MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_019680	CCG	2	6	1249972	1249977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712381
19003	NC_019680	GTA	2	6	1250007	1250012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712381
19004	NC_019680	C	6	6	1250175	1250180	0 %	0 %	0 %	100 %	427712382
19005	NC_019680	CAC	2	6	1250298	1250303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712382
19006	NC_019680	TGC	2	6	1250315	1250320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19007	NC_019680	CAG	2	6	1250341	1250346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19008	NC_019680	TCA	2	6	1250369	1250374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712382
19009	NC_019680	TGT	2	6	1250435	1250440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712382
19010	NC_019680	AAG	2	6	1250584	1250589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712382
19011	NC_019680	C	6	6	1250778	1250783	0 %	0 %	0 %	100 %	427712382
19012	NC_019680	ATG	2	6	1250796	1250801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19013	NC_019680	GAA	2	6	1250805	1250810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712382
19014	NC_019680	ACA	2	6	1250926	1250931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712382
19015	NC_019680	ATT	2	6	1250940	1250945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712382
19016	NC_019680	GCA	2	6	1251073	1251078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19017	NC_019680	AAC	2	6	1251106	1251111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712382
19018	NC_019680	GAC	2	6	1251207	1251212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19019	NC_019680	GAT	2	6	1251309	1251314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19020	NC_019680	TGT	2	6	1251412	1251417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712382
19021	NC_019680	TGG	2	6	1251445	1251450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712382
19022	NC_019680	ATT	2	6	1251497	1251502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712382
19023	NC_019680	CTG	2	6	1251568	1251573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19024	NC_019680	TGC	2	6	1251674	1251679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19025	NC_019680	GCC	2	6	1251700	1251705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19026	NC_019680	TGA	2	6	1251965	1251970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19027	NC_019680	GCTTTT	2	12	1252095	1252106	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	427712382
19028	NC_019680	T	7	7	1252103	1252109	0 %	100 %	0 %	0 %	427712382
19029	NC_019680	TTTG	2	8	1252175	1252182	0 %	75 %	25 %	0 %	427712382
19030	NC_019680	TTAC	2	8	1252306	1252313	25 %	50 %	0 %	25 %	427712382
19031	NC_019680	AAC	2	6	1252333	1252338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712382
19032	NC_019680	TGGC	2	8	1252357	1252364	0 %	25 %	50 %	25 %	427712382
19033	NC_019680	TGA	2	6	1252451	1252456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19034	NC_019680	TGG	2	6	1252472	1252477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712382
19035	NC_019680	CCG	2	6	1252538	1252543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19036	NC_019680	GCG	2	6	1252667	1252672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712382
19037	NC_019680	TTG	2	6	1252728	1252733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712382
19038	NC_019680	CCT	2	6	1252734	1252739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712382
19039	NC_019680	TCAA	2	8	1252765	1252772	50 %	25 %	0 %	25 %	427712382
19040	NC_019680	CCG	2	6	1252843	1252848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19041	NC_019680	TA	3	6	1252887	1252892	50 %	50 %	0 %	0 %	427712382
19042	NC_019680	AACGCA	2	12	1252903	1252914	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427712382
19043	NC_019680	ATG	2	6	1253029	1253034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19044	NC_019680	GGA	2	6	1253102	1253107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712382
19045	NC_019680	CGC	2	6	1253370	1253375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19046	NC_019680	TCT	2	6	1253426	1253431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712382
19047	NC_019680	TC	3	6	1253517	1253522	0 %	50 %	0 %	50 %	427712382
19048	NC_019680	GCT	2	6	1253530	1253535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19049	NC_019680	ATT	2	6	1253572	1253577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712382
19050	NC_019680	TTG	2	6	1253596	1253601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712382
19051	NC_019680	GAT	3	9	1253652	1253660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19052	NC_019680	ATT	2	6	1253673	1253678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712382
19053	NC_019680	ATCA	2	8	1253685	1253692	50 %	25 %	0 %	25 %	427712382
19054	NC_019680	G	6	6	1253698	1253703	0 %	0 %	100 %	0 %	427712382
19055	NC_019680	AAGCC	2	10	1253738	1253747	40 %	0 %	20 %	40 %	427712382
19056	NC_019680	TGA	3	9	1253765	1253773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712382
19057	NC_019680	GCC	2	6	1253776	1253781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19058	NC_019680	CAA	2	6	1253799	1253804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712382
19059	NC_019680	TC	3	6	1253841	1253846	0 %	50 %	0 %	50 %	427712382
19060	NC_019680	GCC	2	6	1253850	1253855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19061	NC_019680	GCT	2	6	1253871	1253876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712382
19062	NC_019680	AAC	2	6	1253983	1253988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712382
19063	NC_019680	ATC	2	6	1254003	1254008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712382
19064	NC_019680	TTC	2	6	1254021	1254026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712382
19065	NC_019680	TTGC	2	8	1254068	1254075	0 %	50 %	25 %	25 %	427712382
19066	NC_019680	TGG	2	6	1254124	1254129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712382
19067	NC_019680	GAA	2	6	1254144	1254149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712382
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19069	NC_019680	TC	3	6	1254315	1254320	0 %	50 %	0 %	50 %	427712382
19070	NC_019680	CGC	2	6	1254356	1254361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712382
19071	NC_019680	CAAA	2	8	1254362	1254369	75 %	0 %	0 %	25 %	427712382
19072	NC_019680	A	6	6	1254529	1254534	100 %	0 %	0 %	0 %	427712383
19073	NC_019680	GCT	2	6	1254553	1254558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712383
19074	NC_019680	TGGC	2	8	1254568	1254575	0 %	25 %	50 %	25 %	427712383
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19082	NC_019680	GCTAA	2	10	1255396	1255405	40 %	20 %	20 %	20 %	427712385
19083	NC_019680	CCACAA	2	12	1255406	1255417	50 %	0 %	0 %	50 %	427712385
19084	NC_019680	A	6	6	1255425	1255430	100 %	0 %	0 %	0 %	427712385
19085	NC_019680	CCGCC	2	10	1255529	1255538	0 %	0 %	20 %	80 %	427712385
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19088	NC_019680	TGC	2	6	1255675	1255680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712385
19089	NC_019680	GTA	2	6	1255752	1255757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712385
19090	NC_019680	TA	3	6	1255808	1255813	50 %	50 %	0 %	0 %	427712385
19091	NC_019680	GGT	3	9	1255831	1255839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712385
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19094	NC_019680	CCCAAT	2	12	1256010	1256021	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427712385
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19099	NC_019680	GC	3	6	1256228	1256233	0 %	0 %	50 %	50 %	427712385
19100	NC_019680	AAC	2	6	1256329	1256334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712385
19101	NC_019680	CGG	2	6	1256994	1256999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712386
19102	NC_019680	CGATG	2	10	1257105	1257114	20 %	20 %	40 %	20 %	427712386
19103	NC_019680	GGC	2	6	1257116	1257121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712386
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19107	NC_019680	GTG	2	6	1257392	1257397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712386
19108	NC_019680	GTA	2	6	1257398	1257403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712386
19109	NC_019680	C	6	6	1257409	1257414	0 %	0 %	0 %	100 %	427712386
19110	NC_019680	TGG	2	6	1257425	1257430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712386
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19112	NC_019680	GGGATT	2	12	1257544	1257555	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427712386
19113	NC_019680	TC	3	6	1257781	1257786	0 %	50 %	0 %	50 %	427712386
19114	NC_019680	CCG	2	6	1257942	1257947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712387
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19116	NC_019680	CAT	2	6	1258060	1258065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712387
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19118	NC_019680	CTGG	2	8	1258162	1258169	0 %	25 %	50 %	25 %	427712387
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19222	NC_019680	G	6	6	1264952	1264957	0 %	0 %	100 %	0 %	427712392
19223	NC_019680	TTGCCA	2	12	1265694	1265705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427712393
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19227	NC_019680	TGC	2	6	1265881	1265886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712393
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19230	NC_019680	GTC	2	6	1266003	1266008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712393
19231	NC_019680	ATG	2	6	1266054	1266059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712393
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19233	NC_019680	T	6	6	1266068	1266073	0 %	100 %	0 %	0 %	427712393
19234	NC_019680	TGG	2	6	1266080	1266085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712393
19235	NC_019680	ATT	2	6	1266113	1266118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712393
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19237	NC_019680	GAT	2	6	1266209	1266214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712393
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19351	NC_019680	GTG	2	6	1273807	1273812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712400
19352	NC_019680	TGA	2	6	1273825	1273830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712400
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19468	NC_019680	GCA	2	6	1281777	1281782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712405
19469	NC_019680	GGCCT	2	10	1281803	1281812	0 %	20 %	40 %	40 %	427712405
19470	NC_019680	GTCTG	2	10	1281815	1281824	0 %	40 %	40 %	20 %	427712405
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19474	NC_019680	ATC	2	6	1282175	1282180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712406
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19493	NC_019680	TGA	2	6	1283151	1283156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712406
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