MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_019702	TGC	2	6	1499687	1499692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221518
22003	NC_019702	TAA	2	6	1499785	1499790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221518
22004	NC_019702	T	6	6	1499830	1499835	0 %	100 %	0 %	0 %	428221518
22005	NC_019702	CTT	2	6	1499838	1499843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221518
22006	NC_019702	AT	3	6	1499871	1499876	50 %	50 %	0 %	0 %	428221518
22007	NC_019702	T	7	7	1499922	1499928	0 %	100 %	0 %	0 %	428221518
22008	NC_019702	TTCT	2	8	1499942	1499949	0 %	75 %	0 %	25 %	428221518
22009	NC_019702	TAGT	2	8	1499975	1499982	25 %	50 %	25 %	0 %	428221518
22010	NC_019702	TTTG	2	8	1500016	1500023	0 %	75 %	25 %	0 %	428221518
22011	NC_019702	TA	3	6	1500055	1500060	50 %	50 %	0 %	0 %	428221518
22012	NC_019702	TTC	2	6	1500092	1500097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221518
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22014	NC_019702	ATC	2	6	1500358	1500363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221519
22015	NC_019702	GTA	2	6	1500449	1500454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221519
22016	NC_019702	ATC	2	6	1500505	1500510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221519
22017	NC_019702	TAG	2	6	1500599	1500604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221519
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22020	NC_019702	GTA	2	6	1500762	1500767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221519
22021	NC_019702	GCT	2	6	1501076	1501081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221519
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22029	NC_019702	T	7	7	1501953	1501959	0 %	100 %	0 %	0 %	428221520
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22055	NC_019702	GAT	2	6	1503907	1503912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221525
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22115	NC_019702	CT	3	6	1508545	1508550	0 %	50 %	0 %	50 %	428221534
22116	NC_019702	ACC	2	6	1508580	1508585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221534
22117	NC_019702	GTCT	2	8	1508608	1508615	0 %	50 %	25 %	25 %	428221534
22118	NC_019702	ATAG	2	8	1508694	1508701	50 %	25 %	25 %	0 %	428221534
22119	NC_019702	CA	3	6	1508733	1508738	50 %	0 %	0 %	50 %	428221534
22120	NC_019702	GCT	2	6	1508755	1508760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221535
22121	NC_019702	CCT	2	6	1508872	1508877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221535
22122	NC_019702	TTC	2	6	1508895	1508900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221535
22123	NC_019702	TGC	4	12	1509009	1509020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221535
22124	NC_019702	T	6	6	1509035	1509040	0 %	100 %	0 %	0 %	428221535
22125	NC_019702	ATT	2	6	1509174	1509179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221536
22126	NC_019702	A	6	6	1509252	1509257	100 %	0 %	0 %	0 %	428221536
22127	NC_019702	AAC	2	6	1509312	1509317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221536
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22129	NC_019702	AAC	2	6	1509359	1509364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221536
22130	NC_019702	GCG	2	6	1509411	1509416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221536
22131	NC_019702	TGC	2	6	1509427	1509432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221536
22132	NC_019702	T	6	6	1509441	1509446	0 %	100 %	0 %	0 %	428221536
22133	NC_019702	GCCTAA	2	12	1509528	1509539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428221536
22134	NC_019702	GAA	2	6	1509577	1509582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221536
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22137	NC_019702	GGC	2	6	1509921	1509926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221537
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22139	NC_019702	GGA	2	6	1510080	1510085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221537
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22141	NC_019702	ATC	2	6	1510234	1510239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221538
22142	NC_019702	AGC	2	6	1510276	1510281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221538
22143	NC_019702	CAA	2	6	1510306	1510311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221538
22144	NC_019702	TAT	2	6	1510356	1510361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221538
22145	NC_019702	GTG	2	6	1510489	1510494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221538
22146	NC_019702	AG	3	6	1510497	1510502	50 %	0 %	50 %	0 %	428221538
22147	NC_019702	CTGA	2	8	1510524	1510531	25 %	25 %	25 %	25 %	428221538
22148	NC_019702	TGC	2	6	1510555	1510560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221538
22149	NC_019702	ATT	2	6	1510706	1510711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221539
22150	NC_019702	CAG	2	6	1510719	1510724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221539
22151	NC_019702	TAC	2	6	1510736	1510741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221539
22152	NC_019702	GCT	2	6	1510755	1510760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221539
22153	NC_019702	ACC	2	6	1510824	1510829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221539
22154	NC_019702	CTA	2	6	1510849	1510854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221539
22155	NC_019702	T	6	6	1510877	1510882	0 %	100 %	0 %	0 %	428221539
22156	NC_019702	TTC	2	6	1510887	1510892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221539
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22174	NC_019702	TGA	2	6	1511587	1511592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221539
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22192	NC_019702	CCA	2	6	1512634	1512639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221540
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22199	NC_019702	TA	3	6	1513189	1513194	50 %	50 %	0 %	0 %	428221542
22200	NC_019702	CAGTG	2	10	1513243	1513252	20 %	20 %	40 %	20 %	428221542
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22202	NC_019702	GTTT	2	8	1513361	1513368	0 %	75 %	25 %	0 %	428221542
22203	NC_019702	CTT	2	6	1513397	1513402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221542
22204	NC_019702	TCTT	2	8	1513405	1513412	0 %	75 %	0 %	25 %	428221542
22205	NC_019702	TGC	2	6	1513748	1513753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221543
22206	NC_019702	CTA	2	6	1513803	1513808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221543
22207	NC_019702	GAA	2	6	1513810	1513815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221543
22208	NC_019702	TCA	2	6	1513831	1513836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221543
22209	NC_019702	CGGA	2	8	1513840	1513847	25 %	0 %	50 %	25 %	428221543
22210	NC_019702	AAC	2	6	1514043	1514048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221543
22211	NC_019702	GAT	2	6	1514137	1514142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221543
22212	NC_019702	CAAA	2	8	1514164	1514171	75 %	0 %	0 %	25 %	428221544
22213	NC_019702	GTG	2	6	1514256	1514261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221544
22214	NC_019702	CAA	2	6	1514276	1514281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221544
22215	NC_019702	TCC	2	6	1514432	1514437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221544
22216	NC_019702	TGA	2	6	1514501	1514506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221544
22217	NC_019702	TGG	2	6	1514531	1514536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221544
22218	NC_019702	ATT	3	9	1514538	1514546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221544
22219	NC_019702	CCTGA	2	10	1514556	1514565	20 %	20 %	20 %	40 %	428221544
22220	NC_019702	ATG	2	6	1514737	1514742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221544
22221	NC_019702	AAG	2	6	1514978	1514983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221545
22222	NC_019702	AGT	2	6	1515014	1515019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22223	NC_019702	TGC	2	6	1515022	1515027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221545
22224	NC_019702	A	6	6	1515079	1515084	100 %	0 %	0 %	0 %	428221545
22225	NC_019702	ATG	2	6	1515131	1515136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22226	NC_019702	TCA	3	9	1515142	1515150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221545
22227	NC_019702	TGAAG	2	10	1515199	1515208	40 %	20 %	40 %	0 %	428221545
22228	NC_019702	A	6	6	1515227	1515232	100 %	0 %	0 %	0 %	428221545
22229	NC_019702	AAG	2	6	1515288	1515293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221545
22230	NC_019702	ATG	2	6	1515335	1515340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22231	NC_019702	GAT	2	6	1515367	1515372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22232	NC_019702	ATG	2	6	1515389	1515394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22233	NC_019702	ATG	2	6	1515410	1515415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22234	NC_019702	ATG	2	6	1515428	1515433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22235	NC_019702	GAT	2	6	1515448	1515453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22236	NC_019702	ATG	2	6	1515470	1515475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22237	NC_019702	ATG	2	6	1515491	1515496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22238	NC_019702	CAT	2	6	1515566	1515571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221545
22239	NC_019702	ATG	2	6	1515584	1515589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221545
22240	NC_019702	ATC	2	6	1515647	1515652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221545
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22243	NC_019702	AAC	2	6	1515806	1515811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221546
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22246	NC_019702	TAC	2	6	1515925	1515930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221546
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22348	NC_019702	GCG	2	6	1521081	1521086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221551
22349	NC_019702	T	6	6	1521253	1521258	0 %	100 %	0 %	0 %	428221551
22350	NC_019702	GCGA	2	8	1521266	1521273	25 %	0 %	50 %	25 %	428221551
22351	NC_019702	ATTT	2	8	1521295	1521302	25 %	75 %	0 %	0 %	428221551
22352	NC_019702	CTT	2	6	1521378	1521383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221552
22353	NC_019702	CTTTAG	2	12	1521422	1521433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428221552
22354	NC_019702	T	6	6	1521599	1521604	0 %	100 %	0 %	0 %	428221552
22355	NC_019702	CTA	2	6	1521638	1521643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221552
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22359	NC_019702	AT	3	6	1521829	1521834	50 %	50 %	0 %	0 %	428221553
22360	NC_019702	AT	3	6	1521889	1521894	50 %	50 %	0 %	0 %	428221553
22361	NC_019702	GCA	2	6	1521920	1521925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221553
22362	NC_019702	TCC	2	6	1521957	1521962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221553
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22364	NC_019702	ATA	2	6	1522216	1522221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221553
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22370	NC_019702	T	6	6	1522596	1522601	0 %	100 %	0 %	0 %	428221553
22371	NC_019702	TAC	2	6	1522671	1522676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221553
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22374	NC_019702	GCC	3	9	1522780	1522788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221553
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22453	NC_019702	TGG	2	6	1527873	1527878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221557
22454	NC_019702	CAT	2	6	1527884	1527889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221557
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22463	NC_019702	TAA	2	6	1528339	1528344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221558
22464	NC_019702	AGA	2	6	1528393	1528398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221558
22465	NC_019702	ATT	2	6	1528417	1528422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221558
22466	NC_019702	CAT	2	6	1528432	1528437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221558
22467	NC_019702	TCCA	2	8	1528540	1528547	25 %	25 %	0 %	50 %	428221558
22468	NC_019702	ACT	2	6	1529033	1529038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221559
22469	NC_019702	A	6	6	1529050	1529055	100 %	0 %	0 %	0 %	428221559
22470	NC_019702	CCCTG	2	10	1529094	1529103	0 %	20 %	20 %	60 %	428221559
22471	NC_019702	TGA	2	6	1529138	1529143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221559
22472	NC_019702	GGTGC	2	10	1529162	1529171	0 %	20 %	60 %	20 %	428221559
22473	NC_019702	TAT	2	6	1529247	1529252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221559
22474	NC_019702	GGT	2	6	1529351	1529356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221559
22475	NC_019702	TGA	2	6	1529363	1529368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221559
22476	NC_019702	AAG	2	6	1529382	1529387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221559
22477	NC_019702	GAGAT	2	10	1529482	1529491	40 %	20 %	40 %	0 %	428221559
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22479	NC_019702	TTG	2	6	1529530	1529535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221559
22480	NC_019702	GAAGG	2	10	1529541	1529550	40 %	0 %	60 %	0 %	428221559
22481	NC_019702	GCT	2	6	1529577	1529582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221559
22482	NC_019702	TG	3	6	1529586	1529591	0 %	50 %	50 %	0 %	428221559
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22484	NC_019702	TGC	2	6	1529654	1529659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221559
22485	NC_019702	CTATCC	2	12	1529744	1529755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428221559
22486	NC_019702	GATTG	2	10	1529808	1529817	20 %	40 %	40 %	0 %	428221559
22487	NC_019702	AAG	2	6	1529911	1529916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221559
22488	NC_019702	GCA	2	6	1530078	1530083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221559
22489	NC_019702	TGC	2	6	1530116	1530121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221559
22490	NC_019702	ATT	2	6	1530162	1530167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221559
22491	NC_019702	TACT	2	8	1530205	1530212	25 %	50 %	0 %	25 %	428221559
22492	NC_019702	AAGCTG	2	12	1530232	1530243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428221559
22493	NC_019702	TTTC	2	8	1530353	1530360	0 %	75 %	0 %	25 %	428221559
22494	NC_019702	GGCT	2	8	1530379	1530386	0 %	25 %	50 %	25 %	428221559
22495	NC_019702	TGA	2	6	1530428	1530433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221559
22496	NC_019702	TGGC	2	8	1530448	1530455	0 %	25 %	50 %	25 %	428221559
22497	NC_019702	GACA	2	8	1530486	1530493	50 %	0 %	25 %	25 %	428221559
22498	NC_019702	G	6	6	1530519	1530524	0 %	0 %	100 %	0 %	428221559
22499	NC_019702	AGT	2	6	1530540	1530545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221559
22500	NC_019702	TA	3	6	1530631	1530636	50 %	50 %	0 %	0 %	428221559

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