MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_019680	TCA	2	6	1188613	1188618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712330
18003	NC_019680	A	6	6	1188640	1188645	100 %	0 %	0 %	0 %	427712330
18004	NC_019680	TTG	2	6	1188703	1188708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712331
18005	NC_019680	GAA	2	6	1188733	1188738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712331
18006	NC_019680	TTC	2	6	1188838	1188843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712331
18007	NC_019680	TTC	2	6	1188847	1188852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712331
18008	NC_019680	CTGCAT	2	12	1188885	1188896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427712331
18009	NC_019680	ATC	2	6	1188955	1188960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712331
18010	NC_019680	AAGT	2	8	1188988	1188995	50 %	25 %	25 %	0 %	427712331
18011	NC_019680	TTCA	2	8	1189006	1189013	25 %	50 %	0 %	25 %	427712331
18012	NC_019680	GAAC	2	8	1189028	1189035	50 %	0 %	25 %	25 %	427712331
18013	NC_019680	AAT	2	6	1189083	1189088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712331
18014	NC_019680	AT	3	6	1189098	1189103	50 %	50 %	0 %	0 %	427712331
18015	NC_019680	ATAAA	2	10	1189111	1189120	80 %	20 %	0 %	0 %	427712331
18016	NC_019680	GCCT	2	8	1189258	1189265	0 %	25 %	25 %	50 %	427712331
18017	NC_019680	GAG	2	6	1189299	1189304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712331
18018	NC_019680	TTC	2	6	1189333	1189338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712331
18019	NC_019680	ACT	2	6	1189709	1189714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712332
18020	NC_019680	TCAAGG	2	12	1189782	1189793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427712332
18021	NC_019680	GGC	2	6	1189805	1189810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712332
18022	NC_019680	TG	3	6	1189811	1189816	0 %	50 %	50 %	0 %	427712332
18023	NC_019680	GCA	2	6	1189840	1189845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712332
18024	NC_019680	GCG	2	6	1189862	1189867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712332
18025	NC_019680	TGG	2	6	1189893	1189898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712332
18026	NC_019680	ATC	2	6	1189938	1189943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712332
18027	NC_019680	AGC	2	6	1189976	1189981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712332
18028	NC_019680	CTC	2	6	1190090	1190095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712332
18029	NC_019680	GGGT	2	8	1190100	1190107	0 %	25 %	75 %	0 %	427712332
18030	NC_019680	CAT	2	6	1190138	1190143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712332
18031	NC_019680	ATT	2	6	1190225	1190230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712332
18032	NC_019680	TGGC	2	8	1190236	1190243	0 %	25 %	50 %	25 %	427712332
18033	NC_019680	GTC	2	6	1190299	1190304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712332
18034	NC_019680	T	6	6	1190356	1190361	0 %	100 %	0 %	0 %	427712332
18035	NC_019680	TGA	2	6	1190373	1190378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712332
18036	NC_019680	AAC	2	6	1190412	1190417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712332
18037	NC_019680	GCCA	2	8	1190432	1190439	25 %	0 %	25 %	50 %	427712332
18038	NC_019680	TC	3	6	1190450	1190455	0 %	50 %	0 %	50 %	427712332
18039	NC_019680	CGGA	2	8	1190501	1190508	25 %	0 %	50 %	25 %	427712332
18040	NC_019680	GTC	2	6	1190594	1190599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712332
18041	NC_019680	TCCAA	2	10	1190794	1190803	40 %	20 %	0 %	40 %	427712332
18042	NC_019680	GCG	2	6	1190855	1190860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712332
18043	NC_019680	TGG	2	6	1190876	1190881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712332
18044	NC_019680	TGG	3	9	1190961	1190969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712332
18045	NC_019680	ACTGAA	2	12	1191284	1191295	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427712332
18046	NC_019680	CCTGG	2	10	1191302	1191311	0 %	20 %	40 %	40 %	427712332
18047	NC_019680	AAG	2	6	1191372	1191377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712332
18048	NC_019680	GAAA	2	8	1191517	1191524	75 %	0 %	25 %	0 %	427712332
18049	NC_019680	ATG	2	6	1191705	1191710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712332
18050	NC_019680	CTG	2	6	1191777	1191782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712332
18051	NC_019680	GCA	2	6	1191821	1191826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712332
18052	NC_019680	CAA	2	6	1191860	1191865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712332
18053	NC_019680	CCTGG	2	10	1191868	1191877	0 %	20 %	40 %	40 %	427712332
18054	NC_019680	GGC	2	6	1191910	1191915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712332
18055	NC_019680	GT	3	6	1191918	1191923	0 %	50 %	50 %	0 %	427712332
18056	NC_019680	GCA	2	6	1191962	1191967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712332
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18058	NC_019680	ATTT	2	8	1192123	1192130	25 %	75 %	0 %	0 %	427712333
18059	NC_019680	CGG	2	6	1192138	1192143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712333
18060	NC_019680	ATC	2	6	1192148	1192153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712333
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18062	NC_019680	GGCC	2	8	1192180	1192187	0 %	0 %	50 %	50 %	427712333
18063	NC_019680	AGCA	2	8	1192337	1192344	50 %	0 %	25 %	25 %	427712333
18064	NC_019680	TTA	2	6	1192355	1192360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712333
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18070	NC_019680	CATT	2	8	1192628	1192635	25 %	50 %	0 %	25 %	427712333
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18078	NC_019680	TAT	2	6	1192943	1192948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712334
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18083	NC_019680	TGC	2	6	1193614	1193619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712335
18084	NC_019680	TTGA	2	8	1193624	1193631	25 %	50 %	25 %	0 %	427712335
18085	NC_019680	CGC	2	6	1193750	1193755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712335
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18087	NC_019680	T	6	6	1193870	1193875	0 %	100 %	0 %	0 %	427712335
18088	NC_019680	GCG	2	6	1193924	1193929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712335
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18091	NC_019680	GTTT	2	8	1194128	1194135	0 %	75 %	25 %	0 %	427712335
18092	NC_019680	CAAC	2	8	1194270	1194277	50 %	0 %	0 %	50 %	427712335
18093	NC_019680	CTA	2	6	1194301	1194306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712335
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18099	NC_019680	TCT	2	6	1194580	1194585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712336
18100	NC_019680	CCTGA	2	10	1194625	1194634	20 %	20 %	20 %	40 %	427712336
18101	NC_019680	CGG	2	6	1194691	1194696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712336
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18103	NC_019680	AGGA	2	8	1194737	1194744	50 %	0 %	50 %	0 %	427712336
18104	NC_019680	TTG	2	6	1194749	1194754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712336
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18107	NC_019680	CT	3	6	1194851	1194856	0 %	50 %	0 %	50 %	427712336
18108	NC_019680	TGCC	2	8	1194857	1194864	0 %	25 %	25 %	50 %	427712336
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18111	NC_019680	GCC	2	6	1194998	1195003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712336
18112	NC_019680	GAAA	2	8	1195079	1195086	75 %	0 %	25 %	0 %	427712336
18113	NC_019680	ATT	2	6	1195114	1195119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712336
18114	NC_019680	CAT	2	6	1195174	1195179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712336
18115	NC_019680	TAAGG	2	10	1195282	1195291	40 %	20 %	40 %	0 %	427712337
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18117	NC_019680	GTC	2	6	1195357	1195362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712337
18118	NC_019680	GTC	2	6	1195498	1195503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712337
18119	NC_019680	GCT	2	6	1195618	1195623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712337
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18232	NC_019680	AT	3	6	1202259	1202264	50 %	50 %	0 %	0 %	427712344
18233	NC_019680	TAC	2	6	1202312	1202317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712344
18234	NC_019680	CACC	2	8	1202450	1202457	25 %	0 %	0 %	75 %	427712344
18235	NC_019680	TGT	2	6	1202483	1202488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712344
18236	NC_019680	GAT	2	6	1202493	1202498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712344
18237	NC_019680	TGA	2	6	1202537	1202542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712344
18238	NC_019680	ATG	2	6	1202684	1202689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712344
18239	NC_019680	TTG	2	6	1202692	1202697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712344
18240	NC_019680	ACT	2	6	1202767	1202772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712344
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18242	NC_019680	ACC	2	6	1202837	1202842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712344
18243	NC_019680	AGC	2	6	1202878	1202883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712344
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18245	NC_019680	GCCA	2	8	1202917	1202924	25 %	0 %	25 %	50 %	427712344
18246	NC_019680	ACT	2	6	1202930	1202935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712344
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18250	NC_019680	CGCT	2	8	1203183	1203190	0 %	25 %	25 %	50 %	427712344
18251	NC_019680	TGG	2	6	1203203	1203208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712344
18252	NC_019680	CAA	2	6	1203223	1203228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712344
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18349	NC_019680	TGC	2	6	1208056	1208061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712346
18350	NC_019680	CCA	2	6	1208114	1208119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712346
18351	NC_019680	TTA	2	6	1208212	1208217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712346
18352	NC_019680	CAA	2	6	1208229	1208234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712346
18353	NC_019680	AC	3	6	1208316	1208321	50 %	0 %	0 %	50 %	427712346
18354	NC_019680	CGCC	2	8	1208340	1208347	0 %	0 %	25 %	75 %	427712346
18355	NC_019680	CGA	2	6	1208351	1208356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712346
18356	NC_019680	ATCA	2	8	1208427	1208434	50 %	25 %	0 %	25 %	427712346
18357	NC_019680	GCT	2	6	1208488	1208493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712346
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18360	NC_019680	ACG	2	6	1208742	1208747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712346
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18365	NC_019680	TGC	2	6	1209054	1209059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712346
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18449	NC_019680	ATTGCT	2	12	1214862	1214873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427712351
18450	NC_019680	CGGGG	2	10	1214894	1214903	0 %	0 %	80 %	20 %	427712351
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18454	NC_019680	AGTGGC	2	12	1215468	1215479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427712351
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18457	NC_019680	GCG	2	6	1215760	1215765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712352
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18459	NC_019680	C	6	6	1215990	1215995	0 %	0 %	0 %	100 %	427712352
18460	NC_019680	ACC	2	6	1216040	1216045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712352
18461	NC_019680	CGG	2	6	1216062	1216067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712352
18462	NC_019680	TATT	2	8	1216085	1216092	25 %	75 %	0 %	0 %	427712352
18463	NC_019680	TGCCT	2	10	1216192	1216201	0 %	40 %	20 %	40 %	427712352
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18465	NC_019680	GTG	2	6	1216304	1216309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712352
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