MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_019680	TGG	2	6	3414796	3414801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714431
51002	NC_019680	AAC	2	6	3414815	3414820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714431
51003	NC_019680	AGT	2	6	3414824	3414829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714431
51004	NC_019680	ATG	2	6	3414880	3414885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714432
51005	NC_019680	AAG	2	6	3414900	3414905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714432
51006	NC_019680	G	6	6	3414978	3414983	0 %	0 %	100 %	0 %	427714432
51007	NC_019680	AAAT	2	8	3414989	3414996	75 %	25 %	0 %	0 %	427714432
51008	NC_019680	TACA	2	8	3415030	3415037	50 %	25 %	0 %	25 %	427714432
51009	NC_019680	TTG	2	6	3415039	3415044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714432
51010	NC_019680	ATCA	2	8	3415048	3415055	50 %	25 %	0 %	25 %	427714432
51011	NC_019680	CCG	3	9	3415092	3415100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714432
51012	NC_019680	TAA	2	6	3415143	3415148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714432
51013	NC_019680	CGT	2	6	3415240	3415245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714432
51014	NC_019680	CGCCA	2	10	3415268	3415277	20 %	0 %	20 %	60 %	427714432
51015	NC_019680	TCC	2	6	3415286	3415291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427714432
51016	NC_019680	TCAAGG	2	12	3415309	3415320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427714433
51017	NC_019680	TTC	2	6	3415468	3415473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714433
51018	NC_019680	CCA	2	6	3415560	3415565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714433
51019	NC_019680	AGCCCA	2	12	3415566	3415577	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427714433
51020	NC_019680	TGT	2	6	3415583	3415588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714433
51021	NC_019680	TTC	2	6	3415627	3415632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714433
51022	NC_019680	ATCA	2	8	3415684	3415691	50 %	25 %	0 %	25 %	427714433
51023	NC_019680	T	7	7	3415706	3415712	0 %	100 %	0 %	0 %	427714433
51024	NC_019680	T	6	6	3415944	3415949	0 %	100 %	0 %	0 %	427714433
51025	NC_019680	GGC	2	6	3415966	3415971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714433
51026	NC_019680	AAC	2	6	3416021	3416026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714433
51027	NC_019680	T	6	6	3416128	3416133	0 %	100 %	0 %	0 %	427714433
51028	NC_019680	GTG	2	6	3416266	3416271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714434
51029	NC_019680	GCTTG	2	10	3416273	3416282	0 %	40 %	40 %	20 %	427714434
51030	NC_019680	G	6	6	3416434	3416439	0 %	0 %	100 %	0 %	427714434
51031	NC_019680	T	6	6	3416442	3416447	0 %	100 %	0 %	0 %	427714434
51032	NC_019680	AAC	2	6	3416566	3416571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714434
51033	NC_019680	CCA	2	6	3416573	3416578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714434
51034	NC_019680	CAG	2	6	3416591	3416596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714434
51035	NC_019680	AAT	2	6	3416663	3416668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714434
51036	NC_019680	GTTTT	2	10	3416692	3416701	0 %	80 %	20 %	0 %	427714434
51037	NC_019680	CGG	2	6	3416756	3416761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714434
51038	NC_019680	GA	3	6	3416772	3416777	50 %	0 %	50 %	0 %	427714434
51039	NC_019680	GTA	2	6	3416838	3416843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714434
51040	NC_019680	CTAAA	2	10	3416879	3416888	60 %	20 %	0 %	20 %	427714434
51041	NC_019680	CGG	2	6	3416901	3416906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714434
51042	NC_019680	CTA	2	6	3416929	3416934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714434
51043	NC_019680	GGT	2	6	3417064	3417069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714434
51044	NC_019680	GTC	2	6	3417105	3417110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714434
51045	NC_019680	TCC	2	6	3417162	3417167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427714434
51046	NC_019680	GAT	2	6	3417205	3417210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714434
51047	NC_019680	A	6	6	3417214	3417219	100 %	0 %	0 %	0 %	427714434
51048	NC_019680	AAT	2	6	3417238	3417243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714434
51049	NC_019680	CCTGG	2	10	3417249	3417258	0 %	20 %	40 %	40 %	427714434
51050	NC_019680	AGC	2	6	3417283	3417288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714434
51051	NC_019680	TG	3	6	3417344	3417349	0 %	50 %	50 %	0 %	427714434
51052	NC_019680	TAT	2	6	3417609	3417614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714435
51053	NC_019680	TGG	2	6	3417654	3417659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714435
51054	NC_019680	CGG	3	9	3417665	3417673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714435
51055	NC_019680	TTGA	2	8	3417760	3417767	25 %	50 %	25 %	0 %	427714435
51056	NC_019680	AGC	2	6	3417774	3417779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714435
51057	NC_019680	ACG	2	6	3417855	3417860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714435
51058	NC_019680	TC	4	8	3417870	3417877	0 %	50 %	0 %	50 %	427714435
51059	NC_019680	GCG	2	6	3417879	3417884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714435
51060	NC_019680	GCAA	2	8	3417929	3417936	50 %	0 %	25 %	25 %	427714435
51061	NC_019680	CGAG	2	8	3417977	3417984	25 %	0 %	50 %	25 %	427714435
51062	NC_019680	GAG	2	6	3418015	3418020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427714435
51063	NC_019680	CTG	2	6	3418069	3418074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714435
51064	NC_019680	AT	3	6	3418076	3418081	50 %	50 %	0 %	0 %	427714435
51065	NC_019680	G	6	6	3418120	3418125	0 %	0 %	100 %	0 %	427714436
51066	NC_019680	TGA	2	6	3418180	3418185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714436
51067	NC_019680	CTC	2	6	3418193	3418198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427714436
51068	NC_019680	GTG	2	6	3418203	3418208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714436
51069	NC_019680	GA	3	6	3418232	3418237	50 %	0 %	50 %	0 %	427714436
51070	NC_019680	ATT	2	6	3418436	3418441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714436
51071	NC_019680	TGT	2	6	3418471	3418476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714436
51072	NC_019680	GTT	2	6	3418545	3418550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714436
51073	NC_019680	TGTT	2	8	3418556	3418563	0 %	75 %	25 %	0 %	427714436
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51078	NC_019680	TCT	2	6	3418651	3418656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714436
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51084	NC_019680	ATGG	2	8	3418898	3418905	25 %	25 %	50 %	0 %	427714436
51085	NC_019680	GTT	2	6	3418910	3418915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714436
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51088	NC_019680	A	6	6	3419533	3419538	100 %	0 %	0 %	0 %	427714437
51089	NC_019680	AGCCGG	2	12	3419559	3419570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	427714437
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51091	NC_019680	AATT	2	8	3419804	3419811	50 %	50 %	0 %	0 %	427714437
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51101	NC_019680	GCCG	2	8	3420346	3420353	0 %	0 %	50 %	50 %	427714437
51102	NC_019680	GCCA	2	8	3420421	3420428	25 %	0 %	25 %	50 %	427714437
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51105	NC_019680	CGG	2	6	3420534	3420539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714437
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51107	NC_019680	ATGA	2	8	3420711	3420718	50 %	25 %	25 %	0 %	427714438
51108	NC_019680	TTG	2	6	3420760	3420765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714438
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51112	NC_019680	TGG	2	6	3420937	3420942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714438
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51115	NC_019680	GGT	2	6	3421223	3421228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714439
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51497	NC_019680	CTG	2	6	3441721	3441726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714456
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