MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus 08BA02176 chromosome

Total Repeats: 54894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018608	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477335
2	NC_018608	CAA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477335
3	NC_018608	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477335
4	NC_018608	TAC	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477335
5	NC_018608	GAA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
6	NC_018608	TAA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477335
7	NC_018608	ACA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477335
8	NC_018608	AAC	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477335
9	NC_018608	AG	3	6	854	859	50 %	0 %	50 %	0 %	404477335
10	NC_018608	ATT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477335
11	NC_018608	ATGC	2	8	1013	1020	25 %	25 %	25 %	25 %	404477335
12	NC_018608	TCA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477335
13	NC_018608	ATA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477335
14	NC_018608	TTA	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477335
15	NC_018608	TTA	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477335
16	NC_018608	GAT	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477335
17	NC_018608	AAG	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
18	NC_018608	ACC	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404477335
19	NC_018608	AGA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
20	NC_018608	TTG	2	6	1341	1346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477335
21	NC_018608	CCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404477335
22	NC_018608	AGA	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
23	NC_018608	GAA	3	9	1400	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
24	NC_018608	CCA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404477335
25	NC_018608	TA	3	6	1439	1444	50 %	50 %	0 %	0 %	404477335
26	NC_018608	CAAAT	2	10	1446	1455	60 %	20 %	0 %	20 %	404477335
27	NC_018608	ATT	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477335
28	NC_018608	CTG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477335
29	NC_018608	A	6	6	1611	1616	100 %	0 %	0 %	0 %	404477335
30	NC_018608	A	7	7	1660	1666	100 %	0 %	0 %	0 %	404477335
31	NC_018608	AG	3	6	1715	1720	50 %	0 %	50 %	0 %	404477335
32	NC_018608	GAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
33	NC_018608	TGG	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477335
34	NC_018608	TCAT	2	8	1782	1789	25 %	50 %	0 %	25 %	404477335
35	NC_018608	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	404477335
36	NC_018608	AGA	2	6	1819	1824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
37	NC_018608	AAG	2	6	1839	1844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477335
38	NC_018608	TAAT	2	8	2151	2158	50 %	50 %	0 %	0 %	404477336
39	NC_018608	ATT	2	6	2182	2187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477336
40	NC_018608	TTA	2	6	2188	2193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477336
41	NC_018608	AAC	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477336
42	NC_018608	AGT	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477336
43	NC_018608	TTG	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477336
44	NC_018608	A	7	7	2417	2423	100 %	0 %	0 %	0 %	404477336
45	NC_018608	ATTA	2	8	2471	2478	50 %	50 %	0 %	0 %	404477336
46	NC_018608	AATTT	2	10	2494	2503	40 %	60 %	0 %	0 %	404477336
47	NC_018608	TTA	2	6	2532	2537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477336
48	NC_018608	CAATT	2	10	2560	2569	40 %	40 %	0 %	20 %	404477336
49	NC_018608	GACT	2	8	2693	2700	25 %	25 %	25 %	25 %	404477336
50	NC_018608	AGA	2	6	2732	2737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477336
51	NC_018608	TCA	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477336
52	NC_018608	TAAA	2	8	2788	2795	75 %	25 %	0 %	0 %	404477336
53	NC_018608	GAA	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477336
54	NC_018608	TCT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404477336
55	NC_018608	TTTA	2	8	2849	2856	25 %	75 %	0 %	0 %	404477336
56	NC_018608	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477336
57	NC_018608	ACA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477336
58	NC_018608	AAATT	2	10	2938	2947	60 %	40 %	0 %	0 %	404477336
59	NC_018608	TTA	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477336
60	NC_018608	GGT	2	6	3009	3014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477336
61	NC_018608	TTA	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477336
62	NC_018608	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477336
63	NC_018608	GTT	2	6	3048	3053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477336
64	NC_018608	TCT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404477336
65	NC_018608	AGA	2	6	3092	3097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477336
66	NC_018608	GGT	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477336
67	NC_018608	TTCA	2	8	3137	3144	25 %	50 %	0 %	25 %	404477336
68	NC_018608	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	404477336
69	NC_018608	GATG	2	8	3158	3165	25 %	25 %	50 %	0 %	404477336
70	NC_018608	ATG	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477336
71	NC_018608	GTTGAA	2	12	3192	3203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477336
72	NC_018608	TTC	2	6	3204	3209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404477336
73	NC_018608	GAC	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477336
74	NC_018608	AATT	2	8	3262	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	404477336
75	NC_018608	AAG	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477337
76	NC_018608	GTA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477337
77	NC_018608	ATT	2	6	3743	3748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477337
78	NC_018608	TGG	2	6	3754	3759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477337
79	NC_018608	ATTA	2	8	3793	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	404477337
80	NC_018608	TTCT	2	8	3883	3890	0 %	75 %	0 %	25 %	404477337
81	NC_018608	TCAT	2	8	3894	3901	25 %	50 %	0 %	25 %	404477337
82	NC_018608	ATG	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477338
83	NC_018608	A	6	6	4177	4182	100 %	0 %	0 %	0 %	404477338
84	NC_018608	GTC	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477338
85	NC_018608	AT	3	6	4230	4235	50 %	50 %	0 %	0 %	404477338
86	NC_018608	AGA	2	6	4266	4271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477338
87	NC_018608	CTC	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404477338
88	NC_018608	GAC	2	6	4304	4309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477338
89	NC_018608	CTG	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477338
90	NC_018608	AAT	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477338
91	NC_018608	A	7	7	4424	4430	100 %	0 %	0 %	0 %	404477338
92	NC_018608	CAG	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477338
93	NC_018608	ATT	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477338
94	NC_018608	GAA	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477338
95	NC_018608	ATA	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477338
96	NC_018608	GAT	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477338
97	NC_018608	TTA	3	9	4849	4857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477338
98	NC_018608	GAT	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477338
99	NC_018608	TTA	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477338
100	NC_018608	ACA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477339
101	NC_018608	GTAT	2	8	5132	5139	25 %	50 %	25 %	0 %	404477339
102	NC_018608	AG	4	8	5154	5161	50 %	0 %	50 %	0 %	404477339
103	NC_018608	ATA	2	6	5192	5197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477339
104	NC_018608	CAAAT	2	10	5225	5234	60 %	20 %	0 %	20 %	404477339
105	NC_018608	GTT	2	6	5239	5244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477339
106	NC_018608	A	6	6	5309	5314	100 %	0 %	0 %	0 %	404477339
107	NC_018608	TGG	2	6	5358	5363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477339
108	NC_018608	TGGCGG	2	12	5370	5381	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	404477339
109	NC_018608	TGG	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477339
110	NC_018608	TCA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477339
111	NC_018608	TA	3	6	5475	5480	50 %	50 %	0 %	0 %	404477339
112	NC_018608	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477339
113	NC_018608	A	6	6	5494	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	404477339
114	NC_018608	AAG	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477339
115	NC_018608	ACA	2	6	5619	5624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477339
116	NC_018608	AG	3	6	5632	5637	50 %	0 %	50 %	0 %	404477339
117	NC_018608	TGA	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477339
118	NC_018608	AGA	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477339
119	NC_018608	ATG	2	6	5777	5782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477339
120	NC_018608	TCA	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477339
121	NC_018608	GAT	2	6	5809	5814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477339
122	NC_018608	GGT	2	6	5899	5904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477339
123	NC_018608	AGA	2	6	5979	5984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477339
124	NC_018608	TATC	2	8	6035	6042	25 %	50 %	0 %	25 %	404477339
125	NC_018608	ATT	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477339
126	NC_018608	TAT	2	6	6192	6197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477339
127	NC_018608	GGC	2	6	6198	6203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404477339
128	NC_018608	TGC	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477339
129	NC_018608	A	6	6	6223	6228	100 %	0 %	0 %	0 %	404477339
130	NC_018608	CGT	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477339
131	NC_018608	GAA	2	6	6313	6318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477339
132	NC_018608	CTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477339
133	NC_018608	G	6	6	6352	6357	0 %	0 %	100 %	0 %	404477339
134	NC_018608	TAGA	2	8	6440	6447	50 %	25 %	25 %	0 %	404477339
135	NC_018608	TGGA	2	8	6566	6573	25 %	25 %	50 %	0 %	404477339
136	NC_018608	TTA	2	6	6592	6597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477339
137	NC_018608	TTC	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404477339
138	NC_018608	TAT	2	6	6694	6699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477339
139	NC_018608	TGAAT	2	10	6735	6744	40 %	40 %	20 %	0 %	404477339
140	NC_018608	AATG	2	8	6789	6796	50 %	25 %	25 %	0 %	404477339
141	NC_018608	ACA	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477339
142	NC_018608	AGA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477339
143	NC_018608	TCAA	2	8	7020	7027	50 %	25 %	0 %	25 %	404477340
144	NC_018608	TCG	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477340
145	NC_018608	A	6	6	7198	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	404477340
146	NC_018608	GTTATC	2	12	7298	7309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	404477340
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148	NC_018608	ATGG	2	8	7342	7349	25 %	25 %	50 %	0 %	404477340
149	NC_018608	GCA	3	9	7357	7365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477340
150	NC_018608	TAA	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404477340
151	NC_018608	ATG	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477340
152	NC_018608	AG	3	6	7468	7473	50 %	0 %	50 %	0 %	404477340
153	NC_018608	GGTA	2	8	7533	7540	25 %	25 %	50 %	0 %	404477340
154	NC_018608	CCA	2	6	7555	7560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404477340
155	NC_018608	TAAG	2	8	7598	7605	50 %	25 %	25 %	0 %	404477340
156	NC_018608	CTG	2	6	7664	7669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477340
157	NC_018608	TTCAA	2	10	7722	7731	40 %	40 %	0 %	20 %	404477340
158	NC_018608	GAA	2	6	7753	7758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477340
159	NC_018608	TTG	2	6	7781	7786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477340
160	NC_018608	A	6	6	7829	7834	100 %	0 %	0 %	0 %	404477340
161	NC_018608	TCGT	2	8	7844	7851	0 %	50 %	25 %	25 %	404477340
162	NC_018608	TGA	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477340
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166	NC_018608	AAG	2	6	8051	8056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477340
167	NC_018608	ATT	2	6	8066	8071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477340
168	NC_018608	GTT	2	6	8089	8094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404477340
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170	NC_018608	ATT	2	6	8185	8190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477340
171	NC_018608	CAGATA	2	12	8207	8218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	404477340
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178	NC_018608	AGTT	2	8	8405	8412	25 %	50 %	25 %	0 %	404477340
179	NC_018608	TGA	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477340
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243	NC_018608	CAA	2	6	11303	11308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404477342
244	NC_018608	TTAGCA	2	12	11351	11362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404477342
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247	NC_018608	TA	3	6	11519	11524	50 %	50 %	0 %	0 %	404477342
248	NC_018608	AGA	2	6	11530	11535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477342
249	NC_018608	TGC	2	6	11560	11565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477342
250	NC_018608	ATG	2	6	11610	11615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477342
251	NC_018608	ACG	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477342
252	NC_018608	CGTTG	2	10	11733	11742	0 %	40 %	40 %	20 %	404477342
253	NC_018608	AATG	2	8	11809	11816	50 %	25 %	25 %	0 %	404477342
254	NC_018608	GGT	2	6	11873	11878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404477342
255	NC_018608	ATC	2	6	11913	11918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404477342
256	NC_018608	CGT	2	6	11957	11962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477342
257	NC_018608	GAT	2	6	12043	12048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477342
258	NC_018608	TGC	3	9	12058	12066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477342
259	NC_018608	AAG	2	6	12138	12143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404477342
260	NC_018608	GCT	2	6	12167	12172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404477342
261	NC_018608	ATT	2	6	12188	12193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404477342
262	NC_018608	GT	3	6	12207	12212	0 %	50 %	50 %	0 %	404477342
263	NC_018608	AGC	2	6	12241	12246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477342
264	NC_018608	ATG	2	6	12294	12299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477342
265	NC_018608	CCAT	2	8	12317	12324	25 %	25 %	0 %	50 %	404477342
266	NC_018608	CAAT	2	8	12380	12387	50 %	25 %	0 %	25 %	404477342
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269	NC_018608	ACG	2	6	12900	12905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404477343
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273	NC_018608	A	7	7	12972	12978	100 %	0 %	0 %	0 %	404477343
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386	NC_018608	A	6	6	19069	19074	100 %	0 %	0 %	0 %	404477348
387	NC_018608	TTGGTG	2	12	19108	19119	0 %	50 %	50 %	0 %	404477348
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499	NC_018608	A	7	7	25114	25120	100 %	0 %	0 %	0 %	404477353
500	NC_018608	ATG	2	6	25155	25160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404477353

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