MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 28648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018683	CGA	2	6	537573	537578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690552
10002	NC_018683	CTG	2	6	537598	537603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690552
10003	NC_018683	GGA	2	6	537627	537632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690552
10004	NC_018683	CGA	2	6	537641	537646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690552
10005	NC_018683	TCG	2	6	537934	537939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690553
10006	NC_018683	CAC	2	6	537944	537949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690553
10007	NC_018683	CGGC	2	8	538000	538007	0 %	0 %	50 %	50 %	407690553
10008	NC_018683	AGGGT	2	10	538008	538017	20 %	20 %	60 %	0 %	407690553
10009	NC_018683	GC	3	6	538048	538053	0 %	0 %	50 %	50 %	407690553
10010	NC_018683	CGG	2	6	538076	538081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690553
10011	NC_018683	GCA	2	6	538111	538116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690553
10012	NC_018683	GTC	2	6	538167	538172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690553
10013	NC_018683	TGG	2	6	538251	538256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690554
10014	NC_018683	GAA	2	6	538372	538377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690554
10015	NC_018683	CAC	2	6	538411	538416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690554
10016	NC_018683	GTCG	2	8	538468	538475	0 %	25 %	50 %	25 %	407690554
10017	NC_018683	GTCA	2	8	538516	538523	25 %	25 %	25 %	25 %	407690554
10018	NC_018683	CCA	2	6	539129	539134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690555
10019	NC_018683	TCGC	2	8	539210	539217	0 %	25 %	25 %	50 %	407690555
10020	NC_018683	TGGT	2	8	539224	539231	0 %	50 %	50 %	0 %	407690555
10021	NC_018683	TCCGC	2	10	539270	539279	0 %	20 %	20 %	60 %	407690555
10022	NC_018683	CGA	2	6	539285	539290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690555
10023	NC_018683	CCTTG	2	10	539306	539315	0 %	40 %	20 %	40 %	407690555
10024	NC_018683	TCC	2	6	539365	539370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690555
10025	NC_018683	CGC	2	6	539994	539999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690556
10026	NC_018683	TGC	2	6	540000	540005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10027	NC_018683	CAG	2	6	540160	540165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10028	NC_018683	CGA	2	6	540183	540188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10029	NC_018683	GCC	2	6	540217	540222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690556
10030	NC_018683	CGA	2	6	540396	540401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10031	NC_018683	ACA	2	6	540473	540478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690556
10032	NC_018683	CGA	2	6	540501	540506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10033	NC_018683	GAA	2	6	540510	540515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690556
10034	NC_018683	CAA	2	6	540522	540527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690556
10035	NC_018683	CGC	2	6	540594	540599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690556
10036	NC_018683	AGC	2	6	540651	540656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10037	NC_018683	CCGCG	2	10	540666	540675	0 %	0 %	40 %	60 %	407690556
10038	NC_018683	CG	4	8	540672	540679	0 %	0 %	50 %	50 %	407690556
10039	NC_018683	CGA	2	6	540711	540716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10040	NC_018683	GCC	2	6	540754	540759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690556
10041	NC_018683	CTG	2	6	540800	540805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10042	NC_018683	GTC	2	6	540817	540822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690556
10043	NC_018683	GCG	2	6	540943	540948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690556
10044	NC_018683	AAG	2	6	540997	541002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690556
10045	NC_018683	GTATG	2	10	541027	541036	20 %	40 %	40 %	0 %	407690556
10046	NC_018683	TTG	2	6	541287	541292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690557
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10048	NC_018683	TCAG	2	8	541363	541370	25 %	25 %	25 %	25 %	407690557
10049	NC_018683	GCC	2	6	541449	541454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690557
10050	NC_018683	CTA	2	6	541545	541550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690557
10051	NC_018683	GGT	2	6	541583	541588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690557
10052	NC_018683	CGG	2	6	541606	541611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690557
10053	NC_018683	CGA	2	6	541640	541645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690557
10054	NC_018683	TGC	2	6	541664	541669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690557
10055	NC_018683	CGCA	2	8	541673	541680	25 %	0 %	25 %	50 %	407690557
10056	NC_018683	AGG	2	6	541681	541686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690557
10057	NC_018683	TCG	2	6	541732	541737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690557
10058	NC_018683	GAC	2	6	541802	541807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690557
10059	NC_018683	CAGAGG	2	12	541810	541821	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407690557
10060	NC_018683	GCGA	2	8	541844	541851	25 %	0 %	50 %	25 %	407690557
10061	NC_018683	CGC	2	6	541853	541858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690557
10062	NC_018683	CAG	2	6	541869	541874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690557
10063	NC_018683	CAAT	2	8	541897	541904	50 %	25 %	0 %	25 %	407690557
10064	NC_018683	GCG	2	6	541970	541975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690557
10065	NC_018683	TCGA	2	8	541977	541984	25 %	25 %	25 %	25 %	407690557
10066	NC_018683	CAG	2	6	542037	542042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690557
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10068	NC_018683	GTG	2	6	542139	542144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690557
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10070	NC_018683	CGG	2	6	542197	542202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690557
10071	NC_018683	TCT	2	6	542336	542341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690557
10072	NC_018683	CGC	2	6	542381	542386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690557
10073	NC_018683	CGA	2	6	542423	542428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690557
10074	NC_018683	TCGAGG	2	12	542476	542487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407690557
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10076	NC_018683	GATG	2	8	542630	542637	25 %	25 %	50 %	0 %	407690557
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10079	NC_018683	CGGG	2	8	542714	542721	0 %	0 %	75 %	25 %	407690557
10080	NC_018683	CAG	2	6	542781	542786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690557
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10083	NC_018683	CGC	2	6	542950	542955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690557
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10087	NC_018683	CGAT	2	8	543148	543155	25 %	25 %	25 %	25 %	407690557
10088	NC_018683	TTC	2	6	543183	543188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690557
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10098	NC_018683	CGT	2	6	543708	543713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690557
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10101	NC_018683	CGA	2	6	544247	544252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690558
10102	NC_018683	CG	3	6	544259	544264	0 %	0 %	50 %	50 %	407690558
10103	NC_018683	TCA	2	6	544311	544316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690558
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10106	NC_018683	GC	3	6	544422	544427	0 %	0 %	50 %	50 %	407690558
10107	NC_018683	TCG	2	6	544457	544462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690558
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10118	NC_018683	GAC	2	6	544753	544758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690558
10119	NC_018683	GTC	2	6	544763	544768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690558
10120	NC_018683	CGA	2	6	544785	544790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690558
10121	NC_018683	GAT	2	6	544828	544833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690558
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10123	NC_018683	CT	3	6	544960	544965	0 %	50 %	0 %	50 %	407690559
10124	NC_018683	CGA	2	6	544999	545004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690559
10125	NC_018683	GAG	2	6	545021	545026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690559
10126	NC_018683	GAT	2	6	545060	545065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690559
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10133	NC_018683	CGGC	2	8	545206	545213	0 %	0 %	50 %	50 %	407690559
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10147	NC_018683	TTGCCG	2	12	546233	546244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690560
10148	NC_018683	CGA	2	6	546270	546275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690560
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10157	NC_018683	GAC	2	6	546589	546594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690560
10158	NC_018683	CGG	3	9	546627	546635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690560
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10164	NC_018683	GTT	2	6	546844	546849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690560
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10207	NC_018683	CGC	2	6	549831	549836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690565
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10211	NC_018683	CGA	2	6	550297	550302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690566
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10222	NC_018683	GGC	2	6	551179	551184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690568
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10224	NC_018683	GCT	2	6	551275	551280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690569
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10230	NC_018683	CGA	2	6	551621	551626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690569
10231	NC_018683	TGA	2	6	551639	551644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690569
10232	NC_018683	GGGC	2	8	551716	551723	0 %	0 %	75 %	25 %	407690569
10233	NC_018683	GGCT	2	8	551738	551745	0 %	25 %	50 %	25 %	407690569
10234	NC_018683	CAC	2	6	551804	551809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690570
10235	NC_018683	GGC	2	6	551812	551817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690570
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10238	NC_018683	GCA	2	6	551940	551945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690570
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10240	NC_018683	AAC	2	6	552027	552032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690570
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10266	NC_018683	AT	3	6	554280	554285	50 %	50 %	0 %	0 %	407690573
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10475	NC_018683	CGT	2	6	566093	566098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690582
10476	NC_018683	CTGG	2	8	566126	566133	0 %	25 %	50 %	25 %	407690582
10477	NC_018683	CGC	2	6	566140	566145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690582
10478	NC_018683	GAC	2	6	566154	566159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690582
10479	NC_018683	CGA	2	6	566207	566212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690582
10480	NC_018683	GAT	2	6	566213	566218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690582
10481	NC_018683	CGC	2	6	566225	566230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690582
10482	NC_018683	TCG	2	6	566359	566364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690582
10483	NC_018683	CCA	2	6	566440	566445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690582
10484	NC_018683	TGG	2	6	566495	566500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690583
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10490	NC_018683	TGC	2	6	566731	566736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690584
10491	NC_018683	GTC	2	6	566745	566750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690584
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10495	NC_018683	CGT	2	6	566846	566851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690584
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