MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_019048	CTT	2	6	1557478	1557483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595173
28502	NC_019048	CTT	2	6	1557562	1557567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595173
28503	NC_019048	T	6	6	1557571	1557576	0 %	100 %	0 %	0 %	410595173
28504	NC_019048	TAC	2	6	1557611	1557616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595173
28505	NC_019048	ATGA	2	8	1557688	1557695	50 %	25 %	25 %	0 %	410595173
28506	NC_019048	AAT	2	6	1557716	1557721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595173
28507	NC_019048	TTG	2	6	1557815	1557820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410595173
28508	NC_019048	TCA	2	6	1557841	1557846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595173
28509	NC_019048	T	6	6	1557903	1557908	0 %	100 %	0 %	0 %	410595173
28510	NC_019048	T	6	6	1557970	1557975	0 %	100 %	0 %	0 %	410595173
28511	NC_019048	ATA	2	6	1558016	1558021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595173
28512	NC_019048	AC	3	6	1558039	1558044	50 %	0 %	0 %	50 %	410595173
28513	NC_019048	CTA	2	6	1558045	1558050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595173
28514	NC_019048	ACT	2	6	1558250	1558255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595174
28515	NC_019048	TCT	2	6	1558256	1558261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595174
28516	NC_019048	AGC	2	6	1558410	1558415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595174
28517	NC_019048	AAT	2	6	1558416	1558421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595174
28518	NC_019048	AAT	2	6	1558446	1558451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595174
28519	NC_019048	AAGCAT	2	12	1558472	1558483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410595174
28520	NC_019048	GAC	2	6	1558502	1558507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595174
28521	NC_019048	TAA	2	6	1558520	1558525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595174
28522	NC_019048	CTT	2	6	1558598	1558603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595174
28523	NC_019048	CTG	2	6	1558619	1558624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595174
28524	NC_019048	CTT	2	6	1558631	1558636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595174
28525	NC_019048	AAC	3	9	1558653	1558661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595174
28526	NC_019048	TCA	2	6	1558705	1558710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595174
28527	NC_019048	TAA	2	6	1558769	1558774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595174
28528	NC_019048	CTT	2	6	1558775	1558780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595174
28529	NC_019048	ATA	2	6	1558804	1558809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595174
28530	NC_019048	GTA	2	6	1558819	1558824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595174
28531	NC_019048	GAC	2	6	1558853	1558858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595174
28532	NC_019048	ATA	2	6	1558933	1558938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595175
28533	NC_019048	ATA	2	6	1558976	1558981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595175
28534	NC_019048	CTT	2	6	1559043	1559048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595175
28535	NC_019048	ACA	2	6	1559117	1559122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595175
28536	NC_019048	TAA	2	6	1559172	1559177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595175
28537	NC_019048	AAT	2	6	1559256	1559261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595175
28538	NC_019048	TGT	2	6	1559269	1559274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410595175
28539	NC_019048	ACC	2	6	1559344	1559349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410595175
28540	NC_019048	GAT	2	6	1559396	1559401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595175
28541	NC_019048	CAAT	2	8	1559499	1559506	50 %	25 %	0 %	25 %	410595175
28542	NC_019048	TTA	2	6	1559576	1559581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595175
28543	NC_019048	CA	4	8	1559586	1559593	50 %	0 %	0 %	50 %	410595175
28544	NC_019048	ATT	2	6	1559626	1559631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595176
28545	NC_019048	TCAA	2	8	1559730	1559737	50 %	25 %	0 %	25 %	410595176
28546	NC_019048	TTC	2	6	1559780	1559785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595176
28547	NC_019048	AC	3	6	1559793	1559798	50 %	0 %	0 %	50 %	410595176
28548	NC_019048	AATC	2	8	1559971	1559978	50 %	25 %	0 %	25 %	410595176
28549	NC_019048	CTT	2	6	1560058	1560063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595176
28550	NC_019048	TAA	2	6	1560094	1560099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595176
28551	NC_019048	TTC	2	6	1560125	1560130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595176
28552	NC_019048	CAT	2	6	1560139	1560144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595176
28553	NC_019048	T	6	6	1560197	1560202	0 %	100 %	0 %	0 %	410595176
28554	NC_019048	CAT	2	6	1560203	1560208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595176
28555	NC_019048	CTT	2	6	1560223	1560228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595176
28556	NC_019048	ACG	2	6	1560257	1560262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595176
28557	NC_019048	TTG	2	6	1560280	1560285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410595176
28558	NC_019048	TTC	2	6	1560332	1560337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595176
28559	NC_019048	TCA	2	6	1560375	1560380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595176
28560	NC_019048	AAATC	2	10	1560396	1560405	60 %	20 %	0 %	20 %	410595176
28561	NC_019048	TGC	3	9	1560533	1560541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595177
28562	NC_019048	ATC	2	6	1560548	1560553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595177
28563	NC_019048	AAT	2	6	1560606	1560611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595177
28564	NC_019048	ACC	2	6	1560632	1560637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410595177
28565	NC_019048	ATCA	2	8	1560662	1560669	50 %	25 %	0 %	25 %	410595177
28566	NC_019048	T	6	6	1560671	1560676	0 %	100 %	0 %	0 %	410595177
28567	NC_019048	TTA	2	6	1560681	1560686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595177
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28570	NC_019048	CGC	2	6	1560832	1560837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410595177
28571	NC_019048	TTC	2	6	1560839	1560844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595177
28572	NC_019048	GCT	2	6	1560861	1560866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595177
28573	NC_019048	TTG	2	6	1560871	1560876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410595177
28574	NC_019048	TAG	2	6	1560880	1560885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595177
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28576	NC_019048	CCA	2	6	1560945	1560950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410595177
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28583	NC_019048	CTT	2	6	1561337	1561342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595178
28584	NC_019048	CTT	2	6	1561346	1561351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595178
28585	NC_019048	TGAAT	2	10	1561369	1561378	40 %	40 %	20 %	0 %	410595178
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28587	NC_019048	TTG	2	6	1561439	1561444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410595178
28588	NC_019048	CTT	2	6	1561469	1561474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595178
28589	NC_019048	ACT	2	6	1561489	1561494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595178
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28591	NC_019048	GTA	2	6	1561584	1561589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595178
28592	NC_019048	AAT	2	6	1561614	1561619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595178
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28595	NC_019048	CTT	2	6	1561685	1561690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595178
28596	NC_019048	GTTTT	2	10	1561841	1561850	0 %	80 %	20 %	0 %	410595179
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28598	NC_019048	CGTC	2	8	1561903	1561910	0 %	25 %	25 %	50 %	410595179
28599	NC_019048	GGT	2	6	1561925	1561930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595179
28600	NC_019048	TGA	2	6	1562058	1562063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595179
28601	NC_019048	TAT	2	6	1562128	1562133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595180
28602	NC_019048	CAC	2	6	1562147	1562152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410595180
28603	NC_019048	CTT	2	6	1562162	1562167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595180
28604	NC_019048	AAG	3	9	1562206	1562214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595180
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28606	NC_019048	ACAGCA	2	12	1562332	1562343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410595180
28607	NC_019048	AAT	2	6	1562358	1562363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595180
28608	NC_019048	CTG	2	6	1562387	1562392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595180
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28611	NC_019048	TAAT	2	8	1562510	1562517	50 %	50 %	0 %	0 %	410595180
28612	NC_019048	GAA	2	6	1562560	1562565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595180
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28614	NC_019048	GTTT	2	8	1562618	1562625	0 %	75 %	25 %	0 %	410595180
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28616	NC_019048	GAA	2	6	1562733	1562738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595180
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