MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Simiduia agarivorans SA1 = DSM 21679

Total Repeats: 78128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018868	GCG	2	6	29629	29634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511767226
502	NC_018868	TCA	2	6	29665	29670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511767226
503	NC_018868	GC	3	6	29676	29681	0 %	0 %	50 %	50 %	511767226
504	NC_018868	CCG	2	6	29716	29721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511767226
505	NC_018868	TGC	2	6	29858	29863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767226
506	NC_018868	CATG	2	8	29883	29890	25 %	25 %	25 %	25 %	511767226
507	NC_018868	TTC	2	6	29898	29903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511767226
508	NC_018868	CGA	2	6	29939	29944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511767226
509	NC_018868	ATC	2	6	29953	29958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511767226
510	NC_018868	TGG	2	6	29992	29997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511767226
511	NC_018868	TCG	2	6	30016	30021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767226
512	NC_018868	GGC	2	6	30115	30120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511767226
513	NC_018868	TTG	2	6	30192	30197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767226
514	NC_018868	GAC	2	6	30204	30209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511767226
515	NC_018868	CTGG	2	8	30213	30220	0 %	25 %	50 %	25 %	511767226
516	NC_018868	GC	3	6	30244	30249	0 %	0 %	50 %	50 %	511767226
517	NC_018868	CTG	2	6	30260	30265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767226
518	NC_018868	TCA	2	6	30310	30315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511767226
519	NC_018868	ATGG	2	8	30331	30338	25 %	25 %	50 %	0 %	511767226
520	NC_018868	TGG	2	6	30461	30466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511767226
521	NC_018868	TGT	2	6	30515	30520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767226
522	NC_018868	GTT	2	6	30597	30602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767226
523	NC_018868	GTCG	2	8	30692	30699	0 %	25 %	50 %	25 %	511767226
524	NC_018868	ACAA	2	8	30700	30707	75 %	0 %	0 %	25 %	511767226
525	NC_018868	TTG	2	6	30721	30726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767226
526	NC_018868	CGT	2	6	30767	30772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767226
527	NC_018868	TGG	2	6	30820	30825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511767226
528	NC_018868	CAAA	2	8	30826	30833	75 %	0 %	0 %	25 %	511767226
529	NC_018868	TG	3	6	30842	30847	0 %	50 %	50 %	0 %	511767226
530	NC_018868	CCT	2	6	30887	30892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511767226
531	NC_018868	GT	3	6	31045	31050	0 %	50 %	50 %	0 %	511767226
532	NC_018868	GT	3	6	31278	31283	0 %	50 %	50 %	0 %	410662625
533	NC_018868	TGT	2	6	31292	31297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662625
534	NC_018868	TTTC	2	8	31299	31306	0 %	75 %	0 %	25 %	410662625
535	NC_018868	TATCTC	2	12	31359	31370	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410662625
536	NC_018868	GTT	2	6	31383	31388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662625
537	NC_018868	GC	3	6	31423	31428	0 %	0 %	50 %	50 %	410662625
538	NC_018868	TGC	2	6	31534	31539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662625
539	NC_018868	GC	3	6	31572	31577	0 %	0 %	50 %	50 %	410662625
540	NC_018868	GTT	2	6	31679	31684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662625
541	NC_018868	CG	3	6	31711	31716	0 %	0 %	50 %	50 %	410662625
542	NC_018868	GAT	2	6	31719	31724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662625
543	NC_018868	CCA	2	6	31735	31740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662625
544	NC_018868	GCA	2	6	31832	31837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662625
545	NC_018868	GCTG	2	8	31871	31878	0 %	25 %	50 %	25 %	410662625
546	NC_018868	GCG	2	6	31908	31913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662625
547	NC_018868	CGG	2	6	31930	31935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662625
548	NC_018868	AGC	2	6	31936	31941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662625
549	NC_018868	CGG	2	6	32001	32006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662625
550	NC_018868	T	6	6	32025	32030	0 %	100 %	0 %	0 %	410662625
551	NC_018868	GCC	2	6	32036	32041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662625
552	NC_018868	CAG	2	6	32116	32121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662626
553	NC_018868	CAGC	2	8	32134	32141	25 %	0 %	25 %	50 %	410662626
554	NC_018868	CGG	2	6	32208	32213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662626
555	NC_018868	CCA	2	6	32289	32294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662626
556	NC_018868	GCCTG	2	10	32328	32337	0 %	20 %	40 %	40 %	410662626
557	NC_018868	GCA	2	6	32348	32353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662626
558	NC_018868	GCG	2	6	32370	32375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410662626
559	NC_018868	GCC	2	6	32404	32409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662626
560	NC_018868	CAGTG	2	10	32419	32428	20 %	20 %	40 %	20 %	410662626
561	NC_018868	TCCA	2	8	32429	32436	25 %	25 %	0 %	50 %	410662626
562	NC_018868	GCT	2	6	32439	32444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662626
563	NC_018868	CAC	2	6	32488	32493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662626
564	NC_018868	AAT	2	6	32503	32508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662626
565	NC_018868	ATG	2	6	32516	32521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662626
566	NC_018868	CAG	2	6	32536	32541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662626
567	NC_018868	ATG	2	6	32573	32578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662626
568	NC_018868	GAT	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410662626
569	NC_018868	GTC	2	6	32719	32724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662626
570	NC_018868	CAG	2	6	32728	32733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662626
571	NC_018868	CAG	2	6	32815	32820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662626
572	NC_018868	ACAG	2	8	32831	32838	50 %	0 %	25 %	25 %	410662626
573	NC_018868	A	6	6	32845	32850	100 %	0 %	0 %	0 %	410662626
574	NC_018868	TCA	2	6	32856	32861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662626
575	NC_018868	T	6	6	32880	32885	0 %	100 %	0 %	0 %	410662627
576	NC_018868	T	6	6	32892	32897	0 %	100 %	0 %	0 %	410662627
577	NC_018868	CTT	2	6	32900	32905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410662627
578	NC_018868	GC	3	6	32930	32935	0 %	0 %	50 %	50 %	410662627
579	NC_018868	AAT	2	6	32953	32958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410662627
580	NC_018868	GCC	2	6	33072	33077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662627
581	NC_018868	GCA	2	6	33170	33175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410662627
582	NC_018868	TGG	2	6	33236	33241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410662627
583	NC_018868	GTT	2	6	33261	33266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662627
584	NC_018868	TTG	2	6	33333	33338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662627
585	NC_018868	GCC	2	6	33376	33381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410662627
586	NC_018868	GGCC	3	12	33382	33393	0 %	0 %	50 %	50 %	410662627
587	NC_018868	CCA	2	6	33437	33442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662627
588	NC_018868	GGTTC	2	10	33453	33462	0 %	40 %	40 %	20 %	410662627
589	NC_018868	TTGG	2	8	33472	33479	0 %	50 %	50 %	0 %	410662627
590	NC_018868	TGT	2	6	33565	33570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410662627
591	NC_018868	CTGG	2	8	33678	33685	0 %	25 %	50 %	25 %	410662627
592	NC_018868	CG	3	6	33697	33702	0 %	0 %	50 %	50 %	410662627
593	NC_018868	CCA	2	6	33713	33718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410662627
594	NC_018868	GC	3	6	33756	33761	0 %	0 %	50 %	50 %	410662627
595	NC_018868	T	6	6	34106	34111	0 %	100 %	0 %	0 %	410662628
596	NC_018868	AGA	2	6	34154	34159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410662628
597	NC_018868	CA	4	8	34245	34252	50 %	0 %	0 %	50 %	410662628
598	NC_018868	TAC	2	6	34326	34331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410662628
599	NC_018868	ACA	2	6	34363	34368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410662628
600	NC_018868	A	7	7	34463	34469	100 %	0 %	0 %	0 %	410662628
601	NC_018868	A	7	7	34486	34492	100 %	0 %	0 %	0 %	410662628
602	NC_018868	TGAA	2	8	34513	34520	50 %	25 %	25 %	0 %	410662628
603	NC_018868	TGC	2	6	34525	34530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410662628
604	NC_018868	CCA	2	6	34572	34577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	511767227
605	NC_018868	GGT	2	6	34579	34584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	511767227
606	NC_018868	GCG	2	6	34630	34635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511767227
607	NC_018868	CG	3	6	34634	34639	0 %	0 %	50 %	50 %	511767227
608	NC_018868	TGC	2	6	34671	34676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767227
609	NC_018868	AAT	2	6	34888	34893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511767227
610	NC_018868	TGCG	2	8	34919	34926	0 %	25 %	50 %	25 %	511767227
611	NC_018868	CTA	2	6	34953	34958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511767227
612	NC_018868	GC	4	8	34985	34992	0 %	0 %	50 %	50 %	511767227
613	NC_018868	CAG	2	6	35017	35022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511767227
614	NC_018868	TTG	2	6	35155	35160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767227
615	NC_018868	GTT	2	6	35185	35190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767227
616	NC_018868	GCA	2	6	35213	35218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511767227
617	NC_018868	CGG	2	6	35220	35225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511767227
618	NC_018868	CTT	2	6	35238	35243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511767227
619	NC_018868	GT	3	6	35309	35314	0 %	50 %	50 %	0 %	511767227
620	NC_018868	TTCA	2	8	35356	35363	25 %	50 %	0 %	25 %	511767227
621	NC_018868	GTTT	2	8	35375	35382	0 %	75 %	25 %	0 %	511767227
622	NC_018868	CGG	2	6	35385	35390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511767227
623	NC_018868	GGTCA	2	10	35434	35443	20 %	20 %	40 %	20 %	511767227
624	NC_018868	CGG	2	6	35628	35633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511767227
625	NC_018868	TTG	2	6	35786	35791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511767227
626	NC_018868	CGT	2	6	35796	35801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767227
627	NC_018868	T	7	7	35805	35811	0 %	100 %	0 %	0 %	511767227
628	NC_018868	TTC	2	6	35969	35974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511767227
629	NC_018868	GCT	2	6	36036	36041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511767227
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