MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_019702	A	6	6	1006410	1006415	100 %	0 %	0 %	0 %	428221075
15002	NC_019702	AAT	2	6	1006433	1006438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221075
15003	NC_019702	AGC	2	6	1006459	1006464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221075
15004	NC_019702	GGCG	2	8	1006591	1006598	0 %	0 %	75 %	25 %	428221075
15005	NC_019702	TCT	2	6	1006651	1006656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221075
15006	NC_019702	TCAG	2	8	1006659	1006666	25 %	25 %	25 %	25 %	428221075
15007	NC_019702	AG	3	6	1006685	1006690	50 %	0 %	50 %	0 %	428221075
15008	NC_019702	CGG	2	6	1006719	1006724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221075
15009	NC_019702	GCA	2	6	1006865	1006870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221076
15010	NC_019702	CAA	2	6	1006929	1006934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221076
15011	NC_019702	AGA	2	6	1006946	1006951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221076
15012	NC_019702	ATC	2	6	1006978	1006983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221076
15013	NC_019702	AATT	2	8	1006999	1007006	50 %	50 %	0 %	0 %	428221076
15014	NC_019702	ATA	2	6	1007040	1007045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221076
15015	NC_019702	TTTCA	2	10	1007122	1007131	20 %	60 %	0 %	20 %	428221076
15016	NC_019702	TAAA	2	8	1007221	1007228	75 %	25 %	0 %	0 %	428221076
15017	NC_019702	AAT	2	6	1007332	1007337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221076
15018	NC_019702	AGA	2	6	1007400	1007405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221076
15019	NC_019702	TC	3	6	1007580	1007585	0 %	50 %	0 %	50 %	428221076
15020	NC_019702	AAT	2	6	1007620	1007625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221076
15021	NC_019702	AGC	2	6	1007713	1007718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221076
15022	NC_019702	TTAG	2	8	1007753	1007760	25 %	50 %	25 %	0 %	428221076
15023	NC_019702	CCA	2	6	1007898	1007903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221076
15024	NC_019702	CAC	2	6	1007973	1007978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221076
15025	NC_019702	AAG	2	6	1008062	1008067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221076
15026	NC_019702	CAA	2	6	1008114	1008119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221076
15027	NC_019702	CAG	2	6	1008138	1008143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221076
15028	NC_019702	TCAC	2	8	1008263	1008270	25 %	25 %	0 %	50 %	428221076
15029	NC_019702	GAT	2	6	1008322	1008327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221076
15030	NC_019702	GAC	2	6	1008337	1008342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221076
15031	NC_019702	TAT	2	6	1008357	1008362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221076
15032	NC_019702	TTC	2	6	1008385	1008390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221076
15033	NC_019702	TTC	2	6	1008469	1008474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221076
15034	NC_019702	CTCTTA	2	12	1008498	1008509	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428221076
15035	NC_019702	GCT	2	6	1008536	1008541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221076
15036	NC_019702	ACCGC	2	10	1008602	1008611	20 %	0 %	20 %	60 %	428221076
15037	NC_019702	TA	3	6	1008619	1008624	50 %	50 %	0 %	0 %	428221076
15038	NC_019702	CA	3	6	1008636	1008641	50 %	0 %	0 %	50 %	428221076
15039	NC_019702	ACT	2	6	1008794	1008799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221077
15040	NC_019702	ATG	2	6	1008807	1008812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221077
15041	NC_019702	TGA	2	6	1008858	1008863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221077
15042	NC_019702	CCA	2	6	1008964	1008969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221077
15043	NC_019702	TTACCT	2	12	1009029	1009040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428221077
15044	NC_019702	GGA	2	6	1009054	1009059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221077
15045	NC_019702	AGA	3	9	1009071	1009079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221077
15046	NC_019702	AAT	2	6	1009202	1009207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221077
15047	NC_019702	CTAAG	2	10	1009288	1009297	40 %	20 %	20 %	20 %	428221077
15048	NC_019702	CAC	2	6	1009298	1009303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221077
15049	NC_019702	ATT	2	6	1009316	1009321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221077
15050	NC_019702	CCTGA	2	10	1009337	1009346	20 %	20 %	20 %	40 %	428221077
15051	NC_019702	TTAC	2	8	1009353	1009360	25 %	50 %	0 %	25 %	428221077
15052	NC_019702	TTC	2	6	1009370	1009375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221077
15053	NC_019702	TGT	2	6	1009407	1009412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221077
15054	NC_019702	GCT	2	6	1009449	1009454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221077
15055	NC_019702	TAT	2	6	1009459	1009464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221077
15056	NC_019702	TAA	2	6	1009677	1009682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221077
15057	NC_019702	AT	3	6	1009802	1009807	50 %	50 %	0 %	0 %	428221077
15058	NC_019702	TAG	2	6	1009843	1009848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221077
15059	NC_019702	GAT	2	6	1009972	1009977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221077
15060	NC_019702	GTA	2	6	1010051	1010056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221077
15061	NC_019702	CGCTA	2	10	1010322	1010331	20 %	20 %	20 %	40 %	428221078
15062	NC_019702	CTG	2	6	1010366	1010371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221078
15063	NC_019702	AAC	2	6	1010441	1010446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221078
15064	NC_019702	AGGA	2	8	1010477	1010484	50 %	0 %	50 %	0 %	428221078
15065	NC_019702	ATT	2	6	1010487	1010492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221078
15066	NC_019702	TGC	2	6	1010501	1010506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221078
15067	NC_019702	TCAGT	2	10	1010529	1010538	20 %	40 %	20 %	20 %	428221078
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15069	NC_019702	ACC	2	6	1010619	1010624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221079
15070	NC_019702	CGG	2	6	1010639	1010644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221079
15071	NC_019702	ATT	2	6	1010658	1010663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221079
15072	NC_019702	CGC	2	6	1010721	1010726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221079
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15075	NC_019702	GCA	2	6	1010988	1010993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221079
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15077	NC_019702	TCAA	2	8	1011016	1011023	50 %	25 %	0 %	25 %	428221079
15078	NC_019702	ATT	2	6	1011039	1011044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221079
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15080	NC_019702	TGAT	2	8	1011160	1011167	25 %	50 %	25 %	0 %	428221079
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15083	NC_019702	TCGG	2	8	1011419	1011426	0 %	25 %	50 %	25 %	428221079
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15085	NC_019702	TGG	2	6	1011598	1011603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221079
15086	NC_019702	TG	3	6	1011625	1011630	0 %	50 %	50 %	0 %	428221079
15087	NC_019702	ATT	2	6	1011671	1011676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221080
15088	NC_019702	ATAG	2	8	1011684	1011691	50 %	25 %	25 %	0 %	428221080
15089	NC_019702	CAT	2	6	1011732	1011737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221080
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15091	NC_019702	ATT	2	6	1012075	1012080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221081
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15094	NC_019702	ATCAG	2	10	1012138	1012147	40 %	20 %	20 %	20 %	428221081
15095	NC_019702	GCA	2	6	1012240	1012245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221081
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15100	NC_019702	AT	3	6	1012390	1012395	50 %	50 %	0 %	0 %	428221081
15101	NC_019702	GCG	2	6	1012402	1012407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221081
15102	NC_019702	CCAT	2	8	1012411	1012418	25 %	25 %	0 %	50 %	428221081
15103	NC_019702	GTG	2	6	1012451	1012456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221081
15104	NC_019702	GATC	2	8	1012472	1012479	25 %	25 %	25 %	25 %	428221081
15105	NC_019702	CTT	2	6	1012481	1012486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221081
15106	NC_019702	CTT	2	6	1012499	1012504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221081
15107	NC_019702	ATA	2	6	1012574	1012579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221081
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15109	NC_019702	CTT	2	6	1012778	1012783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221081
15110	NC_019702	TAAA	2	8	1012817	1012824	75 %	25 %	0 %	0 %	428221081
15111	NC_019702	TCCTGA	2	12	1012885	1012896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428221081
15112	NC_019702	AAT	2	6	1013004	1013009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221081
15113	NC_019702	CAT	2	6	1013058	1013063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221081
15114	NC_019702	TTAA	2	8	1013158	1013165	50 %	50 %	0 %	0 %	428221081
15115	NC_019702	ATA	2	6	1013194	1013199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221081
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15117	NC_019702	CAG	2	6	1013339	1013344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221081
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15232	NC_019702	A	7	7	1024050	1024056	100 %	0 %	0 %	0 %	428221087
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15235	NC_019702	AAT	2	6	1024239	1024244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221087
15236	NC_019702	GCA	2	6	1024294	1024299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221087
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15332	NC_019702	ATA	2	6	1031352	1031357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221095
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15339	NC_019702	AGT	2	6	1031870	1031875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221096
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15342	NC_019702	TTG	2	6	1031959	1031964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221096
15343	NC_019702	GCT	2	6	1032021	1032026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221096
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15345	NC_019702	TCT	2	6	1032155	1032160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221097
15346	NC_019702	AGA	2	6	1032428	1032433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221097
15347	NC_019702	ATG	2	6	1032469	1032474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221097
15348	NC_019702	TGG	2	6	1032509	1032514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221097
15349	NC_019702	TGA	2	6	1032515	1032520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221097
15350	NC_019702	GGT	2	6	1032621	1032626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221097
15351	NC_019702	AAG	2	6	1032631	1032636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221097
15352	NC_019702	CTACAG	2	12	1032748	1032759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428221097
15353	NC_019702	AAC	2	6	1032821	1032826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221097
15354	NC_019702	GCGG	2	8	1032843	1032850	0 %	0 %	75 %	25 %	428221097
15355	NC_019702	AAC	2	6	1033003	1033008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221097
15356	NC_019702	GCG	2	6	1033028	1033033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428221097
15357	NC_019702	A	6	6	1033063	1033068	100 %	0 %	0 %	0 %	428221097
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15359	NC_019702	ATC	2	6	1033105	1033110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221097
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15361	NC_019702	CTAG	2	8	1033131	1033138	25 %	25 %	25 %	25 %	428221097
15362	NC_019702	AGA	2	6	1033157	1033162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221097
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15371	NC_019702	TACAG	2	10	1034199	1034208	40 %	20 %	20 %	20 %	428221098
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15375	NC_019702	ATT	2	6	1034310	1034315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221098
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15380	NC_019702	A	6	6	1034536	1034541	100 %	0 %	0 %	0 %	428221098
15381	NC_019702	CAAG	2	8	1034594	1034601	50 %	0 %	25 %	25 %	428221099
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15403	NC_019702	T	6	6	1035405	1035410	0 %	100 %	0 %	0 %	428221099
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15452	NC_019702	GCTCTG	2	12	1038556	1038567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221103
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15456	NC_019702	A	7	7	1038788	1038794	100 %	0 %	0 %	0 %	428221103
15457	NC_019702	TAG	2	6	1038827	1038832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221103
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15459	NC_019702	GGCA	2	8	1038922	1038929	25 %	0 %	50 %	25 %	428221103
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15461	NC_019702	ATT	2	6	1038996	1039001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221103
15462	NC_019702	TAGGT	2	10	1039033	1039042	20 %	40 %	40 %	0 %	428221103
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15465	NC_019702	TAAT	2	8	1039106	1039113	50 %	50 %	0 %	0 %	428221104
15466	NC_019702	A	6	6	1039193	1039198	100 %	0 %	0 %	0 %	428221104
15467	NC_019702	CTAT	2	8	1039284	1039291	25 %	50 %	0 %	25 %	428221104
15468	NC_019702	ATC	2	6	1039347	1039352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221104
15469	NC_019702	ATT	3	9	1039540	1039548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221104
15470	NC_019702	TAAT	2	8	1039613	1039620	50 %	50 %	0 %	0 %	428221104
15471	NC_019702	TAA	2	6	1039716	1039721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221104
15472	NC_019702	TAG	2	6	1039772	1039777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221104
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15477	NC_019702	CTAG	2	8	1039972	1039979	25 %	25 %	25 %	25 %	428221104
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