MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 34509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018526	TTC	2	6	120329	120334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060823
2002	NC_018526	GTT	2	6	120389	120394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060823
2003	NC_018526	TCCATT	2	12	120441	120452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403060823
2004	NC_018526	A	6	6	120555	120560	100 %	0 %	0 %	0 %	403060823
2005	NC_018526	TAAA	2	8	120589	120596	75 %	25 %	0 %	0 %	403060823
2006	NC_018526	GTC	2	6	120685	120690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060824
2007	NC_018526	GTCG	2	8	120852	120859	0 %	25 %	50 %	25 %	403060824
2008	NC_018526	GAT	2	6	120914	120919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060824
2009	NC_018526	GGA	2	6	120923	120928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060824
2010	NC_018526	TTGA	2	8	120963	120970	25 %	50 %	25 %	0 %	403060824
2011	NC_018526	CTGGA	2	10	120988	120997	20 %	20 %	40 %	20 %	403060824
2012	NC_018526	GTA	2	6	121020	121025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060824
2013	NC_018526	TGG	2	6	121075	121080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060824
2014	NC_018526	GGT	2	6	121092	121097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060824
2015	NC_018526	AGT	2	6	121133	121138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060824
2016	NC_018526	T	6	6	121169	121174	0 %	100 %	0 %	0 %	403060824
2017	NC_018526	GA	3	6	121177	121182	50 %	0 %	50 %	0 %	403060824
2018	NC_018526	GCT	2	6	121188	121193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060824
2019	NC_018526	CTC	2	6	121236	121241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060824
2020	NC_018526	CGAC	2	8	121246	121253	25 %	0 %	25 %	50 %	403060824
2021	NC_018526	GTG	2	6	121263	121268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060824
2022	NC_018526	GCA	2	6	121269	121274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060824
2023	NC_018526	AGCAG	2	10	121344	121353	40 %	0 %	40 %	20 %	403060824
2024	NC_018526	GTC	2	6	121411	121416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060824
2025	NC_018526	AGG	2	6	121420	121425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060824
2026	NC_018526	ACA	2	6	121446	121451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060824
2027	NC_018526	CAA	2	6	121477	121482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060824
2028	NC_018526	GGCCG	2	10	121525	121534	0 %	0 %	60 %	40 %	403060824
2029	NC_018526	AAT	2	6	121578	121583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060824
2030	NC_018526	GAA	2	6	121614	121619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060824
2031	NC_018526	TGT	2	6	121684	121689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060824
2032	NC_018526	GAC	2	6	121721	121726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060824
2033	NC_018526	AAC	2	6	121831	121836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060824
2034	NC_018526	AGA	2	6	121892	121897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060824
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2036	NC_018526	AATCA	2	10	121964	121973	60 %	20 %	0 %	20 %	403060825
2037	NC_018526	T	6	6	121991	121996	0 %	100 %	0 %	0 %	403060825
2038	NC_018526	AAG	2	6	122010	122015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060825
2039	NC_018526	AAG	2	6	122028	122033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060825
2040	NC_018526	AG	3	6	122047	122052	50 %	0 %	50 %	0 %	403060825
2041	NC_018526	AGCG	2	8	122071	122078	25 %	0 %	50 %	25 %	403060825
2042	NC_018526	GTT	2	6	122091	122096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060825
2043	NC_018526	AGT	2	6	122155	122160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060825
2044	NC_018526	CTT	2	6	122179	122184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060825
2045	NC_018526	GAG	2	6	122195	122200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060825
2046	NC_018526	T	6	6	122214	122219	0 %	100 %	0 %	0 %	403060825
2047	NC_018526	ATG	2	6	122223	122228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060825
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2049	NC_018526	CTT	2	6	122377	122382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060825
2050	NC_018526	TAG	2	6	122438	122443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060825
2051	NC_018526	T	6	6	122496	122501	0 %	100 %	0 %	0 %	403060825
2052	NC_018526	ATA	2	6	122604	122609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060825
2053	NC_018526	GGCA	2	8	122618	122625	25 %	0 %	50 %	25 %	403060825
2054	NC_018526	AGGTG	2	10	122652	122661	20 %	20 %	60 %	0 %	403060825
2055	NC_018526	AAC	2	6	122729	122734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060825
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2057	NC_018526	GAG	2	6	122839	122844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060825
2058	NC_018526	CTT	2	6	122986	122991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060825
2059	NC_018526	TTC	3	9	123013	123021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060825
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2062	NC_018526	A	6	6	123802	123807	100 %	0 %	0 %	0 %	403060826
2063	NC_018526	AGG	2	6	123821	123826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060826
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2065	NC_018526	TTTG	2	8	123939	123946	0 %	75 %	25 %	0 %	403060826
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2071	NC_018526	GAC	2	6	124061	124066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060827
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2082	NC_018526	TGG	2	6	124677	124682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060828
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2088	NC_018526	CAG	2	6	125088	125093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060828
2089	NC_018526	TGC	2	6	125164	125169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060828
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2091	NC_018526	A	6	6	125250	125255	100 %	0 %	0 %	0 %	403060828
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2093	NC_018526	ATA	2	6	125340	125345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060829
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2107	NC_018526	AGT	2	6	126099	126104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060830
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2109	NC_018526	ACTTT	2	10	126233	126242	20 %	60 %	0 %	20 %	403060830
2110	NC_018526	TTAG	2	8	126245	126252	25 %	50 %	25 %	0 %	403060830
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2112	NC_018526	T	6	6	126285	126290	0 %	100 %	0 %	0 %	403060830
2113	NC_018526	AGA	2	6	126323	126328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060830
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2117	NC_018526	GACA	2	8	126487	126494	50 %	0 %	25 %	25 %	403060830
2118	NC_018526	ACAG	2	8	126498	126505	50 %	0 %	25 %	25 %	403060830
2119	NC_018526	TG	3	6	126533	126538	0 %	50 %	50 %	0 %	403060830
2120	NC_018526	GA	3	6	126570	126575	50 %	0 %	50 %	0 %	403060830
2121	NC_018526	TCG	2	6	126653	126658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060830
2122	NC_018526	TAG	2	6	126663	126668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060830
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2231	NC_018526	TAC	2	6	132519	132524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060837
2232	NC_018526	ATC	2	6	132559	132564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060837
2233	NC_018526	CAAGA	2	10	132631	132640	60 %	0 %	20 %	20 %	403060837
2234	NC_018526	GAA	2	6	132667	132672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060837
2235	NC_018526	AAAC	2	8	132692	132699	75 %	0 %	0 %	25 %	403060837
2236	NC_018526	TTG	2	6	132755	132760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060837
2237	NC_018526	CGT	2	6	132769	132774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060837
2238	NC_018526	CTC	2	6	132803	132808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060837
2239	NC_018526	TTC	2	6	132856	132861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060837
2240	NC_018526	TGG	2	6	132873	132878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060837
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2242	NC_018526	TTCGAG	2	12	132937	132948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403060837
2243	NC_018526	TCG	2	6	132956	132961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060837
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2355	NC_018526	CTG	2	6	140470	140475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060841
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2359	NC_018526	ATG	2	6	140588	140593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060841
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2363	NC_018526	TCG	2	6	140804	140809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060842
2364	NC_018526	ACTT	2	8	140833	140840	25 %	50 %	0 %	25 %	403060842
2365	NC_018526	T	6	6	140855	140860	0 %	100 %	0 %	0 %	403060842
2366	NC_018526	TGC	2	6	140879	140884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060842
2367	NC_018526	AAG	2	6	140889	140894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060842
2368	NC_018526	CAG	2	6	140934	140939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060842
2369	NC_018526	TGA	2	6	140951	140956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060842
2370	NC_018526	CGT	2	6	140964	140969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060842
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2372	NC_018526	GTC	2	6	140989	140994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060842
2373	NC_018526	TCG	2	6	141030	141035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060842
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2378	NC_018526	TGA	2	6	141318	141323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060843
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2382	NC_018526	CCAGAA	2	12	141460	141471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403060843
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2388	NC_018526	GCATG	2	10	141741	141750	20 %	20 %	40 %	20 %	403060843
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2392	NC_018526	AAAAT	2	10	142154	142163	80 %	20 %	0 %	0 %	403060843
2393	NC_018526	AGCACC	2	12	142167	142178	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403060843
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2395	NC_018526	CGT	2	6	142216	142221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060843
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2400	NC_018526	TC	3	6	142823	142828	0 %	50 %	0 %	50 %	403060844
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2459	NC_018526	CCT	2	6	146297	146302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060848
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2470	NC_018526	GGAGTT	2	12	146643	146654	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403060848
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2473	NC_018526	TTTC	2	8	146894	146901	0 %	75 %	0 %	25 %	403060848
2474	NC_018526	CAG	2	6	146944	146949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060848
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2478	NC_018526	GCT	2	6	147112	147117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060848
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2481	NC_018526	TTGG	2	8	147382	147389	0 %	50 %	50 %	0 %	403060849
2482	NC_018526	TTC	2	6	147400	147405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060849
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2484	NC_018526	T	6	6	147434	147439	0 %	100 %	0 %	0 %	403060849
2485	NC_018526	GAT	2	6	147472	147477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
2486	NC_018526	TTG	2	6	147481	147486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060849
2487	NC_018526	AGT	2	6	147525	147530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
2488	NC_018526	ATC	2	6	147559	147564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060849
2489	NC_018526	TA	3	6	147616	147621	50 %	50 %	0 %	0 %	403060849
2490	NC_018526	T	6	6	147720	147725	0 %	100 %	0 %	0 %	403060849
2491	NC_018526	GAT	2	6	147726	147731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
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