MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_019680	GCG	2	6	1119635	1119640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712259
17002	NC_019680	GGC	2	6	1119658	1119663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712259
17003	NC_019680	A	7	7	1119751	1119757	100 %	0 %	0 %	0 %	427712259
17004	NC_019680	TTG	2	6	1119770	1119775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712259
17005	NC_019680	GTTG	2	8	1119984	1119991	0 %	50 %	50 %	0 %	427712260
17006	NC_019680	ATT	2	6	1120004	1120009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712260
17007	NC_019680	AGA	2	6	1120059	1120064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712260
17008	NC_019680	A	6	6	1120220	1120225	100 %	0 %	0 %	0 %	427712260
17009	NC_019680	GGTT	2	8	1120249	1120256	0 %	50 %	50 %	0 %	427712260
17010	NC_019680	GCG	2	6	1120555	1120560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712260
17011	NC_019680	GGC	2	6	1120647	1120652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712260
17012	NC_019680	A	6	6	1120669	1120674	100 %	0 %	0 %	0 %	427712260
17013	NC_019680	GCC	2	6	1120755	1120760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712260
17014	NC_019680	GT	3	6	1120797	1120802	0 %	50 %	50 %	0 %	427712260
17015	NC_019680	TTGA	2	8	1120835	1120842	25 %	50 %	25 %	0 %	427712260
17016	NC_019680	TGC	2	6	1121155	1121160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712261
17017	NC_019680	CCT	2	6	1121189	1121194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712261
17018	NC_019680	GTG	2	6	1121222	1121227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712261
17019	NC_019680	TC	3	6	1121238	1121243	0 %	50 %	0 %	50 %	427712261
17020	NC_019680	GCG	2	6	1121258	1121263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712261
17021	NC_019680	TCGG	2	8	1121287	1121294	0 %	25 %	50 %	25 %	427712261
17022	NC_019680	GGA	2	6	1121525	1121530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712262
17023	NC_019680	GGC	2	6	1121539	1121544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712262
17024	NC_019680	TGT	2	6	1121545	1121550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712262
17025	NC_019680	ATT	2	6	1121659	1121664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712262
17026	NC_019680	GGA	2	6	1121666	1121671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712262
17027	NC_019680	ATTCG	2	10	1121719	1121728	20 %	40 %	20 %	20 %	427712262
17028	NC_019680	CGC	2	6	1121781	1121786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712262
17029	NC_019680	TGT	2	6	1121794	1121799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712262
17030	NC_019680	GT	3	6	1121916	1121921	0 %	50 %	50 %	0 %	427712263
17031	NC_019680	ATT	2	6	1121923	1121928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712263
17032	NC_019680	CGG	2	6	1121965	1121970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712263
17033	NC_019680	GGC	2	6	1121974	1121979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712263
17034	NC_019680	GCG	2	6	1122045	1122050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712263
17035	NC_019680	GCT	2	6	1122065	1122070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712263
17036	NC_019680	GAG	2	6	1122117	1122122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712263
17037	NC_019680	GCA	3	9	1122177	1122185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712263
17038	NC_019680	GTG	2	6	1122300	1122305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712263
17039	NC_019680	GGA	2	6	1122308	1122313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712263
17040	NC_019680	ACC	2	6	1122427	1122432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712264
17041	NC_019680	G	6	6	1122475	1122480	0 %	0 %	100 %	0 %	427712264
17042	NC_019680	GATG	2	8	1122531	1122538	25 %	25 %	50 %	0 %	427712264
17043	NC_019680	CTC	2	6	1122562	1122567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712264
17044	NC_019680	GCG	2	6	1123191	1123196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712264
17045	NC_019680	TTG	2	6	1123223	1123228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712264
17046	NC_019680	TAC	2	6	1123350	1123355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712264
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17048	NC_019680	GGCTG	2	10	1123624	1123633	0 %	20 %	60 %	20 %	427712264
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17051	NC_019680	GGCCG	2	10	1123929	1123938	0 %	0 %	60 %	40 %	427712265
17052	NC_019680	GGC	2	6	1123946	1123951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712265
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17055	NC_019680	GTTT	2	8	1124123	1124130	0 %	75 %	25 %	0 %	427712265
17056	NC_019680	GCT	2	6	1124153	1124158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712265
17057	NC_019680	C	6	6	1124193	1124198	0 %	0 %	0 %	100 %	427712265
17058	NC_019680	CGG	2	6	1124222	1124227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712265
17059	NC_019680	GAC	2	6	1124238	1124243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712265
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17061	NC_019680	GCA	2	6	1124411	1124416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712265
17062	NC_019680	GGGGC	2	10	1124428	1124437	0 %	0 %	80 %	20 %	427712265
17063	NC_019680	GAT	2	6	1124453	1124458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712265
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17065	NC_019680	GGT	2	6	1124537	1124542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712265
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17084	NC_019680	TGC	2	6	1125323	1125328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712265
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17088	NC_019680	CAA	2	6	1125511	1125516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712265
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17099	NC_019680	GAT	2	6	1126028	1126033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712265
17100	NC_019680	CT	3	6	1126137	1126142	0 %	50 %	0 %	50 %	427712265
17101	NC_019680	CCAAGC	2	12	1126145	1126156	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427712265
17102	NC_019680	CCGG	2	8	1126225	1126232	0 %	0 %	50 %	50 %	427712265
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17113	NC_019680	GCG	2	6	1127828	1127833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712266
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17227	NC_019680	C	6	6	1135794	1135799	0 %	0 %	0 %	100 %	427712277
17228	NC_019680	GGC	2	6	1135868	1135873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712278
17229	NC_019680	GCT	2	6	1135878	1135883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712278
17230	NC_019680	A	6	6	1135893	1135898	100 %	0 %	0 %	0 %	427712278
17231	NC_019680	CGGG	2	8	1136079	1136086	0 %	0 %	75 %	25 %	427712278
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17233	NC_019680	GATG	2	8	1136257	1136264	25 %	25 %	50 %	0 %	427712279
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17466	NC_019680	CAT	2	6	1153273	1153278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712293
17467	NC_019680	ATC	2	6	1153286	1153291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712293
17468	NC_019680	GTT	2	6	1153360	1153365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712293
17469	NC_019680	T	7	7	1153386	1153392	0 %	100 %	0 %	0 %	427712293
17470	NC_019680	CGC	2	6	1153393	1153398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712293
17471	NC_019680	CAA	2	6	1153410	1153415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712293
17472	NC_019680	AG	3	6	1153432	1153437	50 %	0 %	50 %	0 %	427712293
17473	NC_019680	TGT	2	6	1153536	1153541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712293
17474	NC_019680	GCC	2	6	1153796	1153801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712294
17475	NC_019680	TCA	2	6	1153853	1153858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712294
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17477	NC_019680	AAT	2	6	1153879	1153884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712294
17478	NC_019680	GGCG	2	8	1153929	1153936	0 %	0 %	75 %	25 %	427712294
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17481	NC_019680	TGG	2	6	1154071	1154076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712294
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17486	NC_019680	AAAG	2	8	1154228	1154235	75 %	0 %	25 %	0 %	427712294
17487	NC_019680	GCTTT	2	10	1154328	1154337	0 %	60 %	20 %	20 %	427712294
17488	NC_019680	TCA	2	6	1154342	1154347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712294
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17491	NC_019680	GCT	3	9	1154387	1154395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712294
17492	NC_019680	ATC	3	9	1154419	1154427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712294
17493	NC_019680	AATA	2	8	1154428	1154435	75 %	25 %	0 %	0 %	427712294
17494	NC_019680	TGA	2	6	1154494	1154499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712294
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17496	NC_019680	GT	3	6	1154585	1154590	0 %	50 %	50 %	0 %	427712294
17497	NC_019680	CGT	2	6	1154592	1154597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712294
17498	NC_019680	ATT	2	6	1154650	1154655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712294
17499	NC_019680	CGC	2	6	1154656	1154661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712294
17500	NC_019680	TTG	2	6	1154749	1154754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712295

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