MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_019048	GCA	2	6	1006507	1006512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594642
18002	NC_019048	TAG	2	6	1006520	1006525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594642
18003	NC_019048	CTCTT	2	10	1006569	1006578	0 %	60 %	0 %	40 %	410594642
18004	NC_019048	TAT	2	6	1006634	1006639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594642
18005	NC_019048	TTA	2	6	1006640	1006645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594642
18006	NC_019048	A	6	6	1006682	1006687	100 %	0 %	0 %	0 %	410594642
18007	NC_019048	ATT	3	9	1006729	1006737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594642
18008	NC_019048	CAG	2	6	1006802	1006807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594642
18009	NC_019048	TGG	2	6	1006812	1006817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594642
18010	NC_019048	AAG	2	6	1006838	1006843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594642
18011	NC_019048	GCA	3	9	1006912	1006920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594642
18012	NC_019048	TAC	2	6	1007142	1007147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594642
18013	NC_019048	CTA	2	6	1007163	1007168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594642
18014	NC_019048	TTA	2	6	1007207	1007212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594642
18015	NC_019048	ATT	2	6	1007224	1007229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594642
18016	NC_019048	GGT	2	6	1007251	1007256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594642
18017	NC_019048	ATT	2	6	1007350	1007355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594642
18018	NC_019048	TAT	2	6	1007517	1007522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594643
18019	NC_019048	TA	3	6	1007536	1007541	50 %	50 %	0 %	0 %	410594643
18020	NC_019048	TAA	2	6	1007610	1007615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594643
18021	NC_019048	ATT	2	6	1007791	1007796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594643
18022	NC_019048	AAT	2	6	1007797	1007802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594643
18023	NC_019048	TAG	2	6	1007834	1007839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594643
18024	NC_019048	TAA	2	6	1007880	1007885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594643
18025	NC_019048	TAT	2	6	1008006	1008011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594643
18026	NC_019048	GCT	2	6	1008022	1008027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594643
18027	NC_019048	ATT	2	6	1008031	1008036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594643
18028	NC_019048	TTATT	2	10	1008039	1008048	20 %	80 %	0 %	0 %	410594643
18029	NC_019048	GAT	2	6	1008106	1008111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594643
18030	NC_019048	GTA	2	6	1008194	1008199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594643
18031	NC_019048	TC	3	6	1008237	1008242	0 %	50 %	0 %	50 %	410594643
18032	NC_019048	ACT	2	6	1008282	1008287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594643
18033	NC_019048	AGA	2	6	1008345	1008350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594643
18034	NC_019048	A	6	6	1008392	1008397	100 %	0 %	0 %	0 %	410594643
18035	NC_019048	TTA	2	6	1008431	1008436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594643
18036	NC_019048	TCAT	2	8	1008507	1008514	25 %	50 %	0 %	25 %	410594643
18037	NC_019048	GCAA	2	8	1008517	1008524	50 %	0 %	25 %	25 %	410594643
18038	NC_019048	A	6	6	1008557	1008562	100 %	0 %	0 %	0 %	410594643
18039	NC_019048	CAAGT	2	10	1008657	1008666	40 %	20 %	20 %	20 %	410594643
18040	NC_019048	ATT	2	6	1008891	1008896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594644
18041	NC_019048	TCTA	2	8	1008923	1008930	25 %	50 %	0 %	25 %	410594644
18042	NC_019048	GTA	2	6	1008955	1008960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594644
18043	NC_019048	ATC	2	6	1009002	1009007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594644
18044	NC_019048	ATTTT	2	10	1009059	1009068	20 %	80 %	0 %	0 %	410594644
18045	NC_019048	ACC	2	6	1009070	1009075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410594644
18046	NC_019048	TAT	2	6	1009272	1009277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594645
18047	NC_019048	CAA	2	6	1009337	1009342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594645
18048	NC_019048	CTT	2	6	1009348	1009353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594645
18049	NC_019048	TTA	2	6	1009366	1009371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594645
18050	NC_019048	T	6	6	1009377	1009382	0 %	100 %	0 %	0 %	410594645
18051	NC_019048	TAC	2	6	1009411	1009416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594645
18052	NC_019048	CT	3	6	1009475	1009480	0 %	50 %	0 %	50 %	410594645
18053	NC_019048	ATTAGC	2	12	1009519	1009530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410594645
18054	NC_019048	ATC	2	6	1009531	1009536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594645
18055	NC_019048	T	6	6	1009582	1009587	0 %	100 %	0 %	0 %	410594645
18056	NC_019048	CTA	2	6	1009679	1009684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594645
18057	NC_019048	GTT	2	6	1009699	1009704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594645
18058	NC_019048	ATT	2	6	1009749	1009754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594645
18059	NC_019048	AGA	2	6	1009761	1009766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594645
18060	NC_019048	AGG	2	6	1009791	1009796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410594645
18061	NC_019048	A	8	8	1010015	1010022	100 %	0 %	0 %	0 %	410594646
18062	NC_019048	CTGT	2	8	1010038	1010045	0 %	50 %	25 %	25 %	410594646
18063	NC_019048	CTT	2	6	1010074	1010079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594646
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18066	NC_019048	AGG	2	6	1010207	1010212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410594646
18067	NC_019048	ATT	2	6	1010237	1010242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594646
18068	NC_019048	TGG	2	6	1010243	1010248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594646
18069	NC_019048	GAT	2	6	1010316	1010321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594646
18070	NC_019048	ATT	2	6	1010339	1010344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594646
18071	NC_019048	TAG	2	6	1010351	1010356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594646
18072	NC_019048	GTTC	2	8	1010361	1010368	0 %	50 %	25 %	25 %	410594646
18073	NC_019048	CAA	2	6	1010407	1010412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594646
18074	NC_019048	A	6	6	1010429	1010434	100 %	0 %	0 %	0 %	410594646
18075	NC_019048	TGA	2	6	1010477	1010482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594646
18076	NC_019048	TTC	2	6	1010498	1010503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594646
18077	NC_019048	GTC	2	6	1010546	1010551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594646
18078	NC_019048	AACA	2	8	1010601	1010608	75 %	0 %	0 %	25 %	410594646
18079	NC_019048	TAAAA	2	10	1010620	1010629	80 %	20 %	0 %	0 %	410594646
18080	NC_019048	ATT	2	6	1011036	1011041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594647
18081	NC_019048	GAC	2	6	1011120	1011125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18082	NC_019048	GAC	2	6	1011129	1011134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18083	NC_019048	TCT	2	6	1011155	1011160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594647
18084	NC_019048	CTT	2	6	1011258	1011263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594647
18085	NC_019048	ATA	2	6	1011273	1011278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594647
18086	NC_019048	TG	3	6	1011303	1011308	0 %	50 %	50 %	0 %	410594647
18087	NC_019048	CAA	2	6	1011354	1011359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594647
18088	NC_019048	AGTC	2	8	1011369	1011376	25 %	25 %	25 %	25 %	410594647
18089	NC_019048	TTTAC	2	10	1011383	1011392	20 %	60 %	0 %	20 %	410594647
18090	NC_019048	CAG	2	6	1011408	1011413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18091	NC_019048	AAGTGA	2	12	1011460	1011471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410594647
18092	NC_019048	CTT	2	6	1011483	1011488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594647
18093	NC_019048	AACTTC	2	12	1011508	1011519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594647
18094	NC_019048	ACC	2	6	1011598	1011603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410594647
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18096	NC_019048	TGC	2	6	1011694	1011699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18097	NC_019048	GCT	2	6	1011701	1011706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18098	NC_019048	TTC	2	6	1011709	1011714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594647
18099	NC_019048	AAC	2	6	1011715	1011720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594647
18100	NC_019048	ACG	2	6	1011724	1011729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18101	NC_019048	CTG	2	6	1011750	1011755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594647
18102	NC_019048	CTT	2	6	1011762	1011767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594647
18103	NC_019048	CAA	2	6	1011792	1011797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594647
18104	NC_019048	ATCA	2	8	1011826	1011833	50 %	25 %	0 %	25 %	410594647
18105	NC_019048	AAC	2	6	1011913	1011918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594647
18106	NC_019048	CAA	2	6	1011933	1011938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594647
18107	NC_019048	T	6	6	1011970	1011975	0 %	100 %	0 %	0 %	410594647
18108	NC_019048	GAA	2	6	1012023	1012028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594647
18109	NC_019048	AAC	2	6	1012138	1012143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594647
18110	NC_019048	ATTC	3	12	1012233	1012244	25 %	50 %	0 %	25 %	410594647
18111	NC_019048	TTC	2	6	1012604	1012609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594648
18112	NC_019048	AAT	2	6	1012610	1012615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594648
18113	NC_019048	CACT	2	8	1012651	1012658	25 %	25 %	0 %	50 %	410594648
18114	NC_019048	T	8	8	1012714	1012721	0 %	100 %	0 %	0 %	410594648
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18116	NC_019048	CTA	2	6	1012956	1012961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594649
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18469	NC_019048	TC	3	6	1028067	1028072	0 %	50 %	0 %	50 %	410594661
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