MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019680	TGT	2	6	262118	262123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711411
4002	NC_019680	GCC	3	9	262137	262145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711411
4003	NC_019680	TCA	2	6	262164	262169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711411
4004	NC_019680	GA	3	6	262211	262216	50 %	0 %	50 %	0 %	427711411
4005	NC_019680	CTG	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711411
4006	NC_019680	GCC	3	9	262377	262385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711411
4007	NC_019680	ACCA	2	8	262386	262393	50 %	0 %	0 %	50 %	427711411
4008	NC_019680	GCT	2	6	262398	262403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711411
4009	NC_019680	CCA	3	9	262486	262494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711411
4010	NC_019680	GGGT	2	8	262543	262550	0 %	25 %	75 %	0 %	427711411
4011	NC_019680	TTG	2	6	262705	262710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711411
4012	NC_019680	CGGC	2	8	262748	262755	0 %	0 %	50 %	50 %	427711411
4013	NC_019680	ATC	2	6	262970	262975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711411
4014	NC_019680	GGTG	2	8	263118	263125	0 %	25 %	75 %	0 %	427711411
4015	NC_019680	CA	3	6	263442	263447	50 %	0 %	0 %	50 %	427711412
4016	NC_019680	CTTGG	2	10	263461	263470	0 %	40 %	40 %	20 %	427711412
4017	NC_019680	GCG	2	6	263479	263484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711412
4018	NC_019680	GAT	2	6	263497	263502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711412
4019	NC_019680	CCCT	2	8	263597	263604	0 %	25 %	0 %	75 %	427711412
4020	NC_019680	CT	3	6	263609	263614	0 %	50 %	0 %	50 %	427711412
4021	NC_019680	T	7	7	263631	263637	0 %	100 %	0 %	0 %	427711412
4022	NC_019680	TTG	2	6	263655	263660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711412
4023	NC_019680	GTT	2	6	263818	263823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711412
4024	NC_019680	ATG	2	6	263825	263830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711412
4025	NC_019680	TGC	2	6	263847	263852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711412
4026	NC_019680	T	6	6	263857	263862	0 %	100 %	0 %	0 %	427711412
4027	NC_019680	TGG	2	6	263876	263881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711412
4028	NC_019680	TTA	2	6	263892	263897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711412
4029	NC_019680	TCC	2	6	263976	263981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711412
4030	NC_019680	TGA	3	9	263983	263991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711412
4031	NC_019680	TGAT	2	8	264012	264019	25 %	50 %	25 %	0 %	427711412
4032	NC_019680	TGGCC	2	10	264187	264196	0 %	20 %	40 %	40 %	427711412
4033	NC_019680	TGGCC	2	10	264319	264328	0 %	20 %	40 %	40 %	427711412
4034	NC_019680	TTG	2	6	264338	264343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711412
4035	NC_019680	ATC	2	6	264347	264352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711412
4036	NC_019680	GGA	2	6	264520	264525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711412
4037	NC_019680	TGG	2	6	264569	264574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711412
4038	NC_019680	CGG	2	6	264578	264583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711412
4039	NC_019680	G	6	6	264624	264629	0 %	0 %	100 %	0 %	427711412
4040	NC_019680	TTGG	2	8	264638	264645	0 %	50 %	50 %	0 %	427711412
4041	NC_019680	AAT	2	6	264752	264757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711412
4042	NC_019680	CTA	2	6	264790	264795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711412
4043	NC_019680	TTC	2	6	264831	264836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711412
4044	NC_019680	GTT	2	6	264851	264856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711412
4045	NC_019680	CTA	2	6	264874	264879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711412
4046	NC_019680	GCT	2	6	265260	265265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711413
4047	NC_019680	C	6	6	265332	265337	0 %	0 %	0 %	100 %	427711413
4048	NC_019680	GATC	2	8	265388	265395	25 %	25 %	25 %	25 %	427711413
4049	NC_019680	G	6	6	265417	265422	0 %	0 %	100 %	0 %	427711413
4050	NC_019680	CCGAG	2	10	265637	265646	20 %	0 %	40 %	40 %	427711413
4051	NC_019680	TTG	2	6	265660	265665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711413
4052	NC_019680	CCCT	2	8	265692	265699	0 %	25 %	0 %	75 %	427711413
4053	NC_019680	CCA	2	6	265706	265711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711413
4054	NC_019680	GCC	2	6	265747	265752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711413
4055	NC_019680	GCC	2	6	265821	265826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711413
4056	NC_019680	TGG	2	6	265955	265960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711413
4057	NC_019680	GAT	2	6	265991	265996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711413
4058	NC_019680	A	6	6	265999	266004	100 %	0 %	0 %	0 %	427711413
4059	NC_019680	ATT	2	6	266028	266033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711413
4060	NC_019680	GGGGA	2	10	266037	266046	20 %	0 %	80 %	0 %	427711413
4061	NC_019680	AG	4	8	266102	266109	50 %	0 %	50 %	0 %	427711413
4062	NC_019680	C	6	6	266156	266161	0 %	0 %	0 %	100 %	427711413
4063	NC_019680	CCT	2	6	266265	266270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711414
4064	NC_019680	TGG	2	6	266320	266325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711414
4065	NC_019680	AAG	3	9	266357	266365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711414
4066	NC_019680	ACCCA	2	10	266389	266398	40 %	0 %	0 %	60 %	427711414
4067	NC_019680	TGGG	2	8	266433	266440	0 %	25 %	75 %	0 %	427711414
4068	NC_019680	A	7	7	266493	266499	100 %	0 %	0 %	0 %	427711414
4069	NC_019680	AGG	2	6	266510	266515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711414
4070	NC_019680	GAC	2	6	266548	266553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711414
4071	NC_019680	CAC	2	6	266577	266582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711414
4072	NC_019680	CAA	2	6	266589	266594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711414
4073	NC_019680	CT	3	6	266751	266756	0 %	50 %	0 %	50 %	427711414
4074	NC_019680	TCC	2	6	266796	266801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711414
4075	NC_019680	TTC	2	6	266805	266810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711414
4076	NC_019680	CTC	2	6	266819	266824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711414
4077	NC_019680	GCT	2	6	266835	266840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711414
4078	NC_019680	C	6	6	266891	266896	0 %	0 %	0 %	100 %	427711415
4079	NC_019680	CTCC	2	8	266910	266917	0 %	25 %	0 %	75 %	427711415
4080	NC_019680	CCT	2	6	266943	266948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711415
4081	NC_019680	CAA	2	6	267046	267051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711415
4082	NC_019680	G	7	7	267147	267153	0 %	0 %	100 %	0 %	427711415
4083	NC_019680	GGT	2	6	267348	267353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711415
4084	NC_019680	AT	4	8	267482	267489	50 %	50 %	0 %	0 %	427711415
4085	NC_019680	GGC	2	6	267495	267500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711415
4086	NC_019680	AGC	2	6	267519	267524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711415
4087	NC_019680	CCTGG	2	10	267601	267610	0 %	20 %	40 %	40 %	427711415
4088	NC_019680	GGC	2	6	267612	267617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711415
4089	NC_019680	TGA	2	6	267687	267692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711415
4090	NC_019680	ACC	2	6	267733	267738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711415
4091	NC_019680	CCCG	2	8	267764	267771	0 %	0 %	25 %	75 %	427711415
4092	NC_019680	ATT	2	6	267772	267777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711415
4093	NC_019680	TTGGTT	2	12	267858	267869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711415
4094	NC_019680	CAG	2	6	267964	267969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711415
4095	NC_019680	GCC	2	6	268029	268034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711415
4096	NC_019680	CAC	2	6	268088	268093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711415
4097	NC_019680	TCC	2	6	268164	268169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711415
4098	NC_019680	A	6	6	268175	268180	100 %	0 %	0 %	0 %	427711415
4099	NC_019680	C	6	6	268186	268191	0 %	0 %	0 %	100 %	427711415
4100	NC_019680	CCCCAG	2	12	268205	268216	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	427711415
4101	NC_019680	GC	3	6	268504	268509	0 %	0 %	50 %	50 %	427711416
4102	NC_019680	ATT	2	6	268522	268527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711416
4103	NC_019680	CGG	2	6	268668	268673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711416
4104	NC_019680	TGG	2	6	268710	268715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711416
4105	NC_019680	TG	3	6	268819	268824	0 %	50 %	50 %	0 %	427711416
4106	NC_019680	TTGCCA	2	12	268858	268869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427711416
4107	NC_019680	GAA	2	6	268939	268944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711416
4108	NC_019680	CCT	2	6	269004	269009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711416
4109	NC_019680	CTAT	2	8	269167	269174	25 %	50 %	0 %	25 %	427711416
4110	NC_019680	GCC	2	6	269272	269277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711417
4111	NC_019680	CGC	2	6	269322	269327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711417
4112	NC_019680	GTC	2	6	269395	269400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711417
4113	NC_019680	CTG	2	6	269407	269412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711417
4114	NC_019680	TTTTCC	2	12	269494	269505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711417
4115	NC_019680	AT	3	6	269525	269530	50 %	50 %	0 %	0 %	427711417
4116	NC_019680	CAA	2	6	269569	269574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711417
4117	NC_019680	ATC	2	6	269585	269590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711417
4118	NC_019680	GGC	2	6	269605	269610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711417
4119	NC_019680	T	6	6	269647	269652	0 %	100 %	0 %	0 %	427711417
4120	NC_019680	TC	3	6	269709	269714	0 %	50 %	0 %	50 %	427711417
4121	NC_019680	C	6	6	269726	269731	0 %	0 %	0 %	100 %	427711417
4122	NC_019680	AAAC	2	8	269869	269876	75 %	0 %	0 %	25 %	427711417
4123	NC_019680	AGC	2	6	269895	269900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711417
4124	NC_019680	GGC	2	6	269922	269927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711417
4125	NC_019680	TTA	2	6	270085	270090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711417
4126	NC_019680	ATT	2	6	270134	270139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711417
4127	NC_019680	ATC	2	6	270158	270163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711417
4128	NC_019680	GCC	2	6	270275	270280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711417
4129	NC_019680	TAA	2	6	270294	270299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711417
4130	NC_019680	A	6	6	270298	270303	100 %	0 %	0 %	0 %	427711417
4131	NC_019680	GCT	2	6	270328	270333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711417
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4134	NC_019680	A	7	7	270445	270451	100 %	0 %	0 %	0 %	427711417
4135	NC_019680	GTA	2	6	270482	270487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711417
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4139	NC_019680	A	6	6	270732	270737	100 %	0 %	0 %	0 %	427711417
4140	NC_019680	GGA	2	6	270753	270758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711417
4141	NC_019680	ATC	2	6	270842	270847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711417
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4143	NC_019680	AT	3	6	270922	270927	50 %	50 %	0 %	0 %	427711418
4144	NC_019680	TGT	2	6	270943	270948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711418
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4146	NC_019680	TAGA	2	8	271075	271082	50 %	25 %	25 %	0 %	427711418
4147	NC_019680	A	6	6	271102	271107	100 %	0 %	0 %	0 %	427711418
4148	NC_019680	CAT	2	6	271149	271154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711418
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4151	NC_019680	TGAT	2	8	271453	271460	25 %	50 %	25 %	0 %	427711418
4152	NC_019680	ATT	2	6	271467	271472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711418
4153	NC_019680	TCA	2	6	271479	271484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711418
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4159	NC_019680	TGAT	2	8	272788	272795	25 %	50 %	25 %	0 %	427711420
4160	NC_019680	A	6	6	272962	272967	100 %	0 %	0 %	0 %	427711420
4161	NC_019680	AAG	2	6	273016	273021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711420
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4165	NC_019680	ATTGGG	2	12	273214	273225	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427711420
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4200	NC_019680	TGA	2	6	274944	274949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711423
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4202	NC_019680	CGC	2	6	274962	274967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711423
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4205	NC_019680	GTG	3	9	275075	275083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711423
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4213	NC_019680	GATT	2	8	275494	275501	25 %	50 %	25 %	0 %	427711423
4214	NC_019680	G	6	6	275518	275523	0 %	0 %	100 %	0 %	427711423
4215	NC_019680	TAT	2	6	275571	275576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711423
4216	NC_019680	CAAT	2	8	275641	275648	50 %	25 %	0 %	25 %	427711423
4217	NC_019680	GGCGGG	2	12	275664	275675	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	427711423
4218	NC_019680	ACT	2	6	275785	275790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711424
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4220	NC_019680	T	7	7	275844	275850	0 %	100 %	0 %	0 %	427711424
4221	NC_019680	TGA	2	6	276022	276027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711424
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4223	NC_019680	AAC	2	6	276099	276104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711424
4224	NC_019680	ACCCG	2	10	276113	276122	20 %	0 %	20 %	60 %	427711424
4225	NC_019680	CT	3	6	276124	276129	0 %	50 %	0 %	50 %	427711424
4226	NC_019680	ATC	3	9	276180	276188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711424
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4228	NC_019680	CGC	2	6	276315	276320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711424
4229	NC_019680	AT	3	6	276376	276381	50 %	50 %	0 %	0 %	427711424
4230	NC_019680	GTCT	2	8	276451	276458	0 %	50 %	25 %	25 %	427711424
4231	NC_019680	A	6	6	276471	276476	100 %	0 %	0 %	0 %	427711424
4232	NC_019680	CCA	2	6	276559	276564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711424
4233	NC_019680	CCGA	2	8	276580	276587	25 %	0 %	25 %	50 %	427711424
4234	NC_019680	CTC	2	6	276647	276652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711424
4235	NC_019680	GC	3	6	276667	276672	0 %	0 %	50 %	50 %	427711424
4236	NC_019680	CAT	2	6	276679	276684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711424
4237	NC_019680	G	6	6	276860	276865	0 %	0 %	100 %	0 %	427711424
4238	NC_019680	GCT	2	6	276891	276896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711424
4239	NC_019680	ATT	2	6	276902	276907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711424
4240	NC_019680	GAA	2	6	276908	276913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711424
4241	NC_019680	GCG	2	6	276925	276930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711424
4242	NC_019680	ATTT	2	8	276933	276940	25 %	75 %	0 %	0 %	427711424
4243	NC_019680	CGG	2	6	276965	276970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711424
4244	NC_019680	TC	3	6	277234	277239	0 %	50 %	0 %	50 %	427711425
4245	NC_019680	TCC	2	6	277398	277403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711425
4246	NC_019680	CCAGGC	2	12	277411	277422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711425
4247	NC_019680	CTC	2	6	277559	277564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711425
4248	NC_019680	ATCCC	2	10	277594	277603	20 %	20 %	0 %	60 %	427711425
4249	NC_019680	CAT	2	6	277812	277817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711426
4250	NC_019680	TTG	2	6	277825	277830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711426
4251	NC_019680	CTC	2	6	277929	277934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711426
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4253	NC_019680	CTC	2	6	278022	278027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711426
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4262	NC_019680	CCTC	2	8	278458	278465	0 %	25 %	0 %	75 %	427711426
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4273	NC_019680	A	6	6	279263	279268	100 %	0 %	0 %	0 %	427711427
4274	NC_019680	GCCTGG	2	12	279409	279420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711427
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4276	NC_019680	C	6	6	279650	279655	0 %	0 %	0 %	100 %	427711427
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4285	NC_019680	C	6	6	280237	280242	0 %	0 %	0 %	100 %	427711427
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4350	NC_019680	TC	3	6	284889	284894	0 %	50 %	0 %	50 %	427711432
4351	NC_019680	GAA	2	6	284935	284940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711432
4352	NC_019680	GC	3	6	284965	284970	0 %	0 %	50 %	50 %	427711432
4353	NC_019680	GAT	2	6	284974	284979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711432
4354	NC_019680	TGA	2	6	285166	285171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711433
4355	NC_019680	G	8	8	285180	285187	0 %	0 %	100 %	0 %	427711433
4356	NC_019680	ACC	2	6	285203	285208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711433
4357	NC_019680	CAT	2	6	285328	285333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711433
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4360	NC_019680	CGCGG	2	10	285583	285592	0 %	0 %	60 %	40 %	427711433
4361	NC_019680	GAC	2	6	285610	285615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711433
4362	NC_019680	CAT	2	6	285616	285621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711433
4363	NC_019680	TGA	2	6	285637	285642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711433
4364	NC_019680	GAA	2	6	285671	285676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711433
4365	NC_019680	CGG	4	12	285725	285736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711433
4366	NC_019680	CAC	2	6	285763	285768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711433
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4492	NC_019680	TTA	2	6	293433	293438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711441
4493	NC_019680	CTC	2	6	293459	293464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711441
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4495	NC_019680	TGA	2	6	293871	293876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711442
4496	NC_019680	TCC	2	6	293883	293888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711442
4497	NC_019680	ATTC	2	8	293921	293928	25 %	50 %	0 %	25 %	427711442
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4500	NC_019680	A	6	6	293981	293986	100 %	0 %	0 %	0 %	427711442

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