MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_019680	CAA	2	6	3538147	3538152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714548
53002	NC_019680	AAT	2	6	3538184	3538189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714548
53003	NC_019680	TAA	2	6	3538246	3538251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714548
53004	NC_019680	TCC	2	6	3538317	3538322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427714548
53005	NC_019680	GCCACT	2	12	3538337	3538348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427714548
53006	NC_019680	TGG	2	6	3538447	3538452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714548
53007	NC_019680	AGT	2	6	3538503	3538508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714548
53008	NC_019680	GC	3	6	3538627	3538632	0 %	0 %	50 %	50 %	427714548
53009	NC_019680	ACA	2	6	3538768	3538773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714548
53010	NC_019680	ATC	2	6	3538880	3538885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714548
53011	NC_019680	GCCC	2	8	3538962	3538969	0 %	0 %	25 %	75 %	427714548
53012	NC_019680	C	7	7	3538967	3538973	0 %	0 %	0 %	100 %	427714548
53013	NC_019680	ATC	2	6	3539024	3539029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714548
53014	NC_019680	TGC	2	6	3539040	3539045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714548
53015	NC_019680	TCA	2	6	3539062	3539067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714548
53016	NC_019680	CGG	2	6	3539134	3539139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714548
53017	NC_019680	GAA	2	6	3539147	3539152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714548
53018	NC_019680	ATTT	2	8	3539241	3539248	25 %	75 %	0 %	0 %	427714548
53019	NC_019680	TGA	2	6	3539314	3539319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714549
53020	NC_019680	ACA	2	6	3539332	3539337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714549
53021	NC_019680	CAC	2	6	3539358	3539363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714549
53022	NC_019680	ATA	2	6	3539368	3539373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714549
53023	NC_019680	ACC	2	6	3539386	3539391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714549
53024	NC_019680	TGG	2	6	3539419	3539424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714549
53025	NC_019680	ACT	2	6	3539440	3539445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714549
53026	NC_019680	GTT	2	6	3539453	3539458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714549
53027	NC_019680	GCC	2	6	3539603	3539608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714550
53028	NC_019680	CTT	2	6	3539833	3539838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714550
53029	NC_019680	CAA	2	6	3540047	3540052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714550
53030	NC_019680	TCA	2	6	3540076	3540081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714550
53031	NC_019680	GCA	2	6	3540298	3540303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714550
53032	NC_019680	TCT	2	6	3540403	3540408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714550
53033	NC_019680	G	7	7	3540441	3540447	0 %	0 %	100 %	0 %	427714550
53034	NC_019680	CAA	2	6	3540467	3540472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714550
53035	NC_019680	CAA	2	6	3540569	3540574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714550
53036	NC_019680	AGA	2	6	3540589	3540594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714550
53037	NC_019680	GGC	2	6	3540646	3540651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714550
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53039	NC_019680	TG	3	6	3540713	3540718	0 %	50 %	50 %	0 %	427714550
53040	NC_019680	AAC	2	6	3540771	3540776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714550
53041	NC_019680	TTAA	2	8	3540824	3540831	50 %	50 %	0 %	0 %	427714550
53042	NC_019680	GCC	2	6	3540869	3540874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714550
53043	NC_019680	CTG	2	6	3541043	3541048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714550
53044	NC_019680	AGG	2	6	3541113	3541118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427714550
53045	NC_019680	GGGATT	2	12	3541142	3541153	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427714550
53046	NC_019680	CAG	2	6	3541190	3541195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714550
53047	NC_019680	CGG	2	6	3541211	3541216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714550
53048	NC_019680	CAA	2	6	3541253	3541258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714550
53049	NC_019680	CCA	2	6	3541270	3541275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714550
53050	NC_019680	T	6	6	3541319	3541324	0 %	100 %	0 %	0 %	427714550
53051	NC_019680	ATT	2	6	3541523	3541528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714550
53052	NC_019680	ATTTA	2	10	3541549	3541558	40 %	60 %	0 %	0 %	427714550
53053	NC_019680	GCAG	2	8	3541579	3541586	25 %	0 %	50 %	25 %	427714550
53054	NC_019680	CTG	2	6	3541616	3541621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714550
53055	NC_019680	C	6	6	3541624	3541629	0 %	0 %	0 %	100 %	427714550
53056	NC_019680	GAA	2	6	3541721	3541726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714550
53057	NC_019680	TTA	2	6	3541727	3541732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714550
53058	NC_019680	GA	3	6	3541760	3541765	50 %	0 %	50 %	0 %	427714550
53059	NC_019680	GCT	2	6	3541781	3541786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714550
53060	NC_019680	A	7	7	3541893	3541899	100 %	0 %	0 %	0 %	427714551
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53065	NC_019680	GAAG	2	8	3542070	3542077	50 %	0 %	50 %	0 %	427714551
53066	NC_019680	TAG	2	6	3542810	3542815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714552
53067	NC_019680	CA	3	6	3542850	3542855	50 %	0 %	0 %	50 %	427714552
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53071	NC_019680	T	6	6	3543133	3543138	0 %	100 %	0 %	0 %	427714552
53072	NC_019680	CAC	2	6	3543141	3543146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714552
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53078	NC_019680	GGGT	2	8	3543509	3543516	0 %	25 %	75 %	0 %	427714552
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53083	NC_019680	GTT	2	6	3544083	3544088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714553
53084	NC_019680	ATA	2	6	3544229	3544234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714553
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53086	NC_019680	CTTCA	2	10	3544337	3544346	20 %	40 %	0 %	40 %	427714553
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53090	NC_019680	TGG	2	6	3544654	3544659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714553
53091	NC_019680	ACC	2	6	3544685	3544690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714553
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53099	NC_019680	CCG	2	6	3545676	3545681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714555
53100	NC_019680	GGAT	2	8	3545739	3545746	25 %	25 %	50 %	0 %	427714555
53101	NC_019680	G	7	7	3545920	3545926	0 %	0 %	100 %	0 %	427714555
53102	NC_019680	GAT	2	6	3546070	3546075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714555
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53104	NC_019680	G	7	7	3546142	3546148	0 %	0 %	100 %	0 %	427714555
53105	NC_019680	TCA	2	6	3546192	3546197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714555
53106	NC_019680	GTGA	2	8	3546320	3546327	25 %	25 %	50 %	0 %	427714555
53107	NC_019680	GGT	2	6	3546335	3546340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714555
53108	NC_019680	ACG	2	6	3546392	3546397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714555
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53113	NC_019680	GCA	2	6	3546719	3546724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714555
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53115	NC_019680	GAT	2	6	3546875	3546880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714555
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53117	NC_019680	CCA	2	6	3546949	3546954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714556
53118	NC_019680	GCT	2	6	3546972	3546977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714556
53119	NC_019680	ACC	2	6	3547031	3547036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714556
53120	NC_019680	AAT	2	6	3547094	3547099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714556
53121	NC_019680	GATT	2	8	3547114	3547121	25 %	50 %	25 %	0 %	427714556
53122	NC_019680	CGTAAT	2	12	3547130	3547141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427714556
53123	NC_019680	TTCC	2	8	3547147	3547154	0 %	50 %	0 %	50 %	427714556
53124	NC_019680	AAT	2	6	3547231	3547236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714556
53125	NC_019680	TTC	2	6	3547373	3547378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714556
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53210	NC_019680	TGA	2	6	3552656	3552661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714561
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53217	NC_019680	GA	3	6	3553140	3553145	50 %	0 %	50 %	0 %	427714562
53218	NC_019680	GGTT	2	8	3553165	3553172	0 %	50 %	50 %	0 %	427714562
53219	NC_019680	GAT	2	6	3553193	3553198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714562
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53221	NC_019680	TTG	2	6	3553254	3553259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714562
53222	NC_019680	GGC	2	6	3553277	3553282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714562
53223	NC_019680	CAA	2	6	3553552	3553557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714563
53224	NC_019680	CAG	2	6	3553618	3553623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714563
53225	NC_019680	G	6	6	3553834	3553839	0 %	0 %	100 %	0 %	427714563
53226	NC_019680	TTG	2	6	3553868	3553873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714563
53227	NC_019680	CGG	2	6	3554209	3554214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714563
53228	NC_019680	GGCCTT	2	12	3554265	3554276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714563
53229	NC_019680	CGC	2	6	3554350	3554355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714563
53230	NC_019680	CCA	2	6	3554364	3554369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714563
53231	NC_019680	CCA	2	6	3554394	3554399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714563
53232	NC_019680	TCG	2	6	3554421	3554426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714563
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