MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_019680	GCC	2	6	686857	686862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711822
10502	NC_019680	AAG	2	6	686884	686889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711822
10503	NC_019680	G	6	6	686918	686923	0 %	0 %	100 %	0 %	427711822
10504	NC_019680	ATCAAG	2	12	686943	686954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427711822
10505	NC_019680	CGATG	2	10	687225	687234	20 %	20 %	40 %	20 %	427711822
10506	NC_019680	TTG	2	6	687274	687279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711822
10507	NC_019680	C	6	6	687308	687313	0 %	0 %	0 %	100 %	427711822
10508	NC_019680	CCA	2	6	687401	687406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711822
10509	NC_019680	TCT	2	6	687460	687465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711822
10510	NC_019680	TTC	2	6	687466	687471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711822
10511	NC_019680	CCA	2	6	687476	687481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711822
10512	NC_019680	TGT	2	6	687536	687541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711822
10513	NC_019680	CCA	2	6	687587	687592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711822
10514	NC_019680	T	6	6	687617	687622	0 %	100 %	0 %	0 %	427711822
10515	NC_019680	GCAGA	2	10	687779	687788	40 %	0 %	40 %	20 %	427711823
10516	NC_019680	AGG	2	6	687845	687850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711823
10517	NC_019680	AGC	2	6	688050	688055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711823
10518	NC_019680	CCT	2	6	688061	688066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711823
10519	NC_019680	GGC	2	6	688071	688076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711823
10520	NC_019680	ATC	2	6	688167	688172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711823
10521	NC_019680	GTT	2	6	688235	688240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10522	NC_019680	GCG	2	6	688357	688362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711823
10523	NC_019680	GGC	2	6	688406	688411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711823
10524	NC_019680	TGT	2	6	688447	688452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10525	NC_019680	TTG	2	6	688456	688461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10526	NC_019680	GTA	2	6	688605	688610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711823
10527	NC_019680	GTT	2	6	688611	688616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10528	NC_019680	GTT	2	6	688634	688639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10529	NC_019680	TTGA	2	8	688693	688700	25 %	50 %	25 %	0 %	427711823
10530	NC_019680	AATTG	2	10	688738	688747	40 %	40 %	20 %	0 %	427711823
10531	NC_019680	GAA	2	6	688796	688801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711823
10532	NC_019680	TTG	2	6	688803	688808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10533	NC_019680	GAGG	2	8	688814	688821	25 %	0 %	75 %	0 %	427711823
10534	NC_019680	TTGG	2	8	688845	688852	0 %	50 %	50 %	0 %	427711823
10535	NC_019680	GTT	2	6	688958	688963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711823
10536	NC_019680	CCG	2	6	688992	688997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711823
10537	NC_019680	CTT	2	6	689051	689056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711823
10538	NC_019680	CGGG	2	8	689058	689065	0 %	0 %	75 %	25 %	427711823
10539	NC_019680	CTG	2	6	689111	689116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711823
10540	NC_019680	G	6	6	689142	689147	0 %	0 %	100 %	0 %	427711823
10541	NC_019680	TAC	2	6	689171	689176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711823
10542	NC_019680	AAT	2	6	689299	689304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711823
10543	NC_019680	G	6	6	689774	689779	0 %	0 %	100 %	0 %	427711824
10544	NC_019680	CGG	3	9	689790	689798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711824
10545	NC_019680	GCG	2	6	689819	689824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711824
10546	NC_019680	ACC	2	6	689829	689834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711824
10547	NC_019680	GCG	2	6	689882	689887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711824
10548	NC_019680	GAT	2	6	689960	689965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711824
10549	NC_019680	ACA	2	6	690053	690058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711824
10550	NC_019680	TGA	2	6	690125	690130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711824
10551	NC_019680	AGTCC	2	10	690164	690173	20 %	20 %	20 %	40 %	427711824
10552	NC_019680	GAA	2	6	690218	690223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711824
10553	NC_019680	GCC	2	6	690580	690585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711825
10554	NC_019680	TGG	2	6	690626	690631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711825
10555	NC_019680	GCT	2	6	690691	690696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711825
10556	NC_019680	TGA	2	6	690741	690746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711825
10557	NC_019680	TGA	2	6	690789	690794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711825
10558	NC_019680	GAA	2	6	690799	690804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711825
10559	NC_019680	AT	3	6	690837	690842	50 %	50 %	0 %	0 %	427711825
10560	NC_019680	AGA	2	6	690876	690881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711825
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10565	NC_019680	GTC	2	6	691120	691125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711825
10566	NC_019680	TGA	2	6	691268	691273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711825
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10572	NC_019680	TGC	2	6	691485	691490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711825
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10580	NC_019680	TTA	2	6	692089	692094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711826
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10582	NC_019680	GGGAG	2	10	692205	692214	20 %	0 %	80 %	0 %	427711826
10583	NC_019680	TGGG	2	8	692305	692312	0 %	25 %	75 %	0 %	427711826
10584	NC_019680	TGG	2	6	692326	692331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711826
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10588	NC_019680	CT	3	6	693254	693259	0 %	50 %	0 %	50 %	427711827
10589	NC_019680	CTG	2	6	693262	693267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711827
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10591	NC_019680	TGG	2	6	693350	693355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711827
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10594	NC_019680	CGT	2	6	693416	693421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711827
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10609	NC_019680	TC	3	6	694239	694244	0 %	50 %	0 %	50 %	427711828
10610	NC_019680	TAA	2	6	694288	694293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711828
10611	NC_019680	AT	3	6	694324	694329	50 %	50 %	0 %	0 %	427711828
10612	NC_019680	ACC	2	6	694421	694426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711828
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10617	NC_019680	C	6	6	694773	694778	0 %	0 %	0 %	100 %	427711828
10618	NC_019680	ATC	2	6	694893	694898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711828
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