MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 28648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_018683	CGT	2	6	1200312	1200317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691210
22003	NC_018683	CA	3	6	1200390	1200395	50 %	0 %	0 %	50 %	407691210
22004	NC_018683	TGAA	2	8	1200430	1200437	50 %	25 %	25 %	0 %	407691210
22005	NC_018683	GCCA	2	8	1200564	1200571	25 %	0 %	25 %	50 %	407691211
22006	NC_018683	TCGG	2	8	1200657	1200664	0 %	25 %	50 %	25 %	407691211
22007	NC_018683	CAC	2	6	1200818	1200823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691211
22008	NC_018683	TGC	2	6	1200844	1200849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691211
22009	NC_018683	ACC	2	6	1200858	1200863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691211
22010	NC_018683	CCA	2	6	1200974	1200979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691211
22011	NC_018683	CTT	2	6	1201007	1201012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691211
22012	NC_018683	GC	3	6	1201017	1201022	0 %	0 %	50 %	50 %	407691211
22013	NC_018683	TCG	2	6	1201032	1201037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691211
22014	NC_018683	CGT	2	6	1201048	1201053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691211
22015	NC_018683	AGC	2	6	1201083	1201088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691211
22016	NC_018683	AGCG	2	8	1201122	1201129	25 %	0 %	50 %	25 %	407691211
22017	NC_018683	CTTC	2	8	1201180	1201187	0 %	50 %	0 %	50 %	407691211
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22058	NC_018683	GCGG	2	8	1203566	1203573	0 %	0 %	75 %	25 %	407691214
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22092	NC_018683	GC	3	6	1205106	1205111	0 %	0 %	50 %	50 %	407691215
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22115	NC_018683	TGCC	2	8	1206823	1206830	0 %	25 %	25 %	50 %	407691217
22116	NC_018683	CGA	2	6	1206843	1206848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691217
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22118	NC_018683	AAT	3	9	1206946	1206954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691217
22119	NC_018683	TGG	2	6	1207587	1207592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691218
22120	NC_018683	TTC	2	6	1207597	1207602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691218
22121	NC_018683	GCG	2	6	1207606	1207611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691218
22122	NC_018683	GCA	2	6	1207680	1207685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691218
22123	NC_018683	ACA	2	6	1207696	1207701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691218
22124	NC_018683	CAG	2	6	1207750	1207755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691218
22125	NC_018683	GAT	2	6	1207758	1207763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691218
22126	NC_018683	GAT	2	6	1207777	1207782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691218
22127	NC_018683	GTCG	2	8	1207855	1207862	0 %	25 %	50 %	25 %	407691218
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22130	NC_018683	CTG	2	6	1208015	1208020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691219
22131	NC_018683	CGT	2	6	1208033	1208038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691219
22132	NC_018683	GCC	2	6	1208103	1208108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691219
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22136	NC_018683	GGC	2	6	1208335	1208340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691220
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22138	NC_018683	GC	3	6	1208395	1208400	0 %	0 %	50 %	50 %	407691220
22139	NC_018683	CAT	2	6	1208422	1208427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691220
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22143	NC_018683	GCG	2	6	1208676	1208681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691221
22144	NC_018683	GAC	2	6	1208702	1208707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691221
22145	NC_018683	GAC	2	6	1208715	1208720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691221
22146	NC_018683	CTC	2	6	1208721	1208726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407691221
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22149	NC_018683	CGC	2	6	1208831	1208836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691222
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22152	NC_018683	CGT	2	6	1208950	1208955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691222
22153	NC_018683	CT	3	6	1208960	1208965	0 %	50 %	0 %	50 %	407691222
22154	NC_018683	CCG	2	6	1208976	1208981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691222
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22156	NC_018683	CGG	2	6	1209037	1209042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691222
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22202	NC_018683	GTT	2	6	1211717	1211722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691226
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22210	NC_018683	CCG	2	6	1212069	1212074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691227
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22215	NC_018683	ATG	2	6	1212377	1212382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691227
22216	NC_018683	TTG	2	6	1212386	1212391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691227
22217	NC_018683	ATC	2	6	1212419	1212424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691227
22218	NC_018683	ACA	2	6	1212441	1212446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691227
22219	NC_018683	TCCGG	2	10	1212459	1212468	0 %	20 %	40 %	40 %	407691227
22220	NC_018683	ACG	2	6	1212485	1212490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691227
22221	NC_018683	GATG	2	8	1212573	1212580	25 %	25 %	50 %	0 %	407691228
22222	NC_018683	GCG	2	6	1212614	1212619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691228
22223	NC_018683	GAG	2	6	1212701	1212706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407691228
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22225	NC_018683	TGT	2	6	1212774	1212779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691228
22226	NC_018683	GGC	2	6	1212826	1212831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691228
22227	NC_018683	TGG	2	6	1212861	1212866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691228
22228	NC_018683	CGA	2	6	1212874	1212879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691228
22229	NC_018683	GCT	2	6	1212952	1212957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691228
22230	NC_018683	GAT	2	6	1212964	1212969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691228
22231	NC_018683	GGC	2	6	1213023	1213028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691228
22232	NC_018683	GTC	2	6	1213121	1213126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691228
22233	NC_018683	GGA	2	6	1213132	1213137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407691228
22234	NC_018683	GGC	2	6	1213207	1213212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691228
22235	NC_018683	TGG	2	6	1213220	1213225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691228
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22240	NC_018683	TCA	2	6	1213576	1213581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691229
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22245	NC_018683	GCG	2	6	1213792	1213797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691229
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22346	NC_018683	CGG	2	6	1219546	1219551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691235
22347	NC_018683	CGA	2	6	1219569	1219574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691235
22348	NC_018683	ATGG	2	8	1219600	1219607	25 %	25 %	50 %	0 %	407691235
22349	NC_018683	ACG	2	6	1219622	1219627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691235
22350	NC_018683	CCA	2	6	1219699	1219704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691235
22351	NC_018683	CG	3	6	1219785	1219790	0 %	0 %	50 %	50 %	407691235
22352	NC_018683	GAA	2	6	1219822	1219827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691235
22353	NC_018683	CTT	2	6	1219888	1219893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691235
22354	NC_018683	CTG	2	6	1219904	1219909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691235
22355	NC_018683	ACT	2	6	1219961	1219966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691235
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22360	NC_018683	CG	3	6	1220444	1220449	0 %	0 %	50 %	50 %	407691235
22361	NC_018683	CAGGC	2	10	1220458	1220467	20 %	0 %	40 %	40 %	407691235
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22368	NC_018683	ACGA	2	8	1221852	1221859	50 %	0 %	25 %	25 %	407691236
22369	NC_018683	A	8	8	1221907	1221914	100 %	0 %	0 %	0 %	407691236
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22375	NC_018683	CAG	2	6	1222919	1222924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691237
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22451	NC_018683	GCGA	2	8	1228874	1228881	25 %	0 %	50 %	25 %	407691243
22452	NC_018683	CGC	3	9	1228897	1228905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691243
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22460	NC_018683	CG	4	8	1229423	1229430	0 %	0 %	50 %	50 %	407691244
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22463	NC_018683	TCG	2	6	1229620	1229625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691244
22464	NC_018683	CTT	2	6	1229694	1229699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691244
22465	NC_018683	CGGCG	2	10	1229706	1229715	0 %	0 %	60 %	40 %	407691244
22466	NC_018683	GCC	2	6	1229808	1229813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691244
22467	NC_018683	GGT	2	6	1229816	1229821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691244
22468	NC_018683	CATGGG	2	12	1229825	1229836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407691244
22469	NC_018683	ATG	2	6	1229842	1229847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691244
22470	NC_018683	TCG	2	6	1229848	1229853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691244
22471	NC_018683	CGG	2	6	1229873	1229878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691244
22472	NC_018683	CGA	2	6	1229879	1229884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691244
22473	NC_018683	GAA	2	6	1229916	1229921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691244
22474	NC_018683	CCGGCA	2	12	1229926	1229937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407691244
22475	NC_018683	CGG	2	6	1230065	1230070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691244
22476	NC_018683	CAT	2	6	1230120	1230125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691244
22477	NC_018683	GTA	2	6	1230129	1230134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691244
22478	NC_018683	TGC	2	6	1230157	1230162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691244
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22481	NC_018683	GCG	2	6	1230343	1230348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691245
22482	NC_018683	CTT	2	6	1230351	1230356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691245
22483	NC_018683	CGA	2	6	1230435	1230440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691245
22484	NC_018683	CGTT	2	8	1230500	1230507	0 %	50 %	25 %	25 %	407691245
22485	NC_018683	GATGAG	2	12	1230568	1230579	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407691245
22486	NC_018683	GCG	2	6	1230608	1230613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691245
22487	NC_018683	GCA	2	6	1230698	1230703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691245
22488	NC_018683	CCG	2	6	1230777	1230782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691245
22489	NC_018683	AGCG	2	8	1230818	1230825	25 %	0 %	50 %	25 %	407691245
22490	NC_018683	CGT	2	6	1230871	1230876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691245
22491	NC_018683	AAG	2	6	1230907	1230912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691245
22492	NC_018683	CGG	2	6	1230934	1230939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691245
22493	NC_018683	GA	3	6	1230947	1230952	50 %	0 %	50 %	0 %	407691245
22494	NC_018683	CTG	2	6	1230963	1230968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691245
22495	NC_018683	CAG	2	6	1230988	1230993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691245
22496	NC_018683	GCGTCG	2	12	1230998	1231009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407691245
22497	NC_018683	AAG	2	6	1231072	1231077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691245
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22499	NC_018683	CG	3	6	1231115	1231120	0 %	0 %	50 %	50 %	407691245
22500	NC_018683	GAA	2	6	1231128	1231133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691245

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