MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_019680	GCC	2	6	887925	887930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712030
13502	NC_019680	TGC	2	6	888040	888045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13503	NC_019680	CGA	2	6	888062	888067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13504	NC_019680	CGA	2	6	888071	888076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13505	NC_019680	CAG	2	6	888114	888119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13506	NC_019680	TGA	2	6	888170	888175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712030
13507	NC_019680	CAA	2	6	888237	888242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712030
13508	NC_019680	CCTG	2	8	888265	888272	0 %	25 %	25 %	50 %	427712030
13509	NC_019680	ATG	2	6	888373	888378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712030
13510	NC_019680	AAG	2	6	888414	888419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13511	NC_019680	TTC	2	6	888467	888472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712030
13512	NC_019680	CTCA	2	8	888473	888480	25 %	25 %	0 %	50 %	427712030
13513	NC_019680	CTG	2	6	888511	888516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13514	NC_019680	TCT	2	6	888538	888543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712030
13515	NC_019680	TGG	2	6	888568	888573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712030
13516	NC_019680	AAG	2	6	888622	888627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13517	NC_019680	CAA	2	6	888662	888667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712030
13518	NC_019680	GGC	2	6	888705	888710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712030
13519	NC_019680	TGC	2	6	888736	888741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13520	NC_019680	AAC	2	6	888846	888851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712030
13521	NC_019680	CA	3	6	888908	888913	50 %	0 %	0 %	50 %	427712030
13522	NC_019680	AGA	2	6	888929	888934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13523	NC_019680	GAA	2	6	888945	888950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13524	NC_019680	GAA	2	6	888960	888965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13525	NC_019680	AAG	2	6	888987	888992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13526	NC_019680	TGC	2	6	888995	889000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13527	NC_019680	TCA	2	6	889046	889051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712030
13528	NC_019680	CGA	2	6	889118	889123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13529	NC_019680	CTT	2	6	889221	889226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712030
13530	NC_019680	GCT	2	6	889322	889327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13531	NC_019680	CAC	2	6	889400	889405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712030
13532	NC_019680	A	6	6	889431	889436	100 %	0 %	0 %	0 %	427712030
13533	NC_019680	TAA	2	6	889496	889501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712030
13534	NC_019680	TCG	2	6	889515	889520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13535	NC_019680	AAG	2	6	889564	889569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13536	NC_019680	AGCC	2	8	889598	889605	25 %	0 %	25 %	50 %	427712030
13537	NC_019680	CGC	2	6	889628	889633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712030
13538	NC_019680	ATC	2	6	889649	889654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712030
13539	NC_019680	GAT	2	6	889758	889763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712030
13540	NC_019680	GAA	2	6	889788	889793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712030
13541	NC_019680	CGA	2	6	889811	889816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712030
13542	NC_019680	CAT	3	9	889823	889831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712030
13543	NC_019680	ACA	2	6	889873	889878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712031
13544	NC_019680	TAC	2	6	889894	889899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712031
13545	NC_019680	ATG	2	6	889987	889992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712031
13546	NC_019680	CCA	2	6	890055	890060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712031
13547	NC_019680	CTG	2	6	890091	890096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712031
13548	NC_019680	AGCA	2	8	890114	890121	50 %	0 %	25 %	25 %	427712031
13549	NC_019680	ATG	2	6	890209	890214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712031
13550	NC_019680	CAGACC	2	12	890278	890289	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427712031
13551	NC_019680	GAT	2	6	890309	890314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712031
13552	NC_019680	TCACG	2	10	890357	890366	20 %	20 %	20 %	40 %	427712031
13553	NC_019680	GTT	2	6	890372	890377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712031
13554	NC_019680	AAG	2	6	890439	890444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712031
13555	NC_019680	GAT	2	6	890505	890510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712031
13556	NC_019680	CAAG	2	8	890549	890556	50 %	0 %	25 %	25 %	427712031
13557	NC_019680	TG	3	6	890576	890581	0 %	50 %	50 %	0 %	427712031
13558	NC_019680	GAT	2	6	890592	890597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712031
13559	NC_019680	AGC	2	6	890633	890638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712031
13560	NC_019680	GGT	2	6	890639	890644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712031
13561	NC_019680	TGT	2	6	890697	890702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712032
13562	NC_019680	GCT	2	6	890718	890723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
13563	NC_019680	ACA	2	6	890759	890764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712032
13564	NC_019680	AGGA	2	8	890773	890780	50 %	0 %	50 %	0 %	427712032
13565	NC_019680	GCG	2	6	890836	890841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
13566	NC_019680	GAT	2	6	890964	890969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
13567	NC_019680	TGG	2	6	890991	890996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712032
13568	NC_019680	G	6	6	891023	891028	0 %	0 %	100 %	0 %	427712032
13569	NC_019680	GAG	2	6	891067	891072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
13570	NC_019680	ACGA	2	8	891074	891081	50 %	0 %	25 %	25 %	427712032
13571	NC_019680	CTT	2	6	891120	891125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
13572	NC_019680	CTGG	2	8	891129	891136	0 %	25 %	50 %	25 %	427712032
13573	NC_019680	GT	3	6	891161	891166	0 %	50 %	50 %	0 %	427712032
13574	NC_019680	AGA	2	6	891209	891214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
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13581	NC_019680	AAT	2	6	891580	891585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712032
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13583	NC_019680	GAA	2	6	891616	891621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
13584	NC_019680	GAA	2	6	891657	891662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
13585	NC_019680	CTT	2	6	891711	891716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
13586	NC_019680	CCGACC	2	12	891764	891775	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	427712032
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13589	NC_019680	TTTG	2	8	891982	891989	0 %	75 %	25 %	0 %	427712032
13590	NC_019680	GGT	2	6	892065	892070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712032
13591	NC_019680	GTC	2	6	892075	892080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
13592	NC_019680	GCT	2	6	892116	892121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
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13595	NC_019680	AG	3	6	892177	892182	50 %	0 %	50 %	0 %	427712032
13596	NC_019680	GCCA	2	8	892208	892215	25 %	0 %	25 %	50 %	427712032
13597	NC_019680	CCCT	2	8	892267	892274	0 %	25 %	0 %	75 %	427712032
13598	NC_019680	TC	3	6	892281	892286	0 %	50 %	0 %	50 %	427712032
13599	NC_019680	TTC	2	6	892306	892311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
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13601	NC_019680	TGA	2	6	892463	892468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
13602	NC_019680	CTG	2	6	892543	892548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
13603	NC_019680	TTG	2	6	892556	892561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712032
13604	NC_019680	CCG	2	6	892619	892624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712032
13605	NC_019680	TTG	2	6	892778	892783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712032
13606	NC_019680	GAG	2	6	892804	892809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
13607	NC_019680	GGC	2	6	892813	892818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
13608	NC_019680	CAGC	2	8	892841	892848	25 %	0 %	25 %	50 %	427712032
13609	NC_019680	TCA	2	6	892957	892962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712032
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13611	NC_019680	CAA	2	6	893190	893195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712032
13612	NC_019680	CA	3	6	893203	893208	50 %	0 %	0 %	50 %	427712032
13613	NC_019680	GAG	2	6	893234	893239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
13614	NC_019680	GCTG	2	8	893262	893269	0 %	25 %	50 %	25 %	427712032
13615	NC_019680	AC	3	6	893281	893286	50 %	0 %	0 %	50 %	427712032
13616	NC_019680	TGA	2	6	893342	893347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
13617	NC_019680	GCGAA	2	10	893470	893479	40 %	0 %	40 %	20 %	427712032
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13619	NC_019680	GAGAC	2	10	893510	893519	40 %	0 %	40 %	20 %	427712032
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