MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_019680	GCT	2	6	983969	983974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712119
15003	NC_019680	ATT	2	6	983993	983998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712119
15004	NC_019680	GTT	2	6	984052	984057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712119
15005	NC_019680	TGA	2	6	984058	984063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712119
15006	NC_019680	GTG	2	6	984116	984121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712119
15007	NC_019680	A	6	6	984129	984134	100 %	0 %	0 %	0 %	427712119
15008	NC_019680	GTA	2	6	984168	984173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712119
15009	NC_019680	GGCCT	2	10	984203	984212	0 %	20 %	40 %	40 %	427712119
15010	NC_019680	AGA	2	6	984223	984228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712119
15011	NC_019680	CAATC	2	10	984342	984351	40 %	20 %	0 %	40 %	427712120
15012	NC_019680	AGG	2	6	984376	984381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712120
15013	NC_019680	CTGATC	2	12	984421	984432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427712120
15014	NC_019680	TAA	2	6	984515	984520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712120
15015	NC_019680	ATT	2	6	984528	984533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712120
15016	NC_019680	GAA	2	6	984573	984578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712120
15017	NC_019680	G	6	6	984639	984644	0 %	0 %	100 %	0 %	427712121
15018	NC_019680	TGC	2	6	984692	984697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712121
15019	NC_019680	ATG	2	6	984728	984733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712121
15020	NC_019680	CCG	2	6	984734	984739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712121
15021	NC_019680	TGAA	2	8	984740	984747	50 %	25 %	25 %	0 %	427712121
15022	NC_019680	CAG	2	6	984781	984786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712121
15023	NC_019680	TTA	2	6	984847	984852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712122
15024	NC_019680	TAG	2	6	984870	984875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712122
15025	NC_019680	CAA	2	6	984933	984938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712122
15026	NC_019680	ATA	2	6	984961	984966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712122
15027	NC_019680	CATT	2	8	985037	985044	25 %	50 %	0 %	25 %	427712122
15028	NC_019680	GAA	2	6	985190	985195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712122
15029	NC_019680	CTTG	2	8	985459	985466	0 %	50 %	25 %	25 %	427712123
15030	NC_019680	GTT	2	6	985529	985534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712123
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15032	NC_019680	GCA	2	6	985748	985753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712123
15033	NC_019680	TGA	2	6	986381	986386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712124
15034	NC_019680	TAA	2	6	986415	986420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712124
15035	NC_019680	TTG	3	9	986441	986449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712124
15036	NC_019680	GCA	2	6	986485	986490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712124
15037	NC_019680	T	6	6	986541	986546	0 %	100 %	0 %	0 %	427712124
15038	NC_019680	GA	3	6	986604	986609	50 %	0 %	50 %	0 %	427712124
15039	NC_019680	CCTA	2	8	986611	986618	25 %	25 %	0 %	50 %	427712124
15040	NC_019680	CTTGG	2	10	986717	986726	0 %	40 %	40 %	20 %	427712124
15041	NC_019680	ATC	2	6	986731	986736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712124
15042	NC_019680	TAC	2	6	986766	986771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712124
15043	NC_019680	GGGA	2	8	986814	986821	25 %	0 %	75 %	0 %	427712124
15044	NC_019680	CAT	2	6	987620	987625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712125
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15046	NC_019680	CTA	2	6	987769	987774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712125
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15049	NC_019680	AT	3	6	987990	987995	50 %	50 %	0 %	0 %	427712125
15050	NC_019680	A	7	7	988042	988048	100 %	0 %	0 %	0 %	427712125
15051	NC_019680	TGAT	2	8	988057	988064	25 %	50 %	25 %	0 %	427712125
15052	NC_019680	AG	3	6	988092	988097	50 %	0 %	50 %	0 %	427712125
15053	NC_019680	CAA	2	6	988103	988108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712125
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15055	NC_019680	AG	3	6	988295	988300	50 %	0 %	50 %	0 %	427712125
15056	NC_019680	C	7	7	988358	988364	0 %	0 %	0 %	100 %	427712125
15057	NC_019680	A	7	7	988388	988394	100 %	0 %	0 %	0 %	427712125
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15059	NC_019680	C	6	6	988468	988473	0 %	0 %	0 %	100 %	427712125
15060	NC_019680	AAT	2	6	988479	988484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712125
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15062	NC_019680	TGC	2	6	988527	988532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712125
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15068	NC_019680	TCTGAT	2	12	989281	989292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427712126
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15070	NC_019680	CTG	2	6	989397	989402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712126
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15075	NC_019680	ATG	2	6	989505	989510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712126
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15079	NC_019680	CCTGG	2	10	989602	989611	0 %	20 %	40 %	40 %	427712126
15080	NC_019680	GAT	2	6	989695	989700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712126
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15085	NC_019680	TTAA	2	8	990239	990246	50 %	50 %	0 %	0 %	427712126
15086	NC_019680	ATC	2	6	990279	990284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712126
15087	NC_019680	CTGG	2	8	990316	990323	0 %	25 %	50 %	25 %	427712126
15088	NC_019680	C	7	7	990464	990470	0 %	0 %	0 %	100 %	427712126
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15100	NC_019680	C	6	6	991119	991124	0 %	0 %	0 %	100 %	427712126
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15105	NC_019680	ATCC	2	8	991289	991296	25 %	25 %	0 %	50 %	427712126
15106	NC_019680	TGG	2	6	991314	991319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712126
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15108	NC_019680	GCA	2	6	991471	991476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712127
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15112	NC_019680	C	6	6	991725	991730	0 %	0 %	0 %	100 %	427712127
15113	NC_019680	AG	3	6	991743	991748	50 %	0 %	50 %	0 %	427712127
15114	NC_019680	CAC	2	6	991887	991892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712127
15115	NC_019680	GCCAG	2	10	991894	991903	20 %	0 %	40 %	40 %	427712127
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15119	NC_019680	TGGGT	2	10	992519	992528	0 %	40 %	60 %	0 %	427712128
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15121	NC_019680	G	6	6	992655	992660	0 %	0 %	100 %	0 %	427712128
15122	NC_019680	GA	3	6	992670	992675	50 %	0 %	50 %	0 %	427712128
15123	NC_019680	TGT	2	6	992677	992682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712128
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15227	NC_019680	GCCA	2	8	1000790	1000797	25 %	0 %	25 %	50 %	427712139
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15229	NC_019680	TCT	2	6	1000939	1000944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712139
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15236	NC_019680	ATTA	2	8	1001474	1001481	50 %	50 %	0 %	0 %	427712141
15237	NC_019680	CCG	2	6	1001499	1001504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712141
15238	NC_019680	CAT	3	9	1001539	1001547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712141
15239	NC_019680	AACT	2	8	1001578	1001585	50 %	25 %	0 %	25 %	427712141
15240	NC_019680	CAC	2	6	1001747	1001752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712142
15241	NC_019680	TCA	2	6	1001811	1001816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712142
15242	NC_019680	ATC	2	6	1001834	1001839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712142
15243	NC_019680	TTG	2	6	1001890	1001895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712142
15244	NC_019680	TGT	3	9	1001902	1001910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712142
15245	NC_019680	TACA	2	8	1001949	1001956	50 %	25 %	0 %	25 %	427712142
15246	NC_019680	A	6	6	1002185	1002190	100 %	0 %	0 %	0 %	427712143
15247	NC_019680	TA	3	6	1002248	1002253	50 %	50 %	0 %	0 %	427712143
15248	NC_019680	AGC	2	6	1002279	1002284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712143
15249	NC_019680	TCA	2	6	1002323	1002328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712143
15250	NC_019680	CTG	2	6	1002381	1002386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712143
15251	NC_019680	AT	3	6	1002397	1002402	50 %	50 %	0 %	0 %	427712143
15252	NC_019680	GCT	2	6	1002451	1002456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712143
15253	NC_019680	GTTGC	2	10	1002634	1002643	0 %	40 %	40 %	20 %	427712144
15254	NC_019680	TCAA	2	8	1002650	1002657	50 %	25 %	0 %	25 %	427712144
15255	NC_019680	CTT	2	6	1002673	1002678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712144
15256	NC_019680	AGG	2	6	1002715	1002720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712144
15257	NC_019680	GATA	2	8	1002792	1002799	50 %	25 %	25 %	0 %	427712144
15258	NC_019680	TC	3	6	1002933	1002938	0 %	50 %	0 %	50 %	427712145
15259	NC_019680	TTCAAT	2	12	1003134	1003145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	427712145
15260	NC_019680	TAT	2	6	1003148	1003153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712145
15261	NC_019680	T	6	6	1003193	1003198	0 %	100 %	0 %	0 %	427712145
15262	NC_019680	ATA	2	6	1003273	1003278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712145
15263	NC_019680	CAT	2	6	1003286	1003291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712145
15264	NC_019680	TCTT	2	8	1003651	1003658	0 %	75 %	0 %	25 %	427712146
15265	NC_019680	TTA	2	6	1003666	1003671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712146
15266	NC_019680	TGAC	2	8	1003736	1003743	25 %	25 %	25 %	25 %	427712146
15267	NC_019680	TCC	2	6	1003787	1003792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712146
15268	NC_019680	ATT	2	6	1003811	1003816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712146
15269	NC_019680	ATA	2	6	1003850	1003855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712146
15270	NC_019680	CAA	2	6	1003927	1003932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712146
15271	NC_019680	TGC	2	6	1003978	1003983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712146
15272	NC_019680	ACTG	2	8	1004007	1004014	25 %	25 %	25 %	25 %	427712146
15273	NC_019680	AGA	2	6	1004060	1004065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712146
15274	NC_019680	CAA	2	6	1004189	1004194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712147
15275	NC_019680	ATC	2	6	1004226	1004231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712147
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15282	NC_019680	CAC	2	6	1004896	1004901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712148
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15294	NC_019680	C	6	6	1005975	1005980	0 %	0 %	0 %	100 %	427712149
15295	NC_019680	CTT	2	6	1005985	1005990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712149
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15307	NC_019680	CAC	3	9	1006835	1006843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712149
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15310	NC_019680	CAG	2	6	1006925	1006930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712149
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15354	NC_019680	CGG	2	6	1009946	1009951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712151
15355	NC_019680	TGC	2	6	1009986	1009991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712151
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15469	NC_019680	GGC	2	6	1019226	1019231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712156
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15472	NC_019680	CCA	2	6	1019420	1019425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712156
15473	NC_019680	TTG	2	6	1019489	1019494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712156
15474	NC_019680	GAC	2	6	1019520	1019525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15475	NC_019680	TGG	2	6	1019542	1019547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712156
15476	NC_019680	TGC	2	6	1019548	1019553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15477	NC_019680	GCGGGC	2	12	1019646	1019657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712156
15478	NC_019680	CTG	2	6	1019694	1019699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15479	NC_019680	GCTG	2	8	1019726	1019733	0 %	25 %	50 %	25 %	427712156
15480	NC_019680	TTC	2	6	1019754	1019759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712156
15481	NC_019680	ATT	2	6	1019793	1019798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712156
15482	NC_019680	CAT	2	6	1019852	1019857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712156
15483	NC_019680	G	6	6	1019885	1019890	0 %	0 %	100 %	0 %	427712156
15484	NC_019680	GA	3	6	1019943	1019948	50 %	0 %	50 %	0 %	427712156
15485	NC_019680	CTG	2	6	1019970	1019975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15486	NC_019680	GTT	2	6	1019978	1019983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712156
15487	NC_019680	TTG	2	6	1020003	1020008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712156
15488	NC_019680	TGC	2	6	1020024	1020029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15489	NC_019680	CGCT	2	8	1020046	1020053	0 %	25 %	25 %	50 %	427712156
15490	NC_019680	GCT	2	6	1020118	1020123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15491	NC_019680	TAA	2	6	1020210	1020215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712156
15492	NC_019680	TGA	2	6	1020238	1020243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712156
15493	NC_019680	GCC	2	6	1020244	1020249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712156
15494	NC_019680	TAG	2	6	1020304	1020309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712156
15495	NC_019680	GTC	2	6	1020310	1020315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712156
15496	NC_019680	GTT	2	6	1020347	1020352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712156
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15498	NC_019680	TCT	2	6	1020672	1020677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712157
15499	NC_019680	TGG	2	6	1020739	1020744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712157
15500	NC_019680	ACC	2	6	1020912	1020917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712157

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