MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_019680	ATCA	2	8	918873	918880	50 %	25 %	0 %	25 %	427712054
14002	NC_019680	AAG	2	6	918903	918908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712054
14003	NC_019680	AGAA	2	8	918920	918927	75 %	0 %	25 %	0 %	427712054
14004	NC_019680	A	6	6	918941	918946	100 %	0 %	0 %	0 %	427712054
14005	NC_019680	GGC	2	6	918983	918988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712054
14006	NC_019680	AG	3	6	919034	919039	50 %	0 %	50 %	0 %	427712054
14007	NC_019680	G	6	6	919098	919103	0 %	0 %	100 %	0 %	427712054
14008	NC_019680	A	6	6	919145	919150	100 %	0 %	0 %	0 %	427712054
14009	NC_019680	AG	3	6	919174	919179	50 %	0 %	50 %	0 %	427712054
14010	NC_019680	TGA	2	6	919233	919238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712055
14011	NC_019680	AAC	2	6	919254	919259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712055
14012	NC_019680	CCAGGC	2	12	919270	919281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427712055
14013	NC_019680	CGC	2	6	919337	919342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712055
14014	NC_019680	GC	3	6	919423	919428	0 %	0 %	50 %	50 %	427712055
14015	NC_019680	CCA	2	6	919473	919478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712055
14016	NC_019680	TGA	2	6	919543	919548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712055
14017	NC_019680	C	6	6	919604	919609	0 %	0 %	0 %	100 %	427712055
14018	NC_019680	A	6	6	919842	919847	100 %	0 %	0 %	0 %	427712056
14019	NC_019680	CTG	2	6	919869	919874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712056
14020	NC_019680	TTC	2	6	919941	919946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712056
14021	NC_019680	GCC	2	6	919954	919959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712056
14022	NC_019680	TCA	2	6	919972	919977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712056
14023	NC_019680	TC	3	6	920090	920095	0 %	50 %	0 %	50 %	427712056
14024	NC_019680	AGGCC	2	10	920162	920171	20 %	0 %	40 %	40 %	427712056
14025	NC_019680	C	6	6	920170	920175	0 %	0 %	0 %	100 %	427712056
14026	NC_019680	CAC	2	6	920271	920276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712056
14027	NC_019680	GGC	2	6	920397	920402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712057
14028	NC_019680	ATC	2	6	920445	920450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712057
14029	NC_019680	CGC	2	6	920563	920568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712057
14030	NC_019680	TGA	2	6	920581	920586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712057
14031	NC_019680	C	7	7	920592	920598	0 %	0 %	0 %	100 %	427712057
14032	NC_019680	GCT	2	6	920599	920604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712057
14033	NC_019680	AGC	2	6	920652	920657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712057
14034	NC_019680	GTA	2	6	920674	920679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712057
14035	NC_019680	ACT	2	6	920853	920858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712057
14036	NC_019680	CTGG	2	8	921276	921283	0 %	25 %	50 %	25 %	427712058
14037	NC_019680	AGC	2	6	921344	921349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712058
14038	NC_019680	GGT	2	6	921478	921483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712058
14039	NC_019680	GACAT	2	10	921575	921584	40 %	20 %	20 %	20 %	427712058
14040	NC_019680	CCAG	2	8	921698	921705	25 %	0 %	25 %	50 %	427712058
14041	NC_019680	CAT	2	6	921729	921734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712058
14042	NC_019680	GCC	2	6	921838	921843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712058
14043	NC_019680	CATC	2	8	921909	921916	25 %	25 %	0 %	50 %	427712058
14044	NC_019680	CCG	2	6	921978	921983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712058
14045	NC_019680	AAC	2	6	921992	921997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712058
14046	NC_019680	ATC	2	6	922157	922162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712058
14047	NC_019680	ACC	2	6	922202	922207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712058
14048	NC_019680	GAT	2	6	922239	922244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712058
14049	NC_019680	TGC	2	6	922262	922267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712058
14050	NC_019680	GGGT	2	8	922308	922315	0 %	25 %	75 %	0 %	427712058
14051	NC_019680	CAA	2	6	922434	922439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712058
14052	NC_019680	GCA	2	6	922441	922446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712058
14053	NC_019680	TCA	2	6	922455	922460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712058
14054	NC_019680	TTAC	2	8	922538	922545	25 %	50 %	0 %	25 %	427712059
14055	NC_019680	TTG	2	6	922656	922661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712059
14056	NC_019680	GAC	2	6	922672	922677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712059
14057	NC_019680	GCG	2	6	922703	922708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712059
14058	NC_019680	TCT	2	6	922758	922763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712059
14059	NC_019680	CAAAGC	2	12	922876	922887	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427712059
14060	NC_019680	A	7	7	923156	923162	100 %	0 %	0 %	0 %	427712060
14061	NC_019680	GTG	2	6	923172	923177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712060
14062	NC_019680	A	6	6	923248	923253	100 %	0 %	0 %	0 %	427712060
14063	NC_019680	GA	3	6	923476	923481	50 %	0 %	50 %	0 %	427712061
14064	NC_019680	CCA	2	6	923559	923564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712061
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14073	NC_019680	TAG	2	6	924148	924153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712062
14074	NC_019680	TTC	2	6	924276	924281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712062
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14077	NC_019680	ATC	2	6	924405	924410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712062
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14079	NC_019680	AAAC	2	8	924516	924523	75 %	0 %	0 %	25 %	427712062
14080	NC_019680	CTT	2	6	924563	924568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712062
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14085	NC_019680	CTT	2	6	925202	925207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712062
14086	NC_019680	AAT	2	6	925224	925229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712062
14087	NC_019680	CGG	2	6	925246	925251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712062
14088	NC_019680	ATC	2	6	925339	925344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712062
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14091	NC_019680	A	7	7	926229	926235	100 %	0 %	0 %	0 %	427712063
14092	NC_019680	GC	3	6	926274	926279	0 %	0 %	50 %	50 %	427712063
14093	NC_019680	AGCA	2	8	926281	926288	50 %	0 %	25 %	25 %	427712063
14094	NC_019680	TGA	2	6	926315	926320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712063
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14106	NC_019680	C	6	6	926629	926634	0 %	0 %	0 %	100 %	427712063
14107	NC_019680	CAG	2	6	926658	926663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712063
14108	NC_019680	GAA	2	6	926712	926717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712063
14109	NC_019680	TCT	2	6	926745	926750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712063
14110	NC_019680	CAA	2	6	926781	926786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712063
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14112	NC_019680	AG	3	6	926885	926890	50 %	0 %	50 %	0 %	427712063
14113	NC_019680	C	7	7	926893	926899	0 %	0 %	0 %	100 %	427712063
14114	NC_019680	CAAG	2	8	926942	926949	50 %	0 %	25 %	25 %	427712063
14115	NC_019680	CAA	2	6	927027	927032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712063
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14119	NC_019680	TGG	2	6	927175	927180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712063
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14121	NC_019680	TTG	2	6	927217	927222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712063
14122	NC_019680	GAA	3	9	927231	927239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712063
14123	NC_019680	GAA	2	6	927264	927269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712063
14124	NC_019680	GGA	2	6	927335	927340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712063
14125	NC_019680	A	6	6	927414	927419	100 %	0 %	0 %	0 %	427712063
14126	NC_019680	TCC	2	6	927430	927435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712063
14127	NC_019680	CGC	2	6	927438	927443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712063
14128	NC_019680	CCCTG	2	10	927476	927485	0 %	20 %	20 %	60 %	427712063
14129	NC_019680	TCA	2	6	927539	927544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712063
14130	NC_019680	AGC	2	6	927555	927560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712063
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14146	NC_019680	CAGC	2	8	928930	928937	25 %	0 %	25 %	50 %	427712065
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14153	NC_019680	CAA	2	6	929279	929284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712065
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14225	NC_019680	CTG	2	6	933807	933812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712071
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14231	NC_019680	A	6	6	934178	934183	100 %	0 %	0 %	0 %	427712071
14232	NC_019680	TGA	2	6	934194	934199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712071
14233	NC_019680	CT	3	6	934294	934299	0 %	50 %	0 %	50 %	427712071
14234	NC_019680	GCT	2	6	934348	934353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712071
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14236	NC_019680	TGGCCT	2	12	934487	934498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712071
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14240	NC_019680	TGG	2	6	935022	935027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712072
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14242	NC_019680	GATTGG	2	12	935203	935214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427712072
14243	NC_019680	CAA	2	6	935276	935281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712072
14244	NC_019680	CAA	2	6	935288	935293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712072
14245	NC_019680	CAT	2	6	935458	935463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712073
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