MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019680	GAT	2	6	357348	357353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711502
5502	NC_019680	ATT	2	6	357372	357377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711502
5503	NC_019680	CGGTGA	2	12	357398	357409	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427711502
5504	NC_019680	CGCC	2	8	357434	357441	0 %	0 %	25 %	75 %	427711502
5505	NC_019680	GTGATT	2	12	357513	357524	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	427711502
5506	NC_019680	G	6	6	357577	357582	0 %	0 %	100 %	0 %	427711502
5507	NC_019680	TGA	3	9	357683	357691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711502
5508	NC_019680	GCG	3	9	357695	357703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711502
5509	NC_019680	A	6	6	357712	357717	100 %	0 %	0 %	0 %	427711502
5510	NC_019680	GGT	2	6	357785	357790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711502
5511	NC_019680	TGAA	2	8	357862	357869	50 %	25 %	25 %	0 %	427711502
5512	NC_019680	CCCG	2	8	357896	357903	0 %	0 %	25 %	75 %	427711502
5513	NC_019680	AGTG	2	8	357942	357949	25 %	25 %	50 %	0 %	427711502
5514	NC_019680	AG	3	6	357953	357958	50 %	0 %	50 %	0 %	427711502
5515	NC_019680	GC	3	6	357965	357970	0 %	0 %	50 %	50 %	427711502
5516	NC_019680	GCC	2	6	358015	358020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711502
5517	NC_019680	GAA	2	6	358086	358091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711502
5518	NC_019680	CCAT	2	8	358096	358103	25 %	25 %	0 %	50 %	427711502
5519	NC_019680	TTG	2	6	358168	358173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711502
5520	NC_019680	CGG	2	6	358192	358197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711502
5521	NC_019680	GCA	2	6	358322	358327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711502
5522	NC_019680	GGA	2	6	358340	358345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711502
5523	NC_019680	CGG	2	6	358354	358359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711502
5524	NC_019680	ATG	3	9	358396	358404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711502
5525	NC_019680	GAA	2	6	358419	358424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711502
5526	NC_019680	GC	3	6	358425	358430	0 %	0 %	50 %	50 %	427711502
5527	NC_019680	GAA	2	6	358557	358562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711502
5528	NC_019680	A	6	6	359368	359373	100 %	0 %	0 %	0 %	427711503
5529	NC_019680	ATT	2	6	359383	359388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711503
5530	NC_019680	GCC	2	6	359474	359479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711503
5531	NC_019680	GACA	2	8	359486	359493	50 %	0 %	25 %	25 %	427711503
5532	NC_019680	TCG	2	6	359552	359557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711503
5533	NC_019680	A	6	6	359588	359593	100 %	0 %	0 %	0 %	427711503
5534	NC_019680	GGT	2	6	359658	359663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711503
5535	NC_019680	A	7	7	359681	359687	100 %	0 %	0 %	0 %	427711503
5536	NC_019680	AAG	2	6	359690	359695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711503
5537	NC_019680	TGC	2	6	359823	359828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711504
5538	NC_019680	CT	3	6	359899	359904	0 %	50 %	0 %	50 %	427711504
5539	NC_019680	TGG	2	6	359993	359998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711504
5540	NC_019680	TCAAA	2	10	360109	360118	60 %	20 %	0 %	20 %	427711504
5541	NC_019680	TTA	2	6	360127	360132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711504
5542	NC_019680	TTG	2	6	360168	360173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711504
5543	NC_019680	TTC	2	6	360254	360259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711504
5544	NC_019680	C	6	6	360259	360264	0 %	0 %	0 %	100 %	427711504
5545	NC_019680	GGT	2	6	360276	360281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711504
5546	NC_019680	GCG	2	6	360313	360318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711504
5547	NC_019680	AACTC	2	10	360331	360340	40 %	20 %	0 %	40 %	427711504
5548	NC_019680	C	6	6	360371	360376	0 %	0 %	0 %	100 %	427711504
5549	NC_019680	CTGC	2	8	360400	360407	0 %	25 %	25 %	50 %	427711504
5550	NC_019680	ATT	2	6	360415	360420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711504
5551	NC_019680	ACCCA	2	10	360443	360452	40 %	0 %	0 %	60 %	427711504
5552	NC_019680	CAG	2	6	360514	360519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711504
5553	NC_019680	TGG	2	6	360538	360543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711504
5554	NC_019680	TTC	3	9	360710	360718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711505
5555	NC_019680	ATC	3	9	360791	360799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711505
5556	NC_019680	AAG	2	6	360801	360806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711505
5557	NC_019680	TTC	2	6	360902	360907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711505
5558	NC_019680	TCA	2	6	360930	360935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711505
5559	NC_019680	TGG	2	6	360946	360951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711505
5560	NC_019680	GCGA	2	8	361217	361224	25 %	0 %	50 %	25 %	427711506
5561	NC_019680	TCAC	2	8	361284	361291	25 %	25 %	0 %	50 %	427711506
5562	NC_019680	GA	3	6	361359	361364	50 %	0 %	50 %	0 %	427711506
5563	NC_019680	TTC	2	6	361523	361528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711506
5564	NC_019680	AATT	2	8	361535	361542	50 %	50 %	0 %	0 %	427711506
5565	NC_019680	GCG	2	6	361598	361603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711506
5566	NC_019680	CCA	2	6	361640	361645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711506
5567	NC_019680	CCA	2	6	361663	361668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711506
5568	NC_019680	AGCC	2	8	361669	361676	25 %	0 %	25 %	50 %	427711506
5569	NC_019680	CAC	2	6	361733	361738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711506
5570	NC_019680	A	6	6	361741	361746	100 %	0 %	0 %	0 %	427711506
5571	NC_019680	CGC	2	6	361752	361757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711506
5572	NC_019680	GTT	2	6	361822	361827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711506
5573	NC_019680	CATAGC	2	12	362074	362085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427711507
5574	NC_019680	CTG	3	9	362096	362104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711507
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5578	NC_019680	AGCG	2	8	362344	362351	25 %	0 %	50 %	25 %	427711507
5579	NC_019680	GCA	2	6	362361	362366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711507
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5581	NC_019680	A	6	6	362537	362542	100 %	0 %	0 %	0 %	427711507
5582	NC_019680	ATT	2	6	362594	362599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711507
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5585	NC_019680	CGG	2	6	362659	362664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711507
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5587	NC_019680	TCA	2	6	362835	362840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711507
5588	NC_019680	GAT	2	6	362869	362874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711507
5589	NC_019680	GGC	2	6	362990	362995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711507
5590	NC_019680	GAG	2	6	363095	363100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711507
5591	NC_019680	G	6	6	363180	363185	0 %	0 %	100 %	0 %	427711507
5592	NC_019680	CAA	2	6	363311	363316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711507
5593	NC_019680	TGA	2	6	363330	363335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711507
5594	NC_019680	TGGC	2	8	363393	363400	0 %	25 %	50 %	25 %	427711507
5595	NC_019680	TGGG	2	8	363442	363449	0 %	25 %	75 %	0 %	427711507
5596	NC_019680	TCA	2	6	363505	363510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711507
5597	NC_019680	TGGG	2	8	363924	363931	0 %	25 %	75 %	0 %	427711508
5598	NC_019680	GCC	2	6	363973	363978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711508
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5601	NC_019680	ATCAC	2	10	364074	364083	40 %	20 %	0 %	40 %	427711508
5602	NC_019680	GCGG	2	8	364100	364107	0 %	0 %	75 %	25 %	427711508
5603	NC_019680	ATC	2	6	364148	364153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711508
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5605	NC_019680	GC	3	6	364321	364326	0 %	0 %	50 %	50 %	427711508
5606	NC_019680	AAT	2	6	364331	364336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711508
5607	NC_019680	CCA	2	6	364383	364388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711508
5608	NC_019680	CTG	2	6	364461	364466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711508
5609	NC_019680	CAATGG	2	12	364525	364536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427711508
5610	NC_019680	ATCA	2	8	364700	364707	50 %	25 %	0 %	25 %	427711508
5611	NC_019680	GAG	2	6	364843	364848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711508
5612	NC_019680	AATC	2	8	364873	364880	50 %	25 %	0 %	25 %	427711508
5613	NC_019680	CAC	2	6	364883	364888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711508
5614	NC_019680	AG	3	6	364955	364960	50 %	0 %	50 %	0 %	427711508
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5617	NC_019680	G	6	6	365333	365338	0 %	0 %	100 %	0 %	427711509
5618	NC_019680	CTGG	2	8	365399	365406	0 %	25 %	50 %	25 %	427711509
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5621	NC_019680	GC	3	6	365643	365648	0 %	0 %	50 %	50 %	427711509
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5623	NC_019680	CAA	2	6	365967	365972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711510
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5732	NC_019680	C	7	7	372715	372721	0 %	0 %	0 %	100 %	427711519
5733	NC_019680	TGG	2	6	372754	372759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711519
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5738	NC_019680	TGA	2	6	373236	373241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711521
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5741	NC_019680	GCT	2	6	373439	373444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711521
5742	NC_019680	C	6	6	373452	373457	0 %	0 %	0 %	100 %	427711521
5743	NC_019680	ACC	2	6	373510	373515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711521
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5872	NC_019680	GTG	2	6	381674	381679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711528
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5991	NC_019680	TCA	2	6	390172	390177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711538
5992	NC_019680	TGT	2	6	390202	390207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711538
5993	NC_019680	AGCCA	2	10	390501	390510	40 %	0 %	20 %	40 %	427711539
5994	NC_019680	GGT	2	6	390526	390531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711539
5995	NC_019680	TGG	2	6	390745	390750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711539
5996	NC_019680	CGG	2	6	390751	390756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711539
5997	NC_019680	CAG	2	6	390811	390816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711539
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5999	NC_019680	CCT	2	6	390980	390985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711539
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