MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_019702	AATCTA	2	12	1139111	1139122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428221197
17002	NC_019702	CAA	2	6	1139301	1139306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221197
17003	NC_019702	AGAT	2	8	1139329	1139336	50 %	25 %	25 %	0 %	428221197
17004	NC_019702	GAG	2	6	1139344	1139349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221197
17005	NC_019702	TTGGG	2	10	1139389	1139398	0 %	40 %	60 %	0 %	428221197
17006	NC_019702	GAC	2	6	1139459	1139464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221197
17007	NC_019702	TTC	3	9	1139469	1139477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221197
17008	NC_019702	CTGCT	2	10	1139490	1139499	0 %	40 %	20 %	40 %	428221197
17009	NC_019702	ATC	2	6	1139565	1139570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221197
17010	NC_019702	GCGAT	2	10	1139645	1139654	20 %	20 %	40 %	20 %	428221197
17011	NC_019702	A	6	6	1139721	1139726	100 %	0 %	0 %	0 %	428221197
17012	NC_019702	AAG	2	6	1139768	1139773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221197
17013	NC_019702	TAA	2	6	1139885	1139890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221197
17014	NC_019702	ATGT	2	8	1139966	1139973	25 %	50 %	25 %	0 %	428221197
17015	NC_019702	TG	3	6	1140048	1140053	0 %	50 %	50 %	0 %	428221197
17016	NC_019702	GTA	2	6	1140416	1140421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221198
17017	NC_019702	ATA	2	6	1140545	1140550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221198
17018	NC_019702	AGT	2	6	1140649	1140654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221198
17019	NC_019702	CTA	2	6	1140673	1140678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221198
17020	NC_019702	TTA	2	6	1140732	1140737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221198
17021	NC_019702	TCA	2	6	1140765	1140770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221198
17022	NC_019702	CTG	2	6	1140857	1140862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221198
17023	NC_019702	ATT	2	6	1140869	1140874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221198
17024	NC_019702	CAA	2	6	1141045	1141050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221198
17025	NC_019702	GCGGT	2	10	1141098	1141107	0 %	20 %	60 %	20 %	428221198
17026	NC_019702	GAT	2	6	1141138	1141143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221198
17027	NC_019702	TAA	2	6	1141271	1141276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221198
17028	NC_019702	G	6	6	1141524	1141529	0 %	0 %	100 %	0 %	428221199
17029	NC_019702	GCGG	2	8	1141613	1141620	0 %	0 %	75 %	25 %	428221199
17030	NC_019702	CTA	2	6	1141692	1141697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221199
17031	NC_019702	GAG	2	6	1141698	1141703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221199
17032	NC_019702	GCA	2	6	1141733	1141738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221199
17033	NC_019702	A	6	6	1141852	1141857	100 %	0 %	0 %	0 %	428221199
17034	NC_019702	GCTGG	2	10	1142084	1142093	0 %	20 %	60 %	20 %	428221199
17035	NC_019702	GTA	2	6	1142232	1142237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221200
17036	NC_019702	AAT	2	6	1142343	1142348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221200
17037	NC_019702	AGAAA	2	10	1142406	1142415	80 %	0 %	20 %	0 %	428221200
17038	NC_019702	TTGC	2	8	1142516	1142523	0 %	50 %	25 %	25 %	428221200
17039	NC_019702	TTGC	2	8	1142558	1142565	0 %	50 %	25 %	25 %	428221200
17040	NC_019702	GTA	2	6	1142575	1142580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221200
17041	NC_019702	TCTT	2	8	1142731	1142738	0 %	75 %	0 %	25 %	428221201
17042	NC_019702	CAAA	2	8	1142824	1142831	75 %	0 %	0 %	25 %	428221201
17043	NC_019702	TGC	2	6	1142833	1142838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221201
17044	NC_019702	GAA	2	6	1142843	1142848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221201
17045	NC_019702	CAGCTT	2	12	1143029	1143040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428221201
17046	NC_019702	CAG	3	9	1143213	1143221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221201
17047	NC_019702	AAT	2	6	1143368	1143373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221201
17048	NC_019702	AAAT	2	8	1143454	1143461	75 %	25 %	0 %	0 %	428221201
17049	NC_019702	TTA	2	6	1143558	1143563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221201
17050	NC_019702	AAG	2	6	1143667	1143672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221202
17051	NC_019702	T	6	6	1143676	1143681	0 %	100 %	0 %	0 %	428221202
17052	NC_019702	CCT	2	6	1143683	1143688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221202
17053	NC_019702	ACA	2	6	1143710	1143715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221202
17054	NC_019702	TCG	2	6	1143716	1143721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221202
17055	NC_019702	ACC	2	6	1143865	1143870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221202
17056	NC_019702	CTT	2	6	1143896	1143901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221202
17057	NC_019702	T	6	6	1143942	1143947	0 %	100 %	0 %	0 %	428221202
17058	NC_019702	AGG	2	6	1143971	1143976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221202
17059	NC_019702	ACC	2	6	1143984	1143989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221202
17060	NC_019702	ACC	2	6	1144077	1144082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221202
17061	NC_019702	AGCC	2	8	1144094	1144101	25 %	0 %	25 %	50 %	428221202
17062	NC_019702	AT	3	6	1144184	1144189	50 %	50 %	0 %	0 %	428221202
17063	NC_019702	ACC	2	6	1144191	1144196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221202
17064	NC_019702	CGC	2	6	1144199	1144204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221202
17065	NC_019702	T	6	6	1144208	1144213	0 %	100 %	0 %	0 %	428221202
17066	NC_019702	GTA	2	6	1144288	1144293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221202
17067	NC_019702	CAT	2	6	1144304	1144309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221202
17068	NC_019702	CAT	2	6	1144394	1144399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221202
17069	NC_019702	TGA	2	6	1144515	1144520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221203
17070	NC_019702	CAT	2	6	1144550	1144555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221203
17071	NC_019702	TCG	2	6	1144588	1144593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221203
17072	NC_019702	TCA	2	6	1144609	1144614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221203
17073	NC_019702	TCT	2	6	1144644	1144649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221203
17074	NC_019702	CG	3	6	1144653	1144658	0 %	0 %	50 %	50 %	428221203
17075	NC_019702	TTAA	2	8	1144702	1144709	50 %	50 %	0 %	0 %	428221203
17076	NC_019702	AAAG	2	8	1144726	1144733	75 %	0 %	25 %	0 %	428221203
17077	NC_019702	GCA	2	6	1144763	1144768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221203
17078	NC_019702	CAG	2	6	1145198	1145203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221204
17079	NC_019702	GAG	2	6	1145206	1145211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221204
17080	NC_019702	AGAA	2	8	1145268	1145275	75 %	0 %	25 %	0 %	428221204
17081	NC_019702	GCAG	2	8	1145277	1145284	25 %	0 %	50 %	25 %	428221204
17082	NC_019702	CTA	2	6	1145338	1145343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221204
17083	NC_019702	GCC	2	6	1145374	1145379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221204
17084	NC_019702	T	6	6	1145415	1145420	0 %	100 %	0 %	0 %	428221204
17085	NC_019702	GCG	2	6	1145593	1145598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221204
17086	NC_019702	GCT	2	6	1145611	1145616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221204
17087	NC_019702	GAG	2	6	1145697	1145702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221204
17088	NC_019702	A	6	6	1145888	1145893	100 %	0 %	0 %	0 %	428221204
17089	NC_019702	A	6	6	1146084	1146089	100 %	0 %	0 %	0 %	428221205
17090	NC_019702	AGA	2	6	1146145	1146150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221205
17091	NC_019702	CAT	2	6	1146188	1146193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221205
17092	NC_019702	CCG	2	6	1146202	1146207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221205
17093	NC_019702	TAG	2	6	1146228	1146233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221205
17094	NC_019702	TTA	2	6	1146255	1146260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221205
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17096	NC_019702	AG	3	6	1146388	1146393	50 %	0 %	50 %	0 %	428221205
17097	NC_019702	T	6	6	1146445	1146450	0 %	100 %	0 %	0 %	428221205
17098	NC_019702	AG	3	6	1146471	1146476	50 %	0 %	50 %	0 %	428221205
17099	NC_019702	ATAG	2	8	1146551	1146558	50 %	25 %	25 %	0 %	428221206
17100	NC_019702	CAG	2	6	1146576	1146581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221206
17101	NC_019702	CAG	3	9	1146585	1146593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221206
17102	NC_019702	A	6	6	1146647	1146652	100 %	0 %	0 %	0 %	428221206
17103	NC_019702	CAAATT	2	12	1146667	1146678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428221206
17104	NC_019702	ACAAA	2	10	1146757	1146766	80 %	0 %	0 %	20 %	428221206
17105	NC_019702	GCT	2	6	1146767	1146772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221206
17106	NC_019702	ACTA	2	8	1146849	1146856	50 %	25 %	0 %	25 %	428221207
17107	NC_019702	ATC	2	6	1146891	1146896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221207
17108	NC_019702	GC	3	6	1146939	1146944	0 %	0 %	50 %	50 %	428221207
17109	NC_019702	CTA	2	6	1146968	1146973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221207
17110	NC_019702	AGT	2	6	1147007	1147012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221207
17111	NC_019702	AGA	2	6	1147016	1147021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221207
17112	NC_019702	AGTT	2	8	1147082	1147089	25 %	50 %	25 %	0 %	428221207
17113	NC_019702	AGC	2	6	1147257	1147262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221207
17114	NC_019702	TAA	2	6	1147353	1147358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221207
17115	NC_019702	AAC	2	6	1147359	1147364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221207
17116	NC_019702	CTA	2	6	1147379	1147384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221207
17117	NC_019702	GAT	2	6	1147469	1147474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221208
17118	NC_019702	TTC	2	6	1147475	1147480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221208
17119	NC_019702	CCAT	2	8	1147524	1147531	25 %	25 %	0 %	50 %	428221208
17120	NC_019702	GTC	2	6	1147603	1147608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221208
17121	NC_019702	GTAG	2	8	1147646	1147653	25 %	25 %	50 %	0 %	428221208
17122	NC_019702	CA	3	6	1147703	1147708	50 %	0 %	0 %	50 %	428221208
17123	NC_019702	AC	3	6	1147724	1147729	50 %	0 %	0 %	50 %	428221208
17124	NC_019702	T	6	6	1147760	1147765	0 %	100 %	0 %	0 %	428221208
17125	NC_019702	GGAA	2	8	1147886	1147893	50 %	0 %	50 %	0 %	428221208
17126	NC_019702	AT	3	6	1147971	1147976	50 %	50 %	0 %	0 %	428221208
17127	NC_019702	GCT	2	6	1147980	1147985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221208
17128	NC_019702	CTT	2	6	1147993	1147998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221208
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17132	NC_019702	TTC	2	6	1148562	1148567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221209
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17137	NC_019702	ATT	2	6	1148827	1148832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221209
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17140	NC_019702	GTCA	2	8	1148905	1148912	25 %	25 %	25 %	25 %	428221209
17141	NC_019702	TTG	2	6	1148924	1148929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221209
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17144	NC_019702	CCT	2	6	1149169	1149174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221210
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17147	NC_019702	TG	3	6	1149355	1149360	0 %	50 %	50 %	0 %	428221210
17148	NC_019702	GAT	2	6	1149386	1149391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221210
17149	NC_019702	CTC	2	6	1149553	1149558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221210
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17151	NC_019702	T	6	6	1149693	1149698	0 %	100 %	0 %	0 %	428221211
17152	NC_019702	GAT	2	6	1149782	1149787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221211
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17156	NC_019702	CTA	2	6	1149956	1149961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221211
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17181	NC_019702	CAC	2	6	1151677	1151682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221213
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17184	NC_019702	ATC	2	6	1151813	1151818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221213
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17187	NC_019702	ATCA	2	8	1151896	1151903	50 %	25 %	0 %	25 %	428221213
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17190	NC_019702	CTG	2	6	1152042	1152047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221213
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17200	NC_019702	TAC	2	6	1152715	1152720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221213
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17203	NC_019702	AG	3	6	1152909	1152914	50 %	0 %	50 %	0 %	428221214
17204	NC_019702	TACT	2	8	1152959	1152966	25 %	50 %	0 %	25 %	428221214
17205	NC_019702	TAGG	2	8	1152983	1152990	25 %	25 %	50 %	0 %	428221214
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17214	NC_019702	AATT	2	8	1153268	1153275	50 %	50 %	0 %	0 %	428221215
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17217	NC_019702	GGA	2	6	1153358	1153363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221215
17218	NC_019702	AGC	2	6	1153479	1153484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221215
17219	NC_019702	A	6	6	1153686	1153691	100 %	0 %	0 %	0 %	428221216
17220	NC_019702	AAGC	2	8	1153693	1153700	50 %	0 %	25 %	25 %	428221216
17221	NC_019702	AGA	2	6	1153706	1153711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221216
17222	NC_019702	ACT	2	6	1153990	1153995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221217
17223	NC_019702	CCA	2	6	1154003	1154008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221217
17224	NC_019702	AAT	2	6	1154117	1154122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221217
17225	NC_019702	TAA	2	6	1154152	1154157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221217
17226	NC_019702	AATTA	2	10	1154260	1154269	60 %	40 %	0 %	0 %	428221217
17227	NC_019702	CTG	2	6	1154299	1154304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221217
17228	NC_019702	CAT	2	6	1154328	1154333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221217
17229	NC_019702	T	6	6	1154370	1154375	0 %	100 %	0 %	0 %	428221217
17230	NC_019702	TTG	2	6	1154437	1154442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221217
17231	NC_019702	AAG	2	6	1154660	1154665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221217
17232	NC_019702	ATC	2	6	1154713	1154718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221217
17233	NC_019702	AAT	3	9	1154803	1154811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221217
17234	NC_019702	TGC	2	6	1154825	1154830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221217
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17347	NC_019702	GCT	2	6	1162012	1162017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221224
17348	NC_019702	ATAG	2	8	1162019	1162026	50 %	25 %	25 %	0 %	428221224
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17350	NC_019702	AATT	2	8	1162079	1162086	50 %	50 %	0 %	0 %	428221224
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17459	NC_019702	ATC	2	6	1171029	1171034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221236
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17463	NC_019702	CAAC	2	8	1171139	1171146	50 %	0 %	0 %	50 %	428221236
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17466	NC_019702	T	6	6	1171257	1171262	0 %	100 %	0 %	0 %	428221237
17467	NC_019702	CTT	2	6	1171276	1171281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221237
17468	NC_019702	TCA	2	6	1171553	1171558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221237
17469	NC_019702	GTT	2	6	1171584	1171589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221237
17470	NC_019702	TCA	2	6	1171598	1171603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221237
17471	NC_019702	CCT	2	6	1171658	1171663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221238
17472	NC_019702	CAT	2	6	1171668	1171673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221238
17473	NC_019702	CTG	2	6	1171689	1171694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221238
17474	NC_019702	ATCG	2	8	1171725	1171732	25 %	25 %	25 %	25 %	428221238
17475	NC_019702	CTT	2	6	1171740	1171745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221238
17476	NC_019702	TC	3	6	1171946	1171951	0 %	50 %	0 %	50 %	428221238
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17481	NC_019702	TAAA	2	8	1172117	1172124	75 %	25 %	0 %	0 %	428221238
17482	NC_019702	TCA	2	6	1172146	1172151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221238
17483	NC_019702	CTC	2	6	1172208	1172213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221238
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17491	NC_019702	TAA	2	6	1172539	1172544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221238
17492	NC_019702	CTC	2	6	1172546	1172551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221238
17493	NC_019702	CGC	2	6	1172577	1172582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221238
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17495	NC_019702	TCT	2	6	1172627	1172632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221238
17496	NC_019702	GA	3	6	1172644	1172649	50 %	0 %	50 %	0 %	428221238
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17499	NC_019702	TTC	2	6	1172721	1172726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221238
17500	NC_019702	GA	3	6	1172727	1172732	50 %	0 %	50 %	0 %	428221238

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