MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 254494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_019673	TCC	2	6	508869	508874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602329
14002	NC_019673	CAG	3	9	508895	508903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602329
14003	NC_019673	TCGGT	2	10	509040	509049	0 %	40 %	40 %	20 %	433602330
14004	NC_019673	CCTTG	2	10	509084	509093	0 %	40 %	20 %	40 %	433602330
14005	NC_019673	CG	3	6	509103	509108	0 %	0 %	50 %	50 %	433602330
14006	NC_019673	CGG	2	6	509123	509128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
14007	NC_019673	CGAA	2	8	509138	509145	50 %	0 %	25 %	25 %	433602330
14008	NC_019673	TCA	2	6	509148	509153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602330
14009	NC_019673	CGCGCC	2	12	509164	509175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
14010	NC_019673	CCCGAA	2	12	509179	509190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433602330
14011	NC_019673	CCG	2	6	509195	509200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
14012	NC_019673	CGC	2	6	509205	509210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
14013	NC_019673	AGC	2	6	509211	509216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602330
14014	NC_019673	GCCGC	2	10	509225	509234	0 %	0 %	40 %	60 %	433602330
14015	NC_019673	GAA	4	12	509236	509247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602330
14016	NC_019673	GTG	2	6	509288	509293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602330
14017	NC_019673	ACT	2	6	509316	509321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602330
14018	NC_019673	CGC	2	6	509332	509337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
14019	NC_019673	GGCG	2	8	509347	509354	0 %	0 %	75 %	25 %	433602330
14020	NC_019673	GCG	2	6	509409	509414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
14021	NC_019673	GCG	2	6	509469	509474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
14022	NC_019673	TAC	2	6	509480	509485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602330
14023	NC_019673	CTG	2	6	509534	509539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602330
14024	NC_019673	CGG	2	6	509598	509603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
14025	NC_019673	GGT	2	6	509641	509646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602330
14026	NC_019673	CGA	3	9	509656	509664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602330
14027	NC_019673	GCG	2	6	509673	509678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
14028	NC_019673	GC	3	6	509682	509687	0 %	0 %	50 %	50 %	433602330
14029	NC_019673	GCC	2	6	509738	509743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
14030	NC_019673	CCG	2	6	509945	509950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
14031	NC_019673	GCCG	2	8	509964	509971	0 %	0 %	50 %	50 %	433602331
14032	NC_019673	CGG	2	6	510009	510014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
14033	NC_019673	CCG	2	6	510038	510043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
14034	NC_019673	CCG	2	6	510107	510112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
14035	NC_019673	GAG	2	6	510157	510162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602331
14036	NC_019673	GAG	2	6	510166	510171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602331
14037	NC_019673	CGG	3	9	510173	510181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
14038	NC_019673	GAA	2	6	510201	510206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602331
14039	NC_019673	CGC	2	6	510216	510221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
14040	NC_019673	TGG	2	6	510239	510244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602331
14041	NC_019673	CTT	2	6	510249	510254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433602331
14042	NC_019673	CGG	2	6	510293	510298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
14043	NC_019673	CAG	2	6	510319	510324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602331
14044	NC_019673	GAC	2	6	510325	510330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602331
14045	NC_019673	GAA	2	6	510345	510350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602331
14046	NC_019673	GCG	2	6	510359	510364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
14047	NC_019673	GAG	2	6	510424	510429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602331
14048	NC_019673	CGG	2	6	510456	510461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
14049	NC_019673	CTG	2	6	510487	510492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602331
14050	NC_019673	ACCGG	2	10	510559	510568	20 %	0 %	40 %	40 %	433602331
14051	NC_019673	TCA	2	6	510590	510595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602331
14052	NC_019673	CCG	2	6	510653	510658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
14053	NC_019673	CGT	3	9	510822	510830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602332
14054	NC_019673	GGCG	2	8	510834	510841	0 %	0 %	75 %	25 %	433602332
14055	NC_019673	CGG	2	6	510861	510866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602332
14056	NC_019673	GCC	3	9	510949	510957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602332
14057	NC_019673	GGT	2	6	510981	510986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602332
14058	NC_019673	CGG	2	6	511011	511016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602332
14059	NC_019673	GGT	2	6	511149	511154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602332
14060	NC_019673	GCG	2	6	511169	511174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602332
14061	NC_019673	GCC	2	6	511401	511406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
14062	NC_019673	CGC	2	6	511415	511420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
14063	NC_019673	GGC	2	6	511423	511428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602333
14064	NC_019673	GCC	2	6	511480	511485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
14065	NC_019673	CCGC	2	8	511486	511493	0 %	0 %	25 %	75 %	433602333
14066	NC_019673	GCA	3	9	511503	511511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602333
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14068	NC_019673	CGC	2	6	511538	511543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
14069	NC_019673	GCA	2	6	511590	511595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602333
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14071	NC_019673	GCA	2	6	511632	511637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602333
14072	NC_019673	CGC	2	6	511646	511651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
14073	NC_019673	GAA	2	6	511656	511661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602333
14074	NC_019673	GTC	2	6	511690	511695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602333
14075	NC_019673	GTG	2	6	511696	511701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602333
14076	NC_019673	GTG	2	6	511723	511728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602333
14077	NC_019673	ATC	2	6	511735	511740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602333
14078	NC_019673	GGCCG	2	10	511759	511768	0 %	0 %	60 %	40 %	433602333
14079	NC_019673	CCGACG	2	12	511808	511819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602333
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14083	NC_019673	ACT	2	6	511907	511912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602333
14084	NC_019673	CGG	2	6	511929	511934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602333
14085	NC_019673	GCA	2	6	511940	511945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602333
14086	NC_019673	AGG	2	6	512000	512005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602333
14087	NC_019673	ACC	2	6	512026	512031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602333
14088	NC_019673	TCG	2	6	512047	512052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602333
14089	NC_019673	TCG	2	6	512307	512312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
14090	NC_019673	CGG	2	6	512317	512322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602334
14091	NC_019673	CCT	2	6	512358	512363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602334
14092	NC_019673	CAT	2	6	512371	512376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602334
14093	NC_019673	CTG	2	6	512449	512454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
14094	NC_019673	GTCGAC	2	12	512455	512466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433602334
14095	NC_019673	TCGT	2	8	512501	512508	0 %	50 %	25 %	25 %	433602334
14096	NC_019673	GCT	2	6	512514	512519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
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14098	NC_019673	CG	3	6	512648	512653	0 %	0 %	50 %	50 %	433602334
14099	NC_019673	TGA	2	6	512676	512681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602334
14100	NC_019673	CGC	2	6	512698	512703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602334
14101	NC_019673	GCT	2	6	512769	512774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
14102	NC_019673	CGG	2	6	512784	512789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602334
14103	NC_019673	TGG	2	6	512805	512810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602334
14104	NC_019673	GC	3	6	512814	512819	0 %	0 %	50 %	50 %	433602334
14105	NC_019673	GGCGA	2	10	512852	512861	20 %	0 %	60 %	20 %	433602334
14106	NC_019673	CCGGG	2	10	512863	512872	0 %	0 %	60 %	40 %	433602334
14107	NC_019673	CGCC	2	8	512916	512923	0 %	0 %	25 %	75 %	433602334
14108	NC_019673	CTGGAG	2	12	512938	512949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433602334
14109	NC_019673	GTG	2	6	513011	513016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602334
14110	NC_019673	GCT	2	6	513021	513026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
14111	NC_019673	GCT	2	6	513043	513048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
14112	NC_019673	GGCC	2	8	513072	513079	0 %	0 %	50 %	50 %	433602334
14113	NC_019673	TGG	2	6	513099	513104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602334
14114	NC_019673	ACC	2	6	513128	513133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602334
14115	NC_019673	GCC	2	6	513178	513183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602334
14116	NC_019673	AAC	2	6	513236	513241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602334
14117	NC_019673	GAA	2	6	513255	513260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602334
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14119	NC_019673	GA	4	8	513631	513638	50 %	0 %	50 %	0 %	433602335
14120	NC_019673	CCAG	2	8	513643	513650	25 %	0 %	25 %	50 %	433602335
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14333	NC_019673	CGT	3	9	521828	521836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602340
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14337	NC_019673	CGAGCA	2	12	521942	521953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602340
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14340	NC_019673	GC	5	10	522078	522087	0 %	0 %	50 %	50 %	433602340
14341	NC_019673	GTC	2	6	522108	522113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602340
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14345	NC_019673	GCC	2	6	522282	522287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602341
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14349	NC_019673	CGG	2	6	522770	522775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602342
14350	NC_019673	CG	3	6	522781	522786	0 %	0 %	50 %	50 %	433602342
14351	NC_019673	CGT	2	6	522810	522815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602342
14352	NC_019673	CGG	2	6	522960	522965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602342
14353	NC_019673	TCC	2	6	522979	522984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602342
14354	NC_019673	CGA	2	6	523005	523010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602342
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14356	NC_019673	GAC	2	6	523072	523077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602342
14357	NC_019673	CCG	2	6	523080	523085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602342
14358	NC_019673	CGGTCG	2	12	523106	523117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433602342
14359	NC_019673	CCG	2	6	523130	523135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602342
14360	NC_019673	CGGCC	2	10	523155	523164	0 %	0 %	40 %	60 %	433602342
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14366	NC_019673	CGG	2	6	523299	523304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602342
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14473	NC_019673	TCG	2	6	527351	527356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602347
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14480	NC_019673	GCC	2	6	527614	527619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602348
14481	NC_019673	TCG	2	6	527659	527664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602348
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