MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019702	TAA	2	6	34020	34025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220168
502	NC_019702	GGC	2	6	34053	34058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220168
503	NC_019702	TAAC	2	8	34064	34071	50 %	25 %	0 %	25 %	428220168
504	NC_019702	GCT	2	6	34207	34212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220168
505	NC_019702	CAG	2	6	34393	34398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220168
506	NC_019702	TGG	2	6	34412	34417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220168
507	NC_019702	TAA	2	6	34485	34490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220168
508	NC_019702	AAG	2	6	34598	34603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220168
509	NC_019702	TTC	2	6	34652	34657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220168
510	NC_019702	A	6	6	34734	34739	100 %	0 %	0 %	0 %	428220169
511	NC_019702	A	7	7	35147	35153	100 %	0 %	0 %	0 %	428220169
512	NC_019702	AAC	2	6	35168	35173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220169
513	NC_019702	GT	3	6	35191	35196	0 %	50 %	50 %	0 %	428220169
514	NC_019702	ACA	2	6	35216	35221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220169
515	NC_019702	TG	3	6	35228	35233	0 %	50 %	50 %	0 %	428220169
516	NC_019702	GAT	2	6	35325	35330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220169
517	NC_019702	CTGC	2	8	35340	35347	0 %	25 %	25 %	50 %	428220169
518	NC_019702	GAT	2	6	35361	35366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220169
519	NC_019702	GCA	2	6	35747	35752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220169
520	NC_019702	CTTTT	2	10	35798	35807	0 %	80 %	0 %	20 %	428220169
521	NC_019702	T	6	6	35804	35809	0 %	100 %	0 %	0 %	428220169
522	NC_019702	TAT	2	6	35854	35859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220169
523	NC_019702	GCG	2	6	35948	35953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220170
524	NC_019702	GAA	2	6	35959	35964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220170
525	NC_019702	CCA	2	6	35977	35982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220170
526	NC_019702	ATA	2	6	36022	36027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220170
527	NC_019702	ACCTT	2	10	36057	36066	20 %	40 %	0 %	40 %	428220170
528	NC_019702	CGC	2	6	36152	36157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220170
529	NC_019702	A	6	6	36158	36163	100 %	0 %	0 %	0 %	428220170
530	NC_019702	CCA	2	6	36298	36303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220170
531	NC_019702	GATGGT	2	12	36313	36324	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428220170
532	NC_019702	GAT	2	6	36344	36349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220170
533	NC_019702	TAA	3	9	36445	36453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220170
534	NC_019702	TTGA	2	8	36728	36735	25 %	50 %	25 %	0 %	428220171
535	NC_019702	ATT	2	6	36774	36779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220171
536	NC_019702	TCT	2	6	36829	36834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220171
537	NC_019702	AAT	2	6	36846	36851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220171
538	NC_019702	CAT	2	6	36884	36889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220171
539	NC_019702	ACA	2	6	36935	36940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220171
540	NC_019702	TGA	2	6	37060	37065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220171
541	NC_019702	TAA	2	6	37131	37136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220171
542	NC_019702	TCC	2	6	37188	37193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220171
543	NC_019702	TTCA	2	8	37290	37297	25 %	50 %	0 %	25 %	428220171
544	NC_019702	GCC	3	9	37453	37461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220171
545	NC_019702	AAT	2	6	37494	37499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220171
546	NC_019702	CGAT	2	8	37535	37542	25 %	25 %	25 %	25 %	428220171
547	NC_019702	AAT	2	6	37548	37553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220171
548	NC_019702	GCC	3	9	37554	37562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220171
549	NC_019702	AAT	2	6	37563	37568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220171
550	NC_019702	A	7	7	37719	37725	100 %	0 %	0 %	0 %	428220172
551	NC_019702	TGG	2	6	37736	37741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220172
552	NC_019702	AT	3	6	37825	37830	50 %	50 %	0 %	0 %	428220172
553	NC_019702	ACCC	2	8	37849	37856	25 %	0 %	0 %	75 %	428220172
554	NC_019702	CAT	2	6	37873	37878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220172
555	NC_019702	TGG	2	6	37898	37903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220172
556	NC_019702	AG	3	6	37914	37919	50 %	0 %	50 %	0 %	428220172
557	NC_019702	T	6	6	37932	37937	0 %	100 %	0 %	0 %	428220172
558	NC_019702	ATA	2	6	37965	37970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220172
559	NC_019702	AT	3	6	37978	37983	50 %	50 %	0 %	0 %	428220172
560	NC_019702	ATG	2	6	38025	38030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220172
561	NC_019702	TATT	2	8	38037	38044	25 %	75 %	0 %	0 %	428220172
562	NC_019702	TACC	2	8	38093	38100	25 %	25 %	0 %	50 %	428220172
563	NC_019702	GAT	2	6	38149	38154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220172
564	NC_019702	AAT	2	6	38168	38173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220172
565	NC_019702	TAA	2	6	38293	38298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220172
566	NC_019702	TAA	2	6	38305	38310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220173
567	NC_019702	TAA	3	9	38452	38460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220173
568	NC_019702	TGC	2	6	38503	38508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220173
569	NC_019702	AAT	2	6	38596	38601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220173
570	NC_019702	CAT	2	6	38611	38616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220173
571	NC_019702	TCAG	2	8	38663	38670	25 %	25 %	25 %	25 %	428220173
572	NC_019702	CCG	4	12	38691	38702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220173
573	NC_019702	CA	3	6	38739	38744	50 %	0 %	0 %	50 %	428220173
574	NC_019702	TGAC	2	8	38792	38799	25 %	25 %	25 %	25 %	428220173
575	NC_019702	CAT	2	6	38802	38807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220173
576	NC_019702	TAG	2	6	38832	38837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220173
577	NC_019702	TAA	2	6	38986	38991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220174
578	NC_019702	TCA	2	6	39034	39039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220174
579	NC_019702	CTGG	2	8	39167	39174	0 %	25 %	50 %	25 %	428220174
580	NC_019702	CTT	2	6	39297	39302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220175
581	NC_019702	CTT	2	6	39338	39343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220175
582	NC_019702	CCG	2	6	39365	39370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220175
583	NC_019702	ATT	3	9	39471	39479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220175
584	NC_019702	T	6	6	39566	39571	0 %	100 %	0 %	0 %	428220175
585	NC_019702	T	6	6	39621	39626	0 %	100 %	0 %	0 %	428220175
586	NC_019702	AAT	2	6	39630	39635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220175
587	NC_019702	ATGCCC	2	12	39641	39652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428220175
588	NC_019702	AAC	2	6	39668	39673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220175
589	NC_019702	AAG	2	6	39849	39854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220176
590	NC_019702	AACT	2	8	39886	39893	50 %	25 %	0 %	25 %	428220176
591	NC_019702	A	6	6	40021	40026	100 %	0 %	0 %	0 %	428220176
592	NC_019702	TAA	2	6	40087	40092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220176
593	NC_019702	AT	3	6	40250	40255	50 %	50 %	0 %	0 %	428220176
594	NC_019702	A	8	8	40308	40315	100 %	0 %	0 %	0 %	428220176
595	NC_019702	ACCA	2	8	40335	40342	50 %	0 %	0 %	50 %	428220176
596	NC_019702	AGTG	2	8	40409	40416	25 %	25 %	50 %	0 %	428220176
597	NC_019702	CTTA	2	8	40423	40430	25 %	50 %	0 %	25 %	428220176
598	NC_019702	AGAT	2	8	40442	40449	50 %	25 %	25 %	0 %	428220176
599	NC_019702	TAA	2	6	40681	40686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220177
600	NC_019702	ATG	2	6	40696	40701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220177
601	NC_019702	GAT	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220177
602	NC_019702	TAC	2	6	40750	40755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220177
603	NC_019702	CAC	2	6	40803	40808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220177
604	NC_019702	CTA	2	6	40932	40937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220177
605	NC_019702	CAT	2	6	41011	41016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220177
606	NC_019702	AGT	2	6	41119	41124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220178
607	NC_019702	GGC	2	6	41136	41141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220178
608	NC_019702	CTG	2	6	41205	41210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220178
609	NC_019702	TCA	2	6	41239	41244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220178
610	NC_019702	ATA	2	6	41245	41250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220178
611	NC_019702	TTAC	2	8	41326	41333	25 %	50 %	0 %	25 %	428220178
612	NC_019702	GCA	2	6	41338	41343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220178
613	NC_019702	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220179
614	NC_019702	AT	3	6	41632	41637	50 %	50 %	0 %	0 %	428220179
615	NC_019702	GAC	2	6	41651	41656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220179
616	NC_019702	TCT	2	6	41758	41763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220179
617	NC_019702	TAG	2	6	41814	41819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220179
618	NC_019702	AAGT	2	8	41886	41893	50 %	25 %	25 %	0 %	428220179
619	NC_019702	TTA	2	6	42070	42075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220179
620	NC_019702	CCA	2	6	42153	42158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220179
621	NC_019702	ACT	2	6	42292	42297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220179
622	NC_019702	ATC	2	6	42316	42321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220179
623	NC_019702	CAT	2	6	42353	42358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220179
624	NC_019702	GTAG	2	8	42406	42413	25 %	25 %	50 %	0 %	428220179
625	NC_019702	GTG	2	6	42445	42450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220179
626	NC_019702	AT	3	6	42451	42456	50 %	50 %	0 %	0 %	428220179
627	NC_019702	AT	3	6	42483	42488	50 %	50 %	0 %	0 %	428220179
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629	NC_019702	CTTG	2	8	42569	42576	0 %	50 %	25 %	25 %	428220179
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758	NC_019702	TCC	2	6	51886	51891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220188
759	NC_019702	TAT	2	6	52019	52024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220188
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762	NC_019702	TGG	2	6	52218	52223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220188
763	NC_019702	GATT	2	8	52250	52257	25 %	50 %	25 %	0 %	428220188
764	NC_019702	AGTT	2	8	52307	52314	25 %	50 %	25 %	0 %	428220188
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773	NC_019702	AGT	2	6	52889	52894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220190
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831	NC_019702	TAA	2	6	56391	56396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220195
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