MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_019702	CCCG	2	8	942650	942657	0 %	0 %	25 %	75 %	428221022
14002	NC_019702	AAT	2	6	942683	942688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221022
14003	NC_019702	TGG	2	6	942772	942777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221022
14004	NC_019702	TCA	2	6	942826	942831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221022
14005	NC_019702	GAA	2	6	942851	942856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221022
14006	NC_019702	AGA	2	6	942901	942906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221022
14007	NC_019702	TGG	2	6	943009	943014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221022
14008	NC_019702	TGA	2	6	943129	943134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221022
14009	NC_019702	ACT	2	6	943305	943310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221023
14010	NC_019702	AGCGA	2	10	943388	943397	40 %	0 %	40 %	20 %	428221023
14011	NC_019702	CCATT	2	10	943398	943407	20 %	40 %	0 %	40 %	428221023
14012	NC_019702	TTC	2	6	943439	943444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221023
14013	NC_019702	AGG	2	6	943457	943462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221023
14014	NC_019702	GTT	2	6	943475	943480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221023
14015	NC_019702	TAA	2	6	943481	943486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221023
14016	NC_019702	ATC	2	6	943493	943498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221023
14017	NC_019702	GTA	2	6	943506	943511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221023
14018	NC_019702	CAT	2	6	943705	943710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221024
14019	NC_019702	CGC	2	6	943715	943720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221024
14020	NC_019702	CTG	2	6	943828	943833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221024
14021	NC_019702	TGC	2	6	943874	943879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221024
14022	NC_019702	TCA	2	6	943887	943892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221024
14023	NC_019702	ATA	2	6	943893	943898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221024
14024	NC_019702	CTG	3	9	943924	943932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221024
14025	NC_019702	CCA	2	6	944047	944052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221024
14026	NC_019702	TTC	2	6	944108	944113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221024
14027	NC_019702	ATC	2	6	944210	944215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221024
14028	NC_019702	CCAT	2	8	944298	944305	25 %	25 %	0 %	50 %	428221024
14029	NC_019702	CAG	2	6	944407	944412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221024
14030	NC_019702	CTGC	2	8	944514	944521	0 %	25 %	25 %	50 %	428221024
14031	NC_019702	AAT	2	6	944531	944536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221024
14032	NC_019702	TAGAT	2	10	944557	944566	40 %	40 %	20 %	0 %	428221024
14033	NC_019702	CTG	2	6	944695	944700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221025
14034	NC_019702	GATT	2	8	944726	944733	25 %	50 %	25 %	0 %	428221025
14035	NC_019702	CCAC	2	8	944879	944886	25 %	0 %	0 %	75 %	428221025
14036	NC_019702	CATTGG	2	12	944916	944927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428221025
14037	NC_019702	AGGT	2	8	944953	944960	25 %	25 %	50 %	0 %	428221025
14038	NC_019702	TGA	2	6	944961	944966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221025
14039	NC_019702	ATT	3	9	945013	945021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221025
14040	NC_019702	GTT	2	6	945028	945033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221025
14041	NC_019702	ATT	2	6	945043	945048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221025
14042	NC_019702	CAT	2	6	945150	945155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221025
14043	NC_019702	AC	3	6	945183	945188	50 %	0 %	0 %	50 %	428221025
14044	NC_019702	CAG	2	6	945297	945302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221025
14045	NC_019702	GCA	2	6	945449	945454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221025
14046	NC_019702	AAT	2	6	945514	945519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221025
14047	NC_019702	CTG	2	6	945549	945554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221025
14048	NC_019702	AAT	2	6	945750	945755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221025
14049	NC_019702	AGA	2	6	945793	945798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221025
14050	NC_019702	CGC	2	6	945823	945828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428221025
14051	NC_019702	ATA	2	6	945887	945892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221025
14052	NC_019702	AGA	2	6	945955	945960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428221025
14053	NC_019702	TACA	2	8	945979	945986	50 %	25 %	0 %	25 %	428221025
14054	NC_019702	GCT	2	6	946007	946012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221025
14055	NC_019702	TGG	2	6	946405	946410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221026
14056	NC_019702	CTT	2	6	946443	946448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221026
14057	NC_019702	ATT	2	6	946460	946465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221026
14058	NC_019702	GTG	2	6	946467	946472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221026
14059	NC_019702	TGG	3	9	946554	946562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221026
14060	NC_019702	CGTC	2	8	946570	946577	0 %	25 %	25 %	50 %	428221026
14061	NC_019702	GTA	2	6	946776	946781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221027
14062	NC_019702	CTG	2	6	946822	946827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221027
14063	NC_019702	AGC	2	6	946895	946900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221027
14064	NC_019702	AGT	2	6	946907	946912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221027
14065	NC_019702	AGC	2	6	946952	946957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221027
14066	NC_019702	AGG	2	6	947039	947044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221027
14067	NC_019702	GTT	2	6	947099	947104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221027
14068	NC_019702	TTA	2	6	947149	947154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221027
14069	NC_019702	TTG	2	6	947162	947167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428221027
14070	NC_019702	ATG	2	6	947179	947184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221027
14071	NC_019702	TAA	2	6	947261	947266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221027
14072	NC_019702	CCA	2	6	947267	947272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221027
14073	NC_019702	GGA	2	6	947312	947317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221027
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14075	NC_019702	T	6	6	947486	947491	0 %	100 %	0 %	0 %	428221027
14076	NC_019702	ATT	2	6	947537	947542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221027
14077	NC_019702	TGA	2	6	947555	947560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221027
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14079	NC_019702	GATCA	2	10	947693	947702	40 %	20 %	20 %	20 %	428221027
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14081	NC_019702	GCA	2	6	947780	947785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221027
14082	NC_019702	AGG	2	6	947876	947881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221027
14083	NC_019702	AT	3	6	947893	947898	50 %	50 %	0 %	0 %	428221027
14084	NC_019702	GGGT	2	8	947958	947965	0 %	25 %	75 %	0 %	428221027
14085	NC_019702	GGGTA	2	10	948263	948272	20 %	20 %	60 %	0 %	428221028
14086	NC_019702	ATC	2	6	948288	948293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221028
14087	NC_019702	CAAC	2	8	948312	948319	50 %	0 %	0 %	50 %	428221028
14088	NC_019702	CA	3	6	948346	948351	50 %	0 %	0 %	50 %	428221028
14089	NC_019702	CTG	2	6	948381	948386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221028
14090	NC_019702	CGGG	2	8	948395	948402	0 %	0 %	75 %	25 %	428221028
14091	NC_019702	AGG	2	6	948482	948487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428221028
14092	NC_019702	CAG	2	6	948573	948578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221028
14093	NC_019702	T	6	6	948583	948588	0 %	100 %	0 %	0 %	428221028
14094	NC_019702	ATCC	2	8	948645	948652	25 %	25 %	0 %	50 %	428221028
14095	NC_019702	CAT	3	9	948659	948667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221028
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14098	NC_019702	TAAT	2	8	948727	948734	50 %	50 %	0 %	0 %	428221028
14099	NC_019702	CCAA	2	8	948771	948778	50 %	0 %	0 %	50 %	428221028
14100	NC_019702	CTT	2	6	948788	948793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221028
14101	NC_019702	TTC	2	6	948849	948854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221028
14102	NC_019702	ATC	2	6	948903	948908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221028
14103	NC_019702	ATC	2	6	948979	948984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221028
14104	NC_019702	CCA	2	6	948986	948991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221028
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14106	NC_019702	TCA	2	6	949123	949128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221028
14107	NC_019702	TCT	2	6	949246	949251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221028
14108	NC_019702	CTT	2	6	949295	949300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221028
14109	NC_019702	TAG	2	6	949340	949345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221028
14110	NC_019702	TTA	2	6	949366	949371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221028
14111	NC_019702	ATC	2	6	949461	949466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221028
14112	NC_019702	TCG	2	6	949574	949579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221028
14113	NC_019702	AG	3	6	949667	949672	50 %	0 %	50 %	0 %	428221028
14114	NC_019702	TTAC	2	8	949715	949722	25 %	50 %	0 %	25 %	428221028
14115	NC_019702	ATT	2	6	949999	950004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221029
14116	NC_019702	AAT	2	6	950019	950024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221029
14117	NC_019702	CCTG	2	8	950046	950053	0 %	25 %	25 %	50 %	428221029
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14119	NC_019702	AAT	2	6	950537	950542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428221029
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14226	NC_019702	GCA	2	6	957456	957461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221037
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14230	NC_019702	TGA	2	6	957602	957607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428221037
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14233	NC_019702	TACC	2	8	957711	957718	25 %	25 %	0 %	50 %	428221037
14234	NC_019702	TAT	2	6	957824	957829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428221037
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14240	NC_019702	CTA	2	6	958244	958249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221037
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14361	NC_019702	CTT	2	6	965256	965261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221045
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14468	NC_019702	CCA	2	6	971274	971279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428221052
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14472	NC_019702	TCT	2	6	971615	971620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221052
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14475	NC_019702	ATC	2	6	971934	971939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221053
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14477	NC_019702	TCT	2	6	972081	972086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221053
14478	NC_019702	ATC	2	6	972444	972449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221053
14479	NC_019702	GCT	2	6	972971	972976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221054
14480	NC_019702	T	6	6	973080	973085	0 %	100 %	0 %	0 %	428221054
14481	NC_019702	TAC	2	6	973087	973092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428221054
14482	NC_019702	GTG	2	6	973289	973294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428221054
14483	NC_019702	ATGA	2	8	973316	973323	50 %	25 %	25 %	0 %	428221054
14484	NC_019702	TCC	2	6	973366	973371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428221054
14485	NC_019702	A	7	7	973547	973553	100 %	0 %	0 %	0 %	428221054
14486	NC_019702	A	6	6	973589	973594	100 %	0 %	0 %	0 %	428221054
14487	NC_019702	CAA	2	6	973658	973663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428221054
14488	NC_019702	TGC	2	6	973671	973676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221054
14489	NC_019702	TGAA	2	8	973749	973756	50 %	25 %	25 %	0 %	428221054
14490	NC_019702	AT	3	6	973828	973833	50 %	50 %	0 %	0 %	428221054
14491	NC_019702	TTC	2	6	973834	973839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428221054
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14493	NC_019702	CAG	2	6	973913	973918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428221054
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14497	NC_019702	TGC	2	6	974140	974145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428221054
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