MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_019702	CCGAAT	2	12	1453052	1453063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428221467
21502	NC_019702	TAAT	2	8	1453115	1453122	50 %	50 %	0 %	0 %	428221467
21503	NC_019702	AATCA	2	10	1453168	1453177	60 %	20 %	0 %	20 %	428221467
21504	NC_019702	ATA	2	6	1453237	1453242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221468
21505	NC_019702	AATCC	2	10	1453294	1453303	40 %	20 %	0 %	40 %	428221468
21506	NC_019702	CTA	2	6	1453422	1453427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221468
21507	NC_019702	AAT	2	6	1453496	1453501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221468
21508	NC_019702	GAT	2	6	1453520	1453525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221468
21509	NC_019702	TAG	2	6	1453580	1453585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221468
21510	NC_019702	CTG	2	6	1453588	1453593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221468
21511	NC_019702	TC	3	6	1453674	1453679	0 %	50 %	0 %	50 %	428221468
21512	NC_019702	ACT	2	6	1453686	1453691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221468
21513	NC_019702	GATTT	2	10	1453701	1453710	20 %	60 %	20 %	0 %	428221468
21514	NC_019702	TAA	2	6	1453714	1453719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221468
21515	NC_019702	CTA	2	6	1453732	1453737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221468
21516	NC_019702	TGG	2	6	1453805	1453810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221468
21517	NC_019702	AAGG	2	8	1453813	1453820	50 %	0 %	50 %	0 %	428221468
21518	NC_019702	ATT	2	6	1453858	1453863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221468
21519	NC_019702	TGTCAA	2	12	1453938	1453949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428221468
21520	NC_019702	GCA	2	6	1453956	1453961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221468
21521	NC_019702	AT	3	6	1453991	1453996	50 %	50 %	0 %	0 %	428221468
21522	NC_019702	AGA	2	6	1454116	1454121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221468
21523	NC_019702	A	6	6	1454147	1454152	100 %	0 %	0 %	0 %	428221468
21524	NC_019702	CTTC	2	8	1454432	1454439	0 %	50 %	0 %	50 %	428221469
21525	NC_019702	CAAT	2	8	1454550	1454557	50 %	25 %	0 %	25 %	428221469
21526	NC_019702	CAT	2	6	1454560	1454565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221469
21527	NC_019702	GCA	2	6	1454609	1454614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221469
21528	NC_019702	TAA	2	6	1454752	1454757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221469
21529	NC_019702	TGC	2	6	1454845	1454850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221469
21530	NC_019702	AAATT	2	10	1454873	1454882	60 %	40 %	0 %	0 %	428221469
21531	NC_019702	CGC	2	6	1454950	1454955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221469
21532	NC_019702	CCCAGT	2	12	1454963	1454974	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428221469
21533	NC_019702	GCA	2	6	1454990	1454995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221469
21534	NC_019702	TAA	2	6	1455021	1455026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221469
21535	NC_019702	GTCC	2	8	1455086	1455093	0 %	25 %	25 %	50 %	428221469
21536	NC_019702	AGTTGA	2	12	1455128	1455139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221469
21537	NC_019702	AT	3	6	1455167	1455172	50 %	50 %	0 %	0 %	428221469
21538	NC_019702	ACC	2	6	1455190	1455195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221469
21539	NC_019702	CAT	2	6	1455219	1455224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221469
21540	NC_019702	T	6	6	1455487	1455492	0 %	100 %	0 %	0 %	428221469
21541	NC_019702	AGC	2	6	1458552	1458557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221470
21542	NC_019702	GA	3	6	1458620	1458625	50 %	0 %	50 %	0 %	428221470
21543	NC_019702	A	7	7	1458657	1458663	100 %	0 %	0 %	0 %	428221470
21544	NC_019702	CAA	2	6	1458914	1458919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221471
21545	NC_019702	TAA	2	6	1458982	1458987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221471
21546	NC_019702	CAA	2	6	1459025	1459030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221471
21547	NC_019702	TGT	2	6	1459046	1459051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221471
21548	NC_019702	CTA	2	6	1459067	1459072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221471
21549	NC_019702	GA	3	6	1459096	1459101	50 %	0 %	50 %	0 %	428221471
21550	NC_019702	AGC	2	6	1459117	1459122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221471
21551	NC_019702	AAT	2	6	1461859	1461864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221472
21552	NC_019702	CGGAA	2	10	1461934	1461943	40 %	0 %	40 %	20 %	428221472
21553	NC_019702	TAT	2	6	1461996	1462001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221472
21554	NC_019702	GGT	2	6	1462024	1462029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221472
21555	NC_019702	TGA	2	6	1462051	1462056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221472
21556	NC_019702	AGAGC	2	10	1462073	1462082	40 %	0 %	40 %	20 %	428221472
21557	NC_019702	TGA	2	6	1462154	1462159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221473
21558	NC_019702	AG	3	6	1462222	1462227	50 %	0 %	50 %	0 %	428221473
21559	NC_019702	AGT	2	6	1462244	1462249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221473
21560	NC_019702	AGT	2	6	1462262	1462267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221473
21561	NC_019702	ATA	2	6	1462278	1462283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221473
21562	NC_019702	CAA	2	6	1462296	1462301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221473
21563	NC_019702	AGC	2	6	1462310	1462315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221473
21564	NC_019702	CAAGTA	2	12	1462443	1462454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428221473
21565	NC_019702	AATTG	2	10	1465864	1465873	40 %	40 %	20 %	0 %	428221474
21566	NC_019702	ATT	2	6	1465904	1465909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221474
21567	NC_019702	AG	3	6	1466041	1466046	50 %	0 %	50 %	0 %	428221474
21568	NC_019702	AAT	2	6	1466047	1466052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221474
21569	NC_019702	GATT	2	8	1466061	1466068	25 %	50 %	25 %	0 %	428221474
21570	NC_019702	CAT	2	6	1466134	1466139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221474
21571	NC_019702	CGG	2	6	1466180	1466185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221474
21572	NC_019702	AAT	2	6	1466209	1466214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221474
21573	NC_019702	AGAA	2	8	1466235	1466242	75 %	0 %	25 %	0 %	428221474
21574	NC_019702	AAT	2	6	1466268	1466273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221474
21575	NC_019702	CCA	2	6	1466359	1466364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221474
21576	NC_019702	AAT	2	6	1466372	1466377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221474
21577	NC_019702	ACC	2	6	1466635	1466640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221474
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21579	NC_019702	AGT	2	6	1466703	1466708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221474
21580	NC_019702	AAATT	2	10	1466723	1466732	60 %	40 %	0 %	0 %	428221474
21581	NC_019702	GTT	2	6	1466772	1466777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221474
21582	NC_019702	ATC	2	6	1466800	1466805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221474
21583	NC_019702	ATG	2	6	1466968	1466973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221475
21584	NC_019702	GAA	2	6	1466998	1467003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221475
21585	NC_019702	TA	3	6	1467090	1467095	50 %	50 %	0 %	0 %	428221475
21586	NC_019702	ATC	2	6	1467219	1467224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221475
21587	NC_019702	CTT	2	6	1467244	1467249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221475
21588	NC_019702	A	7	7	1467258	1467264	100 %	0 %	0 %	0 %	428221475
21589	NC_019702	AAT	2	6	1467290	1467295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221475
21590	NC_019702	GTT	2	6	1467334	1467339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221475
21591	NC_019702	CAGT	2	8	1467343	1467350	25 %	25 %	25 %	25 %	428221475
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21593	NC_019702	TTA	2	6	1467445	1467450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221475
21594	NC_019702	GA	3	6	1467492	1467497	50 %	0 %	50 %	0 %	428221475
21595	NC_019702	TAG	2	6	1467519	1467524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221475
21596	NC_019702	ATA	2	6	1467550	1467555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221475
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21598	NC_019702	GAATAT	2	12	1467622	1467633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428221476
21599	NC_019702	T	6	6	1467656	1467661	0 %	100 %	0 %	0 %	428221476
21600	NC_019702	GCTT	2	8	1467662	1467669	0 %	50 %	25 %	25 %	428221476
21601	NC_019702	GCG	2	6	1467682	1467687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221476
21602	NC_019702	C	7	7	1467693	1467699	0 %	0 %	0 %	100 %	428221476
21603	NC_019702	CCAAA	2	10	1467701	1467710	60 %	0 %	0 %	40 %	428221476
21604	NC_019702	AAT	2	6	1467715	1467720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221476
21605	NC_019702	AACTTT	2	12	1467729	1467740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428221476
21606	NC_019702	CT	4	8	1467940	1467947	0 %	50 %	0 %	50 %	428221477
21607	NC_019702	AGAT	2	8	1467970	1467977	50 %	25 %	25 %	0 %	428221477
21608	NC_019702	ATG	2	6	1468009	1468014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221477
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21610	NC_019702	TAA	2	6	1468091	1468096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221477
21611	NC_019702	TCC	2	6	1468106	1468111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221477
21612	NC_019702	ATC	2	6	1468241	1468246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221477
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21614	NC_019702	TC	3	6	1468368	1468373	0 %	50 %	0 %	50 %	428221477
21615	NC_019702	TATG	2	8	1468820	1468827	25 %	50 %	25 %	0 %	428221478
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21617	NC_019702	CTGT	2	8	1469005	1469012	0 %	50 %	25 %	25 %	428221478
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21852	NC_019702	TGG	2	6	1488277	1488282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221497
21853	NC_019702	TTG	2	6	1488553	1488558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221498
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