MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_019702	TAT	2	6	1309888	1309893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221345
19502	NC_019702	TGAT	2	8	1309941	1309948	25 %	50 %	25 %	0 %	428221345
19503	NC_019702	AATC	2	8	1309988	1309995	50 %	25 %	0 %	25 %	428221345
19504	NC_019702	CTT	2	6	1310020	1310025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221345
19505	NC_019702	TAAT	2	8	1310037	1310044	50 %	50 %	0 %	0 %	428221345
19506	NC_019702	AAT	2	6	1310048	1310053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221345
19507	NC_019702	CAA	2	6	1310066	1310071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221345
19508	NC_019702	AAT	2	6	1310096	1310101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221345
19509	NC_019702	GCAATA	2	12	1310201	1310212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428221345
19510	NC_019702	TATTGG	2	12	1310492	1310503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428221346
19511	NC_019702	TTAG	2	8	1310535	1310542	25 %	50 %	25 %	0 %	428221346
19512	NC_019702	ATA	2	6	1310641	1310646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221346
19513	NC_019702	AGC	2	6	1310762	1310767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221346
19514	NC_019702	AGC	2	6	1310826	1310831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221346
19515	NC_019702	CAGG	2	8	1310853	1310860	25 %	0 %	50 %	25 %	428221346
19516	NC_019702	TGA	2	6	1310951	1310956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221346
19517	NC_019702	CTG	2	6	1310986	1310991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221346
19518	NC_019702	CAT	2	6	1310996	1311001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221346
19519	NC_019702	TTA	2	6	1311094	1311099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221346
19520	NC_019702	ATT	2	6	1311175	1311180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221346
19521	NC_019702	AAGT	2	8	1311253	1311260	50 %	25 %	25 %	0 %	428221346
19522	NC_019702	TGA	2	6	1311425	1311430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221346
19523	NC_019702	GTG	2	6	1311510	1311515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221346
19524	NC_019702	ATG	2	6	1311836	1311841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221346
19525	NC_019702	TGC	2	6	1311931	1311936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221347
19526	NC_019702	GAA	2	6	1311959	1311964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221347
19527	NC_019702	GTA	2	6	1312017	1312022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221347
19528	NC_019702	ATTA	2	8	1312027	1312034	50 %	50 %	0 %	0 %	428221347
19529	NC_019702	GGC	2	6	1312120	1312125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221347
19530	NC_019702	CTA	2	6	1312161	1312166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221347
19531	NC_019702	CTGGT	2	10	1312171	1312180	0 %	40 %	40 %	20 %	428221347
19532	NC_019702	AATG	2	8	1312228	1312235	50 %	25 %	25 %	0 %	428221347
19533	NC_019702	G	7	7	1312235	1312241	0 %	0 %	100 %	0 %	428221347
19534	NC_019702	GGT	2	6	1312247	1312252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221347
19535	NC_019702	TAAT	2	8	1312269	1312276	50 %	50 %	0 %	0 %	428221347
19536	NC_019702	GGA	2	6	1312295	1312300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221347
19537	NC_019702	CTA	2	6	1312313	1312318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221347
19538	NC_019702	GAA	2	6	1312322	1312327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221347
19539	NC_019702	GGCG	2	8	1312360	1312367	0 %	0 %	75 %	25 %	428221347
19540	NC_019702	CAG	2	6	1312380	1312385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221347
19541	NC_019702	ACC	2	6	1312433	1312438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221347
19542	NC_019702	T	6	6	1312444	1312449	0 %	100 %	0 %	0 %	428221347
19543	NC_019702	ATC	2	6	1312476	1312481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221347
19544	NC_019702	ATCCCC	2	12	1312509	1312520	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428221347
19545	NC_019702	GCC	2	6	1312523	1312528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221347
19546	NC_019702	ATCGG	2	10	1312563	1312572	20 %	20 %	40 %	20 %	428221347
19547	NC_019702	ATA	2	6	1312738	1312743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221348
19548	NC_019702	ATAA	2	8	1312782	1312789	75 %	25 %	0 %	0 %	428221348
19549	NC_019702	TAAA	2	8	1312894	1312901	75 %	25 %	0 %	0 %	428221348
19550	NC_019702	GCA	2	6	1313064	1313069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221348
19551	NC_019702	AGC	2	6	1313142	1313147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221348
19552	NC_019702	ATAA	2	8	1313157	1313164	75 %	25 %	0 %	0 %	428221348
19553	NC_019702	ATT	2	6	1313190	1313195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221348
19554	NC_019702	AAT	2	6	1313282	1313287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221348
19555	NC_019702	AACCCA	2	12	1313352	1313363	50 %	0 %	0 %	50 %	428221348
19556	NC_019702	GTA	2	6	1313428	1313433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221348
19557	NC_019702	CCA	2	6	1313527	1313532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221348
19558	NC_019702	ACC	2	6	1313556	1313561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221348
19559	NC_019702	GAA	2	6	1313576	1313581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221348
19560	NC_019702	GATA	2	8	1313611	1313618	50 %	25 %	25 %	0 %	428221348
19561	NC_019702	CAA	2	6	1313699	1313704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221348
19562	NC_019702	CTG	2	6	1313781	1313786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221349
19563	NC_019702	CAT	2	6	1313898	1313903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221349
19564	NC_019702	CAG	2	6	1313912	1313917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221349
19565	NC_019702	C	6	6	1313989	1313994	0 %	0 %	0 %	100 %	428221349
19566	NC_019702	AAT	2	6	1314022	1314027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221349
19567	NC_019702	GTT	2	6	1314038	1314043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221349
19568	NC_019702	AATCCA	2	12	1314075	1314086	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428221349
19569	NC_019702	CCG	2	6	1314152	1314157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221350
19570	NC_019702	GTA	2	6	1314178	1314183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221350
19571	NC_019702	ATCA	2	8	1314210	1314217	50 %	25 %	0 %	25 %	428221350
19572	NC_019702	ACC	2	6	1314240	1314245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221350
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19574	NC_019702	CTT	2	6	1314419	1314424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221350
19575	NC_019702	CCA	2	6	1314657	1314662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221351
19576	NC_019702	TAA	3	9	1314889	1314897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221351
19577	NC_019702	TGA	2	6	1314917	1314922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221351
19578	NC_019702	GAT	2	6	1314924	1314929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221351
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19580	NC_019702	GGT	2	6	1315005	1315010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221351
19581	NC_019702	AAT	2	6	1315109	1315114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221351
19582	NC_019702	GA	3	6	1315144	1315149	50 %	0 %	50 %	0 %	428221351
19583	NC_019702	AG	3	6	1315205	1315210	50 %	0 %	50 %	0 %	428221351
19584	NC_019702	ATT	2	6	1315295	1315300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221351
19585	NC_019702	TAT	2	6	1315309	1315314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221351
19586	NC_019702	AATTA	2	10	1315391	1315400	60 %	40 %	0 %	0 %	428221351
19587	NC_019702	ATT	2	6	1315407	1315412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221351
19588	NC_019702	ATT	2	6	1315448	1315453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221351
19589	NC_019702	GTG	2	6	1315477	1315482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221351
19590	NC_019702	AAT	2	6	1315496	1315501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221351
19591	NC_019702	TAC	2	6	1315531	1315536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221351
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19597	NC_019702	GAAA	2	8	1315803	1315810	75 %	0 %	25 %	0 %	428221351
19598	NC_019702	GCC	2	6	1315814	1315819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221351
19599	NC_019702	CTTG	2	8	1315843	1315850	0 %	50 %	25 %	25 %	428221351
19600	NC_019702	CAA	2	6	1315864	1315869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221351
19601	NC_019702	TTAAT	2	10	1315933	1315942	40 %	60 %	0 %	0 %	428221351
19602	NC_019702	C	6	6	1316121	1316126	0 %	0 %	0 %	100 %	428221351
19603	NC_019702	TAAT	2	8	1316137	1316144	50 %	50 %	0 %	0 %	428221351
19604	NC_019702	ATT	2	6	1316380	1316385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221352
19605	NC_019702	T	6	6	1316389	1316394	0 %	100 %	0 %	0 %	428221352
19606	NC_019702	AGAATT	2	12	1316431	1316442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428221352
19607	NC_019702	ATT	2	6	1316446	1316451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221352
19608	NC_019702	AG	3	6	1316455	1316460	50 %	0 %	50 %	0 %	428221352
19609	NC_019702	GTC	2	6	1316594	1316599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221352
19610	NC_019702	T	7	7	1316666	1316672	0 %	100 %	0 %	0 %	428221352
19611	NC_019702	CTG	2	6	1316820	1316825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221352
19612	NC_019702	ATT	2	6	1316878	1316883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221352
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19614	NC_019702	TCT	2	6	1317074	1317079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221352
19615	NC_019702	GCC	2	6	1317093	1317098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221352
19616	NC_019702	CTG	2	6	1317111	1317116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221352
19617	NC_019702	ACC	2	6	1317256	1317261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221352
19618	NC_019702	AAG	2	6	1317294	1317299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221352
19619	NC_019702	GAA	2	6	1317303	1317308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221352
19620	NC_019702	CTT	2	6	1317336	1317341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221352
19621	NC_019702	TCA	2	6	1317409	1317414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221353
19622	NC_019702	CTA	2	6	1317455	1317460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221353
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19624	NC_019702	CCA	2	6	1317572	1317577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221353
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19633	NC_019702	TAA	2	6	1318202	1318207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221353
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19968	NC_019702	ACT	2	6	1339592	1339597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221373
19969	NC_019702	CTG	2	6	1339618	1339623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221373
19970	NC_019702	TAAT	2	8	1339696	1339703	50 %	50 %	0 %	0 %	428221373
19971	NC_019702	ATC	2	6	1339835	1339840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221373
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19973	NC_019702	AGA	2	6	1340060	1340065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221373
19974	NC_019702	TCT	2	6	1340121	1340126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221373
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19991	NC_019702	AAT	2	6	1341835	1341840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221374
19992	NC_019702	TAAA	2	8	1341880	1341887	75 %	25 %	0 %	0 %	428221374
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19995	NC_019702	AATT	2	8	1342205	1342212	50 %	50 %	0 %	0 %	428221375
19996	NC_019702	ATA	2	6	1342238	1342243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221375
19997	NC_019702	GCG	2	6	1342249	1342254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221375
19998	NC_019702	ATCC	2	8	1342262	1342269	25 %	25 %	0 %	50 %	428221375
19999	NC_019702	CAT	2	6	1342292	1342297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221375
20000	NC_019702	TAC	2	6	1342328	1342333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221375

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