MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_019702	GTCA	2	8	2180191	2180198	25 %	25 %	25 %	25 %	428222152
32002	NC_019702	T	6	6	2180202	2180207	0 %	100 %	0 %	0 %	428222152
32003	NC_019702	TGATG	2	10	2180238	2180247	20 %	40 %	40 %	0 %	428222152
32004	NC_019702	T	6	6	2180248	2180253	0 %	100 %	0 %	0 %	428222152
32005	NC_019702	TGC	3	9	2180256	2180264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222152
32006	NC_019702	ATT	2	6	2180278	2180283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222152
32007	NC_019702	TGA	2	6	2180322	2180327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222152
32008	NC_019702	GCC	2	6	2180395	2180400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222152
32009	NC_019702	ATTA	2	8	2180483	2180490	50 %	50 %	0 %	0 %	428222152
32010	NC_019702	TAT	2	6	2180567	2180572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222153
32011	NC_019702	TTCTGA	2	12	2180586	2180597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428222153
32012	NC_019702	AG	3	6	2180599	2180604	50 %	0 %	50 %	0 %	428222153
32013	NC_019702	GCCTCT	2	12	2180617	2180628	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428222153
32014	NC_019702	TTC	2	6	2180703	2180708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222153
32015	NC_019702	CAG	2	6	2180756	2180761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222153
32016	NC_019702	A	7	7	2180995	2181001	100 %	0 %	0 %	0 %	428222154
32017	NC_019702	ATT	2	6	2181047	2181052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222154
32018	NC_019702	TTC	2	6	2181125	2181130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222154
32019	NC_019702	CA	3	6	2181180	2181185	50 %	0 %	0 %	50 %	428222154
32020	NC_019702	AG	4	8	2181237	2181244	50 %	0 %	50 %	0 %	428222154
32021	NC_019702	ATT	2	6	2181283	2181288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222154
32022	NC_019702	CTT	2	6	2181311	2181316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222154
32023	NC_019702	TGC	2	6	2181321	2181326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222154
32024	NC_019702	GCT	2	6	2181385	2181390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222154
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32029	NC_019702	A	6	6	2181613	2181618	100 %	0 %	0 %	0 %	428222154
32030	NC_019702	AT	3	6	2181705	2181710	50 %	50 %	0 %	0 %	428222154
32031	NC_019702	CAG	2	6	2181748	2181753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222154
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32034	NC_019702	A	6	6	2181851	2181856	100 %	0 %	0 %	0 %	428222154
32035	NC_019702	A	6	6	2181868	2181873	100 %	0 %	0 %	0 %	428222154
32036	NC_019702	TGGC	2	8	2181885	2181892	0 %	25 %	50 %	25 %	428222154
32037	NC_019702	GGT	2	6	2181895	2181900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222154
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32039	NC_019702	CAG	2	6	2182014	2182019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222155
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32041	NC_019702	TTG	2	6	2182117	2182122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222155
32042	NC_019702	AAT	2	6	2182177	2182182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222155
32043	NC_019702	CGC	2	6	2182204	2182209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222155
32044	NC_019702	TTGG	2	8	2182228	2182235	0 %	50 %	50 %	0 %	428222155
32045	NC_019702	GCC	3	9	2182258	2182266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222155
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32047	NC_019702	ACT	3	9	2182367	2182375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222155
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32050	NC_019702	TAACT	2	10	2182547	2182556	40 %	40 %	0 %	20 %	428222156
32051	NC_019702	TGGG	2	8	2182636	2182643	0 %	25 %	75 %	0 %	428222156
32052	NC_019702	GTG	2	6	2182851	2182856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222156
32053	NC_019702	GTG	2	6	2182866	2182871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222156
32054	NC_019702	ATG	2	6	2182872	2182877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222156
32055	NC_019702	TCGTGA	2	12	2182879	2182890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428222156
32056	NC_019702	TTGA	2	8	2182937	2182944	25 %	50 %	25 %	0 %	428222156
32057	NC_019702	TAC	2	6	2183013	2183018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222156
32058	NC_019702	T	8	8	2183049	2183056	0 %	100 %	0 %	0 %	428222156
32059	NC_019702	TTA	2	6	2183059	2183064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222156
32060	NC_019702	TGA	2	6	2183117	2183122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222156
32061	NC_019702	ATG	2	6	2183125	2183130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222156
32062	NC_019702	CATA	2	8	2183135	2183142	50 %	25 %	0 %	25 %	428222156
32063	NC_019702	TGT	2	6	2183233	2183238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222156
32064	NC_019702	CTA	2	6	2183351	2183356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222156
32065	NC_019702	CAT	2	6	2183360	2183365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222156
32066	NC_019702	GCA	2	6	2183373	2183378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222156
32067	NC_019702	CAT	2	6	2183400	2183405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222156
32068	NC_019702	TAAG	2	8	2183510	2183517	50 %	25 %	25 %	0 %	428222156
32069	NC_019702	A	6	6	2183536	2183541	100 %	0 %	0 %	0 %	428222156
32070	NC_019702	TTGG	2	8	2183595	2183602	0 %	50 %	50 %	0 %	428222156
32071	NC_019702	GTT	2	6	2183801	2183806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222157
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32077	NC_019702	TTTA	2	8	2184230	2184237	25 %	75 %	0 %	0 %	428222157
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32086	NC_019702	CTT	2	6	2185002	2185007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222158
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32089	NC_019702	GC	3	6	2185308	2185313	0 %	0 %	50 %	50 %	428222158
32090	NC_019702	AAT	2	6	2185336	2185341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222158
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32093	NC_019702	TTC	2	6	2185702	2185707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222159
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32099	NC_019702	TAAA	2	8	2185995	2186002	75 %	25 %	0 %	0 %	428222159
32100	NC_019702	A	6	6	2186050	2186055	100 %	0 %	0 %	0 %	428222159
32101	NC_019702	ATA	2	6	2186066	2186071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222159
32102	NC_019702	ATG	2	6	2186200	2186205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222160
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32109	NC_019702	A	7	7	2186536	2186542	100 %	0 %	0 %	0 %	428222160
32110	NC_019702	AAC	2	6	2186567	2186572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222160
32111	NC_019702	ACT	2	6	2186670	2186675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222160
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32113	NC_019702	TTAA	2	8	2186730	2186737	50 %	50 %	0 %	0 %	428222160
32114	NC_019702	A	6	6	2186787	2186792	100 %	0 %	0 %	0 %	428222160
32115	NC_019702	A	8	8	2186853	2186860	100 %	0 %	0 %	0 %	428222160
32116	NC_019702	GAA	2	6	2186886	2186891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222160
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32118	NC_019702	TCA	2	6	2187071	2187076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222160
32119	NC_019702	GGGA	2	8	2187214	2187221	25 %	0 %	75 %	0 %	428222160
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32219	NC_019702	ATA	2	6	2194912	2194917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222167
32220	NC_019702	A	6	6	2194950	2194955	100 %	0 %	0 %	0 %	428222167
32221	NC_019702	CTA	2	6	2194956	2194961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222167
32222	NC_019702	GCC	2	6	2194971	2194976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222167
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32226	NC_019702	T	6	6	2195500	2195505	0 %	100 %	0 %	0 %	428222168
32227	NC_019702	TCC	2	6	2195579	2195584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222168
32228	NC_019702	TTCAT	2	10	2195625	2195634	20 %	60 %	0 %	20 %	428222168
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32230	NC_019702	AGCG	2	8	2195767	2195774	25 %	0 %	50 %	25 %	428222168
32231	NC_019702	GTT	2	6	2195785	2195790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222168
32232	NC_019702	TCC	2	6	2195795	2195800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222168
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32341	NC_019702	T	6	6	2203303	2203308	0 %	100 %	0 %	0 %	428222177
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32350	NC_019702	ACC	2	6	2204104	2204109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222179
32351	NC_019702	TAA	2	6	2204155	2204160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222179
32352	NC_019702	TGC	2	6	2204234	2204239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222179
32353	NC_019702	CAA	2	6	2204271	2204276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222179
32354	NC_019702	TTCTGA	2	12	2204305	2204316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428222179
32355	NC_019702	TA	3	6	2204433	2204438	50 %	50 %	0 %	0 %	428222179
32356	NC_019702	TTC	2	6	2204485	2204490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222179
32357	NC_019702	AAAAT	2	10	2204494	2204503	80 %	20 %	0 %	0 %	428222179
32358	NC_019702	TAAA	2	8	2204508	2204515	75 %	25 %	0 %	0 %	428222179
32359	NC_019702	AATAGC	2	12	2204647	2204658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428222179
32360	NC_019702	CAT	2	6	2204695	2204700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222179
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32362	NC_019702	CTAA	2	8	2204985	2204992	50 %	25 %	0 %	25 %	428222180
32363	NC_019702	TGG	2	6	2204993	2204998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222180
32364	NC_019702	ACT	2	6	2205007	2205012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222180
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32366	NC_019702	CTA	2	6	2205139	2205144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222180
32367	NC_019702	TTGA	2	8	2205160	2205167	25 %	50 %	25 %	0 %	428222180
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32369	NC_019702	TGT	2	6	2205230	2205235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222181
32370	NC_019702	GGT	2	6	2205284	2205289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222181
32371	NC_019702	CTT	2	6	2205435	2205440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222181
32372	NC_019702	AGCTTG	2	12	2205460	2205471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428222181
32373	NC_019702	TTA	2	6	2205497	2205502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222181
32374	NC_019702	GCCA	2	8	2205532	2205539	25 %	0 %	25 %	50 %	428222181
32375	NC_019702	AATA	2	8	2205577	2205584	75 %	25 %	0 %	0 %	428222181
32376	NC_019702	ATC	2	6	2205604	2205609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222181
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32378	NC_019702	AG	3	6	2205832	2205837	50 %	0 %	50 %	0 %	428222181
32379	NC_019702	CAC	2	6	2205856	2205861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222181
32380	NC_019702	AATC	2	8	2205888	2205895	50 %	25 %	0 %	25 %	428222181
32381	NC_019702	A	6	6	2205979	2205984	100 %	0 %	0 %	0 %	428222181
32382	NC_019702	AGA	2	6	2206083	2206088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222182
32383	NC_019702	TGCC	2	8	2206102	2206109	0 %	25 %	25 %	50 %	428222182
32384	NC_019702	CAC	3	9	2206128	2206136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222182
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32387	NC_019702	CTT	2	6	2206316	2206321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222182
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32390	NC_019702	A	6	6	2206510	2206515	100 %	0 %	0 %	0 %	428222182
32391	NC_019702	TAATA	2	10	2206570	2206579	60 %	40 %	0 %	0 %	428222182
32392	NC_019702	CTT	2	6	2206591	2206596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222182
32393	NC_019702	CAAAG	2	10	2206650	2206659	60 %	0 %	20 %	20 %	428222182
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32400	NC_019702	TGG	2	6	2207283	2207288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222183
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32406	NC_019702	CTTA	2	8	2207485	2207492	25 %	50 %	0 %	25 %	428222183
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32410	NC_019702	TTA	2	6	2207631	2207636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222183
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32414	NC_019702	TGC	2	6	2207818	2207823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222183
32415	NC_019702	TGT	2	6	2207830	2207835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222183
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32422	NC_019702	ATT	2	6	2208400	2208405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222184
32423	NC_019702	GCA	2	6	2208442	2208447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222184
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32425	NC_019702	ATG	2	6	2208583	2208588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222184
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32432	NC_019702	ACA	2	6	2209005	2209010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222185
32433	NC_019702	TGC	2	6	2209048	2209053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222185
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32435	NC_019702	CCCT	2	8	2209240	2209247	0 %	25 %	0 %	75 %	428222185
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32439	NC_019702	TGC	2	6	2209475	2209480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222185
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32441	NC_019702	CTTT	2	8	2209628	2209635	0 %	75 %	0 %	25 %	428222186
32442	NC_019702	G	7	7	2209676	2209682	0 %	0 %	100 %	0 %	428222186
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32451	NC_019702	GTTG	2	8	2210283	2210290	0 %	50 %	50 %	0 %	428222186
32452	NC_019702	CAT	2	6	2210353	2210358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222186
32453	NC_019702	TGCT	2	8	2210474	2210481	0 %	50 %	25 %	25 %	428222186
32454	NC_019702	TTG	2	6	2210560	2210565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222186
32455	NC_019702	CAT	2	6	2210601	2210606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222186
32456	NC_019702	G	6	6	2210617	2210622	0 %	0 %	100 %	0 %	428222186
32457	NC_019702	GGC	2	6	2210824	2210829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222186
32458	NC_019702	TTG	2	6	2210854	2210859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222186
32459	NC_019702	CAA	2	6	2210863	2210868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222186
32460	NC_019702	ATA	2	6	2210999	2211004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222186
32461	NC_019702	GCT	2	6	2211061	2211066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222186
32462	NC_019702	A	6	6	2211238	2211243	100 %	0 %	0 %	0 %	428222187
32463	NC_019702	AAC	2	6	2211269	2211274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222187
32464	NC_019702	CTT	2	6	2211448	2211453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222187
32465	NC_019702	CA	3	6	2211499	2211504	50 %	0 %	0 %	50 %	428222187
32466	NC_019702	ACG	2	6	2211683	2211688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222187
32467	NC_019702	GCAT	2	8	2211726	2211733	25 %	25 %	25 %	25 %	428222187
32468	NC_019702	CTGA	2	8	2211787	2211794	25 %	25 %	25 %	25 %	428222187
32469	NC_019702	GAG	2	6	2211835	2211840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222187
32470	NC_019702	CTG	2	6	2211883	2211888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222187
32471	NC_019702	CATA	2	8	2211895	2211902	50 %	25 %	0 %	25 %	428222187
32472	NC_019702	GCA	2	6	2212059	2212064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222187
32473	NC_019702	AGA	2	6	2212109	2212114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222187
32474	NC_019702	TCA	2	6	2212215	2212220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222187
32475	NC_019702	GTA	2	6	2212226	2212231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222187
32476	NC_019702	TAA	2	6	2212272	2212277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222188
32477	NC_019702	ATG	2	6	2212455	2212460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222189
32478	NC_019702	TTG	2	6	2212487	2212492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222189
32479	NC_019702	CCG	2	6	2212666	2212671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222189
32480	NC_019702	TAAA	2	8	2212711	2212718	75 %	25 %	0 %	0 %	428222189
32481	NC_019702	ACT	2	6	2212737	2212742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222189
32482	NC_019702	AAT	2	6	2212838	2212843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222189
32483	NC_019702	C	6	6	2212851	2212856	0 %	0 %	0 %	100 %	428222189
32484	NC_019702	TTC	2	6	2212859	2212864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222189
32485	NC_019702	ACC	2	6	2212865	2212870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222189
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32487	NC_019702	GCT	2	6	2212953	2212958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222189
32488	NC_019702	T	6	6	2213006	2213011	0 %	100 %	0 %	0 %	428222189
32489	NC_019702	AAT	2	6	2213040	2213045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222189
32490	NC_019702	TCA	2	6	2213082	2213087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222189
32491	NC_019702	C	6	6	2213198	2213203	0 %	0 %	0 %	100 %	428222189
32492	NC_019702	GGTA	2	8	2213221	2213228	25 %	25 %	50 %	0 %	428222189
32493	NC_019702	CAT	2	6	2213302	2213307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222189
32494	NC_019702	TAAA	2	8	2213358	2213365	75 %	25 %	0 %	0 %	428222189
32495	NC_019702	AAATT	2	10	2213398	2213407	60 %	40 %	0 %	0 %	428222189
32496	NC_019702	AT	3	6	2213505	2213510	50 %	50 %	0 %	0 %	428222189
32497	NC_019702	TGGC	2	8	2213538	2213545	0 %	25 %	50 %	25 %	428222189
32498	NC_019702	CCG	2	6	2213563	2213568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222189
32499	NC_019702	AGC	2	6	2213582	2213587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222189
32500	NC_019702	CAA	2	6	2213620	2213625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222189

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