MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018682	GGC	2	6	201127	201132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689955
3502	NC_018682	CTG	2	6	201169	201174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689955
3503	NC_018682	TCT	2	6	201215	201220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689955
3504	NC_018682	CGA	2	6	201243	201248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689955
3505	NC_018682	ATG	2	6	201296	201301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689955
3506	NC_018682	GAG	2	6	201413	201418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689955
3507	NC_018682	GGC	2	6	201754	201759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689956
3508	NC_018682	TCA	2	6	201762	201767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689956
3509	NC_018682	GAA	2	6	201830	201835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689956
3510	NC_018682	TGA	2	6	201868	201873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689956
3511	NC_018682	GGC	2	6	201949	201954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689956
3512	NC_018682	ACG	2	6	201974	201979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689956
3513	NC_018682	GAGCC	2	10	201990	201999	20 %	0 %	40 %	40 %	407689956
3514	NC_018682	CGA	2	6	202048	202053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689956
3515	NC_018682	ACG	2	6	202058	202063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689956
3516	NC_018682	GGC	2	6	202115	202120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689956
3517	NC_018682	GAC	2	6	202231	202236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689956
3518	NC_018682	CGC	2	6	202242	202247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689956
3519	NC_018682	ACC	2	6	202251	202256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689956
3520	NC_018682	TCGC	2	8	202547	202554	0 %	25 %	25 %	50 %	407689957
3521	NC_018682	A	6	6	202595	202600	100 %	0 %	0 %	0 %	407689957
3522	NC_018682	GCG	2	6	202798	202803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689957
3523	NC_018682	CGC	2	6	202910	202915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689957
3524	NC_018682	GC	4	8	202922	202929	0 %	0 %	50 %	50 %	407689957
3525	NC_018682	TGT	2	6	202954	202959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689957
3526	NC_018682	TCG	2	6	202960	202965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689957
3527	NC_018682	TGC	2	6	203053	203058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689957
3528	NC_018682	GCG	2	6	203100	203105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689957
3529	NC_018682	CTTT	2	8	203131	203138	0 %	75 %	0 %	25 %	407689957
3530	NC_018682	CCG	2	6	203191	203196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689957
3531	NC_018682	CTG	2	6	203202	203207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689957
3532	NC_018682	TGC	2	6	203233	203238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689957
3533	NC_018682	CGTG	2	8	203303	203310	0 %	25 %	50 %	25 %	407689957
3534	NC_018682	GCG	2	6	203415	203420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689957
3535	NC_018682	ATG	2	6	203428	203433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689957
3536	NC_018682	CGG	2	6	203533	203538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689957
3537	NC_018682	GCC	3	9	203589	203597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689957
3538	NC_018682	ATT	2	6	203602	203607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689957
3539	NC_018682	CAA	2	6	203612	203617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689957
3540	NC_018682	GCA	2	6	203691	203696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689958
3541	NC_018682	TTG	2	6	203761	203766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689958
3542	NC_018682	CTT	2	6	203777	203782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689958
3543	NC_018682	GCG	2	6	203829	203834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689958
3544	NC_018682	CGA	2	6	203855	203860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689958
3545	NC_018682	GGC	2	6	203864	203869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689958
3546	NC_018682	GCG	2	6	203922	203927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689958
3547	NC_018682	CGT	2	6	203951	203956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689958
3548	NC_018682	CGC	2	6	203971	203976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689958
3549	NC_018682	GAA	2	6	203981	203986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689958
3550	NC_018682	TCC	2	6	204039	204044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689958
3551	NC_018682	GTC	2	6	204066	204071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689958
3552	NC_018682	CG	3	6	204112	204117	0 %	0 %	50 %	50 %	407689958
3553	NC_018682	GGC	4	12	204195	204206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689958
3554	NC_018682	AGCCG	2	10	204266	204275	20 %	0 %	40 %	40 %	407689958
3555	NC_018682	GAT	2	6	204285	204290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689958
3556	NC_018682	CAT	2	6	204317	204322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689958
3557	NC_018682	CGA	2	6	204326	204331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689958
3558	NC_018682	GGA	2	6	204428	204433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689958
3559	NC_018682	TCG	2	6	204439	204444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689958
3560	NC_018682	GTGCC	2	10	204496	204505	0 %	20 %	40 %	40 %	407689958
3561	NC_018682	GAA	2	6	204521	204526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689958
3562	NC_018682	TCA	3	9	204559	204567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689958
3563	NC_018682	CGG	2	6	204569	204574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689958
3564	NC_018682	CTCGAT	2	12	204723	204734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407689959
3565	NC_018682	GTCG	2	8	204818	204825	0 %	25 %	50 %	25 %	407689959
3566	NC_018682	CAG	2	6	204840	204845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689959
3567	NC_018682	GT	3	6	204865	204870	0 %	50 %	50 %	0 %	407689959
3568	NC_018682	GCG	2	6	204907	204912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689959
3569	NC_018682	GATC	2	8	204959	204966	25 %	25 %	25 %	25 %	407689959
3570	NC_018682	CGA	2	6	205013	205018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689959
3571	NC_018682	GCG	2	6	205111	205116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689959
3572	NC_018682	ACC	3	9	205119	205127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689959
3573	NC_018682	TAT	2	6	205344	205349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689959
3574	NC_018682	GT	3	6	205366	205371	0 %	50 %	50 %	0 %	407689959
3575	NC_018682	TGA	2	6	205451	205456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689959
3576	NC_018682	TGA	2	6	205495	205500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689959
3577	NC_018682	CGACC	2	10	205691	205700	20 %	0 %	20 %	60 %	407689959
3578	NC_018682	TGG	2	6	205888	205893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689960
3579	NC_018682	GGT	2	6	206037	206042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689960
3580	NC_018682	GGC	2	6	206136	206141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689960
3581	NC_018682	CGG	2	6	206164	206169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689960
3582	NC_018682	GC	3	6	206261	206266	0 %	0 %	50 %	50 %	407689960
3583	NC_018682	TCGATC	2	12	206377	206388	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407689960
3584	NC_018682	TGA	2	6	206396	206401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689960
3585	NC_018682	TCA	2	6	206410	206415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689960
3586	NC_018682	TCG	2	6	206427	206432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689960
3587	NC_018682	GGAC	2	8	206491	206498	25 %	0 %	50 %	25 %	407689960
3588	NC_018682	GCA	2	6	206538	206543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689960
3589	NC_018682	CAG	2	6	206618	206623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689960
3590	NC_018682	GAC	2	6	206625	206630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689960
3591	NC_018682	AGA	2	6	206684	206689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689960
3592	NC_018682	AC	3	6	206798	206803	50 %	0 %	0 %	50 %	407689960
3593	NC_018682	CAT	2	6	207025	207030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689961
3594	NC_018682	GAG	2	6	207033	207038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689961
3595	NC_018682	GTC	2	6	207071	207076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689961
3596	NC_018682	GGAG	2	8	207082	207089	25 %	0 %	75 %	0 %	407689961
3597	NC_018682	GCG	2	6	207356	207361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689961
3598	NC_018682	TGA	2	6	207489	207494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689961
3599	NC_018682	GAT	2	6	207500	207505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689961
3600	NC_018682	GCC	2	6	207656	207661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689961
3601	NC_018682	GC	3	6	207686	207691	0 %	0 %	50 %	50 %	407689961
3602	NC_018682	CTG	2	6	207827	207832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689961
3603	NC_018682	AAG	2	6	208286	208291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689962
3604	NC_018682	GTGCCT	2	12	208329	208340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3605	NC_018682	GTC	2	6	208433	208438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3606	NC_018682	CGA	2	6	208456	208461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3607	NC_018682	GGT	2	6	208472	208477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689962
3608	NC_018682	CGA	3	9	208527	208535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3609	NC_018682	GC	3	6	208572	208577	0 %	0 %	50 %	50 %	407689962
3610	NC_018682	GTC	2	6	208586	208591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3611	NC_018682	GCC	2	6	208592	208597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689962
3612	NC_018682	GC	4	8	208662	208669	0 %	0 %	50 %	50 %	407689962
3613	NC_018682	GCT	2	6	208687	208692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3614	NC_018682	CAT	2	6	208738	208743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689962
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3616	NC_018682	GAC	2	6	208787	208792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3617	NC_018682	CCG	2	6	208800	208805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689962
3618	NC_018682	GAG	2	6	208883	208888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689962
3619	NC_018682	TCG	2	6	208958	208963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3620	NC_018682	CGA	2	6	208975	208980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689962
3621	NC_018682	GCG	2	6	208997	209002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689962
3622	NC_018682	GCA	2	6	209229	209234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689963
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3652	NC_018682	GC	3	6	210775	210780	0 %	0 %	50 %	50 %	407689964
3653	NC_018682	GCAA	2	8	210884	210891	50 %	0 %	25 %	25 %	407689964
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3657	NC_018682	TCC	2	6	211224	211229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689965
3658	NC_018682	CGA	2	6	211234	211239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689965
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3732	NC_018682	CAAGC	2	10	215157	215166	40 %	0 %	20 %	40 %	407689969
3733	NC_018682	GGA	2	6	215235	215240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689969
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3983	NC_018682	GC	3	6	230595	230600	0 %	0 %	50 %	50 %	407689985
3984	NC_018682	CGC	2	6	230605	230610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689985
3985	NC_018682	CGA	2	6	230743	230748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689985
3986	NC_018682	GCA	2	6	230833	230838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689985
3987	NC_018682	AGC	2	6	230869	230874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689985
3988	NC_018682	GATC	2	8	230935	230942	25 %	25 %	25 %	25 %	407689985
3989	NC_018682	TC	3	6	230941	230946	0 %	50 %	0 %	50 %	407689985
3990	NC_018682	CGG	2	6	230953	230958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689985
3991	NC_018682	AGGC	2	8	231132	231139	25 %	0 %	50 %	25 %	407689986
3992	NC_018682	GCC	2	6	231185	231190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689986
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3997	NC_018682	GCT	2	6	231276	231281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689986
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3999	NC_018682	GC	4	8	231403	231410	0 %	0 %	50 %	50 %	407689986
4000	NC_018682	GTC	2	6	231453	231458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689986

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