MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_019680	TC	3	6	1219120	1219125	0 %	50 %	0 %	50 %	427712355
18502	NC_019680	GAA	2	6	1219138	1219143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
18503	NC_019680	ATG	2	6	1219220	1219225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18504	NC_019680	TCG	2	6	1219248	1219253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712355
18505	NC_019680	GACA	2	8	1219286	1219293	50 %	0 %	25 %	25 %	427712355
18506	NC_019680	TA	3	6	1219304	1219309	50 %	50 %	0 %	0 %	427712355
18507	NC_019680	A	6	6	1219342	1219347	100 %	0 %	0 %	0 %	427712355
18508	NC_019680	TGA	2	6	1219461	1219466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18509	NC_019680	TAAT	2	8	1219481	1219488	50 %	50 %	0 %	0 %	427712355
18510	NC_019680	AGT	2	6	1219492	1219497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18511	NC_019680	T	6	6	1219516	1219521	0 %	100 %	0 %	0 %	427712355
18512	NC_019680	TG	4	8	1219544	1219551	0 %	50 %	50 %	0 %	427712355
18513	NC_019680	CAT	2	6	1219581	1219586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712355
18514	NC_019680	CAG	3	9	1219592	1219600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712355
18515	NC_019680	GAT	2	6	1219654	1219659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18516	NC_019680	ATTT	2	8	1219679	1219686	25 %	75 %	0 %	0 %	427712355
18517	NC_019680	AGA	2	6	1219725	1219730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
18518	NC_019680	GATT	2	8	1219743	1219750	25 %	50 %	25 %	0 %	427712355
18519	NC_019680	TGA	2	6	1219752	1219757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18520	NC_019680	GAT	2	6	1219879	1219884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18521	NC_019680	GAA	2	6	1219911	1219916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
18522	NC_019680	CGA	2	6	1219918	1219923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712355
18523	NC_019680	GCA	2	6	1219931	1219936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712355
18524	NC_019680	GAT	2	6	1220010	1220015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18525	NC_019680	TATT	2	8	1220081	1220088	25 %	75 %	0 %	0 %	427712355
18526	NC_019680	G	6	6	1220115	1220120	0 %	0 %	100 %	0 %	427712355
18527	NC_019680	TGC	2	6	1220135	1220140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712355
18528	NC_019680	AAC	2	6	1220155	1220160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712355
18529	NC_019680	TCT	2	6	1220161	1220166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712355
18530	NC_019680	GC	3	6	1220194	1220199	0 %	0 %	50 %	50 %	427712355
18531	NC_019680	CA	3	6	1220248	1220253	50 %	0 %	0 %	50 %	427712355
18532	NC_019680	GTT	2	6	1220271	1220276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712355
18533	NC_019680	ATG	2	6	1220291	1220296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18534	NC_019680	T	6	6	1220344	1220349	0 %	100 %	0 %	0 %	427712355
18535	NC_019680	AAG	2	6	1220401	1220406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
18536	NC_019680	T	7	7	1220544	1220550	0 %	100 %	0 %	0 %	427712355
18537	NC_019680	CAG	2	6	1220593	1220598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712355
18538	NC_019680	ATGG	2	8	1220602	1220609	25 %	25 %	50 %	0 %	427712355
18539	NC_019680	AGTTG	2	10	1220619	1220628	20 %	40 %	40 %	0 %	427712355
18540	NC_019680	AGA	2	6	1220646	1220651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
18541	NC_019680	A	6	6	1220735	1220740	100 %	0 %	0 %	0 %	427712355
18542	NC_019680	GAA	2	6	1220743	1220748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
18543	NC_019680	TCAAT	2	10	1220779	1220788	40 %	40 %	0 %	20 %	427712355
18544	NC_019680	TGA	2	6	1220790	1220795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18545	NC_019680	TCAA	2	8	1220803	1220810	50 %	25 %	0 %	25 %	427712355
18546	NC_019680	AATG	2	8	1220860	1220867	50 %	25 %	25 %	0 %	427712355
18547	NC_019680	AAC	2	6	1220879	1220884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712355
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18550	NC_019680	AGT	2	6	1220961	1220966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712355
18551	NC_019680	TTC	2	6	1220978	1220983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712355
18552	NC_019680	TTCT	2	8	1221059	1221066	0 %	75 %	0 %	25 %	427712355
18553	NC_019680	TA	4	8	1221126	1221133	50 %	50 %	0 %	0 %	427712355
18554	NC_019680	CTT	2	6	1221157	1221162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712355
18555	NC_019680	A	7	7	1221229	1221235	100 %	0 %	0 %	0 %	427712355
18556	NC_019680	CAA	2	6	1221241	1221246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712355
18557	NC_019680	TGT	2	6	1221260	1221265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712355
18558	NC_019680	A	6	6	1221299	1221304	100 %	0 %	0 %	0 %	427712355
18559	NC_019680	ATC	2	6	1221395	1221400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712355
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18561	NC_019680	ATC	2	6	1221453	1221458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712355
18562	NC_019680	ATTT	2	8	1221567	1221574	25 %	75 %	0 %	0 %	427712355
18563	NC_019680	AAG	2	6	1221578	1221583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712355
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18566	NC_019680	AAT	2	6	1221679	1221684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712355
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18568	NC_019680	TA	3	6	1221757	1221762	50 %	50 %	0 %	0 %	427712355
18569	NC_019680	TTGG	2	8	1221769	1221776	0 %	50 %	50 %	0 %	427712355
18570	NC_019680	AACT	2	8	1221816	1221823	50 %	25 %	0 %	25 %	427712355
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18588	NC_019680	ACT	2	6	1222583	1222588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712357
18589	NC_019680	A	6	6	1222623	1222628	100 %	0 %	0 %	0 %	427712357
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18594	NC_019680	GCCG	2	8	1223256	1223263	0 %	0 %	50 %	50 %	427712358
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18601	NC_019680	AGTC	2	8	1223652	1223659	25 %	25 %	25 %	25 %	427712358
18602	NC_019680	CGG	2	6	1223684	1223689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712358
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18605	NC_019680	CCAATG	2	12	1223786	1223797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427712358
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18608	NC_019680	TGA	2	6	1223954	1223959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712359
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18610	NC_019680	TTC	2	6	1224087	1224092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712359
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18736	NC_019680	CATTG	2	10	1231689	1231698	20 %	40 %	20 %	20 %	427712368
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18970	NC_019680	AAT	2	6	1247384	1247389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712378
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