 %	0 %	0 %	428222309
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34384	NC_019702	GAC	2	6	2346883	2346888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222311
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34386	NC_019702	AATT	2	8	2346950	2346957	50 %	50 %	0 %	0 %	428222311
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34457	NC_019702	GA	3	6	2352030	2352035	50 %	0 %	50 %	0 %	428222315
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34464	NC_019702	GAAA	2	8	2352971	2352978	75 %	0 %	25 %	0 %	428222315
34465	NC_019702	AGC	2	6	2352981	2352986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222315
34466	NC_019702	CAC	2	6	2352993	2352998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222315
34467	NC_019702	GTT	3	9	2353025	2353033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222315
34468	NC_019702	CAT	2	6	2353106	2353111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222315
34469	NC_019702	TGG	2	6	2353342	2353347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222315
34470	NC_019702	TGC	2	6	2354911	2354916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222316
34471	NC_019702	CTTG	2	8	2354928	2354935	0 %	50 %	25 %	25 %	428222316
34472	NC_019702	CTA	2	6	2354949	2354954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222316
34473	NC_019702	TTAGTA	2	12	2355086	2355097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428222316
34474	NC_019702	ATT	2	6	2355127	2355132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222316
34475	NC_019702	TAAT	2	8	2355273	2355280	50 %	50 %	0 %	0 %	428222316
34476	NC_019702	ATA	2	6	2355332	2355337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222316
34477	NC_019702	ATT	2	6	2355388	2355393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222316
34478	NC_019702	ACC	2	6	2355397	2355402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222316
34479	NC_019702	AAC	2	6	2355435	2355440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222316
34480	NC_019702	CTC	3	9	2355444	2355452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222316
34481	NC_019702	CTT	2	6	2355491	2355496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222316
34482	NC_019702	T	6	6	2355520	2355525	0 %	100 %	0 %	0 %	428222316
34483	NC_019702	TC	3	6	2355576	2355581	0 %	50 %	0 %	50 %	428222316
34484	NC_019702	ACTTG	2	10	2355640	2355649	20 %	40 %	20 %	20 %	428222316
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34487	NC_019702	TTAA	2	8	2355792	2355799	50 %	50 %	0 %	0 %	428222317
34488	NC_019702	CAT	2	6	2355804	2355809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222317
34489	NC_019702	CTG	2	6	2355822	2355827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222317
34490	NC_019702	CCA	2	6	2355892	2355897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222317
34491	NC_019702	CGG	2	6	2355900	2355905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222317
34492	NC_019702	AATA	2	8	2355921	2355928	75 %	25 %	0 %	0 %	428222317
34493	NC_019702	ATCT	2	8	2356132	2356139	25 %	50 %	0 %	25 %	428222318
34494	NC_019702	TTG	2	6	2356327	2356332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222318
34495	NC_019702	TTA	2	6	2356419	2356424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222318
34496	NC_019702	C	6	6	2356446	2356451	0 %	0 %	0 %	100 %	428222318
34497	NC_019702	GCC	2	6	2356452	2356457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222318
34498	NC_019702	ATT	2	6	2356533	2356538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222318
34499	NC_019702	TAAT	2	8	2356588	2356595	50 %	50 %	0 %	0 %	428222318
34500	NC_019702	TAT	2	6	2356651	2356656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222318

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