MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_019702	AT	3	6	1830130	1830135	50 %	50 %	0 %	0 %	428221831
27002	NC_019702	CTGG	2	8	1830187	1830194	0 %	25 %	50 %	25 %	428221831
27003	NC_019702	CTG	2	6	1830252	1830257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27004	NC_019702	GAC	2	6	1830338	1830343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27005	NC_019702	GGTTT	2	10	1830422	1830431	0 %	60 %	40 %	0 %	428221831
27006	NC_019702	GGC	2	6	1830530	1830535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221831
27007	NC_019702	ATC	2	6	1830651	1830656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221831
27008	NC_019702	TGC	2	6	1830667	1830672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27009	NC_019702	TGG	2	6	1830699	1830704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221831
27010	NC_019702	GAA	2	6	1830731	1830736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221831
27011	NC_019702	CGC	2	6	1830920	1830925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221831
27012	NC_019702	C	6	6	1830970	1830975	0 %	0 %	0 %	100 %	428221831
27013	NC_019702	GCC	2	6	1830998	1831003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221831
27014	NC_019702	TCCA	2	8	1831022	1831029	25 %	25 %	0 %	50 %	428221831
27015	NC_019702	CCG	2	6	1831080	1831085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221831
27016	NC_019702	GCC	2	6	1831157	1831162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221831
27017	NC_019702	GAA	2	6	1831184	1831189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221831
27018	NC_019702	CAC	2	6	1831373	1831378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221831
27019	NC_019702	TAC	2	6	1831391	1831396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221831
27020	NC_019702	TCAA	2	8	1831404	1831411	50 %	25 %	0 %	25 %	428221831
27021	NC_019702	TAC	2	6	1831541	1831546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221831
27022	NC_019702	TAA	2	6	1831552	1831557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221831
27023	NC_019702	CGA	2	6	1831569	1831574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27024	NC_019702	AATT	2	8	1831668	1831675	50 %	50 %	0 %	0 %	428221831
27025	NC_019702	GAA	2	6	1831808	1831813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221831
27026	NC_019702	ACA	2	6	1831818	1831823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221831
27027	NC_019702	ATT	2	6	1831988	1831993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221831
27028	NC_019702	CAA	2	6	1832073	1832078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221831
27029	NC_019702	AAAGCT	2	12	1832117	1832128	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428221831
27030	NC_019702	TGG	2	6	1832308	1832313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221831
27031	NC_019702	AT	3	6	1832338	1832343	50 %	50 %	0 %	0 %	428221831
27032	NC_019702	TGG	2	6	1832356	1832361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221831
27033	NC_019702	TGC	2	6	1832385	1832390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27034	NC_019702	TGC	2	6	1832440	1832445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27035	NC_019702	GCT	2	6	1832453	1832458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27036	NC_019702	ACT	2	6	1832476	1832481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221831
27037	NC_019702	ATA	2	6	1832550	1832555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221831
27038	NC_019702	TGG	2	6	1832595	1832600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221831
27039	NC_019702	AGA	2	6	1832659	1832664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221831
27040	NC_019702	TGT	2	6	1832686	1832691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221831
27041	NC_019702	TCA	2	6	1832724	1832729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221831
27042	NC_019702	GCA	2	6	1832765	1832770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27043	NC_019702	TGA	2	6	1832776	1832781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221831
27044	NC_019702	AGA	2	6	1832827	1832832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221831
27045	NC_019702	GAA	3	9	1832939	1832947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221831
27046	NC_019702	CCTTCG	2	12	1832976	1832987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428221831
27047	NC_019702	CAA	2	6	1833008	1833013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221831
27048	NC_019702	ACT	2	6	1833102	1833107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221831
27049	NC_019702	CCAA	2	8	1833119	1833126	50 %	0 %	0 %	50 %	428221831
27050	NC_019702	GCT	2	6	1833247	1833252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27051	NC_019702	ATG	2	6	1833387	1833392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221831
27052	NC_019702	TTG	2	6	1833459	1833464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221831
27053	NC_019702	TGC	2	6	1833525	1833530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221831
27054	NC_019702	AACTA	2	10	1834096	1834105	60 %	20 %	0 %	20 %	428221832
27055	NC_019702	TGA	2	6	1834139	1834144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
27056	NC_019702	CTT	3	9	1834145	1834153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27057	NC_019702	AGC	2	6	1834197	1834202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221832
27058	NC_019702	GA	3	6	1834280	1834285	50 %	0 %	50 %	0 %	428221832
27059	NC_019702	ATCC	2	8	1834295	1834302	25 %	25 %	0 %	50 %	428221832
27060	NC_019702	AGA	2	6	1834325	1834330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221832
27061	NC_019702	CG	3	6	1834350	1834355	0 %	0 %	50 %	50 %	428221832
27062	NC_019702	AGT	2	6	1834479	1834484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
27063	NC_019702	GCA	2	6	1834516	1834521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221832
27064	NC_019702	TGC	2	6	1834766	1834771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221832
27065	NC_019702	AGT	2	6	1835001	1835006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
27066	NC_019702	GGAT	2	8	1835018	1835025	25 %	25 %	50 %	0 %	428221832
27067	NC_019702	TCA	2	6	1835101	1835106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221832
27068	NC_019702	ATA	2	6	1835138	1835143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221832
27069	NC_019702	TCA	3	9	1835155	1835163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221832
27070	NC_019702	CTT	3	9	1835177	1835185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27071	NC_019702	CT	4	8	1835222	1835229	0 %	50 %	0 %	50 %	428221832
27072	NC_019702	CAT	2	6	1835246	1835251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221832
27073	NC_019702	ATA	2	6	1835263	1835268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221832
27074	NC_019702	TGA	2	6	1835281	1835286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
27075	NC_019702	GCAC	2	8	1835290	1835297	25 %	0 %	25 %	50 %	428221832
27076	NC_019702	ATCA	2	8	1835421	1835428	50 %	25 %	0 %	25 %	428221832
27077	NC_019702	ATATCT	2	12	1835446	1835457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428221832
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27081	NC_019702	CAA	2	6	1835609	1835614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221832
27082	NC_019702	AAT	2	6	1835661	1835666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221832
27083	NC_019702	CTT	2	6	1835734	1835739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27084	NC_019702	TC	3	6	1835845	1835850	0 %	50 %	0 %	50 %	428221832
27085	NC_019702	T	6	6	1835852	1835857	0 %	100 %	0 %	0 %	428221832
27086	NC_019702	CTG	2	6	1835907	1835912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221832
27087	NC_019702	TCTTGA	2	12	1835920	1835931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428221832
27088	NC_019702	CAA	2	6	1835934	1835939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221832
27089	NC_019702	CTTG	2	8	1836024	1836031	0 %	50 %	25 %	25 %	428221832
27090	NC_019702	GTA	2	6	1836101	1836106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
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27094	NC_019702	T	6	6	1836141	1836146	0 %	100 %	0 %	0 %	428221832
27095	NC_019702	AGG	2	6	1836156	1836161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221832
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27098	NC_019702	ATT	2	6	1836244	1836249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221832
27099	NC_019702	TCA	2	6	1836256	1836261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221832
27100	NC_019702	TAG	2	6	1836269	1836274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
27101	NC_019702	AGT	2	6	1836285	1836290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221832
27102	NC_019702	TTC	2	6	1836339	1836344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
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27105	NC_019702	TCA	2	6	1836400	1836405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221832
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27109	NC_019702	GTT	2	6	1836524	1836529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221832
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27112	NC_019702	TTC	2	6	1836618	1836623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27113	NC_019702	TTC	2	6	1836657	1836662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27114	NC_019702	CTC	2	6	1836666	1836671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221832
27115	NC_019702	TCA	2	6	1836679	1836684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221832
27116	NC_019702	TTC	2	6	1836711	1836716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27117	NC_019702	TTC	2	6	1836750	1836755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221832
27118	NC_019702	CTC	2	6	1836759	1836764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221832
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27120	NC_019702	CTC	2	6	1836852	1836857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221832
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27349	NC_019702	TAA	2	6	1855606	1855611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221845
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27351	NC_019702	GGA	2	6	1855639	1855644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221845
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27456	NC_019702	GGGA	2	8	1862631	1862638	25 %	0 %	75 %	0 %	428221855
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27462	NC_019702	GA	3	6	1862817	1862822	50 %	0 %	50 %	0 %	428221855
27463	NC_019702	T	6	6	1862839	1862844	0 %	100 %	0 %	0 %	428221855
27464	NC_019702	A	6	6	1862854	1862859	100 %	0 %	0 %	0 %	428221855
27465	NC_019702	AG	3	6	1862883	1862888	50 %	0 %	50 %	0 %	428221855
27466	NC_019702	TGA	2	6	1862931	1862936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221855
27467	NC_019702	GCCT	2	8	1863006	1863013	0 %	25 %	25 %	50 %	428221855
27468	NC_019702	ATAA	2	8	1863080	1863087	75 %	25 %	0 %	0 %	428221855
27469	NC_019702	AAAT	2	8	1863311	1863318	75 %	25 %	0 %	0 %	428221856
27470	NC_019702	GCT	2	6	1863429	1863434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221856
27471	NC_019702	AAGG	2	8	1863549	1863556	50 %	0 %	50 %	0 %	428221856
27472	NC_019702	TACAG	2	10	1863560	1863569	40 %	20 %	20 %	20 %	428221856
27473	NC_019702	GTCC	2	8	1863936	1863943	0 %	25 %	25 %	50 %	428221856
27474	NC_019702	GCTCAA	2	12	1863960	1863971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428221856
27475	NC_019702	CAAA	2	8	1864121	1864128	75 %	0 %	0 %	25 %	428221856
27476	NC_019702	ATG	2	6	1864264	1864269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221856
27477	NC_019702	CTG	2	6	1864285	1864290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221856
27478	NC_019702	TAG	2	6	1864309	1864314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221856
27479	NC_019702	TGA	2	6	1864331	1864336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221856
27480	NC_019702	TAGT	2	8	1864388	1864395	25 %	50 %	25 %	0 %	428221856
27481	NC_019702	AAC	2	6	1864666	1864671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221857
27482	NC_019702	AAAT	2	8	1864736	1864743	75 %	25 %	0 %	0 %	428221857
27483	NC_019702	GCA	2	6	1864825	1864830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221857
27484	NC_019702	GATG	2	8	1864833	1864840	25 %	25 %	50 %	0 %	428221857
27485	NC_019702	CAGT	2	8	1864861	1864868	25 %	25 %	25 %	25 %	428221857
27486	NC_019702	TTAGC	2	10	1864886	1864895	20 %	40 %	20 %	20 %	428221858
27487	NC_019702	T	6	6	1864940	1864945	0 %	100 %	0 %	0 %	428221858
27488	NC_019702	AAT	2	6	1864997	1865002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221858
27489	NC_019702	CTAT	2	8	1865028	1865035	25 %	50 %	0 %	25 %	428221858
27490	NC_019702	T	6	6	1865165	1865170	0 %	100 %	0 %	0 %	428221858
27491	NC_019702	GTA	2	6	1865264	1865269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221858
27492	NC_019702	ATG	2	6	1865279	1865284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221858
27493	NC_019702	GGA	2	6	1865285	1865290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221858
27494	NC_019702	TGC	2	6	1865324	1865329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221858
27495	NC_019702	TAA	2	6	1865336	1865341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221858
27496	NC_019702	ATC	2	6	1865526	1865531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221858
27497	NC_019702	AGT	2	6	1865933	1865938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221858
27498	NC_019702	AT	3	6	1865940	1865945	50 %	50 %	0 %	0 %	428221858
27499	NC_019702	CTG	2	6	1865979	1865984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221858
27500	NC_019702	CCG	2	6	1866030	1866035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221858

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