MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_019048	GTCGTT	2	12	1805966	1805977	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410595410
33003	NC_019048	ACA	2	6	1805979	1805984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595410
33004	NC_019048	ATTA	2	8	1806028	1806035	50 %	50 %	0 %	0 %	410595410
33005	NC_019048	GTG	2	6	1806066	1806071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595410
33006	NC_019048	GAA	3	9	1806214	1806222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595411
33007	NC_019048	GAT	2	6	1806226	1806231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595411
33008	NC_019048	ATG	2	6	1806266	1806271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595411
33009	NC_019048	TTC	2	6	1806299	1806304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595411
33010	NC_019048	ATT	2	6	1806382	1806387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595411
33011	NC_019048	A	9	9	1806408	1806416	100 %	0 %	0 %	0 %	410595411
33012	NC_019048	ATTTA	2	10	1806542	1806551	40 %	60 %	0 %	0 %	410595411
33013	NC_019048	A	6	6	1806670	1806675	100 %	0 %	0 %	0 %	410595412
33014	NC_019048	GTG	2	6	1806677	1806682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595412
33015	NC_019048	TCA	2	6	1806687	1806692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595412
33016	NC_019048	CT	3	6	1806716	1806721	0 %	50 %	0 %	50 %	410595412
33017	NC_019048	A	6	6	1806728	1806733	100 %	0 %	0 %	0 %	410595412
33018	NC_019048	TACTCG	2	12	1806738	1806749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410595412
33019	NC_019048	GCA	2	6	1806766	1806771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595412
33020	NC_019048	A	6	6	1806826	1806831	100 %	0 %	0 %	0 %	410595412
33021	NC_019048	AGA	2	6	1806840	1806845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595412
33022	NC_019048	GACG	2	8	1807054	1807061	25 %	0 %	50 %	25 %	410595412
33023	NC_019048	AAC	2	6	1807063	1807068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595412
33024	NC_019048	CTG	2	6	1807145	1807150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595412
33025	NC_019048	GAA	2	6	1807171	1807176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595412
33026	NC_019048	GAA	2	6	1807279	1807284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595412
33027	NC_019048	CTT	2	6	1807309	1807314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595412
33028	NC_019048	A	6	6	1807345	1807350	100 %	0 %	0 %	0 %	410595412
33029	NC_019048	TAA	2	6	1807353	1807358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595412
33030	NC_019048	ATCTT	2	10	1807364	1807373	20 %	60 %	0 %	20 %	410595412
33031	NC_019048	TGA	2	6	1807464	1807469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595412
33032	NC_019048	TTAAA	2	10	1807578	1807587	60 %	40 %	0 %	0 %	410595412
33033	NC_019048	GAAAAA	2	12	1807647	1807658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410595413
33034	NC_019048	A	8	8	1807654	1807661	100 %	0 %	0 %	0 %	410595413
33035	NC_019048	CT	3	6	1807697	1807702	0 %	50 %	0 %	50 %	410595413
33036	NC_019048	A	6	6	1807834	1807839	100 %	0 %	0 %	0 %	410595413
33037	NC_019048	GCTTG	2	10	1807932	1807941	0 %	40 %	40 %	20 %	410595413
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33039	NC_019048	ATT	2	6	1808025	1808030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595413
33040	NC_019048	TTA	2	6	1808095	1808100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595413
33041	NC_019048	TTA	2	6	1808134	1808139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595413
33042	NC_019048	TTA	2	6	1808157	1808162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595413
33043	NC_019048	ATCA	2	8	1808212	1808219	50 %	25 %	0 %	25 %	410595413
33044	NC_019048	TATT	2	8	1808263	1808270	25 %	75 %	0 %	0 %	410595413
33045	NC_019048	TCT	2	6	1808290	1808295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595413
33046	NC_019048	A	6	6	1808307	1808312	100 %	0 %	0 %	0 %	410595413
33047	NC_019048	ATT	2	6	1808345	1808350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595413
33048	NC_019048	CTTG	2	8	1808526	1808533	0 %	50 %	25 %	25 %	410595413
33049	NC_019048	GCA	2	6	1808544	1808549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595413
33050	NC_019048	GCT	2	6	1808565	1808570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595413
33051	NC_019048	AAG	2	6	1808572	1808577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595413
33052	NC_019048	ACTC	2	8	1808629	1808636	25 %	25 %	0 %	50 %	410595413
33053	NC_019048	CA	3	6	1808684	1808689	50 %	0 %	0 %	50 %	410595413
33054	NC_019048	CAT	2	6	1808719	1808724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595413
33055	NC_019048	TGG	2	6	1808867	1808872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595413
33056	NC_019048	TTAC	2	8	1808879	1808886	25 %	50 %	0 %	25 %	410595413
33057	NC_019048	A	6	6	1808974	1808979	100 %	0 %	0 %	0 %	410595413
33058	NC_019048	TAT	2	6	1809017	1809022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595413
33059	NC_019048	TGC	2	6	1809050	1809055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595413
33060	NC_019048	A	6	6	1809108	1809113	100 %	0 %	0 %	0 %	410595414
33061	NC_019048	GGT	2	6	1809128	1809133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595414
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33063	NC_019048	AAG	2	6	1809219	1809224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595414
33064	NC_019048	ATG	2	6	1809228	1809233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595414
33065	NC_019048	AGCA	2	8	1809282	1809289	50 %	0 %	25 %	25 %	410595414
33066	NC_019048	GAAG	2	8	1809347	1809354	50 %	0 %	50 %	0 %	410595414
33067	NC_019048	AGT	2	6	1809427	1809432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595414
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33072	NC_019048	TTA	2	6	1809624	1809629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595414
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33077	NC_019048	TTG	2	6	1809948	1809953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410595414
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33079	NC_019048	AT	3	6	1810164	1810169	50 %	50 %	0 %	0 %	410595415
33080	NC_019048	ACA	2	6	1810224	1810229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595415
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33084	NC_019048	ATC	2	6	1810547	1810552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595415
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33086	NC_019048	GAC	2	6	1810615	1810620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595415
33087	NC_019048	CTG	2	6	1810621	1810626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595415
33088	NC_019048	CAT	2	6	1810627	1810632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595415
33089	NC_019048	GCT	2	6	1810779	1810784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595415
33090	NC_019048	CTG	2	6	1810810	1810815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595415
33091	NC_019048	ATA	2	6	1810901	1810906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595415
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33093	NC_019048	AAT	2	6	1810984	1810989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595415
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33097	NC_019048	CTAC	2	8	1811124	1811131	25 %	25 %	0 %	50 %	410595415
33098	NC_019048	GAT	2	6	1811297	1811302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595416
33099	NC_019048	TAA	2	6	1811331	1811336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33100	NC_019048	ATA	2	6	1811357	1811362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33101	NC_019048	TA	3	6	1811397	1811402	50 %	50 %	0 %	0 %	410595416
33102	NC_019048	AAT	2	6	1811440	1811445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33103	NC_019048	AAT	2	6	1811466	1811471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33104	NC_019048	T	6	6	1811484	1811489	0 %	100 %	0 %	0 %	410595416
33105	NC_019048	TA	3	6	1811574	1811579	50 %	50 %	0 %	0 %	410595416
33106	NC_019048	TAA	2	6	1811638	1811643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33107	NC_019048	CAA	2	6	1811673	1811678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595416
33108	NC_019048	TAG	2	6	1811691	1811696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595416
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33110	NC_019048	A	6	6	1811771	1811776	100 %	0 %	0 %	0 %	410595416
33111	NC_019048	A	7	7	1811784	1811790	100 %	0 %	0 %	0 %	410595416
33112	NC_019048	AAT	2	6	1811801	1811806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33113	NC_019048	A	6	6	1811815	1811820	100 %	0 %	0 %	0 %	410595416
33114	NC_019048	CCA	2	6	1811847	1811852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410595416
33115	NC_019048	ATA	2	6	1811858	1811863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595416
33116	NC_019048	CTGT	2	8	1811868	1811875	0 %	50 %	25 %	25 %	410595416
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.