MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_019702	ACA	2	6	1041206	1041211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221106
15502	NC_019702	CGT	2	6	1041228	1041233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221106
15503	NC_019702	GGT	2	6	1041414	1041419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221106
15504	NC_019702	TTG	2	6	1041429	1041434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221106
15505	NC_019702	TTTG	2	8	1041509	1041516	0 %	75 %	25 %	0 %	428221106
15506	NC_019702	TTA	2	6	1041558	1041563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221106
15507	NC_019702	TCA	2	6	1041588	1041593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221107
15508	NC_019702	TTCT	2	8	1041726	1041733	0 %	75 %	0 %	25 %	428221107
15509	NC_019702	CAG	2	6	1041768	1041773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221107
15510	NC_019702	GTT	2	6	1041775	1041780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221107
15511	NC_019702	TTA	2	6	1041899	1041904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221107
15512	NC_019702	GCC	2	6	1041965	1041970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221107
15513	NC_019702	ATG	2	6	1042077	1042082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221107
15514	NC_019702	CAT	2	6	1042230	1042235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221107
15515	NC_019702	A	7	7	1042503	1042509	100 %	0 %	0 %	0 %	428221108
15516	NC_019702	ATG	2	6	1042526	1042531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221108
15517	NC_019702	A	6	6	1042548	1042553	100 %	0 %	0 %	0 %	428221108
15518	NC_019702	GCA	2	6	1042561	1042566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221108
15519	NC_019702	AAG	2	6	1042575	1042580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221108
15520	NC_019702	GAA	2	6	1042616	1042621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221108
15521	NC_019702	CTG	2	6	1042632	1042637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221108
15522	NC_019702	AAG	2	6	1042668	1042673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221108
15523	NC_019702	GCAA	2	8	1042701	1042708	50 %	0 %	25 %	25 %	428221108
15524	NC_019702	ATT	2	6	1042808	1042813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221108
15525	NC_019702	A	6	6	1042860	1042865	100 %	0 %	0 %	0 %	428221108
15526	NC_019702	CAGA	2	8	1042961	1042968	50 %	0 %	25 %	25 %	428221109
15527	NC_019702	GTT	2	6	1043051	1043056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221109
15528	NC_019702	GCT	2	6	1043087	1043092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221109
15529	NC_019702	CTC	3	9	1043103	1043111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221109
15530	NC_019702	GCC	2	6	1043185	1043190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221109
15531	NC_019702	TAAA	2	8	1043196	1043203	75 %	25 %	0 %	0 %	428221109
15532	NC_019702	TGTA	2	8	1043230	1043237	25 %	50 %	25 %	0 %	428221109
15533	NC_019702	TGA	2	6	1043256	1043261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221109
15534	NC_019702	ATGG	2	8	1043279	1043286	25 %	25 %	50 %	0 %	428221109
15535	NC_019702	TAT	2	6	1043440	1043445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221110
15536	NC_019702	CTT	2	6	1043452	1043457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221110
15537	NC_019702	GCT	2	6	1043475	1043480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221110
15538	NC_019702	TAA	2	6	1043759	1043764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221110
15539	NC_019702	AG	3	6	1043780	1043785	50 %	0 %	50 %	0 %	428221110
15540	NC_019702	CCA	2	6	1043794	1043799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221110
15541	NC_019702	TC	3	6	1043822	1043827	0 %	50 %	0 %	50 %	428221110
15542	NC_019702	TTGAGT	2	12	1043908	1043919	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428221110
15543	NC_019702	T	6	6	1043987	1043992	0 %	100 %	0 %	0 %	428221111
15544	NC_019702	T	6	6	1044011	1044016	0 %	100 %	0 %	0 %	428221111
15545	NC_019702	A	6	6	1044095	1044100	100 %	0 %	0 %	0 %	428221111
15546	NC_019702	ATT	2	6	1044144	1044149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221111
15547	NC_019702	ATC	2	6	1044362	1044367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221112
15548	NC_019702	TGG	3	9	1044463	1044471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221112
15549	NC_019702	ACC	2	6	1044594	1044599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221112
15550	NC_019702	G	7	7	1044613	1044619	0 %	0 %	100 %	0 %	428221112
15551	NC_019702	TAA	2	6	1044640	1044645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221112
15552	NC_019702	TCT	2	6	1044712	1044717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221112
15553	NC_019702	TGC	2	6	1044803	1044808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221112
15554	NC_019702	TTC	2	6	1044824	1044829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221112
15555	NC_019702	CAAA	2	8	1044837	1044844	75 %	0 %	0 %	25 %	428221112
15556	NC_019702	TAA	2	6	1045030	1045035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221112
15557	NC_019702	TGC	2	6	1045080	1045085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221112
15558	NC_019702	TGA	2	6	1045415	1045420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221113
15559	NC_019702	ATAA	2	8	1045436	1045443	75 %	25 %	0 %	0 %	428221113
15560	NC_019702	CACC	2	8	1045510	1045517	25 %	0 %	0 %	75 %	428221113
15561	NC_019702	T	6	6	1045519	1045524	0 %	100 %	0 %	0 %	428221113
15562	NC_019702	ATA	2	6	1045534	1045539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221113
15563	NC_019702	TAT	2	6	1045614	1045619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221113
15564	NC_019702	TGC	2	6	1045664	1045669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221113
15565	NC_019702	TGG	2	6	1045728	1045733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221113
15566	NC_019702	GCT	2	6	1045889	1045894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221113
15567	NC_019702	ACT	2	6	1045919	1045924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221113
15568	NC_019702	GCT	2	6	1045967	1045972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221113
15569	NC_019702	ACC	2	6	1046118	1046123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221113
15570	NC_019702	TAA	2	6	1046203	1046208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221113
15571	NC_019702	ATC	2	6	1046209	1046214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221113
15572	NC_019702	CAGA	2	8	1046225	1046232	50 %	0 %	25 %	25 %	428221113
15573	NC_019702	G	6	6	1046268	1046273	0 %	0 %	100 %	0 %	428221113
15574	NC_019702	CTG	2	6	1046298	1046303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221113
15575	NC_019702	GA	3	6	1046318	1046323	50 %	0 %	50 %	0 %	428221113
15576	NC_019702	TCT	2	6	1046468	1046473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221113
15577	NC_019702	ATT	2	6	1046483	1046488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221113
15578	NC_019702	CTT	2	6	1046643	1046648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221114
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15580	NC_019702	TAA	2	6	1046661	1046666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221114
15581	NC_019702	TCA	2	6	1046669	1046674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221114
15582	NC_019702	CCA	2	6	1046717	1046722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221114
15583	NC_019702	TAG	2	6	1046818	1046823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221114
15584	NC_019702	CAC	2	6	1046830	1046835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221114
15585	NC_019702	TAA	2	6	1046877	1046882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221114
15586	NC_019702	AGG	2	6	1046910	1046915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221114
15587	NC_019702	GCC	2	6	1046996	1047001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221114
15588	NC_019702	CGA	2	6	1047048	1047053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221114
15589	NC_019702	ATT	2	6	1047074	1047079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221114
15590	NC_019702	TGT	2	6	1047092	1047097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221114
15591	NC_019702	ATC	2	6	1047172	1047177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221114
15592	NC_019702	ATT	2	6	1047242	1047247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221114
15593	NC_019702	AGC	2	6	1047280	1047285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221114
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15596	NC_019702	T	6	6	1047425	1047430	0 %	100 %	0 %	0 %	428221114
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15600	NC_019702	CCG	2	6	1047717	1047722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221114
15601	NC_019702	CTG	2	6	1047753	1047758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221114
15602	NC_019702	CTG	2	6	1047778	1047783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221114
15603	NC_019702	CTG	2	6	1047835	1047840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221114
15604	NC_019702	GCT	2	6	1047866	1047871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221114
15605	NC_019702	CAA	2	6	1048023	1048028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221114
15606	NC_019702	GCA	2	6	1048040	1048045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221114
15607	NC_019702	A	7	7	1048097	1048103	100 %	0 %	0 %	0 %	428221114
15608	NC_019702	CCA	2	6	1048114	1048119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221114
15609	NC_019702	CAG	2	6	1048370	1048375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221115
15610	NC_019702	CACC	2	8	1048376	1048383	25 %	0 %	0 %	75 %	428221115
15611	NC_019702	AT	3	6	1048393	1048398	50 %	50 %	0 %	0 %	428221115
15612	NC_019702	GA	3	6	1048430	1048435	50 %	0 %	50 %	0 %	428221115
15613	NC_019702	GAA	2	6	1048441	1048446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221115
15614	NC_019702	ATT	2	6	1048519	1048524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221115
15615	NC_019702	ATG	2	6	1048558	1048563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221115
15616	NC_019702	GAA	2	6	1048633	1048638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221115
15617	NC_019702	CAC	2	6	1048725	1048730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221115
15618	NC_019702	ATT	2	6	1048732	1048737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221115
15619	NC_019702	TGA	2	6	1048821	1048826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221115
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15621	NC_019702	ATT	2	6	1048837	1048842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221115
15622	NC_019702	GGGA	2	8	1048950	1048957	25 %	0 %	75 %	0 %	428221115
15623	NC_019702	CAT	2	6	1049019	1049024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221115
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15627	NC_019702	TGGT	2	8	1049340	1049347	0 %	50 %	50 %	0 %	428221115
15628	NC_019702	TGTTA	2	10	1049365	1049374	20 %	60 %	20 %	0 %	428221115
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15630	NC_019702	TGC	2	6	1049451	1049456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221115
15631	NC_019702	GC	3	6	1049482	1049487	0 %	0 %	50 %	50 %	428221115
15632	NC_019702	GAT	2	6	1049494	1049499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221115
15633	NC_019702	CAG	2	6	1049615	1049620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221115
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15635	NC_019702	TG	3	6	1049633	1049638	0 %	50 %	50 %	0 %	428221115
15636	NC_019702	TTACG	2	10	1049957	1049966	20 %	40 %	20 %	20 %	428221116
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15642	NC_019702	T	6	6	1050248	1050253	0 %	100 %	0 %	0 %	428221116
15643	NC_019702	GGCAT	2	10	1050254	1050263	20 %	20 %	40 %	20 %	428221116
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15646	NC_019702	CTTTA	2	10	1050458	1050467	20 %	60 %	0 %	20 %	428221116
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15648	NC_019702	T	7	7	1050550	1050556	0 %	100 %	0 %	0 %	428221116
15649	NC_019702	CTAG	2	8	1050666	1050673	25 %	25 %	25 %	25 %	428221116
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15651	NC_019702	T	6	6	1051038	1051043	0 %	100 %	0 %	0 %	428221117
15652	NC_019702	GTG	2	6	1051069	1051074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221117
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15656	NC_019702	ACT	2	6	1051371	1051376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221117
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15702	NC_019702	ACT	2	6	1053876	1053881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221120
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15720	NC_019702	AT	4	8	1055123	1055130	50 %	50 %	0 %	0 %	428221121
15721	NC_019702	TCC	2	6	1055161	1055166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221121
15722	NC_019702	AACTTC	2	12	1055182	1055193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221121
15723	NC_019702	A	6	6	1055243	1055248	100 %	0 %	0 %	0 %	428221121
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15725	NC_019702	CTC	2	6	1055296	1055301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221121
15726	NC_019702	GCA	2	6	1055389	1055394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221121
15727	NC_019702	AT	3	6	1055520	1055525	50 %	50 %	0 %	0 %	428221122
15728	NC_019702	AGC	2	6	1055598	1055603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221122
15729	NC_019702	AGC	2	6	1055607	1055612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221122
15730	NC_019702	AAG	2	6	1055613	1055618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221122
15731	NC_019702	ATT	2	6	1055633	1055638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221122
15732	NC_019702	AAG	2	6	1055651	1055656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221122
15733	NC_019702	GTC	2	6	1055742	1055747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221122
15734	NC_019702	AGT	2	6	1055939	1055944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221122
15735	NC_019702	CTC	2	6	1055982	1055987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221122
15736	NC_019702	TGA	2	6	1056001	1056006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221122
15737	NC_019702	AT	3	6	1056193	1056198	50 %	50 %	0 %	0 %	428221123
15738	NC_019702	CTA	2	6	1056253	1056258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221123
15739	NC_019702	TGG	2	6	1056366	1056371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221123
15740	NC_019702	A	7	7	1056400	1056406	100 %	0 %	0 %	0 %	428221123
15741	NC_019702	GAT	2	6	1056460	1056465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221124
15742	NC_019702	CTG	2	6	1056466	1056471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221124
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15744	NC_019702	ATCC	2	8	1056612	1056619	25 %	25 %	0 %	50 %	428221124
15745	NC_019702	TAA	2	6	1056775	1056780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221124
15746	NC_019702	GTA	2	6	1056848	1056853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221124
15747	NC_019702	TTTGAT	2	12	1056854	1056865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428221124
15748	NC_019702	TGG	2	6	1056910	1056915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221124
15749	NC_019702	GGGT	2	8	1056928	1056935	0 %	25 %	75 %	0 %	428221124
15750	NC_019702	GCC	2	6	1056937	1056942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221124
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15757	NC_019702	TGG	2	6	1057611	1057616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221124
15758	NC_019702	CAGCTT	2	12	1057617	1057628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428221124
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15760	NC_019702	T	6	6	1057827	1057832	0 %	100 %	0 %	0 %	428221124
15761	NC_019702	ATC	2	6	1057862	1057867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221124
15762	NC_019702	T	6	6	1057950	1057955	0 %	100 %	0 %	0 %	428221124
15763	NC_019702	TGT	2	6	1057997	1058002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221124
15764	NC_019702	T	6	6	1058025	1058030	0 %	100 %	0 %	0 %	428221124
15765	NC_019702	GAC	2	6	1058083	1058088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221124
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15770	NC_019702	TC	3	6	1058351	1058356	0 %	50 %	0 %	50 %	428221124
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15826	NC_019702	ACT	2	6	1062542	1062547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221126
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15830	NC_019702	CAC	2	6	1062802	1062807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221126
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15833	NC_019702	TG	3	6	1062961	1062966	0 %	50 %	50 %	0 %	428221126
15834	NC_019702	CCTG	2	8	1063100	1063107	0 %	25 %	25 %	50 %	428221126
15835	NC_019702	ATCA	2	8	1063150	1063157	50 %	25 %	0 %	25 %	428221126
15836	NC_019702	TCAC	2	8	1063460	1063467	25 %	25 %	0 %	50 %	428221126
15837	NC_019702	ATTTGA	2	12	1063739	1063750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428221127
15838	NC_019702	AC	3	6	1063833	1063838	50 %	0 %	0 %	50 %	428221127
15839	NC_019702	TCT	2	6	1063867	1063872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221127
15840	NC_019702	CGCAA	2	10	1063875	1063884	40 %	0 %	20 %	40 %	428221127
15841	NC_019702	ATT	2	6	1063892	1063897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221127
15842	NC_019702	TAG	2	6	1063979	1063984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221127
15843	NC_019702	TTTG	2	8	1064002	1064009	0 %	75 %	25 %	0 %	428221127
15844	NC_019702	CAG	2	6	1064248	1064253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221127
15845	NC_019702	CAT	2	6	1064260	1064265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221127
15846	NC_019702	TCAGG	2	10	1064294	1064303	20 %	20 %	40 %	20 %	428221127
15847	NC_019702	TAT	2	6	1064322	1064327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221127
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15849	NC_019702	TAG	2	6	1064607	1064612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221128
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15961	NC_019702	CCGTA	2	10	1071739	1071748	20 %	20 %	20 %	40 %	428221132
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