MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_019680	GGA	2	6	391251	391256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711539
6003	NC_019680	AAGGCA	2	12	391297	391308	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	427711539
6004	NC_019680	TGT	2	6	391325	391330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711539
6005	NC_019680	ACT	2	6	391520	391525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711540
6006	NC_019680	GAA	2	6	391554	391559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711540
6007	NC_019680	CTG	2	6	391561	391566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711540
6008	NC_019680	TTGCC	2	10	391592	391601	0 %	40 %	20 %	40 %	427711540
6009	NC_019680	T	8	8	391615	391622	0 %	100 %	0 %	0 %	427711540
6010	NC_019680	TTTG	2	8	391676	391683	0 %	75 %	25 %	0 %	427711540
6011	NC_019680	GT	3	6	391856	391861	0 %	50 %	50 %	0 %	427711540
6012	NC_019680	TTG	2	6	391924	391929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711540
6013	NC_019680	TGG	2	6	392001	392006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711540
6014	NC_019680	GAT	2	6	392012	392017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711540
6015	NC_019680	AGC	2	6	392119	392124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711541
6016	NC_019680	TGA	2	6	392128	392133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711541
6017	NC_019680	GA	3	6	392137	392142	50 %	0 %	50 %	0 %	427711541
6018	NC_019680	GAA	2	6	392180	392185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711541
6019	NC_019680	GTT	2	6	392225	392230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711541
6020	NC_019680	TGA	2	6	392265	392270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711542
6021	NC_019680	AGCC	2	8	392281	392288	25 %	0 %	25 %	50 %	427711542
6022	NC_019680	GCTCT	2	10	392336	392345	0 %	40 %	20 %	40 %	427711542
6023	NC_019680	TTAT	2	8	392369	392376	25 %	75 %	0 %	0 %	427711542
6024	NC_019680	GAT	2	6	392435	392440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711542
6025	NC_019680	AAC	2	6	392441	392446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711542
6026	NC_019680	CAT	2	6	392458	392463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711542
6027	NC_019680	GATCA	2	10	392549	392558	40 %	20 %	20 %	20 %	427711543
6028	NC_019680	AG	3	6	392565	392570	50 %	0 %	50 %	0 %	427711543
6029	NC_019680	TGC	2	6	392761	392766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711544
6030	NC_019680	TGG	2	6	392785	392790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711544
6031	NC_019680	TTG	2	6	392808	392813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711544
6032	NC_019680	GC	3	6	392818	392823	0 %	0 %	50 %	50 %	427711544
6033	NC_019680	CGG	2	6	392824	392829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711544
6034	NC_019680	TGTT	2	8	392841	392848	0 %	75 %	25 %	0 %	427711544
6035	NC_019680	CTCTTG	2	12	392862	392873	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427711544
6036	NC_019680	TGC	2	6	392965	392970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711544
6037	NC_019680	CTG	2	6	393039	393044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711544
6038	NC_019680	T	6	6	393063	393068	0 %	100 %	0 %	0 %	427711544
6039	NC_019680	CTC	2	6	393085	393090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711544
6040	NC_019680	CAA	2	6	393228	393233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711544
6041	NC_019680	GTT	2	6	393259	393264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711544
6042	NC_019680	TTGG	2	8	393273	393280	0 %	50 %	50 %	0 %	427711544
6043	NC_019680	CAGT	2	8	393305	393312	25 %	25 %	25 %	25 %	427711544
6044	NC_019680	AG	3	6	393320	393325	50 %	0 %	50 %	0 %	427711544
6045	NC_019680	ACAG	2	8	393327	393334	50 %	0 %	25 %	25 %	427711544
6046	NC_019680	GAT	2	6	393336	393341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711544
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6048	NC_019680	GCCC	2	8	393579	393586	0 %	0 %	25 %	75 %	427711544
6049	NC_019680	CGC	2	6	393719	393724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711544
6050	NC_019680	TC	3	6	393726	393731	0 %	50 %	0 %	50 %	427711544
6051	NC_019680	TCA	2	6	393734	393739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711544
6052	NC_019680	G	6	6	393815	393820	0 %	0 %	100 %	0 %	427711544
6053	NC_019680	ATT	2	6	393879	393884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711544
6054	NC_019680	GTT	2	6	393970	393975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711544
6055	NC_019680	ATTG	2	8	394043	394050	25 %	50 %	25 %	0 %	427711544
6056	NC_019680	A	7	7	394073	394079	100 %	0 %	0 %	0 %	427711544
6057	NC_019680	G	6	6	394142	394147	0 %	0 %	100 %	0 %	427711544
6058	NC_019680	TTC	2	6	394170	394175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711544
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6060	NC_019680	TGA	2	6	394384	394389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711544
6061	NC_019680	TTA	2	6	394563	394568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711544
6062	NC_019680	TGG	2	6	394663	394668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711544
6063	NC_019680	GCT	2	6	394713	394718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711544
6064	NC_019680	TAAG	2	8	394720	394727	50 %	25 %	25 %	0 %	427711544
6065	NC_019680	TC	3	6	394768	394773	0 %	50 %	0 %	50 %	427711544
6066	NC_019680	C	6	6	395143	395148	0 %	0 %	0 %	100 %	427711545
6067	NC_019680	CTCG	2	8	395172	395179	0 %	25 %	25 %	50 %	427711545
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6070	NC_019680	CGG	2	6	395284	395289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711545
6071	NC_019680	TTCAG	2	10	395365	395374	20 %	40 %	20 %	20 %	427711545
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6074	NC_019680	ATTT	2	8	395458	395465	25 %	75 %	0 %	0 %	427711545
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6079	NC_019680	GAC	2	6	395654	395659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711545
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6082	NC_019680	GGA	2	6	395875	395880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711546
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6094	NC_019680	GGC	2	6	397170	397175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711547
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6105	NC_019680	TGC	2	6	397654	397659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711547
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6112	NC_019680	CCT	2	6	398053	398058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711547
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6242	NC_019680	TCAG	2	8	407013	407020	25 %	25 %	25 %	25 %	427711554
6243	NC_019680	GTGA	2	8	407024	407031	25 %	25 %	50 %	0 %	427711554
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6494	NC_019680	TTGGC	2	10	423748	423757	0 %	40 %	40 %	20 %	427711567
6495	NC_019680	CGG	2	6	423820	423825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711567
6496	NC_019680	TAA	2	6	423855	423860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711567
6497	NC_019680	TGC	2	6	423947	423952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711567
6498	NC_019680	GCC	2	6	423979	423984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711567
6499	NC_019680	GCA	2	6	424050	424055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711567
6500	NC_019680	TTGG	2	8	424104	424111	0 %	50 %	50 %	0 %	427711567

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