MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019702	GGTA	2	8	165625	165632	25 %	25 %	50 %	0 %	428220304
2502	NC_019702	TCA	2	6	165642	165647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220304
2503	NC_019702	TGT	2	6	165667	165672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220304
2504	NC_019702	TCA	2	6	165690	165695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220304
2505	NC_019702	CATC	2	8	165957	165964	25 %	25 %	0 %	50 %	428220305
2506	NC_019702	CAA	2	6	165985	165990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220305
2507	NC_019702	ATC	2	6	166003	166008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220305
2508	NC_019702	TCA	2	6	166100	166105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220305
2509	NC_019702	GCC	2	6	166121	166126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220305
2510	NC_019702	TCA	3	9	166139	166147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220305
2511	NC_019702	TCT	2	6	166164	166169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2512	NC_019702	TAT	2	6	166218	166223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220305
2513	NC_019702	AC	3	6	166326	166331	50 %	0 %	0 %	50 %	428220305
2514	NC_019702	ATG	2	6	166424	166429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220305
2515	NC_019702	CAGT	2	8	166536	166543	25 %	25 %	25 %	25 %	428220305
2516	NC_019702	CTG	2	6	166557	166562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2517	NC_019702	GCG	2	6	166588	166593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220305
2518	NC_019702	CTT	2	6	166665	166670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2519	NC_019702	GAC	2	6	166704	166709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2520	NC_019702	CCA	2	6	166717	166722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220305
2521	NC_019702	GAA	2	6	166753	166758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220305
2522	NC_019702	TTC	2	6	166822	166827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2523	NC_019702	GAT	2	6	166836	166841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220305
2524	NC_019702	GCA	2	6	166850	166855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2525	NC_019702	CTT	2	6	166881	166886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2526	NC_019702	TTCT	2	8	166891	166898	0 %	75 %	0 %	25 %	428220305
2527	NC_019702	TTGA	2	8	166915	166922	25 %	50 %	25 %	0 %	428220305
2528	NC_019702	CAC	2	6	166968	166973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220305
2529	NC_019702	AAT	2	6	167172	167177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220305
2530	NC_019702	CTG	2	6	167299	167304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2531	NC_019702	TCT	2	6	167339	167344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2532	NC_019702	GAA	2	6	167345	167350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220305
2533	NC_019702	CTT	2	6	167369	167374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2534	NC_019702	CGG	2	6	167400	167405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220305
2535	NC_019702	GCA	2	6	167422	167427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2536	NC_019702	GAC	2	6	167445	167450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2537	NC_019702	CCG	2	6	167519	167524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220305
2538	NC_019702	TCG	2	6	167606	167611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2539	NC_019702	GGC	2	6	167655	167660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220305
2540	NC_019702	CAA	3	9	167667	167675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220305
2541	NC_019702	GTT	2	6	167727	167732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220305
2542	NC_019702	CCA	2	6	167825	167830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220305
2543	NC_019702	CAT	2	6	167857	167862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220305
2544	NC_019702	TAGTGC	2	12	167892	167903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428220305
2545	NC_019702	ACC	2	6	167950	167955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220305
2546	NC_019702	GCT	2	6	167991	167996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2547	NC_019702	A	6	6	168127	168132	100 %	0 %	0 %	0 %	428220305
2548	NC_019702	AGC	2	6	168142	168147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220305
2549	NC_019702	CTT	2	6	168171	168176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220305
2550	NC_019702	GTG	2	6	168476	168481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220306
2551	NC_019702	TAA	2	6	168504	168509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220306
2552	NC_019702	GGAA	2	8	168528	168535	50 %	0 %	50 %	0 %	428220306
2553	NC_019702	TTATGC	2	12	168560	168571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220306
2554	NC_019702	AGT	2	6	168668	168673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220306
2555	NC_019702	AATT	2	8	168771	168778	50 %	50 %	0 %	0 %	428220307
2556	NC_019702	TTAA	2	8	168785	168792	50 %	50 %	0 %	0 %	428220307
2557	NC_019702	TGC	2	6	168823	168828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220307
2558	NC_019702	TTA	2	6	168854	168859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220307
2559	NC_019702	ATTA	2	8	168919	168926	50 %	50 %	0 %	0 %	428220307
2560	NC_019702	TGTC	2	8	168977	168984	0 %	50 %	25 %	25 %	428220307
2561	NC_019702	TAAGT	2	10	169207	169216	40 %	40 %	20 %	0 %	428220307
2562	NC_019702	AGGT	2	8	169400	169407	25 %	25 %	50 %	0 %	428220308
2563	NC_019702	TTA	2	6	169525	169530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220308
2564	NC_019702	AGTTT	2	10	169546	169555	20 %	60 %	20 %	0 %	428220308
2565	NC_019702	ATCA	2	8	169610	169617	50 %	25 %	0 %	25 %	428220308
2566	NC_019702	ATC	2	6	169638	169643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220308
2567	NC_019702	TC	3	6	169661	169666	0 %	50 %	0 %	50 %	428220308
2568	NC_019702	AAG	2	6	169681	169686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220308
2569	NC_019702	AGA	2	6	169725	169730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220308
2570	NC_019702	T	6	6	169789	169794	0 %	100 %	0 %	0 %	428220308
2571	NC_019702	TAA	2	6	169854	169859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220308
2572	NC_019702	TCC	2	6	169861	169866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220308
2573	NC_019702	AAT	2	6	169873	169878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220308
2574	NC_019702	TGGC	2	8	169885	169892	0 %	25 %	50 %	25 %	428220308
2575	NC_019702	TGA	3	9	169908	169916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220308
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2578	NC_019702	AAAG	2	8	170045	170052	75 %	0 %	25 %	0 %	428220308
2579	NC_019702	GTC	2	6	170087	170092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220308
2580	NC_019702	TA	3	6	170138	170143	50 %	50 %	0 %	0 %	428220308
2581	NC_019702	ATT	2	6	170174	170179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220308
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2583	NC_019702	ATTA	2	8	170311	170318	50 %	50 %	0 %	0 %	428220309
2584	NC_019702	TACAAA	2	12	170371	170382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428220309
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2586	NC_019702	GAT	2	6	170506	170511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220309
2587	NC_019702	GCTAA	2	10	170582	170591	40 %	20 %	20 %	20 %	428220309
2588	NC_019702	TCA	2	6	170669	170674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220309
2589	NC_019702	TCC	2	6	170848	170853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220309
2590	NC_019702	TTGA	2	8	170923	170930	25 %	50 %	25 %	0 %	428220309
2591	NC_019702	ATG	2	6	171022	171027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220309
2592	NC_019702	AGC	2	6	171160	171165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220309
2593	NC_019702	GTAA	2	8	171170	171177	50 %	25 %	25 %	0 %	428220309
2594	NC_019702	TA	3	6	171184	171189	50 %	50 %	0 %	0 %	428220309
2595	NC_019702	CTT	2	6	171246	171251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220309
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2599	NC_019702	TACA	2	8	171666	171673	50 %	25 %	0 %	25 %	428220310
2600	NC_019702	TCTT	2	8	172050	172057	0 %	75 %	0 %	25 %	428220311
2601	NC_019702	AGTTC	2	10	172067	172076	20 %	40 %	20 %	20 %	428220311
2602	NC_019702	AGT	2	6	172091	172096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220311
2603	NC_019702	ATC	2	6	172143	172148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220311
2604	NC_019702	ATT	2	6	172221	172226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220311
2605	NC_019702	CCG	2	6	172249	172254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220311
2606	NC_019702	ATG	2	6	172282	172287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220311
2607	NC_019702	CAT	2	6	172315	172320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220311
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2609	NC_019702	AGC	2	6	172584	172589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220312
2610	NC_019702	CGC	2	6	172617	172622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220312
2611	NC_019702	CAGT	2	8	172655	172662	25 %	25 %	25 %	25 %	428220312
2612	NC_019702	CTA	2	6	172669	172674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220312
2613	NC_019702	CAA	2	6	172680	172685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220312
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2615	NC_019702	TCA	2	6	172814	172819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220312
2616	NC_019702	TGC	2	6	172828	172833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220312
2617	NC_019702	AACAT	2	10	173024	173033	60 %	20 %	0 %	20 %	428220312
2618	NC_019702	CGG	2	6	173076	173081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220312
2619	NC_019702	ACC	2	6	173137	173142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220312
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2621	NC_019702	ACA	2	6	173195	173200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220312
2622	NC_019702	TTG	2	6	173201	173206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220312
2623	NC_019702	CAA	2	6	173253	173258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220312
2624	NC_019702	CTT	2	6	173274	173279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220312
2625	NC_019702	AGT	2	6	173295	173300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220312
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2634	NC_019702	TAGCT	2	10	173995	174004	20 %	40 %	20 %	20 %	428220313
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2743	NC_019702	ATT	2	6	181849	181854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220319
2744	NC_019702	TGA	2	6	181885	181890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220319
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2746	NC_019702	A	6	6	181946	181951	100 %	0 %	0 %	0 %	428220319
2747	NC_019702	AC	3	6	181987	181992	50 %	0 %	0 %	50 %	428220319
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2751	NC_019702	T	6	6	182344	182349	0 %	100 %	0 %	0 %	428220320
2752	NC_019702	ATC	2	6	182357	182362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
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2848	NC_019702	GTACT	2	10	188252	188261	20 %	40 %	20 %	20 %	428220324
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2851	NC_019702	CAA	2	6	188372	188377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220324
2852	NC_019702	TAA	2	6	188403	188408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220324
2853	NC_019702	AAT	2	6	188409	188414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220324
2854	NC_019702	A	6	6	188508	188513	100 %	0 %	0 %	0 %	428220324
2855	NC_019702	TAA	2	6	188526	188531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220324
2856	NC_019702	TTGT	2	8	188537	188544	0 %	75 %	25 %	0 %	428220324
2857	NC_019702	CTT	2	6	188609	188614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220324
2858	NC_019702	ACTGG	2	10	188746	188755	20 %	20 %	40 %	20 %	428220325
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2860	NC_019702	CTG	2	6	188880	188885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220325
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2862	NC_019702	CAC	2	6	188987	188992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220325
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2984	NC_019702	GCA	2	6	196245	196250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220335
2985	NC_019702	GATTTA	2	12	196261	196272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428220335
2986	NC_019702	TCA	2	6	196308	196313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220335
2987	NC_019702	GTT	2	6	196349	196354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220335
2988	NC_019702	GGT	2	6	196408	196413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220335
2989	NC_019702	TAC	2	6	196445	196450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220335
2990	NC_019702	ATTTT	2	10	196462	196471	20 %	80 %	0 %	0 %	428220335
2991	NC_019702	AGA	2	6	196507	196512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220335
2992	NC_019702	ATT	2	6	196525	196530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220335
2993	NC_019702	AAC	2	6	196566	196571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220335
2994	NC_019702	GAA	2	6	196582	196587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220335
2995	NC_019702	AAT	2	6	196621	196626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220335
2996	NC_019702	CCG	2	6	196652	196657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220335
2997	NC_019702	AGT	3	9	196683	196691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220335
2998	NC_019702	CAA	2	6	196705	196710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220335
2999	NC_019702	AGA	2	6	196806	196811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220335
3000	NC_019702	GCA	2	6	196951	196956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220336

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