MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_019702	CCGCC	2	10	2282212	2282221	0 %	0 %	20 %	80 %	428222258
33502	NC_019702	CTTT	2	8	2282222	2282229	0 %	75 %	0 %	25 %	428222258
33503	NC_019702	TCA	2	6	2282291	2282296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222258
33504	NC_019702	GCT	2	6	2282313	2282318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33505	NC_019702	GCT	2	6	2282345	2282350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33506	NC_019702	CCG	2	6	2282408	2282413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222258
33507	NC_019702	ATC	2	6	2282488	2282493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222258
33508	NC_019702	TAGAA	2	10	2282509	2282518	60 %	20 %	20 %	0 %	428222258
33509	NC_019702	ATG	2	6	2282534	2282539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222258
33510	NC_019702	GTC	2	6	2282572	2282577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33511	NC_019702	CGT	2	6	2282607	2282612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33512	NC_019702	GAAA	2	8	2282673	2282680	75 %	0 %	25 %	0 %	428222258
33513	NC_019702	GCT	2	6	2282721	2282726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33514	NC_019702	ATA	2	6	2282770	2282775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222258
33515	NC_019702	CTG	3	9	2283024	2283032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33516	NC_019702	CT	3	6	2283123	2283128	0 %	50 %	0 %	50 %	428222258
33517	NC_019702	TCA	2	6	2283185	2283190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222258
33518	NC_019702	TCT	2	6	2283245	2283250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222258
33519	NC_019702	CAT	2	6	2283334	2283339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222258
33520	NC_019702	GCT	2	6	2283350	2283355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222258
33521	NC_019702	T	6	6	2283388	2283393	0 %	100 %	0 %	0 %	428222258
33522	NC_019702	TCA	2	6	2283404	2283409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222258
33523	NC_019702	AAT	2	6	2283443	2283448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222258
33524	NC_019702	AAACC	2	10	2283494	2283503	60 %	0 %	0 %	40 %	428222258
33525	NC_019702	TAGA	2	8	2283541	2283548	50 %	25 %	25 %	0 %	428222258
33526	NC_019702	AGT	2	6	2283637	2283642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222258
33527	NC_019702	ATCTTT	2	12	2283880	2283891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428222258
33528	NC_019702	TTA	2	6	2283917	2283922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222258
33529	NC_019702	ATT	2	6	2283946	2283951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222258
33530	NC_019702	TCC	2	6	2283963	2283968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222259
33531	NC_019702	AATA	2	8	2284012	2284019	75 %	25 %	0 %	0 %	428222259
33532	NC_019702	TAA	2	6	2284140	2284145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222259
33533	NC_019702	GTA	2	6	2284213	2284218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222259
33534	NC_019702	GTT	2	6	2284231	2284236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222259
33535	NC_019702	AG	3	6	2284264	2284269	50 %	0 %	50 %	0 %	428222259
33536	NC_019702	T	8	8	2284273	2284280	0 %	100 %	0 %	0 %	428222259
33537	NC_019702	TAG	2	6	2284310	2284315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222260
33538	NC_019702	TGG	2	6	2284348	2284353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222260
33539	NC_019702	TTTC	2	8	2284449	2284456	0 %	75 %	0 %	25 %	428222260
33540	NC_019702	ACT	2	6	2284512	2284517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222260
33541	NC_019702	GGT	2	6	2284788	2284793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222261
33542	NC_019702	T	7	7	2284834	2284840	0 %	100 %	0 %	0 %	428222261
33543	NC_019702	ATC	2	6	2284862	2284867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222261
33544	NC_019702	AGT	2	6	2285035	2285040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222261
33545	NC_019702	TAGT	2	8	2285110	2285117	25 %	50 %	25 %	0 %	428222261
33546	NC_019702	GAA	2	6	2285284	2285289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222261
33547	NC_019702	TTC	2	6	2285429	2285434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222261
33548	NC_019702	CTA	2	6	2285505	2285510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222261
33549	NC_019702	TTG	2	6	2285600	2285605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222261
33550	NC_019702	GTT	2	6	2285614	2285619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222261
33551	NC_019702	TTC	2	6	2285625	2285630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222261
33552	NC_019702	CAA	2	6	2287102	2287107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222262
33553	NC_019702	CATT	2	8	2287125	2287132	25 %	50 %	0 %	25 %	428222262
33554	NC_019702	TGA	2	6	2287199	2287204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222262
33555	NC_019702	CTT	2	6	2287306	2287311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222262
33556	NC_019702	CAA	2	6	2287348	2287353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222262
33557	NC_019702	TTGAG	2	10	2287404	2287413	20 %	40 %	40 %	0 %	428222262
33558	NC_019702	TGC	2	6	2287436	2287441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222262
33559	NC_019702	GCT	3	9	2287470	2287478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222262
33560	NC_019702	ACG	2	6	2287484	2287489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222262
33561	NC_019702	GTA	2	6	2287542	2287547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222262
33562	NC_019702	TCA	2	6	2287578	2287583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222262
33563	NC_019702	TAA	2	6	2287633	2287638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222262
33564	NC_019702	T	6	6	2287727	2287732	0 %	100 %	0 %	0 %	428222262
33565	NC_019702	CAT	2	6	2287891	2287896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222262
33566	NC_019702	TGG	2	6	2287954	2287959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222262
33567	NC_019702	CTG	2	6	2288322	2288327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222263
33568	NC_019702	AAC	2	6	2288346	2288351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222263
33569	NC_019702	CCA	2	6	2288379	2288384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222263
33570	NC_019702	CAC	2	6	2288388	2288393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222263
33571	NC_019702	TGC	2	6	2288430	2288435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222263
33572	NC_019702	ATT	2	6	2288540	2288545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222263
33573	NC_019702	TTG	2	6	2288610	2288615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222263
33574	NC_019702	CTG	2	6	2288628	2288633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222263
33575	NC_019702	TTGG	2	8	2288664	2288671	0 %	50 %	50 %	0 %	428222263
33576	NC_019702	TATC	2	8	2288677	2288684	25 %	50 %	0 %	25 %	428222263
33577	NC_019702	CGG	2	6	2288724	2288729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222263
33578	NC_019702	GGA	2	6	2288837	2288842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222263
33579	NC_019702	CTG	2	6	2288909	2288914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222263
33580	NC_019702	GGA	2	6	2288921	2288926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222263
33581	NC_019702	TTA	2	6	2288982	2288987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222263
33582	NC_019702	CGA	2	6	2289226	2289231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222263
33583	NC_019702	TCC	2	6	2289274	2289279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222263
33584	NC_019702	T	7	7	2289340	2289346	0 %	100 %	0 %	0 %	428222263
33585	NC_019702	AGA	2	6	2289513	2289518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222264
33586	NC_019702	CTG	2	6	2289578	2289583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222264
33587	NC_019702	AAT	2	6	2289826	2289831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222264
33588	NC_019702	AGG	2	6	2289893	2289898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222264
33589	NC_019702	C	6	6	2289931	2289936	0 %	0 %	0 %	100 %	428222264
33590	NC_019702	TAAC	2	8	2289971	2289978	50 %	25 %	0 %	25 %	428222264
33591	NC_019702	TTAC	2	8	2290033	2290040	25 %	50 %	0 %	25 %	428222264
33592	NC_019702	TAA	2	6	2290092	2290097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222264
33593	NC_019702	ATT	2	6	2290098	2290103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222264
33594	NC_019702	CTTAGC	2	12	2290188	2290199	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428222264
33595	NC_019702	TCAG	2	8	2290266	2290273	25 %	25 %	25 %	25 %	428222264
33596	NC_019702	GAT	2	6	2290363	2290368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222264
33597	NC_019702	CAT	2	6	2290406	2290411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222265
33598	NC_019702	TTC	2	6	2290511	2290516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222265
33599	NC_019702	T	6	6	2290651	2290656	0 %	100 %	0 %	0 %	428222265
33600	NC_019702	TGC	2	6	2290701	2290706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222265
33601	NC_019702	ATC	2	6	2290745	2290750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222265
33602	NC_019702	GATC	2	8	2291291	2291298	25 %	25 %	25 %	25 %	428222266
33603	NC_019702	TAAA	2	8	2291344	2291351	75 %	25 %	0 %	0 %	428222266
33604	NC_019702	A	6	6	2291349	2291354	100 %	0 %	0 %	0 %	428222266
33605	NC_019702	TGCCAT	2	12	2291443	2291454	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428222266
33606	NC_019702	T	6	6	2291500	2291505	0 %	100 %	0 %	0 %	428222266
33607	NC_019702	CCCGCA	2	12	2291618	2291629	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428222266
33608	NC_019702	T	6	6	2291830	2291835	0 %	100 %	0 %	0 %	428222266
33609	NC_019702	TCA	2	6	2292494	2292499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222267
33610	NC_019702	T	7	7	2292579	2292585	0 %	100 %	0 %	0 %	428222267
33611	NC_019702	TG	3	6	2292644	2292649	0 %	50 %	50 %	0 %	428222267
33612	NC_019702	GGA	2	6	2292761	2292766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222267
33613	NC_019702	TGC	2	6	2292784	2292789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222267
33614	NC_019702	ATTA	2	8	2292832	2292839	50 %	50 %	0 %	0 %	428222267
33615	NC_019702	CG	3	6	2292870	2292875	0 %	0 %	50 %	50 %	428222267
33616	NC_019702	GCT	2	6	2292906	2292911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222267
33617	NC_019702	TCT	2	6	2292938	2292943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222267
33618	NC_019702	GCT	3	9	2292959	2292967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222267
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33718	NC_019702	AT	3	6	2299335	2299340	50 %	50 %	0 %	0 %	428222272
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33729	NC_019702	ATG	2	6	2300302	2300307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222273
33730	NC_019702	GGC	2	6	2300457	2300462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222273
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33732	NC_019702	GAT	2	6	2301025	2301030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222274
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33952	NC_019702	AAGGT	2	10	2314884	2314893	40 %	20 %	40 %	0 %	428222285
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33955	NC_019702	TAG	2	6	2315089	2315094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222285
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33967	NC_019702	CGT	2	6	2315639	2315644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222285
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